MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021829	TTA	2	6	50831	50836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721288
1002	NC_021829	TTGCA	2	10	50879	50888	20 %	40 %	20 %	20 %	525721288
1003	NC_021829	ACT	2	6	50908	50913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721288
1004	NC_021829	AAC	2	6	50990	50995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721288
1005	NC_021829	A	6	6	51017	51022	100 %	0 %	0 %	0 %	525721288
1006	NC_021829	GTTTA	2	10	51023	51032	20 %	60 %	20 %	0 %	525721288
1007	NC_021829	ATG	2	6	51076	51081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721288
1008	NC_021829	GAA	2	6	51106	51111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721288
1009	NC_021829	TTA	2	6	51121	51126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721288
1010	NC_021829	TTA	2	6	51134	51139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721288
1011	NC_021829	GAT	2	6	51195	51200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721288
1012	NC_021829	TGA	2	6	51242	51247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721288
1013	NC_021829	CTT	2	6	51257	51262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721288
1014	NC_021829	CAT	2	6	51267	51272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721288
1015	NC_021829	GGA	2	6	51410	51415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525721288
1016	NC_021829	T	7	7	51479	51485	0 %	100 %	0 %	0 %	525721289
1017	NC_021829	AACG	2	8	51509	51516	50 %	0 %	25 %	25 %	525721289
1018	NC_021829	TTC	2	6	51520	51525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721289
1019	NC_021829	TCA	2	6	51539	51544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721289
1020	NC_021829	ACA	2	6	51581	51586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721289
1021	NC_021829	CAA	2	6	51606	51611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721289
1022	NC_021829	T	6	6	51612	51617	0 %	100 %	0 %	0 %	525721289
1023	NC_021829	ATTG	2	8	51727	51734	25 %	50 %	25 %	0 %	525721289
1024	NC_021829	TTC	2	6	51745	51750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721289
1025	NC_021829	AAT	2	6	51759	51764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721289
1026	NC_021829	TTCTTT	2	12	51802	51813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525721289
1027	NC_021829	AT	3	6	51854	51859	50 %	50 %	0 %	0 %	525721289
1028	NC_021829	CATTC	2	10	51885	51894	20 %	40 %	0 %	40 %	525721289
1029	NC_021829	TAC	2	6	51982	51987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721289
1030	NC_021829	TAG	2	6	52059	52064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721290
1031	NC_021829	T	6	6	52070	52075	0 %	100 %	0 %	0 %	525721290
1032	NC_021829	TCT	2	6	52142	52147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721290
1033	NC_021829	ACT	2	6	52160	52165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721290
1034	NC_021829	CGCT	2	8	52222	52229	0 %	25 %	25 %	50 %	525721290
1035	NC_021829	CAA	2	6	52251	52256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721290
1036	NC_021829	TTC	2	6	52264	52269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721290
1037	NC_021829	CCT	2	6	52318	52323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721291
1038	NC_021829	TTC	2	6	52338	52343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1039	NC_021829	GGT	2	6	52353	52358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721291
1040	NC_021829	GA	3	6	52399	52404	50 %	0 %	50 %	0 %	525721291
1041	NC_021829	AGT	2	6	52414	52419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721291
1042	NC_021829	TCG	2	6	52525	52530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721291
1043	NC_021829	AAC	2	6	52536	52541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721291
1044	NC_021829	AAC	2	6	52586	52591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721291
1045	NC_021829	CTG	2	6	52658	52663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721291
1046	NC_021829	T	6	6	52670	52675	0 %	100 %	0 %	0 %	525721291
1047	NC_021829	TCT	2	6	52744	52749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1048	NC_021829	AAT	2	6	52761	52766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721291
1049	NC_021829	AT	3	6	52765	52770	50 %	50 %	0 %	0 %	525721291
1050	NC_021829	AAT	2	6	52798	52803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721291
1051	NC_021829	TAA	2	6	52853	52858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721291
1052	NC_021829	TTAA	2	8	52888	52895	50 %	50 %	0 %	0 %	525721291
1053	NC_021829	CAT	2	6	52956	52961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721291
1054	NC_021829	TTC	2	6	52963	52968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1055	NC_021829	TCT	2	6	52996	53001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1056	NC_021829	TCT	2	6	53026	53031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1057	NC_021829	A	6	6	53034	53039	100 %	0 %	0 %	0 %	525721291
1058	NC_021829	GAC	2	6	53040	53045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721291
1059	NC_021829	ATA	2	6	53103	53108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721291
1060	NC_021829	T	7	7	53177	53183	0 %	100 %	0 %	0 %	525721291
1061	NC_021829	T	7	7	53240	53246	0 %	100 %	0 %	0 %	525721291
1062	NC_021829	CTT	2	6	53247	53252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721291
1063	NC_021829	CGT	2	6	53403	53408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721292
