MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817

Total Repeats: 58853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021827	AATT	2	8	26684	26691	50 %	50 %	0 %	0 %	525899284
502	NC_021827	CTT	2	6	26695	26700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
503	NC_021827	CAG	2	6	26707	26712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899284
504	NC_021827	T	7	7	26717	26723	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
505	NC_021827	ATT	2	6	26732	26737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899284
506	NC_021827	TTTC	2	8	26796	26803	0 %	75 %	0 %	25 %	525899284
507	NC_021827	CTT	2	6	26809	26814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
508	NC_021827	TTGT	2	8	26853	26860	0 %	75 %	25 %	0 %	525899284
509	NC_021827	TGC	2	6	26933	26938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
510	NC_021827	T	8	8	26968	26975	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
511	NC_021827	T	7	7	26995	27001	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
512	NC_021827	T	6	6	27044	27049	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
513	NC_021827	GC	3	6	27073	27078	0 %	0 %	50 %	50 %	525899284
514	NC_021827	GCT	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
515	NC_021827	A	6	6	27141	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	525899284
516	NC_021827	TCT	3	9	27207	27215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
517	NC_021827	TTC	2	6	27269	27274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
518	NC_021827	ACC	2	6	27287	27292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525899284
519	NC_021827	CTT	2	6	27307	27312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
520	NC_021827	TGG	2	6	27323	27328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
521	NC_021827	TCT	2	6	27444	27449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
522	NC_021827	AAG	2	6	27509	27514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899284
523	NC_021827	GGT	3	9	27558	27566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
524	NC_021827	AAG	2	6	27614	27619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525899284
525	NC_021827	GGT	2	6	27666	27671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525899284
526	NC_021827	TCT	2	6	27703	27708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
527	NC_021827	TAA	2	6	27713	27718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525899284
528	NC_021827	CAA	2	6	27745	27750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525899284
529	NC_021827	TTC	2	6	27756	27761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
530	NC_021827	TCG	2	6	27774	27779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
531	NC_021827	T	7	7	27814	27820	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
532	NC_021827	GTT	2	6	27841	27846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899284
533	NC_021827	T	6	6	27944	27949	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
534	NC_021827	TTG	2	6	27961	27966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899284
535	NC_021827	TAAG	2	8	27978	27985	50 %	25 %	25 %	0 %	525899284
536	NC_021827	GAT	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525899284
537	NC_021827	CTT	2	6	28023	28028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
538	NC_021827	T	7	7	28027	28033	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
539	NC_021827	GAC	2	6	28069	28074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525899284
540	NC_021827	GGTC	2	8	28092	28099	0 %	25 %	50 %	25 %	525899284
541	NC_021827	CTT	2	6	28111	28116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
542	NC_021827	TGT	2	6	28147	28152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525899284
543	NC_021827	TAT	2	6	28153	28158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525899284
544	NC_021827	TGCTTT	2	12	28178	28189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525899284
545	NC_021827	ACTT	2	8	28265	28272	25 %	50 %	0 %	25 %	525899284
546	NC_021827	GCT	2	6	28315	28320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525899284
547	NC_021827	T	6	6	28327	28332	0 %	100 %	0 %	0 %	525899284
548	NC_021827	CTT	2	6	28333	28338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525899284
549	NC_021827	CAT	2	6	28436	28441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525899284
550	NC_021827	CGCA	2	8	28442	28449	25 %	0 %	25 %	50 %	525899284
551	NC_021827	T	6	6	28704	28709	0 %	100 %	0 %	0 %	525896820
552	NC_021827	CGC	2	6	28737	28742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525896820
553	NC_021827	TTG	2	6	28743	28748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896820
554	NC_021827	T	6	6	28755	28760	0 %	100 %	0 %	0 %	525896820
555	NC_021827	T	7	7	28779	28785	0 %	100 %	0 %	0 %	525896820
556	NC_021827	CTGTT	2	10	28818	28827	0 %	60 %	20 %	20 %	525896820
557	NC_021827	TTTTC	2	10	28828	28837	0 %	80 %	0 %	20 %	525896820
558	NC_021827	GCT	2	6	28861	28866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525896820
559	NC_021827	CTT	2	6	28984	28989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896820
