MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021827	TAA	2	6	149592	149597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899305
3002	NC_021827	AAT	2	6	149601	149606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899305
3003	NC_021827	T	7	7	149630	149636	0 %	100 %	0 %	0 %	525899305
3004	NC_021827	TAA	2	6	149686	149691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899305
3005	NC_021827	TCT	2	6	149771	149776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899305
3006	NC_021827	TTTA	2	8	149791	149798	25 %	75 %	0 %	0 %	525899305
3007	NC_021827	TTG	2	6	149803	149808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899305
3008	NC_021827	CTTA	2	8	149836	149843	25 %	50 %	0 %	25 %	525899305
3009	NC_021827	CTG	2	6	149902	149907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899305
3010	NC_021827	TCAA	2	8	149924	149931	50 %	25 %	0 %	25 %	525899305
3011	NC_021827	A	6	6	149938	149943	100 %	0 %	0 %	0 %	525899305
3012	NC_021827	CTT	2	6	150072	150077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899305
3013	NC_021827	T	6	6	150076	150081	0 %	100 %	0 %	0 %	525899305
3014	NC_021827	TCTT	2	8	150193	150200	0 %	75 %	0 %	25 %	525899305
3015	NC_021827	ATT	2	6	150221	150226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899305
3016	NC_021827	AG	3	6	150234	150239	50 %	0 %	50 %	0 %	525899305
3017	NC_021827	ATA	2	6	150256	150261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899305
3018	NC_021827	TAT	2	6	150297	150302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899305
3019	NC_021827	TCCT	2	8	150348	150355	0 %	50 %	0 %	50 %	525899305
3020	NC_021827	A	6	6	150383	150388	100 %	0 %	0 %	0 %	525899305
3021	NC_021827	TAA	2	6	150763	150768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896917
3022	NC_021827	GTG	2	6	150779	150784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896917
3023	NC_021827	CAGCG	2	10	150939	150948	20 %	0 %	40 %	40 %	525896917
3024	NC_021827	ACA	2	6	150997	151002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896917
3025	NC_021827	AGC	2	6	151011	151016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896917
3026	NC_021827	GTT	2	6	151054	151059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896917
3027	NC_021827	ACA	2	6	151108	151113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896917
3028	NC_021827	AAT	2	6	151126	151131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896917
3029	NC_021827	GCT	2	6	151168	151173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896917
3030	NC_021827	AATA	2	8	151193	151200	75 %	25 %	0 %	0 %	525896917
3031	NC_021827	AGC	2	6	151215	151220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896917
3032	NC_021827	TTC	2	6	151247	151252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896917
3033	NC_021827	AAT	2	6	151260	151265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896917
3034	NC_021827	AATC	2	8	151386	151393	50 %	25 %	0 %	25 %	525896917
3035	NC_021827	CCG	2	6	151406	151411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896917
3036	NC_021827	T	7	7	151467	151473	0 %	100 %	0 %	0 %	525896917
3037	NC_021827	T	6	6	151522	151527	0 %	100 %	0 %	0 %	525896917
3038	NC_021827	GAA	2	6	151558	151563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896917
3039	NC_021827	AAT	2	6	151572	151577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896917
3040	NC_021827	T	6	6	151597	151602	0 %	100 %	0 %	0 %	525896917
3041	NC_021827	GTA	2	6	151682	151687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896917
3042	NC_021827	CGCT	2	8	151706	151713	0 %	25 %	25 %	50 %	525896917
3043	NC_021827	TCA	2	6	151715	151720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896917
3044	NC_021827	A	7	7	151852	151858	100 %	0 %	0 %	0 %	525896918
3045	NC_021827	AAC	2	6	151959	151964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896918
3046	NC_021827	ATT	2	6	152005	152010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896918
3047	NC_021827	TGT	2	6	152064	152069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896918
3048	NC_021827	ATT	2	6	152113	152118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896918
3049	NC_021827	AATT	2	8	152144	152151	50 %	50 %	0 %	0 %	525896918
3050	NC_021827	GGCG	2	8	152256	152263	0 %	0 %	75 %	25 %	525896918
3051	NC_021827	GC	3	6	152351	152356	0 %	0 %	50 %	50 %	525896918
3052	NC_021827	GTT	2	6	152463	152468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896918
3053	NC_021827	GC	3	6	152551	152556	0 %	0 %	50 %	50 %	525896919
3054	NC_021827	CCT	2	6	152573	152578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896919
3055	NC_021827	GCC	2	6	152673	152678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896919
3056	NC_021827	TCG	2	6	152728	152733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896919
3057	NC_021827	ATCA	2	8	152794	152801	50 %	25 %	0 %	25 %	525896919
3058	NC_021827	ATT	3	9	152846	152854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896919
3059	NC_021827	T	6	6	152856	152861	0 %	100 %	0 %	0 %	525896919
3060	NC_021827	T	6	6	152896	152901	0 %	100 %	0 %	0 %	525896919
