MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021827	TCT	2	6	174691	174696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896925
3502	NC_021827	CTT	2	6	174725	174730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896925
3503	NC_021827	GTT	2	6	174736	174741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896925
3504	NC_021827	AAT	2	6	174765	174770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896925
3505	NC_021827	GCT	2	6	174799	174804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896925
3506	NC_021827	T	6	6	174806	174811	0 %	100 %	0 %	0 %	525896925
3507	NC_021827	ATC	2	6	174931	174936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896925
3508	NC_021827	AAC	2	6	174984	174989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896925
3509	NC_021827	ATC	2	6	175005	175010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896925
3510	NC_021827	TG	3	6	175106	175111	0 %	50 %	50 %	0 %	525896925
3511	NC_021827	T	6	6	175112	175117	0 %	100 %	0 %	0 %	525896925
3512	NC_021827	TAT	2	6	175121	175126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896925
3513	NC_021827	GAAA	2	8	175180	175187	75 %	0 %	25 %	0 %	525896925
3514	NC_021827	TTCA	2	8	175231	175238	25 %	50 %	0 %	25 %	525896925
3515	NC_021827	GTT	2	6	175407	175412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896926
3516	NC_021827	TCT	2	6	175440	175445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896926
3517	NC_021827	ATC	2	6	175516	175521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896926
3518	NC_021827	GTT	2	6	175560	175565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896926
3519	NC_021827	CG	3	6	175630	175635	0 %	0 %	50 %	50 %	525896926
3520	NC_021827	ATA	2	6	175792	175797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899327
3521	NC_021827	ACA	2	6	175810	175815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899327
3522	NC_021827	A	6	6	175885	175890	100 %	0 %	0 %	0 %	525899327
3523	NC_021827	TAT	2	6	175913	175918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899327
3524	NC_021827	A	6	6	175930	175935	100 %	0 %	0 %	0 %	525899327
3525	NC_021827	GGC	2	6	176090	176095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896927
3526	NC_021827	ATC	2	6	176109	176114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
3527	NC_021827	TTC	2	6	176157	176162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896927
3528	NC_021827	AGT	2	6	176281	176286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896927
3529	NC_021827	ACG	2	6	176316	176321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896927
3530	NC_021827	AACC	2	8	176347	176354	50 %	0 %	0 %	50 %	525896927
3531	NC_021827	GAC	2	6	176366	176371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896927
3532	NC_021827	AAT	2	6	176428	176433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3533	NC_021827	CAA	2	6	176486	176491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896927
3534	NC_021827	TGAT	2	8	176494	176501	25 %	50 %	25 %	0 %	525896927
3535	NC_021827	CCA	2	6	176536	176541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896927
3536	NC_021827	ATA	2	6	176618	176623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3537	NC_021827	CAT	2	6	176633	176638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
3538	NC_021827	ACA	2	6	176656	176661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896927
3539	NC_021827	TTG	2	6	176688	176693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896927
3540	NC_021827	ATA	2	6	176703	176708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3541	NC_021827	TTC	2	6	176709	176714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896927
3542	NC_021827	TCT	2	6	176722	176727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896927
3543	NC_021827	TAA	2	6	176760	176765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3544	NC_021827	TAA	2	6	176820	176825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3545	NC_021827	AAT	2	6	176829	176834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896927
3546	NC_021827	GCT	2	6	176851	176856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896927
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3548	NC_021827	TTTG	2	8	176901	176908	0 %	75 %	25 %	0 %	525896927
3549	NC_021827	TTC	2	6	176919	176924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896927
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3553	NC_021827	T	6	6	177080	177085	0 %	100 %	0 %	0 %	525896927
3554	NC_021827	GAAA	2	8	177202	177209	75 %	0 %	25 %	0 %	525896927
3555	NC_021827	CTA	2	6	177251	177256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896927
3556	NC_021827	CAA	2	6	177257	177262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896927
3557	NC_021827	CCA	2	6	177354	177359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525899328
3558	NC_021827	T	6	6	177413	177418	0 %	100 %	0 %	0 %	525899328
3559	NC_021827	ATAAA	2	10	177473	177482	80 %	20 %	0 %	0 %	525899328
