MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 1111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	TGGTTC	2	12	2756	2767	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525896799
2	NC_021827	TTTTTC	2	12	3320	3331	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896799
3	NC_021827	TAATTT	2	12	3970	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896800
4	NC_021827	TTCTGC	2	12	7285	7296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525896804
5	NC_021827	GTTTTT	2	12	8829	8840	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525896805
6	NC_021827	CACCGA	2	12	10312	10323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525896806
7	NC_021827	CACTTG	2	12	14233	14244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525896808
8	NC_021827	TTTGTT	2	12	17084	17095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525896811
9	NC_021827	CTTTTT	2	12	20060	20071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896811
10	NC_021827	TTTTTC	2	12	21285	21296	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896813
11	NC_021827	AAAGAA	2	12	23374	23385	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525896815
12	NC_021827	TGCTTT	2	12	28178	28189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525899284
13	NC_021827	TTTCTT	2	12	29738	29749	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896820
14	NC_021827	ACCGGA	2	12	40293	40304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896829
15	NC_021827	GCTGCA	2	12	43631	43642	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525896833
16	NC_021827	TCAATG	2	12	44286	44297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525896834
17	NC_021827	CGCTCC	2	12	45502	45513	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525896836
18	NC_021827	TTTTGT	2	12	46722	46733	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525896837
19	NC_021827	ACTTCA	2	12	52407	52418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
20	NC_021827	ATCTTT	2	12	56652	56663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896842
21	NC_021827	GGATTG	2	12	58663	58674	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525896844
22	NC_021827	ACTTCT	2	12	60579	60590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525896846
23	NC_021827	AGTGCA	2	12	62726	62737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525896847
24	NC_021827	TACTTT	2	12	65594	65605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896849
25	NC_021827	TAATGC	2	12	66576	66587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525896850
26	NC_021827	TAAAAA	2	12	66806	66817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525896850
27	NC_021827	GTAAAA	2	12	67843	67854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525896852
28	NC_021827	TTTTAC	2	12	69887	69898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896856
29	NC_021827	ATCAAC	2	12	70250	70261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525896856
30	NC_021827	GAAAAC	2	12	71866	71877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525896858
31	NC_021827	GTTACG	2	12	72887	72898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525896859
32	NC_021827	TTGGTG	2	12	74824	74835	0 %	50 %	50 %	0 %	525896860
33	NC_021827	CCGCCT	2	12	75783	75794	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525896860
34	NC_021827	GCAATC	2	12	81431	81442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525896864
35	NC_021827	CTGCAA	2	12	81492	81503	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525896864
36	NC_021827	TTATTC	2	12	85744	85755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525899287
37	NC_021827	TTCAGA	2	12	87559	87570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525899290
38	NC_021827	GATAAT	2	12	91459	91470	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525896869
39	NC_021827	TAACGG	2	12	100286	100297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525896876
40	NC_021827	TTACTT	2	12	103793	103804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525899295
41	NC_021827	AAATCA	2	12	107764	107775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525896882
42	NC_021827	TAAAAC	2	12	109780	109791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525896885
43	NC_021827	GTATTA	2	12	115159	115170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525896893
44	NC_021827	GATTTT	2	12	115377	115388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525896893
45	NC_021827	CGCTTG	2	12	115546	115557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896893
46	NC_021827	ATTTTA	2	12	116688	116699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896893
47	NC_021827	AAATAA	2	12	124606	124617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525899299
48	NC_021827	CTGCTA	2	12	128068	128079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525896904
49	NC_021827	CTAATA	2	12	128131	128142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525896904
50	NC_021827	CTGGTT	2	12	132424	132435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525896909
51	NC_021827	ACTAAT	2	12	132701	132712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525896909
52	NC_021827	CCGCTT	2	12	133483	133494	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525896910
53	NC_021827	ATAGTT	2	12	137662	137673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525896914
54	NC_021827	AATCTG	2	12	140438	140449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525896915
55	NC_021827	AATATC	2	12	143955	143966	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525896915
56	NC_021827	AGTGAT	2	12	144014	144025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896915
57	NC_021827	TATTTT	2	12	162958	162969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525899321
58	NC_021827	ATTTTT	2	12	165552	165563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525896921
59	NC_021827	AGCAAA	2	12	171989	172000	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525896924
60	NC_021827	AAATCA	2	12	172595	172606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525896925
61	NC_021827	ACCTTT	2	12	179315	179326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525896929
62	NC_021827	TTCTGC	2	12	179404	179415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525896930
63	NC_021827	ATTTTT	2	12	183329	183340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525896932
64	NC_021827	ATTTTG	2	12	185775	185786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525896937
65	NC_021827	CCGCCA	2	12	185896	185907	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525896937
66	NC_021827	ATTTCA	2	12	189029	189040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525899329
