MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-1091

Total Repeats: 59345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021825	CTT	2	6	26391	26396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880215
502	NC_021825	AAC	2	6	26404	26409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525880215
503	NC_021825	CAT	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880215
504	NC_021825	T	6	6	26624	26629	0 %	100 %	0 %	0 %	525880215
505	NC_021825	TC	4	8	26655	26662	0 %	50 %	0 %	50 %	525880215
506	NC_021825	CTA	2	6	26844	26849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880217
507	NC_021825	CTA	2	6	26859	26864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880217
508	NC_021825	CAAA	2	8	26916	26923	75 %	0 %	0 %	25 %	525880217
509	NC_021825	TTTG	2	8	26982	26989	0 %	75 %	25 %	0 %	525880217
510	NC_021825	CTAC	2	8	27124	27131	25 %	25 %	0 %	50 %	525880218
511	NC_021825	TAA	2	6	27148	27153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
512	NC_021825	A	6	6	27180	27185	100 %	0 %	0 %	0 %	525880218
513	NC_021825	ATA	2	6	27192	27197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
514	NC_021825	TC	4	8	27205	27212	0 %	50 %	0 %	50 %	525880218
515	NC_021825	GCAA	2	8	27241	27248	50 %	0 %	25 %	25 %	525880218
516	NC_021825	ATT	2	6	27261	27266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880218
517	NC_021825	TAA	2	6	27318	27323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880218
518	NC_021825	TCT	2	6	27355	27360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880218
519	NC_021825	A	6	6	27376	27381	100 %	0 %	0 %	0 %	525880218
520	NC_021825	TAC	3	9	27399	27407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880218
521	NC_021825	TAG	2	6	27446	27451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525880218
522	NC_021825	ATT	2	6	27454	27459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880218
523	NC_021825	ACCA	2	8	27515	27522	50 %	0 %	0 %	50 %	525880218
524	NC_021825	T	6	6	27564	27569	0 %	100 %	0 %	0 %	525880218
525	NC_021825	CTC	3	9	27584	27592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880219
526	NC_021825	TAA	2	6	27678	27683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880219
527	NC_021825	AAT	2	6	27743	27748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880219
528	NC_021825	TCA	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880219
529	NC_021825	TCC	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880220
530	NC_021825	TCT	2	6	27853	27858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880220
531	NC_021825	TCA	2	6	27935	27940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880220
532	NC_021825	AAAT	2	8	27984	27991	75 %	25 %	0 %	0 %	525880220
533	NC_021825	CCA	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525880220
534	NC_021825	GTC	2	6	28126	28131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877711
535	NC_021825	TTC	2	6	28200	28205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877711
536	NC_021825	ATT	2	6	28216	28221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877711
537	NC_021825	AGT	2	6	28222	28227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877711
538	NC_021825	CAA	2	6	28325	28330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877712
539	NC_021825	TTCTT	2	10	28368	28377	0 %	80 %	0 %	20 %	525877712
540	NC_021825	AATATC	2	12	28379	28390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525877712
541	NC_021825	AT	3	6	28416	28421	50 %	50 %	0 %	0 %	525877712
542	NC_021825	ATTTT	3	15	28473	28487	20 %	80 %	0 %	0 %	525877712
543	NC_021825	TTCTG	2	10	28523	28532	0 %	60 %	20 %	20 %	525877712
544	NC_021825	CAA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877712
545	NC_021825	T	7	7	28777	28783	0 %	100 %	0 %	0 %	525877712
546	NC_021825	CATAGC	2	12	28792	28803	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525877712
547	NC_021825	T	6	6	28804	28809	0 %	100 %	0 %	0 %	525877712
548	NC_021825	CTTT	2	8	28898	28905	0 %	75 %	0 %	25 %	525880221
549	NC_021825	TGT	2	6	28926	28931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
550	NC_021825	TTGTT	2	10	28941	28950	0 %	80 %	20 %	0 %	525880221
551	NC_021825	CTT	3	9	28985	28993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525880221
552	NC_021825	TGT	2	6	29012	29017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
553	NC_021825	GTT	2	6	29057	29062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
554	NC_021825	TTA	2	6	29125	29130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880221
555	NC_021825	ATC	2	6	29214	29219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
556	NC_021825	CAAG	2	8	29224	29231	50 %	0 %	25 %	25 %	525880221
557	NC_021825	CAT	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
558	NC_021825	TGT	4	12	29306	29317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
559	NC_021825	GTT	2	6	29353	29358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
560	NC_021825	TGTT	2	8	29362	29369	0 %	75 %	25 %	0 %	525880221
561	NC_021825	GT	3	6	29408	29413	0 %	50 %	50 %	0 %	525880221
562	NC_021825	TTG	2	6	29477	29482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880221
563	NC_021825	CCACTC	2	12	29628	29639	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525880221