3560	NC_021827	CGT	3	9	177541	177549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896928
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3562	NC_021827	AAT	3	9	177635	177643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896928
3563	NC_021827	CAT	2	6	177655	177660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
3564	NC_021827	CAT	2	6	177752	177757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
3565	NC_021827	CTT	2	6	177868	177873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896928
3566	NC_021827	CCA	2	6	177888	177893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896928
3567	NC_021827	AATC	2	8	177922	177929	50 %	25 %	0 %	25 %	525896928
3568	NC_021827	TTCA	2	8	177983	177990	25 %	50 %	0 %	25 %	525896928
3569	NC_021827	ATC	2	6	178007	178012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
3570	NC_021827	AT	4	8	178014	178021	50 %	50 %	0 %	0 %	525896928
3571	NC_021827	ATC	2	6	178067	178072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
3572	NC_021827	CCGT	2	8	178087	178094	0 %	25 %	25 %	50 %	525896928
3573	NC_021827	TTCC	2	8	178114	178121	0 %	50 %	0 %	50 %	525896928
3574	NC_021827	GTT	2	6	178144	178149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896928
3575	NC_021827	TCG	2	6	178185	178190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896928
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3577	NC_021827	CAA	2	6	178258	178263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896928
3578	NC_021827	ATC	2	6	178367	178372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
3579	NC_021827	CG	3	6	178486	178491	0 %	0 %	50 %	50 %	525896928
3580	NC_021827	ATA	2	6	178557	178562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896928
3581	NC_021827	CCGC	2	8	178629	178636	0 %	0 %	25 %	75 %	525896928
3582	NC_021827	TCT	2	6	178638	178643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896928
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3584	NC_021827	ATC	2	6	178757	178762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896928
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3587	NC_021827	ATT	2	6	178906	178911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896929
3588	NC_021827	TCAC	2	8	178914	178921	25 %	25 %	0 %	50 %	525896929
3589	NC_021827	T	6	6	179041	179046	0 %	100 %	0 %	0 %	525896929
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3592	NC_021827	TTC	2	6	179171	179176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896929
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3595	NC_021827	T	6	6	179195	179200	0 %	100 %	0 %	0 %	525896929
3596	NC_021827	ATT	2	6	179231	179236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896929
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3598	NC_021827	T	6	6	179309	179314	0 %	100 %	0 %	0 %	525896929
3599	NC_021827	ACCTTT	2	12	179315	179326	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525896929
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3601	NC_021827	TTCTGC	2	12	179404	179415	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525896930
3602	NC_021827	TG	3	6	179435	179440	0 %	50 %	50 %	0 %	525896930
3603	NC_021827	TAA	2	6	179550	179555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896930
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3605	NC_021827	CAT	2	6	179661	179666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896930
3606	NC_021827	AGT	2	6	179710	179715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896930
3607	NC_021827	CTTC	2	8	179721	179728	0 %	50 %	0 %	50 %	525896930
3608	NC_021827	CGC	2	6	179779	179784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896930
3609	NC_021827	TTC	2	6	179819	179824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896930
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3612	NC_021827	ACG	2	6	179983	179988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896930
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3615	NC_021827	CAA	2	6	180066	180071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896930
3616	NC_021827	TTC	2	6	180148	180153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896930
3617	NC_021827	TCAT	2	8	180158	180165	25 %	50 %	0 %	25 %	525896930
3618	NC_021827	TCAT	2	8	180224	180231	25 %	50 %	0 %	25 %	525896930
3619	NC_021827	CCG	2	6	180446	180451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896930
3620	NC_021827	AGACT	2	10	180470	180479	40 %	20 %	20 %	20 %	525896930
3621	NC_021827	AATCA	2	10	180499	180508	60 %	20 %	0 %	20 %	525896930
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3623	NC_021827	TCC	2	6	180623	180628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896930
3624	NC_021827	AAAT	2	8	180668	180675	75 %	25 %	0 %	0 %	525896930
3625	NC_021827	ATT	2	6	180718	180723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896930
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3992	NC_021827	GTA	2	6	197458	197463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896942
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