560	NC_021827	CA	3	6	29013	29018	50 %	0 %	0 %	50 %	525896820
561	NC_021827	AATAA	2	10	29052	29061	80 %	20 %	0 %	0 %	525896820
562	NC_021827	CAA	2	6	29159	29164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896820
563	NC_021827	ATT	2	6	29244	29249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896820
564	NC_021827	CT	3	6	29305	29310	0 %	50 %	0 %	50 %	525896820
565	NC_021827	ATTT	2	8	29508	29515	25 %	75 %	0 %	0 %	525896820
566	NC_021827	T	7	7	29619	29625	0 %	100 %	0 %	0 %	525896820
567	NC_021827	AAT	2	6	29655	29660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896820
568	NC_021827	TAT	2	6	29699	29704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896820
569	NC_021827	TGA	3	9	29729	29737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896820
570	NC_021827	TTTCTT	2	12	29738	29749	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525896820
571	NC_021827	T	7	7	29824	29830	0 %	100 %	0 %	0 %	525896820
572	NC_021827	TAT	2	6	29900	29905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896820
573	NC_021827	TCA	2	6	29929	29934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896820
574	NC_021827	CAG	2	6	30071	30076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896820
575	NC_021827	TAT	2	6	30095	30100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896820
576	NC_021827	TTC	2	6	30111	30116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896820
577	NC_021827	ATG	2	6	30172	30177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896820
578	NC_021827	ATT	2	6	30534	30539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896821
579	NC_021827	TCA	2	6	30632	30637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896821
580	NC_021827	CCA	2	6	30649	30654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525896821
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582	NC_021827	ATTT	2	8	30808	30815	25 %	75 %	0 %	0 %	525896821
583	NC_021827	TCC	2	6	30847	30852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525896821
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586	NC_021827	GTT	2	6	30916	30921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896821
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590	NC_021827	T	6	6	31009	31014	0 %	100 %	0 %	0 %	525896821
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592	NC_021827	GAAG	2	8	31096	31103	50 %	0 %	50 %	0 %	525896821
593	NC_021827	TGA	2	6	31110	31115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525896821
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595	NC_021827	AT	3	6	31247	31252	50 %	50 %	0 %	0 %	525896821
596	NC_021827	AGG	2	6	31255	31260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525896821
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598	NC_021827	TAT	2	6	31434	31439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896821
599	NC_021827	AATT	2	8	31471	31478	50 %	50 %	0 %	0 %	525896821
600	NC_021827	TCA	2	6	31502	31507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525896821
601	NC_021827	GTT	2	6	31585	31590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896821
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603	NC_021827	T	6	6	31610	31615	0 %	100 %	0 %	0 %	525896821
604	NC_021827	ACA	2	6	31616	31621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896821
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607	NC_021827	ATT	2	6	31789	31794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896821
608	NC_021827	TTGA	2	8	31795	31802	25 %	50 %	25 %	0 %	525896821
609	NC_021827	TCT	2	6	31809	31814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525896821
610	NC_021827	AT	3	6	31829	31834	50 %	50 %	0 %	0 %	525896821
611	NC_021827	GGC	2	6	31862	31867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525896821
612	NC_021827	AATCC	2	10	31917	31926	40 %	20 %	0 %	40 %	525896821
613	NC_021827	TA	3	6	31930	31935	50 %	50 %	0 %	0 %	525896821
614	NC_021827	TGG	2	6	31999	32004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525896821
615	NC_021827	AAATT	2	10	32016	32025	60 %	40 %	0 %	0 %	525896821
616	NC_021827	TTG	2	6	32062	32067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525896821
617	NC_021827	ACTA	2	8	32080	32087	50 %	25 %	0 %	25 %	525896821
618	NC_021827	TAA	2	6	32097	32102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896821
619	NC_021827	ATT	2	6	32111	32116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896821
620	NC_021827	T	7	7	32115	32121	0 %	100 %	0 %	0 %	525896821
621	NC_021827	ATT	2	6	32377	32382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525896822
622	NC_021827	TTTTA	2	10	32411	32420	20 %	80 %	0 %	0 %	525896822
623	NC_021827	T	6	6	32424	32429	0 %	100 %	0 %	0 %	525896822
624	NC_021827	TAA	2	6	32462	32467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525896822
625	NC_021827	AGC	2	6	32540	32545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525896822
626	NC_021827	CT	3	6	32547	32552	0 %	50 %	0 %	50 %	525896822
627	NC_021827	AACCA	2	10	32606	32615	60 %	0 %	0 %	40 %	525896822
628	NC_021827	CAA	2	6	32646	32651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525896822
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