MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 59345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021825	TCT	2	6	53458	53463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880246
1002	NC_021825	CTT	2	6	53468	53473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880246
1003	NC_021825	ATT	2	6	53499	53504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880246
1004	NC_021825	GTC	2	6	53568	53573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880246
1005	NC_021825	CTTC	2	8	53588	53595	0 %	50 %	0 %	50 %	525880246
1006	NC_021825	T	6	6	53634	53639	0 %	100 %	0 %	0 %	525880247
1007	NC_021825	TCTG	2	8	53650	53657	0 %	50 %	25 %	25 %	525880247
1008	NC_021825	ACA	2	6	53687	53692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880247
1009	NC_021825	T	7	7	53764	53770	0 %	100 %	0 %	0 %	525880247
1010	NC_021825	CTG	2	6	53814	53819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880247
1011	NC_021825	TTA	2	6	53823	53828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880247
1012	NC_021825	TGT	2	6	53933	53938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880247
1013	NC_021825	CCT	2	6	53952	53957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880248
1014	NC_021825	TCA	2	6	53975	53980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880248
1015	NC_021825	AAT	2	6	53984	53989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880248
1016	NC_021825	TAA	2	6	53992	53997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880248
1017	NC_021825	ACA	2	6	54032	54037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880248
1018	NC_021825	ATC	2	6	54041	54046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880248
1019	NC_021825	T	7	7	54101	54107	0 %	100 %	0 %	0 %	525880248
1020	NC_021825	TAA	2	6	54144	54149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880248
1021	NC_021825	CTT	2	6	54204	54209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880248
1022	NC_021825	TC	3	6	54222	54227	0 %	50 %	0 %	50 %	525880248
1023	NC_021825	GAAA	2	8	54255	54262	75 %	0 %	25 %	0 %	525880248
1024	NC_021825	ATTC	2	8	54292	54299	25 %	50 %	0 %	25 %	525880248
1025	NC_021825	AGT	2	6	54344	54349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880248
1026	NC_021825	T	6	6	54360	54365	0 %	100 %	0 %	0 %	525880248
1027	NC_021825	ATA	2	6	54415	54420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880248
1028	NC_021825	AATC	2	8	54432	54439	50 %	25 %	0 %	25 %	525880248
1029	NC_021825	GCC	3	9	54445	54453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880248
1030	NC_021825	CAT	2	6	54471	54476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880248
1031	NC_021825	TCT	2	6	54524	54529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880248
1032	NC_021825	TAA	2	6	54535	54540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880248
1033	NC_021825	A	6	6	54539	54544	100 %	0 %	0 %	0 %	525880248
1034	NC_021825	TCT	2	6	54697	54702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880249
1035	NC_021825	CTTT	2	8	54716	54723	0 %	75 %	0 %	25 %	525880249
1036	NC_021825	TTC	2	6	54739	54744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880249
1037	NC_021825	AATT	2	8	54765	54772	50 %	50 %	0 %	0 %	525880249
1038	NC_021825	T	6	6	54849	54854	0 %	100 %	0 %	0 %	525880249
1039	NC_021825	T	6	6	54872	54877	0 %	100 %	0 %	0 %	525880249
1040	NC_021825	T	6	6	54894	54899	0 %	100 %	0 %	0 %	525880249
1041	NC_021825	CCTCT	2	10	54949	54958	0 %	40 %	0 %	60 %	525880250
1042	NC_021825	T	6	6	54964	54969	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1043	NC_021825	TCTT	2	8	54977	54984	0 %	75 %	0 %	25 %	525880250
1044	NC_021825	TGCT	2	8	54985	54992	0 %	50 %	25 %	25 %	525880250
1045	NC_021825	TCT	2	6	55001	55006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880250
1046	NC_021825	TA	3	6	55096	55101	50 %	50 %	0 %	0 %	525880250
1047	NC_021825	GCT	2	6	55110	55115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880250
1048	NC_021825	T	7	7	55130	55136	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1049	NC_021825	T	6	6	55186	55191	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1050	NC_021825	T	6	6	55224	55229	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1051	NC_021825	CAT	2	6	55230	55235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880250
1052	NC_021825	T	7	7	55237	55243	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1053	NC_021825	T	6	6	55288	55293	0 %	100 %	0 %	0 %	525880250
1054	NC_021825	CAT	2	6	55327	55332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880250
1055	NC_021825	ATT	2	6	55348	55353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877722
1056	NC_021825	T	6	6	55375	55380	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1057	NC_021825	CTT	2	6	55429	55434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1058	NC_021825	TGT	2	6	55441	55446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1059	NC_021825	T	6	6	55498	55503	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1060	NC_021825	TA	3	6	55540	55545	50 %	50 %	0 %	0 %	525877722
1061	NC_021825	GCA	2	6	55647	55652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1062	NC_021825	TAG	2	6	55667	55672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877722
1063	NC_021825	TACA	2	8	55673	55680	50 %	25 %	0 %	25 %	525877722
1064	NC_021825	TTC	2	6	55691	55696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1065	NC_021825	ACAT	2	8	55698	55705	50 %	25 %	0 %	25 %	525877722
