MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021829	TGT	2	6	231371	231376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721465
4502	NC_021829	CCG	2	6	231409	231414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721465
4503	NC_021829	GCC	2	6	231420	231425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721465
4504	NC_021829	GCC	2	6	231432	231437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721465
4505	NC_021829	GCCACC	2	12	231459	231470	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525721465
4506	NC_021829	TGC	3	9	231546	231554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721465
4507	NC_021829	AAG	2	6	231579	231584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721465
4508	NC_021829	TCT	2	6	231619	231624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4509	NC_021829	CTT	2	6	231632	231637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4510	NC_021829	T	6	6	231641	231646	0 %	100 %	0 %	0 %	525721465
4511	NC_021829	T	6	6	231714	231719	0 %	100 %	0 %	0 %	525721465
4512	NC_021829	TTC	2	6	231726	231731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4513	NC_021829	CTT	2	6	231785	231790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4514	NC_021829	TA	3	6	231857	231862	50 %	50 %	0 %	0 %	525721465
4515	NC_021829	GCT	2	6	231895	231900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721465
4516	NC_021829	CTT	2	6	231932	231937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4517	NC_021829	GTA	2	6	231947	231952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721465
4518	NC_021829	TTGC	2	8	231965	231972	0 %	50 %	25 %	25 %	525721465
4519	NC_021829	GC	3	6	232019	232024	0 %	0 %	50 %	50 %	525721465
4520	NC_021829	ACG	2	6	232041	232046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721465
4521	NC_021829	TAA	2	6	232092	232097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721465
4522	NC_021829	ATA	2	6	232103	232108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721465
4523	NC_021829	TTTTTC	2	12	232116	232127	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525721465
4524	NC_021829	GAA	2	6	232140	232145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721465
4525	NC_021829	TTTC	2	8	232169	232176	0 %	75 %	0 %	25 %	525721465
4526	NC_021829	TTG	2	6	232244	232249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721465
4527	NC_021829	CTG	2	6	232274	232279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721465
4528	NC_021829	CTT	2	6	232283	232288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4529	NC_021829	ATC	2	6	232305	232310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721465
4530	NC_021829	ACC	2	6	232476	232481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525721465
4531	NC_021829	AAT	2	6	232569	232574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721465
4532	NC_021829	GTT	2	6	232587	232592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721465
4533	NC_021829	CTT	2	6	232724	232729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721465
4534	NC_021829	T	6	6	232760	232765	0 %	100 %	0 %	0 %	525721465
4535	NC_021829	TTA	2	6	233255	233260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721466
4536	NC_021829	T	6	6	233282	233287	0 %	100 %	0 %	0 %	525721466
4537	NC_021829	TCT	2	6	233316	233321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721466
4538	NC_021829	GTTCC	2	10	233359	233368	0 %	40 %	20 %	40 %	525721466
4539	NC_021829	TCT	2	6	233490	233495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721466
4540	NC_021829	GTT	2	6	233562	233567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721466
4541	NC_021829	ATC	2	6	233576	233581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721466
4542	NC_021829	GAA	2	6	233647	233652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721466
4543	NC_021829	GTT	2	6	233655	233660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721466
4544	NC_021829	CTT	2	6	233662	233667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721466
4545	NC_021829	T	6	6	233666	233671	0 %	100 %	0 %	0 %	525721466
4546	NC_021829	CTG	2	6	233689	233694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721466
4547	NC_021829	TGC	2	6	233702	233707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721466
4548	NC_021829	T	7	7	233781	233787	0 %	100 %	0 %	0 %	525721466
4549	NC_021829	T	6	6	233809	233814	0 %	100 %	0 %	0 %	525721466
4550	NC_021829	TTC	2	6	233875	233880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721466
4551	NC_021829	ATC	2	6	233910	233915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721466
4552	NC_021829	GCTT	2	8	234006	234013	0 %	50 %	25 %	25 %	525721466
4553	NC_021829	ATA	2	6	234063	234068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721466
4554	NC_021829	TTTC	2	8	234079	234086	0 %	75 %	0 %	25 %	525721466
4555	NC_021829	TCT	3	9	234117	234125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721466
4556	NC_021829	GT	3	6	234253	234258	0 %	50 %	50 %	0 %	525721466
4557	NC_021829	AGCA	2	8	234287	234294	50 %	0 %	25 %	25 %	525721466
4558	NC_021829	CTG	2	6	234313	234318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721466
4559	NC_021829	TGGTA	2	10	234392	234401	20 %	40 %	40 %	0 %	525721466
4560	NC_021829	TAGA	2	8	234498	234505	50 %	25 %	25 %	0 %	525721466
4561	NC_021829	ATAA	2	8	234598	234605	75 %	25 %	0 %	0 %	525721466
4562	NC_021829	GCC	2	6	234621	234626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721466
4563	NC_021829	ATG	2	6	234662	234667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721466
4564	NC_021829	CTC	2	6	234703	234708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721466
4565	NC_021829	ACA	2	6	234717	234722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721466
4566	NC_021829	TGT	2	6	234915	234920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525721466
