MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021829	ATAA	2	8	309873	309880	75 %	25 %	0 %	0 %	525723703
6003	NC_021829	GAA	2	6	309966	309971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723703
6004	NC_021829	ATCA	2	8	309984	309991	50 %	25 %	0 %	25 %	525723703
6005	NC_021829	TTGT	2	8	310089	310096	0 %	75 %	25 %	0 %	525723704
6006	NC_021829	T	7	7	310123	310129	0 %	100 %	0 %	0 %	525723704
6007	NC_021829	T	6	6	310160	310165	0 %	100 %	0 %	0 %	525723704
6008	NC_021829	TA	4	8	310168	310175	50 %	50 %	0 %	0 %	525723704
6009	NC_021829	T	6	6	310178	310183	0 %	100 %	0 %	0 %	525723704
6010	NC_021829	ACT	2	6	310208	310213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723704
6011	NC_021829	A	6	6	310259	310264	100 %	0 %	0 %	0 %	525723704
6012	NC_021829	TCAA	2	8	310290	310297	50 %	25 %	0 %	25 %	525723704
6013	NC_021829	CTT	2	6	310338	310343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723704
6014	NC_021829	TTC	2	6	310344	310349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723704
6015	NC_021829	CAAT	2	8	310359	310366	50 %	25 %	0 %	25 %	525723704
6016	NC_021829	AGAA	2	8	310439	310446	75 %	0 %	25 %	0 %	525723704
6017	NC_021829	A	7	7	310483	310489	100 %	0 %	0 %	0 %	525723704
6018	NC_021829	A	6	6	310550	310555	100 %	0 %	0 %	0 %	525721520
6019	NC_021829	TCA	2	6	310556	310561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721520
6020	NC_021829	TC	3	6	310613	310618	0 %	50 %	0 %	50 %	525721520
6021	NC_021829	AAT	2	6	310648	310653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721520
6022	NC_021829	T	6	6	310693	310698	0 %	100 %	0 %	0 %	525721520
6023	NC_021829	TAAT	2	8	310773	310780	50 %	50 %	0 %	0 %	525721520
6024	NC_021829	GTT	2	6	310812	310817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721520
6025	NC_021829	AAT	2	6	310831	310836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721520
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6028	NC_021829	T	6	6	310933	310938	0 %	100 %	0 %	0 %	525721520
6029	NC_021829	ATT	2	6	310955	310960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721520
6030	NC_021829	CAT	2	6	311026	311031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721520
6031	NC_021829	CAA	2	6	311067	311072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721520
6032	NC_021829	T	6	6	311091	311096	0 %	100 %	0 %	0 %	525721520
6033	NC_021829	GAT	2	6	311119	311124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721520
6034	NC_021829	TAT	2	6	311172	311177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721520
6035	NC_021829	CTT	2	6	311334	311339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721520
6036	NC_021829	AAAT	2	8	311361	311368	75 %	25 %	0 %	0 %	525721520
6037	NC_021829	AGCG	2	8	311420	311427	25 %	0 %	50 %	25 %	525721520
6038	NC_021829	T	7	7	311550	311556	0 %	100 %	0 %	0 %	525721520
6039	NC_021829	TAC	2	6	311670	311675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721520
6040	NC_021829	ACT	2	6	311693	311698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721520
6041	NC_021829	TG	3	6	311717	311722	0 %	50 %	50 %	0 %	525721520
6042	NC_021829	CAA	2	6	311853	311858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721520
6043	NC_021829	TCT	2	6	311885	311890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721520
6044	NC_021829	ATA	2	6	311903	311908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721520
6045	NC_021829	ACC	2	6	312022	312027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721520
6046	NC_021829	A	6	6	312040	312045	100 %	0 %	0 %	0 %	525721520
6047	NC_021829	CGT	2	6	312126	312131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721520
6048	NC_021829	AACT	2	8	312198	312205	50 %	25 %	0 %	25 %	525721520
6049	NC_021829	GCT	2	6	312233	312238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721520
6050	NC_021829	GCT	3	9	312248	312256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721520
6051	NC_021829	TCG	2	6	312264	312269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721520
6052	NC_021829	ATC	2	6	312272	312277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721520
6053	NC_021829	GCT	2	6	312365	312370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721520
6054	NC_021829	GTCT	2	8	312377	312384	0 %	50 %	25 %	25 %	525721520
6055	NC_021829	ATT	2	6	312719	312724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721521
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6057	NC_021829	T	6	6	312735	312740	0 %	100 %	0 %	0 %	525721521
6058	NC_021829	T	6	6	312773	312778	0 %	100 %	0 %	0 %	525721521
6059	NC_021829	GCG	2	6	312802	312807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525721521
6060	NC_021829	CTT	2	6	312839	312844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721521
6061	NC_021829	TAA	2	6	312856	312861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721521
6062	NC_021829	TTTTC	2	10	313160	313169	0 %	80 %	0 %	20 %	525721521
6063	NC_021829	TTC	2	6	313251	313256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721521
6064	NC_021829	CTT	2	6	313283	313288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721521
6065	NC_021829	GAA	2	6	313304	313309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721521
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6067	NC_021829	GTT	2	6	313349	313354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721521