1066	NC_021825	TCT	2	6	55755	55760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1067	NC_021825	TA	3	6	55824	55829	50 %	50 %	0 %	0 %	525877722
1068	NC_021825	GTT	2	6	55835	55840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1069	NC_021825	T	6	6	56176	56181	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1070	NC_021825	AAT	2	6	56183	56188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1071	NC_021825	TTC	2	6	56273	56278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1072	NC_021825	CTT	2	6	56307	56312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1073	NC_021825	ATAA	2	8	56331	56338	75 %	25 %	0 %	0 %	525877722
1074	NC_021825	CTT	2	6	56530	56535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1075	NC_021825	CGA	2	6	56622	56627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1076	NC_021825	T	6	6	56687	56692	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1077	NC_021825	GTA	2	6	56698	56703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877722
1078	NC_021825	TAAA	2	8	56726	56733	75 %	25 %	0 %	0 %	525877722
1079	NC_021825	ATTGTT	2	12	56772	56783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525877722
1080	NC_021825	AATT	2	8	56848	56855	50 %	50 %	0 %	0 %	525877722
1081	NC_021825	GTT	2	6	56917	56922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1082	NC_021825	TCC	2	6	56982	56987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525877722
1083	NC_021825	GGC	2	6	56991	56996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525877722
1084	NC_021825	ATCA	2	8	57053	57060	50 %	25 %	0 %	25 %	525877722
1085	NC_021825	ATC	2	6	57092	57097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877722
1086	NC_021825	CTT	2	6	57098	57103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1087	NC_021825	TCG	2	6	57166	57171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1088	NC_021825	CAC	2	6	57214	57219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525877722
1089	NC_021825	TTA	2	6	57252	57257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877722
1090	NC_021825	CTG	2	6	57295	57300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1091	NC_021825	ACG	2	6	57393	57398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1092	NC_021825	GTT	2	6	57487	57492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1093	NC_021825	TTGT	2	8	57560	57567	0 %	75 %	25 %	0 %	525877722
1094	NC_021825	GC	3	6	57670	57675	0 %	0 %	50 %	50 %	525877722
1095	NC_021825	CCG	2	6	57735	57740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525877722
1096	NC_021825	GTT	2	6	57840	57845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1097	NC_021825	GCG	2	6	58066	58071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525877722
1098	NC_021825	CTT	2	6	58090	58095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1099	NC_021825	CTG	2	6	58105	58110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1100	NC_021825	AAT	2	6	58160	58165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1101	NC_021825	GAA	2	6	58280	58285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525877722
1102	NC_021825	TCG	2	6	58317	58322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1103	NC_021825	CG	3	6	58438	58443	0 %	0 %	50 %	50 %	525877722
1104	NC_021825	CTTCT	2	10	58526	58535	0 %	60 %	0 %	40 %	525877722
1105	NC_021825	TAA	2	6	58549	58554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1106	NC_021825	ATA	2	6	58565	58570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1107	NC_021825	GTT	2	6	58609	58614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1108	NC_021825	ATTG	2	8	58685	58692	25 %	50 %	25 %	0 %	525877722
1109	NC_021825	CTT	2	6	58720	58725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
1110	NC_021825	CGA	2	6	58771	58776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1111	NC_021825	TCG	2	6	58791	58796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1112	NC_021825	ATG	2	6	58826	58831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877722
1113	NC_021825	T	6	6	58840	58845	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1114	NC_021825	T	6	6	58876	58881	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1115	NC_021825	GTT	2	6	58993	58998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877722
1116	NC_021825	T	6	6	59015	59020	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1117	NC_021825	CTG	2	6	59062	59067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877722
1118	NC_021825	ATA	3	9	59082	59090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1119	NC_021825	CCA	2	6	59134	59139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525877722
1120	NC_021825	GGT	2	6	59148	59153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525877722
1121	NC_021825	AAT	2	6	59156	59161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1122	NC_021825	TTAA	2	8	59163	59170	50 %	50 %	0 %	0 %	525877722
1123	NC_021825	T	6	6	59218	59223	0 %	100 %	0 %	0 %	525877722
1124	NC_021825	AAT	2	6	59240	59245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877722
1125	NC_021825	GGT	2	6	59257	59262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525877722
1126	NC_021825	CGAA	2	8	59281	59288	50 %	0 %	25 %	25 %	525877722
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1128	NC_021825	TCT	2	6	59355	59360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877722
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