3061	NC_021827	CAA	2	6	152928	152933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896919
3062	NC_021827	ATC	3	9	152953	152961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896919
3063	NC_021827	AGTTT	2	10	152984	152993	20 %	60 %	20 %	0 %	525896919
3064	NC_021827	CAAGC	2	10	152994	153003	40 %	0 %	20 %	40 %	525896919
3065	NC_021827	CGC	2	6	153161	153166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896919
3066	NC_021827	CTT	2	6	153202	153207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896919
3067	NC_021827	TCA	2	6	153245	153250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896919
3068	NC_021827	T	6	6	153268	153273	0 %	100 %	0 %	0 %	525896919
3069	NC_021827	CAA	2	6	153297	153302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896919
3070	NC_021827	TCG	2	6	153327	153332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896919
3071	NC_021827	CCT	2	6	153384	153389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896919
3072	NC_021827	TTC	2	6	153428	153433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896919
3073	NC_021827	CGT	2	6	153463	153468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896919
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3075	NC_021827	A	6	6	153481	153486	100 %	0 %	0 %	0 %	525896919
3076	NC_021827	ATA	2	6	153526	153531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896919
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3078	NC_021827	A	7	7	153621	153627	100 %	0 %	0 %	0 %	525896920
3079	NC_021827	T	6	6	153662	153667	0 %	100 %	0 %	0 %	525896920
3080	NC_021827	CATCC	2	10	153687	153696	20 %	20 %	0 %	60 %	525896920
3081	NC_021827	AATT	2	8	153744	153751	50 %	50 %	0 %	0 %	525896920
3082	NC_021827	CCT	2	6	153794	153799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896920
3083	NC_021827	CTT	2	6	153824	153829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896920
3084	NC_021827	CAA	2	6	153831	153836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896920
3085	NC_021827	CGC	2	6	153909	153914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896920
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3088	NC_021827	TTG	2	6	154230	154235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896920
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3090	NC_021827	GTGGG	2	10	154280	154289	0 %	20 %	80 %	0 %	525896920
3091	NC_021827	T	6	6	154311	154316	0 %	100 %	0 %	0 %	525896920
3092	NC_021827	T	6	6	154321	154326	0 %	100 %	0 %	0 %	525896920
3093	NC_021827	TC	3	6	154518	154523	0 %	50 %	0 %	50 %	525899306
3094	NC_021827	TGT	2	6	154533	154538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899306
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3098	NC_021827	ATT	2	6	154977	154982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899307
3099	NC_021827	AATA	3	12	155026	155037	75 %	25 %	0 %	0 %	525899307
3100	NC_021827	TCT	3	9	155038	155046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899307
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3103	NC_021827	T	6	6	155215	155220	0 %	100 %	0 %	0 %	525899308
3104	NC_021827	GCA	2	6	155232	155237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899308
3105	NC_021827	TAAA	2	8	155259	155266	75 %	25 %	0 %	0 %	525899308
3106	NC_021827	CTT	2	6	155340	155345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899308
3107	NC_021827	AT	3	6	155380	155385	50 %	50 %	0 %	0 %	525899308
3108	NC_021827	TGA	2	6	155407	155412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899308
3109	NC_021827	A	6	6	155449	155454	100 %	0 %	0 %	0 %	525899308
3110	NC_021827	TTTC	2	8	155504	155511	0 %	75 %	0 %	25 %	525899308
3111	NC_021827	T	6	6	155541	155546	0 %	100 %	0 %	0 %	525899308
3112	NC_021827	CAA	2	6	155875	155880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899309
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3114	NC_021827	T	7	7	156074	156080	0 %	100 %	0 %	0 %	525899309
3115	NC_021827	TAA	2	6	156084	156089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899309
3116	NC_021827	TCTT	2	8	156101	156108	0 %	75 %	0 %	25 %	525899309
3117	NC_021827	GACA	2	8	156149	156156	50 %	0 %	25 %	25 %	525899309
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3119	NC_021827	ATT	2	6	156239	156244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899309
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3121	NC_021827	A	6	6	156446	156451	100 %	0 %	0 %	0 %	525899309
3122	NC_021827	TATT	2	8	156519	156526	25 %	75 %	0 %	0 %	525899310
3123	NC_021827	A	6	6	156593	156598	100 %	0 %	0 %	0 %	525899310
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3125	NC_021827	TAC	2	6	156668	156673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899310
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3497	NC_021827	ATA	2	6	174562	174567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896925
3498	NC_021827	CTTT	2	8	174586	174593	0 %	75 %	0 %	25 %	525896925
3499	NC_021827	ATT	2	6	174651	174656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896925
3500	NC_021827	TGT	2	6	174665	174670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896925

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