1064	NC_021829	AAT	2	6	53419	53424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721292
1065	NC_021829	AGA	2	6	53437	53442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721292
1066	NC_021829	TAAC	2	8	53457	53464	50 %	25 %	0 %	25 %	525721292
1067	NC_021829	AAT	2	6	53474	53479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721292
1068	NC_021829	CCA	2	6	53508	53513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721292
1069	NC_021829	CATG	2	8	53581	53588	25 %	25 %	25 %	25 %	525721292
1070	NC_021829	TGA	2	6	53589	53594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721292
1071	NC_021829	TAA	2	6	53624	53629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721292
1072	NC_021829	A	6	6	53628	53633	100 %	0 %	0 %	0 %	525721292
1073	NC_021829	CTA	2	6	53644	53649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721292
1074	NC_021829	TTC	2	6	53673	53678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721292
1075	NC_021829	TGTT	2	8	53687	53694	0 %	75 %	25 %	0 %	525721292
1076	NC_021829	T	6	6	53701	53706	0 %	100 %	0 %	0 %	525721292
1077	NC_021829	A	6	6	53792	53797	100 %	0 %	0 %	0 %	525723683
1078	NC_021829	TA	3	6	53835	53840	50 %	50 %	0 %	0 %	525723683
1079	NC_021829	GAC	2	6	53902	53907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1080	NC_021829	GCT	2	6	53922	53927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1081	NC_021829	GATG	2	8	53949	53956	25 %	25 %	50 %	0 %	525721293
1082	NC_021829	ATA	2	6	54024	54029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721293
1083	NC_021829	TCT	2	6	54075	54080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721293
1084	NC_021829	AAAG	2	8	54120	54127	75 %	0 %	25 %	0 %	525721293
1085	NC_021829	CCG	2	6	54141	54146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721293
1086	NC_021829	AGC	2	6	54158	54163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1087	NC_021829	CTT	2	6	54190	54195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721293
1088	NC_021829	ACA	2	6	54237	54242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721293
1089	NC_021829	CAG	2	6	54292	54297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1090	NC_021829	TAGC	2	8	54312	54319	25 %	25 %	25 %	25 %	525721293
1091	NC_021829	TTGT	2	8	54389	54396	0 %	75 %	25 %	0 %	525721293
1092	NC_021829	CTA	2	6	54403	54408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721293
1093	NC_021829	CGA	2	6	54468	54473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1094	NC_021829	TAGTTT	2	12	54505	54516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525721293
1095	NC_021829	CAG	2	6	54562	54567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1096	NC_021829	ACC	2	6	54668	54673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721293
1097	NC_021829	TAGT	2	8	54682	54689	25 %	50 %	25 %	0 %	525721293
1098	NC_021829	AT	3	6	54732	54737	50 %	50 %	0 %	0 %	525721293
1099	NC_021829	CCG	2	6	54738	54743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721293
1100	NC_021829	T	6	6	54758	54763	0 %	100 %	0 %	0 %	525721293
1101	NC_021829	AGTGCA	2	12	54777	54788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525721293
1102	NC_021829	GTT	2	6	54866	54871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721293
1103	NC_021829	ATC	2	6	54920	54925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721293
1104	NC_021829	GAA	2	6	54929	54934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721293
1105	NC_021829	AAG	2	6	54971	54976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721293
1106	NC_021829	CGC	2	6	55009	55014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721293
1107	NC_021829	CTG	2	6	55057	55062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721293
1108	NC_021829	CTT	2	6	55090	55095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721293
1109	NC_021829	GGAA	2	8	55127	55134	50 %	0 %	50 %	0 %	525721293
1110	NC_021829	CA	3	6	55152	55157	50 %	0 %	0 %	50 %	525721293
1111	NC_021829	CCG	2	6	55158	55163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721293
1112	NC_021829	AAT	2	6	55178	55183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721293
1113	NC_021829	TCTT	2	8	55262	55269	0 %	75 %	0 %	25 %	525721293
1114	NC_021829	CTA	2	6	55282	55287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721293
1115	NC_021829	TAA	2	6	55311	55316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721294
1116	NC_021829	TAA	2	6	55329	55334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721294
1117	NC_021829	GGT	2	6	55385	55390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721294
1118	NC_021829	TGC	2	6	55419	55424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721294
1119	NC_021829	TAAT	2	8	55495	55502	50 %	50 %	0 %	0 %	525721294
1120	NC_021829	CCG	2	6	55522	55527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721294
1121	NC_021829	CAG	2	6	55574	55579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721294
1122	NC_021829	TCA	2	6	55621	55626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721294
1123	NC_021829	T	6	6	55644	55649	0 %	100 %	0 %	0 %	525721294
1124	NC_021829	CTG	2	6	55694	55699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721294
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1126	NC_021829	CAT	2	6	55745	55750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721294
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1251	NC_021829	TTTC	2	8	63178	63185	0 %	75 %	0 %	25 %	525721301
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