MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021827	AGC	2	6	197789	197794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4002	NC_021827	TGC	2	6	197864	197869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896942
4003	NC_021827	ATA	2	6	197880	197885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4004	NC_021827	AAT	2	6	197923	197928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4005	NC_021827	GAAT	2	8	197941	197948	50 %	25 %	25 %	0 %	525896942
4006	NC_021827	CAAG	2	8	197989	197996	50 %	0 %	25 %	25 %	525896942
4007	NC_021827	AAT	2	6	198008	198013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896942
4008	NC_021827	ATC	2	6	198024	198029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896942
4009	NC_021827	T	6	6	198076	198081	0 %	100 %	0 %	0 %	525896942
4010	NC_021827	TC	3	6	198125	198130	0 %	50 %	0 %	50 %	525896942
4011	NC_021827	T	7	7	198139	198145	0 %	100 %	0 %	0 %	525896942
4012	NC_021827	TCC	2	6	198147	198152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896943
4013	NC_021827	ATT	2	6	198239	198244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896943
4014	NC_021827	CAT	2	6	198365	198370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4015	NC_021827	TCG	2	6	198546	198551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4016	NC_021827	TTC	2	6	198587	198592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896943
4017	NC_021827	TGT	2	6	198618	198623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4018	NC_021827	T	6	6	198656	198661	0 %	100 %	0 %	0 %	525896943
4019	NC_021827	CTG	2	6	198670	198675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4020	NC_021827	T	6	6	198710	198715	0 %	100 %	0 %	0 %	525896943
4021	NC_021827	GTTT	2	8	198753	198760	0 %	75 %	25 %	0 %	525896943
4022	NC_021827	GCC	2	6	198789	198794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896943
4023	NC_021827	TAAA	2	8	198806	198813	75 %	25 %	0 %	0 %	525896943
4024	NC_021827	TGA	2	6	198828	198833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896943
4025	NC_021827	AT	3	6	198971	198976	50 %	50 %	0 %	0 %	525896943
4026	NC_021827	TTTG	2	8	198980	198987	0 %	75 %	25 %	0 %	525896943
4027	NC_021827	AAG	2	6	199015	199020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4028	NC_021827	ATA	2	6	199028	199033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4029	NC_021827	TAG	2	6	199159	199164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896943
4030	NC_021827	CG	3	6	199240	199245	0 %	0 %	50 %	50 %	525896943
4031	NC_021827	CAT	2	6	199252	199257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4032	NC_021827	CAA	2	6	199267	199272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896943
4033	NC_021827	AAAAT	2	10	199338	199347	80 %	20 %	0 %	0 %	525896943
4034	NC_021827	CTT	2	6	199363	199368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896943
4035	NC_021827	CCG	2	6	199444	199449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896943
4036	NC_021827	GCT	2	6	199459	199464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4037	NC_021827	CCA	2	6	199491	199496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896943
4038	NC_021827	ATA	2	6	199530	199535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4039	NC_021827	AGA	2	6	199616	199621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4040	NC_021827	AAT	2	6	199724	199729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4041	NC_021827	AAC	2	6	199775	199780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896943
4042	NC_021827	TTG	2	6	199827	199832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4043	NC_021827	TAT	2	6	199891	199896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896943
4044	NC_021827	TAATT	2	10	199943	199952	40 %	60 %	0 %	0 %	525896943
4045	NC_021827	AAT	2	6	199962	199967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4046	NC_021827	CAG	2	6	199978	199983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896943
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4048	NC_021827	CAT	2	6	200068	200073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896943
4049	NC_021827	AT	4	8	200120	200127	50 %	50 %	0 %	0 %	525896943
4050	NC_021827	CGT	2	6	200146	200151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896943
4051	NC_021827	GAA	2	6	200337	200342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896943
4052	NC_021827	TGT	2	6	200412	200417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896943
4053	NC_021827	TAAA	2	8	200425	200432	75 %	25 %	0 %	0 %	525896943
4054	NC_021827	AAT	2	6	200510	200515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896943
4055	NC_021827	TCC	2	6	200560	200565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896944
4056	NC_021827	AAC	2	6	200638	200643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896944
4057	NC_021827	A	6	6	200699	200704	100 %	0 %	0 %	0 %	525896944
4058	NC_021827	TAGC	2	8	200781	200788	25 %	25 %	25 %	25 %	525896944
4059	NC_021827	AAT	2	6	200806	200811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896944
4060	NC_021827	GAA	2	6	200847	200852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896944
4061	NC_021827	AGTT	2	8	200863	200870	25 %	50 %	25 %	0 %	525896944
4062	NC_021827	CTT	2	6	200928	200933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896944
4063	NC_021827	CA	3	6	200962	200967	50 %	0 %	0 %	50 %	525896944
4064	NC_021827	CTA	2	6	201009	201014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896944
4065	NC_021827	TCCA	2	8	201064	201071	25 %	25 %	0 %	50 %	525896944
4066	NC_021827	CAG	2	6	201081	201086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896944
4067	NC_021827	TAAA	3	12	201106	201117	75 %	25 %	0 %	0 %	525896944
4068	NC_021827	GTTT	2	8	201121	201128	0 %	75 %	25 %	0 %	525896944
4069	NC_021827	CCAA	2	8	201136	201143	50 %	0 %	0 %	50 %	525896944
4070	NC_021827	ACA	2	6	201170	201175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896944
4071	NC_021827	GTTT	2	8	201317	201324	0 %	75 %	25 %	0 %	525896944
4072	NC_021827	ATC	2	6	201355	201360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896944
4073	NC_021827	A	7	7	201721	201727	100 %	0 %	0 %	0 %	525896945
