MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021829	TAA	2	6	284900	284905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721501
5502	NC_021829	GCA	2	6	284914	284919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5503	NC_021829	AGC	2	6	285063	285068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5504	NC_021829	T	7	7	285137	285143	0 %	100 %	0 %	0 %	525721501
5505	NC_021829	TGGA	2	8	285159	285166	25 %	25 %	50 %	0 %	525721501
5506	NC_021829	CCT	2	6	285178	285183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721501
5507	NC_021829	CCAA	2	8	285217	285224	50 %	0 %	0 %	50 %	525721501
5508	NC_021829	CG	3	6	285309	285314	0 %	0 %	50 %	50 %	525721501
5509	NC_021829	CATT	2	8	285353	285360	25 %	50 %	0 %	25 %	525721501
5510	NC_021829	TAT	2	6	285368	285373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721501
5511	NC_021829	TGC	2	6	285378	285383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5512	NC_021829	GCA	2	6	285415	285420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5513	NC_021829	CAC	2	6	285443	285448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721501
5514	NC_021829	CTA	2	6	285512	285517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721501
5515	NC_021829	CTT	2	6	285617	285622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721501
5516	NC_021829	CAC	2	6	285701	285706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721501
5517	NC_021829	GATG	2	8	285724	285731	25 %	25 %	50 %	0 %	525721501
5518	NC_021829	GTT	2	6	285755	285760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721501
5519	NC_021829	TTCG	2	8	285762	285769	0 %	50 %	25 %	25 %	525721501
5520	NC_021829	ATG	2	6	285772	285777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721501
5521	NC_021829	TGC	2	6	285786	285791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5522	NC_021829	CAGAAA	2	12	285800	285811	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525721501
5523	NC_021829	TTG	2	6	285842	285847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721501
5524	NC_021829	GCC	2	6	285901	285906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721501
5525	NC_021829	ACA	2	6	285907	285912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721501
5526	NC_021829	AAAG	2	8	286036	286043	75 %	0 %	25 %	0 %	525721501
5527	NC_021829	CTT	2	6	286073	286078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721501
5528	NC_021829	CGT	2	6	286111	286116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721501
5529	NC_021829	TCT	2	6	286117	286122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721501
5530	NC_021829	T	7	7	286127	286133	0 %	100 %	0 %	0 %	525721501
5531	NC_021829	ACT	2	6	286283	286288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721502
5532	NC_021829	ACG	2	6	286364	286369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721502
5533	NC_021829	TGT	2	6	286450	286455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721502
5534	NC_021829	TAA	2	6	286460	286465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721502
5535	NC_021829	CAAAAA	2	12	286526	286537	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525721502
5536	NC_021829	CTT	2	6	286596	286601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721502
5537	NC_021829	TAAA	2	8	286690	286697	75 %	25 %	0 %	0 %	525721502
5538	NC_021829	GCC	2	6	286754	286759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721502
5539	NC_021829	GAA	2	6	286821	286826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721502
5540	NC_021829	CAT	2	6	286897	286902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721502
5541	NC_021829	ATT	2	6	286972	286977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721502
5542	NC_021829	CGT	2	6	287008	287013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721502
5543	NC_021829	ATTGC	2	10	287058	287067	20 %	40 %	20 %	20 %	525721502
5544	NC_021829	TTTA	2	8	287286	287293	25 %	75 %	0 %	0 %	525721503
5545	NC_021829	CTT	3	9	287312	287320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721503
5546	NC_021829	ATA	2	6	287356	287361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721503
5547	NC_021829	CTA	2	6	287516	287521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721503
5548	NC_021829	TGT	2	6	287525	287530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721503
5549	NC_021829	TA	3	6	287684	287689	50 %	50 %	0 %	0 %	525721503
5550	NC_021829	GC	3	6	287701	287706	0 %	0 %	50 %	50 %	525721503
5551	NC_021829	TCA	2	6	287788	287793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721503
5552	NC_021829	GTT	2	6	287842	287847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721503
5553	NC_021829	TCT	2	6	287857	287862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721503
5554	NC_021829	CT	3	6	287861	287866	0 %	50 %	0 %	50 %	525721503
5555	NC_021829	CTT	2	6	287900	287905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721503
5556	NC_021829	AGC	3	9	287916	287924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721503
5557	NC_021829	CAA	2	6	288192	288197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721504
