MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid

Total Repeats: 1138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021828	TTGA	2	8	26098	26105	25 %	50 %	25 %	0 %	525901192
502	NC_021828	TCA	2	6	26154	26159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901192
503	NC_021828	TTC	2	6	26234	26239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901192
504	NC_021828	TAA	2	6	26272	26277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901192
505	NC_021828	TTTCA	2	10	26315	26324	20 %	60 %	0 %	20 %	525901192
506	NC_021828	TCC	2	6	26425	26430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901192
507	NC_021828	TTA	2	6	26442	26447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901192
508	NC_021828	A	7	7	26488	26494	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
509	NC_021828	TAA	2	6	26527	26532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901192
510	NC_021828	ACAA	2	8	26554	26561	75 %	0 %	0 %	25 %	525901192
511	NC_021828	ATC	2	6	26591	26596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901192
512	NC_021828	A	6	6	26665	26670	100 %	0 %	0 %	0 %	525901192
513	NC_021828	T	7	7	26687	26693	0 %	100 %	0 %	0 %	525901192
514	NC_021828	TAT	2	6	26713	26718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901192
515	NC_021828	CAT	2	6	26734	26739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901192
516	NC_021828	TGC	3	9	26813	26821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901192
517	NC_021828	ATT	2	6	26840	26845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901192
518	NC_021828	AGA	2	6	27401	27406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901160
519	NC_021828	AAAC	2	8	27411	27418	75 %	0 %	0 %	25 %	525901160
520	NC_021828	GCT	2	6	27462	27467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901160
521	NC_021828	CCA	2	6	27487	27492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901160
522	NC_021828	A	7	7	27563	27569	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
523	NC_021828	GAAA	2	8	27575	27582	75 %	0 %	25 %	0 %	525901160
524	NC_021828	GAA	2	6	27588	27593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901160
525	NC_021828	CTC	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901160
526	NC_021828	A	7	7	27605	27611	100 %	0 %	0 %	0 %	525901160
527	NC_021828	CAAGAA	2	12	27659	27670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525901161
528	NC_021828	GCC	2	6	27675	27680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525901161
529	NC_021828	CTA	2	6	27727	27732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901161
530	NC_021828	AAAG	2	8	27759	27766	75 %	0 %	25 %	0 %	525901161
531	NC_021828	GTT	2	6	27778	27783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901161
532	NC_021828	CGA	2	6	27966	27971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525901161
533	NC_021828	TCAA	2	8	28029	28036	50 %	25 %	0 %	25 %	525901161
534	NC_021828	CCA	2	6	28095	28100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901161
535	NC_021828	ATT	2	6	28124	28129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901161
536	NC_021828	GAT	2	6	28181	28186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901161
537	NC_021828	GCT	2	6	28354	28359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901161
538	NC_021828	AAAG	2	8	28360	28367	75 %	0 %	25 %	0 %	525901161
539	NC_021828	GAA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525901161
540	NC_021828	TTAT	2	8	28477	28484	25 %	75 %	0 %	0 %	525901161
541	NC_021828	GCT	2	6	28514	28519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901161
542	NC_021828	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
543	NC_021828	T	7	7	28648	28654	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
544	NC_021828	AAAT	2	8	28667	28674	75 %	25 %	0 %	0 %	525901162
545	NC_021828	TTC	2	6	28675	28680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901162
546	NC_021828	T	6	6	28685	28690	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
547	NC_021828	ACCT	2	8	28722	28729	25 %	25 %	0 %	50 %	525901162
548	NC_021828	T	6	6	28771	28776	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
549	NC_021828	AACA	2	8	28791	28798	75 %	0 %	0 %	25 %	525901162
550	NC_021828	T	7	7	28830	28836	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
551	NC_021828	ATTT	2	8	28852	28859	25 %	75 %	0 %	0 %	525901162
552	NC_021828	T	6	6	28863	28868	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
553	NC_021828	ATG	2	6	28879	28884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901162
554	NC_021828	T	7	7	28885	28891	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
555	NC_021828	CTT	2	6	28959	28964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901162
556	NC_021828	ACT	2	6	28990	28995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901162
557	NC_021828	TGA	2	6	29088	29093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901162
558	NC_021828	TTTC	2	8	29110	29117	0 %	75 %	0 %	25 %	525901162
559	NC_021828	T	7	7	29134	29140	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
560	NC_021828	TTA	2	6	29154	29159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901162
561	NC_021828	TC	3	6	29266	29271	0 %	50 %	0 %	50 %	525901162
562	NC_021828	T	7	7	29278	29284	0 %	100 %	0 %	0 %	525901162
563	NC_021828	GTT	2	6	29362	29367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901193
564	NC_021828	TAA	2	6	29380	29385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901193
565	NC_021828	A	7	7	29418	29424	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