67	NC_021827	ATCTTT	2	12	189866	189877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525899330
68	NC_021827	ACATAA	2	12	193518	193529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525899333
69	NC_021827	TGGTGA	2	12	203440	203451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525896946
70	NC_021827	TTTTGG	2	12	205201	205212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899336
71	NC_021827	TTTCAA	2	12	215351	215362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525896957
72	NC_021827	TGATGT	2	12	217746	217757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525896959
73	NC_021827	CTTTAT	2	12	218100	218111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896959
74	NC_021827	CCAAAA	2	12	219001	219012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899340
75	NC_021827	ATGAAG	2	12	219365	219376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525899340
76	NC_021827	TGAAAA	2	12	220381	220392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525896961
77	NC_021827	CCAGTA	2	12	221113	221124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525896962
78	NC_021827	GTTGAA	2	12	225734	225745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899343
79	NC_021827	TAAATT	2	12	226122	226133	50 %	50 %	0 %	0 %	525899343
80	NC_021827	ATTTTC	2	12	227629	227640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525899345
81	NC_021827	TTTTGC	2	12	228253	228264	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525899345
82	NC_021827	TCTTCA	2	12	232792	232803	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525896968
83	NC_021827	CATCAG	2	12	234789	234800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525896969
84	NC_021827	ATCAAA	2	12	235738	235749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525896969
85	NC_021827	AATTTC	2	12	236110	236121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525896969
86	NC_021827	TGCAAG	2	12	237337	237348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525896970
87	NC_021827	TGCTTT	2	12	241164	241175	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525896974
88	NC_021827	TAAAAG	2	12	246524	246535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525899347
89	NC_021827	CAGAAA	2	12	252011	252022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525896985
90	NC_021827	TGGAAT	2	12	256024	256035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896988
91	NC_021827	GGTTGT	2	12	257339	257350	0 %	50 %	50 %	0 %	525896989
92	NC_021827	GCATTC	2	12	261618	261629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525896992
93	NC_021827	TGAAAA	2	12	262586	262597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525896994
94	NC_021827	GGTTTA	2	12	269307	269318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525896999
95	NC_021827	GTTGGT	2	12	269394	269405	0 %	50 %	50 %	0 %	525896999
96	NC_021827	CTTGTT	2	12	269840	269851	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525897000
97	NC_021827	ATTTTA	2	12	271924	271935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525897004
98	NC_021827	ATTGAT	2	12	275352	275363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525897006
99	NC_021827	GAATAT	2	12	281126	281137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525899348
100	NC_021827	GAAACG	2	12	281268	281279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525899348
101	NC_021827	CAAGGT	2	12	283261	283272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525897010
102	NC_021827	TTTGGC	2	12	286845	286856	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525897013
103	NC_021827	AAATAA	2	12	289220	289231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525897015
104	NC_021827	AATTTT	2	12	289810	289821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525897016
105	NC_021827	CTAAAA	2	12	290622	290633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525897017
106	NC_021827	AATATT	2	12	304258	304269	50 %	50 %	0 %	0 %	525897031
107	NC_021827	GAAAGC	2	12	308900	308911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525897036
108	NC_021827	ATTGAA	2	12	308972	308983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525897036
109	NC_021827	AACGGA	2	12	309659	309670	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525897038
110	NC_021827	CAGAAA	2	12	311638	311649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525897039
111	NC_021827	GAAAAT	2	12	313660	313671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525897040
112	NC_021827	AAAGAT	2	12	317989	318000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525897044
113	NC_021827	TTTATT	2	12	319155	319166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525897045
114	NC_021827	AAAGTA	2	12	322910	322921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525899352
115	NC_021827	TATGCT	2	12	323709	323720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525899352
116	NC_021827	GTGCAT	2	12	329328	329339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525897050
117	NC_021827	TTTTCT	2	12	331495	331506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525897050
118	NC_021827	AGAAAC	2	12	333885	333896	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525897053
119	NC_021827	ACAGAG	2	12	334670	334681	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525897054
120	NC_021827	TGCTTC	2	12	335606	335617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525897055
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122	NC_021827	AGATGT	2	12	342020	342031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525897061
123	NC_021827	GCAATT	2	12	342977	342988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525897062
124	NC_021827	AAGATA	2	12	345067	345078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525897063
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220	NC_021827	TCAGGT	2	12	622690	622701	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525897317
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223	NC_021827	AACGTA	2	12	625677	625688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525897318
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228	NC_021827	GATTTC	2	12	645620	645631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525897335
229	NC_021827	TACACT	2	12	646979	646990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525897336
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343	NC_021827	TATATG	2	12	908874	908885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525897549
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455	NC_021827	CGAAAT	2	12	1147692	1147703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525897741
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