5558	NC_021829	AAG	2	6	288205	288210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721504
5559	NC_021829	AC	3	6	288218	288223	50 %	0 %	0 %	50 %	525721504
5560	NC_021829	TAT	2	6	288249	288254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721504
5561	NC_021829	ATA	2	6	288295	288300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721504
5562	NC_021829	ATG	2	6	288316	288321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721504
5563	NC_021829	TTG	2	6	288391	288396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721504
5564	NC_021829	AACT	2	8	288397	288404	50 %	25 %	0 %	25 %	525721504
5565	NC_021829	CAA	2	6	288456	288461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721504
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5568	NC_021829	A	6	6	288513	288518	100 %	0 %	0 %	0 %	525721504
5569	NC_021829	TAAA	2	8	288550	288557	75 %	25 %	0 %	0 %	525721504
5570	NC_021829	T	6	6	288590	288595	0 %	100 %	0 %	0 %	525721505
5571	NC_021829	GTT	2	6	288599	288604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721505
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5573	NC_021829	TAA	2	6	288626	288631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721505
5574	NC_021829	ATAA	2	8	288633	288640	75 %	25 %	0 %	0 %	525721505
5575	NC_021829	CAA	2	6	288674	288679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721505
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5577	NC_021829	T	6	6	288729	288734	0 %	100 %	0 %	0 %	525721505
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5579	NC_021829	AAAT	2	8	288818	288825	75 %	25 %	0 %	0 %	525721505
5580	NC_021829	CTT	2	6	288875	288880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721505
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5582	NC_021829	T	6	6	288923	288928	0 %	100 %	0 %	0 %	525721505
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5589	NC_021829	T	7	7	289247	289253	0 %	100 %	0 %	0 %	525721505
5590	NC_021829	TTGG	2	8	289256	289263	0 %	50 %	50 %	0 %	525721505
5591	NC_021829	CTA	2	6	289389	289394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721506
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5594	NC_021829	AAG	2	6	289435	289440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721506
5595	NC_021829	TTC	2	6	289537	289542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721506
5596	NC_021829	CTATAA	2	12	289667	289678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525721506
5597	NC_021829	TCT	2	6	289685	289690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721506
5598	NC_021829	CTT	2	6	289725	289730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721506
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5602	NC_021829	TTC	2	6	290012	290017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721507
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5605	NC_021829	TG	3	6	290083	290088	0 %	50 %	50 %	0 %	525721507
5606	NC_021829	TAA	2	6	290162	290167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721507
5607	NC_021829	CAT	2	6	290206	290211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721507
5608	NC_021829	TGT	3	9	290220	290228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721507
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5610	NC_021829	CTC	2	6	290348	290353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721507
5611	NC_021829	CTA	2	6	290362	290367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721507
5612	NC_021829	TAG	2	6	290396	290401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721507
5613	NC_021829	TAT	2	6	290416	290421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721507
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5617	NC_021829	T	7	7	290574	290580	0 %	100 %	0 %	0 %	525721507
5618	NC_021829	T	7	7	290605	290611	0 %	100 %	0 %	0 %	525721507
5619	NC_021829	CAA	2	6	290641	290646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721507
5620	NC_021829	GTG	2	6	290647	290652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721507
5621	NC_021829	TAA	2	6	290753	290758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721507
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5623	NC_021829	AGA	2	6	290913	290918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721508
5624	NC_021829	GTG	2	6	290931	290936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721508
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5995	NC_021829	A	6	6	309549	309554	100 %	0 %	0 %	0 %	525723703
5996	NC_021829	TCAATA	2	12	309571	309582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525723703
5997	NC_021829	CTT	2	6	309594	309599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723703
5998	NC_021829	TTA	2	6	309622	309627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723703
5999	NC_021829	TAA	2	6	309634	309639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723703
6000	NC_021829	GAA	2	6	309750	309755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723703

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