MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021827	TTCCA	2	10	52705	52714	20 %	40 %	0 %	40 %	525896841
1003	NC_021827	CATA	2	8	52816	52823	50 %	25 %	0 %	25 %	525896841
1004	NC_021827	TCT	2	6	52839	52844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1005	NC_021827	CAG	2	6	52853	52858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896841
1006	NC_021827	CAT	2	6	52868	52873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1007	NC_021827	ATTC	2	8	52928	52935	25 %	50 %	0 %	25 %	525896841
1008	NC_021827	GTC	2	6	52973	52978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896841
1009	NC_021827	CAG	2	6	53077	53082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896841
1010	NC_021827	GAAT	2	8	53086	53093	50 %	25 %	25 %	0 %	525896841
1011	NC_021827	TCT	2	6	53189	53194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1012	NC_021827	GC	3	6	53248	53253	0 %	0 %	50 %	50 %	525896841
1013	NC_021827	CAT	2	6	53284	53289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1014	NC_021827	TGT	2	6	53292	53297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1015	NC_021827	GTA	2	6	53306	53311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896841
1016	NC_021827	TCA	2	6	53349	53354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1017	NC_021827	CGC	2	6	53401	53406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896841
1018	NC_021827	ATCA	2	8	53435	53442	50 %	25 %	0 %	25 %	525896841
1019	NC_021827	ACC	2	6	53461	53466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896841
1020	NC_021827	T	7	7	53468	53474	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1021	NC_021827	CTT	2	6	53476	53481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1022	NC_021827	CAC	2	6	53558	53563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896841
1023	NC_021827	CTT	2	6	53587	53592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1024	NC_021827	GTT	2	6	53611	53616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1025	NC_021827	TGT	2	6	53668	53673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1026	NC_021827	ATA	2	6	53795	53800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896841
1027	NC_021827	GTT	2	6	53862	53867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1028	NC_021827	GTT	2	6	53903	53908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1029	NC_021827	TTC	2	6	53964	53969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1030	NC_021827	ATTT	2	8	54032	54039	25 %	75 %	0 %	0 %	525896841
1031	NC_021827	AC	3	6	54112	54117	50 %	0 %	0 %	50 %	525896841
1032	NC_021827	AAACA	2	10	54190	54199	80 %	0 %	0 %	20 %	525896841
1033	NC_021827	CTT	3	9	54259	54267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1034	NC_021827	TTG	2	6	54294	54299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1035	NC_021827	ATC	2	6	54422	54427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1036	NC_021827	T	6	6	54428	54433	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1037	NC_021827	GAT	2	6	54444	54449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896841
1038	NC_021827	GAT	2	6	54530	54535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896841
1039	NC_021827	TAAA	2	8	54553	54560	75 %	25 %	0 %	0 %	525896841
1040	NC_021827	ATC	2	6	54635	54640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1041	NC_021827	TTG	2	6	54667	54672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896841
1042	NC_021827	ATA	2	6	54680	54685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896841
1043	NC_021827	CTT	2	6	54700	54705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1044	NC_021827	CAT	2	6	54739	54744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
1045	NC_021827	T	7	7	54744	54750	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1046	NC_021827	TCT	2	6	54754	54759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1047	NC_021827	GCGT	2	8	54874	54881	0 %	25 %	50 %	25 %	525896841
1048	NC_021827	TCACT	2	10	54943	54952	20 %	40 %	0 %	40 %	525896841
1049	NC_021827	T	6	6	55063	55068	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1050	NC_021827	CAT	2	6	55141	55146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896841
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1053	NC_021827	TAA	2	6	55292	55297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896841
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1055	NC_021827	TAA	2	6	55373	55378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896841
1056	NC_021827	TAAA	2	8	55406	55413	75 %	25 %	0 %	0 %	525896841
1057	NC_021827	CTT	2	6	55492	55497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896841
1058	NC_021827	TGAT	2	8	55509	55516	25 %	50 %	25 %	0 %	525896841
1059	NC_021827	AAG	2	6	55537	55542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896841
