MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021828	A	7	7	1441	1447	100 %	0 %	0 %	0 %	525901168
2	NC_021828	A	7	7	1925	1931	100 %	0 %	0 %	0 %	525901169
3	NC_021828	A	6	6	2218	2223	100 %	0 %	0 %	0 %	525901169
4	NC_021828	T	6	6	2279	2284	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
5	NC_021828	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
6	NC_021828	T	6	6	2492	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	525901170
7	NC_021828	C	6	6	2627	2632	0 %	0 %	0 %	100 %	525901170
8	NC_021828	T	6	6	2925	2930	0 %	100 %	0 %	0 %	525901171
9	NC_021828	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	525901172
10	NC_021828	T	7	7	4318	4324	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
11	NC_021828	T	6	6	4526	4531	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
12	NC_021828	T	6	6	4986	4991	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
13	NC_021828	T	6	6	5116	5121	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
14	NC_021828	T	6	6	5172	5177	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
15	NC_021828	T	6	6	5203	5208	0 %	100 %	0 %	0 %	525901173
16	NC_021828	T	6	6	5438	5443	0 %	100 %	0 %	0 %	525901174
17	NC_021828	T	6	6	5614	5619	0 %	100 %	0 %	0 %	525901174
18	NC_021828	T	6	6	5916	5921	0 %	100 %	0 %	0 %	525901175
19	NC_021828	T	7	7	6017	6023	0 %	100 %	0 %	0 %	525901175
20	NC_021828	T	8	8	6707	6714	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
21	NC_021828	T	6	6	6791	6796	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
22	NC_021828	T	6	6	6833	6838	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
23	NC_021828	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
24	NC_021828	T	6	6	6961	6966	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
25	NC_021828	T	7	7	7348	7354	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
26	NC_021828	T	6	6	7378	7383	0 %	100 %	0 %	0 %	525901176
27	NC_021828	A	6	6	7499	7504	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
28	NC_021828	A	6	6	7555	7560	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
29	NC_021828	A	6	6	7753	7758	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
30	NC_021828	A	7	7	7766	7772	100 %	0 %	0 %	0 %	525901177
31	NC_021828	T	7	7	7779	7785	0 %	100 %	0 %	0 %	525901177
32	NC_021828	T	7	7	7867	7873	0 %	100 %	0 %	0 %	525901178
33	NC_021828	A	6	6	7920	7925	100 %	0 %	0 %	0 %	525901178
34	NC_021828	A	6	6	8598	8603	100 %	0 %	0 %	0 %	525901179
35	NC_021828	A	6	6	9733	9738	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
36	NC_021828	A	7	7	9746	9752	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
37	NC_021828	A	6	6	9825	9830	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
38	NC_021828	A	7	7	10044	10050	100 %	0 %	0 %	0 %	525901180
39	NC_021828	A	7	7	10558	10564	100 %	0 %	0 %	0 %	525901155
40	NC_021828	A	6	6	11093	11098	100 %	0 %	0 %	0 %	525901181
41	NC_021828	T	6	6	11777	11782	0 %	100 %	0 %	0 %	525901181
42	NC_021828	T	8	8	11788	11795	0 %	100 %	0 %	0 %	525901181
43	NC_021828	T	8	8	12288	12295	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
44	NC_021828	T	6	6	12414	12419	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
45	NC_021828	T	6	6	12570	12575	0 %	100 %	0 %	0 %	525901183
46	NC_021828	T	6	6	14023	14028	0 %	100 %	0 %	0 %	525901184
47	NC_021828	T	11	11	14059	14069	0 %	100 %	0 %	0 %	525901184
48	NC_021828	A	6	6	14482	14487	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
49	NC_021828	A	6	6	14608	14613	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
50	NC_021828	T	6	6	14802	14807	0 %	100 %	0 %	0 %	525901185
51	NC_021828	A	7	7	15097	15103	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
52	NC_021828	A	6	6	15116	15121	100 %	0 %	0 %	0 %	525901185
53	NC_021828	T	6	6	15344	15349	0 %	100 %	0 %	0 %	525901185
54	NC_021828	A	8	8	15495	15502	100 %	0 %	0 %	0 %	525901186
55	NC_021828	T	7	7	16052	16058	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
56	NC_021828	T	6	6	16331	16336	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
57	NC_021828	T	6	6	16607	16612	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
58	NC_021828	T	6	6	16639	16644	0 %	100 %	0 %	0 %	525901156
59	NC_021828	A	6	6	16907	16912	100 %	0 %	0 %	0 %	525901156
60	NC_021828	A	6	6	16957	16962	100 %	0 %	0 %	0 %	525901156
61	NC_021828	T	6	6	17591	17596	0 %	100 %	0 %	0 %	525901188
62	NC_021828	T	6	6	18106	18111	0 %	100 %	0 %	0 %	525901188
63	NC_021828	T	6	6	18520	18525	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
64	NC_021828	T	6	6	18528	18533	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
65	NC_021828	T	7	7	19103	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
66	NC_021828	T	6	6	19384	19389	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
67	NC_021828	T	7	7	19425	19431	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
68	NC_021828	T	6	6	19587	19592	0 %	100 %	0 %	0 %	525901189
69	NC_021828	T	6	6	20294	20299	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
70	NC_021828	T	6	6	20308	20313	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
71	NC_021828	T	6	6	21067	21072	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
72	NC_021828	T	6	6	21094	21099	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
73	NC_021828	T	6	6	21185	21190	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
74	NC_021828	T	6	6	21977	21982	0 %	100 %	0 %	0 %	525901157
