MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 38280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021827	AAT	2	6	936	941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
2	NC_021827	CCA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
3	NC_021827	CGG	2	6	1016	1021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896798
4	NC_021827	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896798
5	NC_021827	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
6	NC_021827	TTC	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
7	NC_021827	TCT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
8	NC_021827	CTT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
9	NC_021827	TGT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
10	NC_021827	TGC	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896798
11	NC_021827	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
12	NC_021827	GCA	3	9	1767	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
13	NC_021827	CCA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896798
14	NC_021827	TTC	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
15	NC_021827	GTT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896798
16	NC_021827	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
17	NC_021827	ATA	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896798
18	NC_021827	AGC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896798
19	NC_021827	TTC	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
20	NC_021827	TTC	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
21	NC_021827	TTC	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
22	NC_021827	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
23	NC_021827	TTC	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896798
24	NC_021827	TTC	2	6	2546	2551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
25	NC_021827	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
26	NC_021827	AGC	2	6	2612	2617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
27	NC_021827	ATA	2	6	2654	2659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
28	NC_021827	GAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896799
29	NC_021827	ATC	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
30	NC_021827	TCT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
31	NC_021827	CAG	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
32	NC_021827	TTC	2	6	3071	3076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896799
33	NC_021827	CAG	2	6	3130	3135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896799
34	NC_021827	AAT	2	6	3230	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896799
35	NC_021827	CAC	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896799
36	NC_021827	ACT	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896799
37	NC_021827	TTC	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896800
38	NC_021827	CAT	3	9	3763	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896800
39	NC_021827	ATA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
40	NC_021827	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896800
41	NC_021827	AGC	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896800
42	NC_021827	CTT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
43	NC_021827	GGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896801
44	NC_021827	TAA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896801
45	NC_021827	CTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
46	NC_021827	GTC	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896801
47	NC_021827	TTC	2	6	4377	4382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896801
48	NC_021827	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896802
49	NC_021827	TCA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896802
50	NC_021827	CGT	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
51	NC_021827	AAT	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
52	NC_021827	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
53	NC_021827	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
54	NC_021827	TTC	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
55	NC_021827	CCA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896802
56	NC_021827	AAT	2	6	5119	5124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896802
57	NC_021827	TGC	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896802
58	NC_021827	TCT	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
59	NC_021827	CTT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
60	NC_021827	CTT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896802
61	NC_021827	TAT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896802
62	NC_021827	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
63	NC_021827	TTG	2	6	5424	5429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
64	NC_021827	TGG	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
65	NC_021827	AGA	2	6	5610	5615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896802
66	NC_021827	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896802
67	NC_021827	TGG	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896802
68	NC_021827	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896803
69	NC_021827	GCT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896803
70	NC_021827	GAA	2	6	6298	6303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896803
71	NC_021827	CTA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896803
72	NC_021827	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896803
73	NC_021827	ACC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896803
74	NC_021827	TTC	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896803
75	NC_021827	GTT	2	6	6628	6633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896803
76	NC_021827	TTG	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896803
77	NC_021827	TGC	3	9	6843	6851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896803
78	NC_021827	ATC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896803
79	NC_021827	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896803
80	NC_021827	CTT	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
81	NC_021827	TTC	3	9	7243	7251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
82	NC_021827	TCT	2	6	7328	7333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
83	NC_021827	ATT	2	6	7346	7351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896804
84	NC_021827	CGC	2	6	7428	7433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896804
85	NC_021827	TCA	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896804
86	NC_021827	GCT	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896804
87	NC_021827	ATC	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896804
88	NC_021827	GGA	2	6	7624	7629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896804
89	NC_021827	CGC	2	6	7764	7769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896804
90	NC_021827	TCT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