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1061	NC_021827	T	6	6	55603	55608	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1062	NC_021827	T	6	6	55611	55616	0 %	100 %	0 %	0 %	525896841
1063	NC_021827	TTGTT	2	10	55763	55772	0 %	80 %	20 %	0 %	525896842
1064	NC_021827	TGT	2	6	55775	55780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896842
1065	NC_021827	AT	3	6	55897	55902	50 %	50 %	0 %	0 %	525896842
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1069	NC_021827	TTCG	2	8	56028	56035	0 %	50 %	25 %	25 %	525896842
1070	NC_021827	GAAG	2	8	56043	56050	50 %	0 %	50 %	0 %	525896842
1071	NC_021827	GCT	2	6	56062	56067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896842
1072	NC_021827	T	6	6	56070	56075	0 %	100 %	0 %	0 %	525896842
1073	NC_021827	GAA	2	6	56109	56114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896842
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1076	NC_021827	TCT	2	6	56239	56244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896842
1077	NC_021827	TGC	2	6	56319	56324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896842
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1081	NC_021827	T	7	7	56466	56472	0 %	100 %	0 %	0 %	525896842
1082	NC_021827	CTT	2	6	56480	56485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896842
1083	NC_021827	CAT	2	6	56600	56605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896842
1084	NC_021827	TTGT	2	8	56625	56632	0 %	75 %	25 %	0 %	525896842
1085	NC_021827	ATCTTT	2	12	56652	56663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525896842
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1088	NC_021827	ACT	3	9	56925	56933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896842
1089	NC_021827	CCG	2	6	56938	56943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896842
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1091	NC_021827	AAT	2	6	56986	56991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896842
1092	NC_021827	T	6	6	56997	57002	0 %	100 %	0 %	0 %	525896842
1093	NC_021827	T	6	6	57029	57034	0 %	100 %	0 %	0 %	525896843
1094	NC_021827	CAT	2	6	57132	57137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896843
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1096	NC_021827	CTT	2	6	57353	57358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896843
1097	NC_021827	TAA	2	6	57393	57398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896843
1098	NC_021827	TCA	2	6	57470	57475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896843
1099	NC_021827	CAT	2	6	57513	57518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896843
1100	NC_021827	AAGTA	2	10	57526	57535	60 %	20 %	20 %	0 %	525896843
1101	NC_021827	AAT	2	6	57538	57543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896843
1102	NC_021827	GCG	2	6	57722	57727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896843
1103	NC_021827	CAAA	2	8	57775	57782	75 %	0 %	0 %	25 %	525896843
1104	NC_021827	CCA	2	6	57802	57807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896843
1105	NC_021827	GAT	2	6	57813	57818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896843
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1107	NC_021827	ACC	2	6	57892	57897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896844
1108	NC_021827	T	6	6	57898	57903	0 %	100 %	0 %	0 %	525896844
1109	NC_021827	AAT	2	6	57917	57922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896844
1110	NC_021827	ATG	2	6	57927	57932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896844
1111	NC_021827	ACC	2	6	58043	58048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896844
1112	NC_021827	ATC	2	6	58059	58064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896844
1113	NC_021827	GTA	2	6	58119	58124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896844
1114	NC_021827	AAG	2	6	58130	58135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896844
1115	NC_021827	AAT	2	6	58152	58157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896844
1116	NC_021827	CCA	2	6	58224	58229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896844
1117	NC_021827	TAA	3	9	58273	58281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896844
1118	NC_021827	ATC	2	6	58287	58292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896844
1119	NC_021827	AAG	2	6	58344	58349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896844
1120	NC_021827	AAG	2	6	58428	58433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525896844
1121	NC_021827	T	6	6	58465	58470	0 %	100 %	0 %	0 %	525896844
1122	NC_021827	GAT	2	6	58526	58531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896844
1123	NC_021827	GGATTG	2	12	58663	58674	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525896844
1124	NC_021827	TTTC	2	8	58736	58743	0 %	75 %	0 %	25 %	525896844
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