566	NC_021828	TTC	2	6	29437	29442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901193
567	NC_021828	T	8	8	29464	29471	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
568	NC_021828	TTA	2	6	29480	29485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901193
569	NC_021828	TTC	2	6	29520	29525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901193
570	NC_021828	ACC	2	6	29563	29568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901193
571	NC_021828	T	7	7	29596	29602	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
572	NC_021828	TTA	2	6	29637	29642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901193
573	NC_021828	A	6	6	29666	29671	100 %	0 %	0 %	0 %	525901193
574	NC_021828	TTC	2	6	29682	29687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901193
575	NC_021828	T	7	7	29722	29728	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
576	NC_021828	AAT	2	6	29731	29736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901193
577	NC_021828	ATT	2	6	29755	29760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901193
578	NC_021828	T	6	6	29836	29841	0 %	100 %	0 %	0 %	525901193
579	NC_021828	AGT	2	6	29886	29891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901193
580	NC_021828	GGT	2	6	29972	29977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901193
581	NC_021828	TTC	2	6	30148	30153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901194
582	NC_021828	AAT	2	6	30154	30159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901194
583	NC_021828	AT	3	6	30163	30168	50 %	50 %	0 %	0 %	525901194
584	NC_021828	GTA	2	6	30173	30178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901194
585	NC_021828	TCT	2	6	30182	30187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901194
586	NC_021828	CATT	2	8	30198	30205	25 %	50 %	0 %	25 %	525901194
587	NC_021828	T	6	6	30212	30217	0 %	100 %	0 %	0 %	525901194
588	NC_021828	TTC	2	6	30232	30237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901194
589	NC_021828	T	6	6	30296	30301	0 %	100 %	0 %	0 %	525901194
590	NC_021828	CCA	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525901194
591	NC_021828	ATT	2	6	30388	30393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525901194
592	NC_021828	TA	3	6	30511	30516	50 %	50 %	0 %	0 %	525901195
593	NC_021828	TC	3	6	30519	30524	0 %	50 %	0 %	50 %	525901195
594	NC_021828	AGTCAG	2	12	30546	30557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525901195
595	NC_021828	TCT	2	6	30608	30613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901195
596	NC_021828	TAC	2	6	30703	30708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901195
597	NC_021828	GAT	2	6	30889	30894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901196
598	NC_021828	ATGT	2	8	31016	31023	25 %	50 %	25 %	0 %	525901196
599	NC_021828	TC	4	8	31094	31101	0 %	50 %	0 %	50 %	525901196
600	NC_021828	TTG	2	6	31526	31531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901163
601	NC_021828	TTG	2	6	31693	31698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525901163
602	NC_021828	CTTCC	2	10	31731	31740	0 %	40 %	0 %	60 %	525901163
603	NC_021828	CA	3	6	31786	31791	50 %	0 %	0 %	50 %	525901163
604	NC_021828	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	525901163
605	NC_021828	TCTT	2	8	31824	31831	0 %	75 %	0 %	25 %	525901163
606	NC_021828	AAAT	2	8	31850	31857	75 %	25 %	0 %	0 %	525901163
607	NC_021828	TAAT	2	8	31910	31917	50 %	50 %	0 %	0 %	525901197
608	NC_021828	TTTC	2	8	31936	31943	0 %	75 %	0 %	25 %	525901197
609	NC_021828	CAAA	2	8	32094	32101	75 %	0 %	0 %	25 %	525901197
610	NC_021828	GC	3	6	32109	32114	0 %	0 %	50 %	50 %	525901197
611	NC_021828	TTTTCT	2	12	32152	32163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525901197
612	NC_021828	ATTC	2	8	32292	32299	25 %	50 %	0 %	25 %	525901197
613	NC_021828	TA	3	6	32302	32307	50 %	50 %	0 %	0 %	525901197
614	NC_021828	AAT	2	6	32335	32340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901197
615	NC_021828	CTT	2	6	32400	32405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901197
616	NC_021828	GGT	2	6	32424	32429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525901197
617	NC_021828	TCA	2	6	32463	32468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901197
618	NC_021828	TTC	2	6	32500	32505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901197
619	NC_021828	GCT	2	6	32519	32524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525901197
620	NC_021828	AGT	2	6	32531	32536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525901197
621	NC_021828	T	7	7	32536	32542	0 %	100 %	0 %	0 %	525901197
622	NC_021828	TCC	2	6	32578	32583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525901198
623	NC_021828	CAA	2	6	32595	32600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525901198
624	NC_021828	T	7	7	32630	32636	0 %	100 %	0 %	0 %	525901198
625	NC_021828	CAT	2	6	32699	32704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525901198
626	NC_021828	TAA	2	6	32714	32719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525901198
627	NC_021828	CTT	2	6	32741	32746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
628	NC_021828	CTT	2	6	32801	32806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
629	NC_021828	CTT	2	6	32810	32815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
630	NC_021828	CTT	2	6	32831	32836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525901198
631	NC_021828	GTTT	2	8	32839	32846	0 %	75 %	25 %	0 %	525901198
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