4567	NC_021829	CTT	2	6	235032	235037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721467
4568	NC_021829	ACA	2	6	235058	235063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721467
4569	NC_021829	AAG	2	6	235156	235161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721467
4570	NC_021829	CGC	2	6	235162	235167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721467
4571	NC_021829	AACC	2	8	235214	235221	50 %	0 %	0 %	50 %	525721467
4572	NC_021829	TTC	2	6	235222	235227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721467
4573	NC_021829	CA	3	6	235240	235245	50 %	0 %	0 %	50 %	525721467
4574	NC_021829	CCG	2	6	235247	235252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721467
4575	NC_021829	GAT	2	6	235302	235307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721467
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4577	NC_021829	ATA	2	6	235390	235395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721467
4578	NC_021829	T	6	6	235407	235412	0 %	100 %	0 %	0 %	525721467
4579	NC_021829	TGA	2	6	235640	235645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721467
4580	NC_021829	TAC	2	6	235653	235658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721467
4581	NC_021829	AT	3	6	235670	235675	50 %	50 %	0 %	0 %	525721467
4582	NC_021829	TCA	2	6	235754	235759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721467
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4584	NC_021829	TAATTC	2	12	235777	235788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525721467
4585	NC_021829	ACT	2	6	235820	235825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721467
4586	NC_021829	ACTG	2	8	235837	235844	25 %	25 %	25 %	25 %	525721467
4587	NC_021829	GAA	2	6	235860	235865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721467
4588	NC_021829	TAAT	2	8	235959	235966	50 %	50 %	0 %	0 %	525721467
4589	NC_021829	TTC	2	6	235972	235977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721467
4590	NC_021829	ACA	2	6	236129	236134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721468
4591	NC_021829	ATT	2	6	236189	236194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721468
4592	NC_021829	T	6	6	236193	236198	0 %	100 %	0 %	0 %	525721468
4593	NC_021829	TTCA	2	8	236221	236228	25 %	50 %	0 %	25 %	525721468
4594	NC_021829	TAA	2	6	236246	236251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721468
4595	NC_021829	TCA	2	6	236267	236272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721468
4596	NC_021829	TC	3	6	236302	236307	0 %	50 %	0 %	50 %	525721468
4597	NC_021829	TCT	2	6	236309	236314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721468
4598	NC_021829	GTG	2	6	236373	236378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525721468
4599	NC_021829	TTTC	2	8	236613	236620	0 %	75 %	0 %	25 %	525721468
4600	NC_021829	AAT	2	6	236641	236646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721468
4601	NC_021829	T	6	6	236733	236738	0 %	100 %	0 %	0 %	525721468
4602	NC_021829	A	6	6	236740	236745	100 %	0 %	0 %	0 %	525721468
4603	NC_021829	AT	3	6	236792	236797	50 %	50 %	0 %	0 %	525721468
4604	NC_021829	GCA	2	6	236882	236887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525721468
4605	NC_021829	CAA	2	6	236908	236913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721468
4606	NC_021829	ATTC	2	8	236926	236933	25 %	50 %	0 %	25 %	525721468
4607	NC_021829	TCC	2	6	236937	236942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525721469
4608	NC_021829	GC	3	6	236965	236970	0 %	0 %	50 %	50 %	525721469
4609	NC_021829	TCCA	2	8	237107	237114	25 %	25 %	0 %	50 %	525721469
4610	NC_021829	A	6	6	237120	237125	100 %	0 %	0 %	0 %	525721469
4611	NC_021829	TCGT	2	8	237193	237200	0 %	50 %	25 %	25 %	525721469
4612	NC_021829	CTT	2	6	237202	237207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721469
4613	NC_021829	ATC	2	6	237273	237278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721469
4614	NC_021829	T	6	6	237301	237306	0 %	100 %	0 %	0 %	525721469
4615	NC_021829	GAA	2	6	237402	237407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721469
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4617	NC_021829	TA	3	6	237444	237449	50 %	50 %	0 %	0 %	525721469
4618	NC_021829	AAAATT	2	12	237650	237661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721469
4619	NC_021829	T	7	7	237679	237685	0 %	100 %	0 %	0 %	525721469
4620	NC_021829	CTA	2	6	237733	237738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721469
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4623	NC_021829	A	6	6	238055	238060	100 %	0 %	0 %	0 %	525721469
4624	NC_021829	ATT	2	6	238070	238075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525721469
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4655	NC_021829	TAAA	2	8	239546	239553	75 %	25 %	0 %	0 %	525721471
4656	NC_021829	CCAT	2	8	239608	239615	25 %	25 %	0 %	50 %	525721471
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4991	NC_021829	ACA	2	6	254721	254726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721485
4992	NC_021829	CTT	2	6	254749	254754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721485
4993	NC_021829	CTT	2	6	254770	254775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721485
4994	NC_021829	CTT	2	6	254839	254844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721485
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4996	NC_021829	GCC	2	6	255038	255043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525721485
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4999	NC_021829	TCA	2	6	255201	255206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525721485
5000	NC_021829	ATAA	2	8	255211	255218	75 %	25 %	0 %	0 %	525721485

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