91	NC_021827	GCG	2	6	7973	7978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896804
92	NC_021827	TCT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
93	NC_021827	CTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896804
94	NC_021827	GTT	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896804
95	NC_021827	CTG	2	6	8037	8042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896804
96	NC_021827	AAT	2	6	8085	8090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896804
97	NC_021827	AGA	2	6	8197	8202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896805
98	NC_021827	ATC	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896805
99	NC_021827	ACT	3	9	8240	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896805
100	NC_021827	CGA	2	6	8301	8306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896805
101	NC_021827	GAT	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896805
102	NC_021827	AGC	2	6	8395	8400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896805
103	NC_021827	TTC	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896805
104	NC_021827	TGC	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896805
105	NC_021827	ACG	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896805
106	NC_021827	ATA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896805
107	NC_021827	TGT	2	6	8803	8808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896805
108	NC_021827	CTT	2	6	9067	9072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
109	NC_021827	TTC	2	6	9077	9082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
110	NC_021827	TTC	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
111	NC_021827	CTT	3	9	9103	9111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
112	NC_021827	CTT	2	6	9118	9123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
113	NC_021827	TCT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
114	NC_021827	CTT	2	6	9151	9156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
115	NC_021827	TCA	2	6	9222	9227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896806
116	NC_021827	TGT	2	6	9294	9299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896806
117	NC_021827	GCG	2	6	9500	9505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896806
118	NC_021827	GTT	2	6	9546	9551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896806
119	NC_021827	CTT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
120	NC_021827	TCT	2	6	9642	9647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
121	NC_021827	ACC	2	6	9668	9673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896806
122	NC_021827	TCA	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896806
123	NC_021827	CGA	2	6	9736	9741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896806
124	NC_021827	ACC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896806
125	NC_021827	GCG	2	6	9773	9778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896806
126	NC_021827	TGC	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896806
127	NC_021827	GAA	2	6	10075	10080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896806
128	NC_021827	TGC	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896806
129	NC_021827	AAT	2	6	10118	10123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896806
130	NC_021827	GAT	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896806
131	NC_021827	CCG	2	6	10200	10205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896806
132	NC_021827	GAC	2	6	10225	10230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896806
133	NC_021827	TCA	2	6	10245	10250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896806
134	NC_021827	TTC	2	6	10275	10280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
135	NC_021827	AGA	2	6	10357	10362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896806
136	NC_021827	GGA	2	6	10419	10424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896806
137	NC_021827	CTA	2	6	10426	10431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896806
138	NC_021827	CTA	2	6	10495	10500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896806
139	NC_021827	CAA	2	6	10504	10509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896806
140	NC_021827	TCT	2	6	10558	10563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
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142	NC_021827	ACC	2	6	10613	10618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896806
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144	NC_021827	GAA	3	9	10646	10654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896806
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146	NC_021827	TCT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896806
147	NC_021827	TGT	2	6	10805	10810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896806
148	NC_021827	TGC	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896806
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151	NC_021827	CAA	2	6	11017	11022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896806
152	NC_021827	ATA	2	6	11028	11033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896806
153	NC_021827	ACG	2	6	11512	11517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899282
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156	NC_021827	ACT	2	6	11857	11862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899282
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158	NC_021827	TCC	2	6	11932	11937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525899282
159	NC_021827	TCC	2	6	11979	11984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525899282
160	NC_021827	TAA	2	6	12002	12007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899282
161	NC_021827	CTT	2	6	12051	12056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899282
162	NC_021827	AAC	2	6	12279	12284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899282
163	NC_021827	TAT	2	6	12317	12322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899282
164	NC_021827	TGA	2	6	12352	12357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899282
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172	NC_021827	CTT	2	6	13115	13120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899282
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250	NC_021827	AAT	2	6	19596	19601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896811
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256	NC_021827	GAA	2	6	19870	19875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896811
257	NC_021827	CTG	2	6	19886	19891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896811
258	NC_021827	ATC	2	6	19932	19937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896811
259	NC_021827	GAA	2	6	20029	20034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896811
260	NC_021827	TTG	2	6	20121	20126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896811
261	NC_021827	ATA	2	6	20340	20345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896812
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