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6071	NC_021829	TCT	2	6	313724	313729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721522
6072	NC_021829	ATA	2	6	313783	313788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721522
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6077	NC_021829	ATT	2	6	314115	314120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721523
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6079	NC_021829	GAT	2	6	314202	314207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721523
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6081	NC_021829	A	6	6	314276	314281	100 %	0 %	0 %	0 %	525721523
6082	NC_021829	CTT	2	6	314299	314304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721523
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6084	NC_021829	GAT	2	6	314337	314342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721523
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6087	NC_021829	GAC	2	6	314381	314386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721523
6088	NC_021829	TG	3	6	314475	314480	0 %	50 %	50 %	0 %	525721523
6089	NC_021829	GTGA	2	8	314535	314542	25 %	25 %	50 %	0 %	525721523
6090	NC_021829	ATT	2	6	314566	314571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721523
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6093	NC_021829	TACA	2	8	314741	314748	50 %	25 %	0 %	25 %	525721523
6094	NC_021829	AAG	2	6	314758	314763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721523
6095	NC_021829	GAA	2	6	315138	315143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721524
6096	NC_021829	TCG	2	6	315162	315167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721524
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6098	NC_021829	CGGGA	2	10	315216	315225	20 %	0 %	60 %	20 %	525721524
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6101	NC_021829	TA	3	6	315286	315291	50 %	50 %	0 %	0 %	525721524
6102	NC_021829	TTG	2	6	315389	315394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721524
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6104	NC_021829	ATT	2	6	315425	315430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721524
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6107	NC_021829	TTA	2	6	315623	315628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721524
6108	NC_021829	TCG	2	6	315638	315643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721524
6109	NC_021829	GGC	2	6	315670	315675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525721524
6110	NC_021829	CTG	2	6	315701	315706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721524
6111	NC_021829	T	6	6	315730	315735	0 %	100 %	0 %	0 %	525721524
6112	NC_021829	CTT	2	6	315750	315755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721524
6113	NC_021829	TTTC	2	8	315767	315774	0 %	75 %	0 %	25 %	525721524
6114	NC_021829	TGGT	2	8	315788	315795	0 %	50 %	50 %	0 %	525721524
6115	NC_021829	ATT	2	6	315895	315900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721524
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6118	NC_021829	CTG	2	6	316049	316054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721524
6119	NC_021829	A	6	6	316108	316113	100 %	0 %	0 %	0 %	525721524
6120	NC_021829	GTAAA	2	10	316130	316139	60 %	20 %	20 %	0 %	525721524
6121	NC_021829	CGT	2	6	316141	316146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721524
6122	NC_021829	ACG	2	6	316174	316179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721524
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6124	NC_021829	CATT	2	8	316196	316203	25 %	50 %	0 %	25 %	525721524
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6372	NC_021829	TCC	2	6	329888	329893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721535
6373	NC_021829	CAAG	2	8	329928	329935	50 %	0 %	25 %	25 %	525721535
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6384	NC_021829	T	6	6	330413	330418	0 %	100 %	0 %	0 %	525721535
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6394	NC_021829	TCG	2	6	331069	331074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721536
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6405	NC_021829	ATC	2	6	331484	331489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721536
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6478	NC_021829	GC	3	6	335066	335071	0 %	0 %	50 %	50 %	525721538
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6488	NC_021829	TCGCA	2	10	335642	335651	20 %	20 %	20 %	40 %	525721538
6489	NC_021829	GAA	2	6	335664	335669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721538
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6491	NC_021829	GAA	2	6	335702	335707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721538
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6493	NC_021829	AATC	2	8	335783	335790	50 %	25 %	0 %	25 %	525721538
6494	NC_021829	ATG	2	6	335833	335838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721538
6495	NC_021829	AACA	2	8	335896	335903	75 %	0 %	0 %	25 %	525721538
6496	NC_021829	AAG	2	6	335908	335913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721538
6497	NC_021829	CA	3	6	336316	336321	50 %	0 %	0 %	50 %	525721539
6498	NC_021829	TTG	2	6	336341	336346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721539
6499	NC_021829	TTA	2	6	336390	336395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721539
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