75	NC_021828	A	6	6	22173	22178	100 %	0 %	0 %	0 %	525901157
76	NC_021828	A	7	7	22693	22699	100 %	0 %	0 %	0 %	525901158
77	NC_021828	T	7	7	23478	23484	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
78	NC_021828	T	6	6	23583	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
79	NC_021828	A	6	6	23768	23773	100 %	0 %	0 %	0 %	525901159
80	NC_021828	T	8	8	23935	23942	0 %	100 %	0 %	0 %	525901159
81	NC_021828	T	6	6	25284	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
82	NC_021828	T	6	6	25315	25320	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
83	NC_021828	A	7	7	26488	26494	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
84	NC_021828	A	6	6	26665	26670	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
85	NC_021828	T	7	7	26687	26693	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
86	NC_021828	A	7	7	27563	27569	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
87	NC_021828	A	7	7	27605	27611	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
88	NC_021828	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
89	NC_021828	T	7	7	28648	28654	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
90	NC_021828	T	6	6	28685	28690	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
91	NC_021828	T	6	6	28771	28776	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
92	NC_021828	T	7	7	28830	28836	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
93	NC_021828	T	6	6	28863	28868	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
94	NC_021828	T	7	7	28885	28891	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
95	NC_021828	T	7	7	29134	29140	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
96	NC_021828	T	7	7	29278	29284	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
97	NC_021828	A	7	7	29418	29424	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
98	NC_021828	T	8	8	29464	29471	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
99	NC_021828	T	7	7	29596	29602	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
100	NC_021828	A	6	6	29666	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
101	NC_021828	T	7	7	29722	29728	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
102	NC_021828	T	6	6	29836	29841	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
103	NC_021828	T	6	6	30212	30217	0 %	100 %	0 %	0 %	525901194
104	NC_021828	T	6	6	30296	30301	0 %	100 %	0 %	0 %	525901194
105	NC_021828	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	525901163
106	NC_021828	T	7	7	32536	32542	0 %	100 %	0 %	0 %	525901197
107	NC_021828	T	7	7	32630	32636	0 %	100 %	0 %	0 %	525901198
108	NC_021828	A	6	6	33049	33054	100 %	0 %	0 %	0 %	525901199
109	NC_021828	A	6	6	33271	33276	100 %	0 %	0 %	0 %	525901199
110	NC_021828	T	6	6	34586	34591	0 %	100 %	0 %	0 %	525901202
111	NC_021828	T	7	7	35470	35476	0 %	100 %	0 %	0 %	525901202
112	NC_021828	T	6	6	35555	35560	0 %	100 %	0 %	0 %	525901202
113	NC_021828	T	6	6	35983	35988	0 %	100 %	0 %	0 %	525901202
114	NC_021828	A	7	7	37285	37291	100 %	0 %	0 %	0 %	525901164
115	NC_021828	G	6	6	37292	37297	0 %	0 %	100 %	0 %	525901164
116	NC_021828	A	7	7	37871	37877	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
117	NC_021828	A	6	6	38126	38131	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
118	NC_021828	A	7	7	38259	38265	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
119	NC_021828	T	6	6	38284	38289	0 %	100 %	0 %	0 %	525901204
120	NC_021828	A	6	6	38707	38712	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
121	NC_021828	A	6	6	38762	38767	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
122	NC_021828	A	6	6	38842	38847	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
123	NC_021828	A	7	7	39052	39058	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
124	NC_021828	A	7	7	39097	39103	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
125	NC_021828	A	6	6	39742	39747	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
126	NC_021828	A	6	6	39931	39936	100 %	0 %	0 %	0 %	525901204
127	NC_021828	T	6	6	40082	40087	0 %	100 %	0 %	0 %	525901204
128	NC_021828	T	7	7	40454	40460	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
129	NC_021828	T	6	6	40493	40498	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
130	NC_021828	T	6	6	40842	40847	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
131	NC_021828	T	6	6	41042	41047	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
132	NC_021828	T	7	7	41172	41178	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
133	NC_021828	T	6	6	41301	41306	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
134	NC_021828	T	6	6	41338	41343	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
135	NC_021828	T	6	6	41362	41367	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
136	NC_021828	T	7	7	41513	41519	0 %	100 %	0 %	0 %	525901205
137	NC_021828	T	7	7	41710	41716	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
138	NC_021828	T	6	6	41724	41729	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
139	NC_021828	A	6	6	41739	41744	100 %	0 %	0 %	0 %	525901206
140	NC_021828	T	6	6	42227	42232	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
141	NC_021828	T	7	7	42890	42896	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
142	NC_021828	T	6	6	43286	43291	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
143	NC_021828	T	6	6	43619	43624	0 %	100 %	0 %	0 %	525901206
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.