4074	NC_021827	TAA	2	6	201789	201794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896945
4075	NC_021827	A	7	7	201823	201829	100 %	0 %	0 %	0 %	525896945
4076	NC_021827	TGA	2	6	201843	201848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896945
4077	NC_021827	AC	3	6	201857	201862	50 %	0 %	0 %	50 %	525896945
4078	NC_021827	GAA	2	6	201900	201905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896945
4079	NC_021827	ATTTC	2	10	201941	201950	20 %	60 %	0 %	20 %	525896945
4080	NC_021827	CGA	2	6	201995	202000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896945
4081	NC_021827	ATA	2	6	202031	202036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896945
4082	NC_021827	AAT	2	6	202039	202044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896945
4083	NC_021827	GAA	2	6	202060	202065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896945
4084	NC_021827	TA	3	6	202153	202158	50 %	50 %	0 %	0 %	525896945
4085	NC_021827	AAT	2	6	202177	202182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896945
4086	NC_021827	GTT	3	9	202192	202200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896945
4087	NC_021827	TTTA	2	8	202230	202237	25 %	75 %	0 %	0 %	525896945
4088	NC_021827	A	7	7	202251	202257	100 %	0 %	0 %	0 %	525896945
4089	NC_021827	AAC	2	6	202263	202268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896945
4090	NC_021827	TTAG	2	8	202270	202277	25 %	50 %	25 %	0 %	525896945
4091	NC_021827	CAC	2	6	202341	202346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896945
4092	NC_021827	AAG	2	6	202367	202372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896945
4093	NC_021827	GAC	2	6	202402	202407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896945
4094	NC_021827	TCTG	2	8	202416	202423	0 %	50 %	25 %	25 %	525896945
4095	NC_021827	ATT	2	6	202424	202429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896945
4096	NC_021827	GCA	2	6	202447	202452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896945
4097	NC_021827	ATG	2	6	202544	202549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896945
4098	NC_021827	TAC	2	6	202830	202835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896946
4099	NC_021827	CAA	2	6	202877	202882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896946
4100	NC_021827	AGA	2	6	202888	202893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896946
4101	NC_021827	TCA	2	6	202897	202902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896946
4102	NC_021827	CGG	2	6	202990	202995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896946
4103	NC_021827	A	6	6	203031	203036	100 %	0 %	0 %	0 %	525896946
4104	NC_021827	TTTTC	2	10	203097	203106	0 %	80 %	0 %	20 %	525896946
4105	NC_021827	TAC	2	6	203120	203125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896946
4106	NC_021827	ATT	2	6	203142	203147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896946
4107	NC_021827	GAA	2	6	203156	203161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896946
4108	NC_021827	CAAAA	2	10	203200	203209	80 %	0 %	0 %	20 %	525896946
4109	NC_021827	GAA	2	6	203261	203266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896946
4110	NC_021827	TTC	2	6	203329	203334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896946
4111	NC_021827	AAT	2	6	203342	203347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896946
4112	NC_021827	A	6	6	203375	203380	100 %	0 %	0 %	0 %	525896946
4113	NC_021827	TGGTGA	2	12	203440	203451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525896946
4114	NC_021827	A	7	7	203519	203525	100 %	0 %	0 %	0 %	525896946
4115	NC_021827	TAC	2	6	203539	203544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896946
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4117	NC_021827	TAC	2	6	203567	203572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896946
4118	NC_021827	A	6	6	203579	203584	100 %	0 %	0 %	0 %	525896946
4119	NC_021827	TAA	2	6	203597	203602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896946
4120	NC_021827	TTC	2	6	203639	203644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896947
4121	NC_021827	AGC	2	6	203651	203656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896947
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4123	NC_021827	TTAA	2	8	203667	203674	50 %	50 %	0 %	0 %	525896947
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4249	NC_021827	GCT	2	6	208881	208886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896949
4250	NC_021827	T	7	7	208886	208892	0 %	100 %	0 %	0 %	525896949
4251	NC_021827	CCT	2	6	208938	208943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896949
4252	NC_021827	GCT	2	6	208998	209003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896949
4253	NC_021827	ATC	2	6	209033	209038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896949
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4257	NC_021827	AAC	2	6	209146	209151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896949
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4261	NC_021827	TAC	3	9	209354	209362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896950
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4280	NC_021827	T	7	7	210085	210091	0 %	100 %	0 %	0 %	525896950
4281	NC_021827	GTT	2	6	210191	210196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896950
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4355	NC_021827	GTAA	2	8	213809	213816	50 %	25 %	25 %	0 %	525896954
4356	NC_021827	GAA	2	6	213845	213850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896954
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4361	NC_021827	CCTGA	2	10	214139	214148	20 %	20 %	20 %	40 %	525896954
4362	NC_021827	CGA	2	6	214169	214174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896954
4363	NC_021827	CCG	2	6	214207	214212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896954
4364	NC_021827	TTA	2	6	214307	214312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896954
4365	NC_021827	TAAC	2	8	214373	214380	50 %	25 %	0 %	25 %	525896954
4366	NC_021827	T	7	7	214435	214441	0 %	100 %	0 %	0 %	525896955
4367	NC_021827	T	6	6	214558	214563	0 %	100 %	0 %	0 %	525896955
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