564	NC_021825	CAT	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525880221
565	NC_021825	T	6	6	29684	29689	0 %	100 %	0 %	0 %	525880221
566	NC_021825	TTTC	2	8	29720	29727	0 %	75 %	0 %	25 %	525880221
567	NC_021825	ACCC	2	8	29746	29753	25 %	0 %	0 %	75 %	525880221
568	NC_021825	T	7	7	29980	29986	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
569	NC_021825	T	6	6	30005	30010	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
570	NC_021825	T	6	6	30079	30084	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
571	NC_021825	ATTA	2	8	30092	30099	50 %	50 %	0 %	0 %	525877713
572	NC_021825	CAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877713
573	NC_021825	TTG	2	6	30141	30146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877713
574	NC_021825	TTC	2	6	30164	30169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877713
575	NC_021825	AAC	2	6	30374	30379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525877713
576	NC_021825	T	6	6	30394	30399	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
577	NC_021825	GTC	2	6	30407	30412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525877713
578	NC_021825	T	6	6	30455	30460	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
579	NC_021825	T	6	6	30573	30578	0 %	100 %	0 %	0 %	525877713
580	NC_021825	ATT	2	6	30597	30602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877713
581	NC_021825	T	6	6	30649	30654	0 %	100 %	0 %	0 %	525877714
582	NC_021825	TTC	2	6	30670	30675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877714
583	NC_021825	TAA	2	6	30705	30710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877714
584	NC_021825	CTT	2	6	30756	30761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877714
585	NC_021825	ATT	2	6	30778	30783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877714
586	NC_021825	TTTC	3	12	30789	30800	0 %	75 %	0 %	25 %	525877714
587	NC_021825	T	7	7	30862	30868	0 %	100 %	0 %	0 %	525877714
588	NC_021825	CGTT	2	8	30969	30976	0 %	50 %	25 %	25 %	525877714
589	NC_021825	ATT	2	6	31001	31006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877714
590	NC_021825	TGAT	2	8	31007	31014	25 %	50 %	25 %	0 %	525877714
591	NC_021825	TTTC	2	8	31035	31042	0 %	75 %	0 %	25 %	525877714
592	NC_021825	AAAT	2	8	31044	31051	75 %	25 %	0 %	0 %	525877714
593	NC_021825	TCC	2	6	31057	31062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525877714
594	NC_021825	GCTTT	2	10	31082	31091	0 %	60 %	20 %	20 %	525877714
595	NC_021825	ATGCTG	2	12	31173	31184	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525877714
596	NC_021825	ACCA	2	8	31210	31217	50 %	0 %	0 %	50 %	525877714
597	NC_021825	CAT	2	6	31267	31272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877714
598	NC_021825	CTT	2	6	31326	31331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877714
599	NC_021825	ATG	2	6	31439	31444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877714
600	NC_021825	TCTTT	2	10	31536	31545	0 %	80 %	0 %	20 %	525877714
601	NC_021825	AT	3	6	31556	31561	50 %	50 %	0 %	0 %	525877714
602	NC_021825	T	6	6	31712	31717	0 %	100 %	0 %	0 %	525877715
603	NC_021825	CATC	2	8	31786	31793	25 %	25 %	0 %	50 %	525877715
604	NC_021825	CCT	2	6	31803	31808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525880222
605	NC_021825	TGT	2	6	31848	31853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880222
606	NC_021825	CTG	2	6	31882	31887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525880222
607	NC_021825	TTG	2	6	31980	31985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880222
608	NC_021825	T	7	7	32067	32073	0 %	100 %	0 %	0 %	525880223
609	NC_021825	CCG	2	6	32136	32141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525880223
610	NC_021825	T	7	7	32207	32213	0 %	100 %	0 %	0 %	525880224
611	NC_021825	TGT	2	6	32243	32248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880224
612	NC_021825	TTA	2	6	32607	32612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525880224
613	NC_021825	CTAT	2	8	32630	32637	25 %	50 %	0 %	25 %	525880224
614	NC_021825	TGCG	2	8	32651	32658	0 %	25 %	50 %	25 %	525880224
615	NC_021825	TTG	2	6	32685	32690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525880224
616	NC_021825	ATA	2	6	32711	32716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525880224
617	NC_021825	TTGT	2	8	32847	32854	0 %	75 %	25 %	0 %	525877716
618	NC_021825	AAT	2	6	32863	32868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525877716
619	NC_021825	T	6	6	32957	32962	0 %	100 %	0 %	0 %	525877716
620	NC_021825	TAT	2	6	33002	33007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525877716
621	NC_021825	TTTA	2	8	33018	33025	25 %	75 %	0 %	0 %	525877716
622	NC_021825	TAG	2	6	33098	33103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525877716
623	NC_021825	ACT	2	6	33157	33162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525877716
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625	NC_021825	T	6	6	33225	33230	0 %	100 %	0 %	0 %	525877716
626	NC_021825	TCT	2	6	33247	33252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525877716
627	NC_021825	GTT	2	6	33345	33350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525877716
628	NC_021825	A	6	6	33388	33393	100 %	0 %	0 %	0 %	525877716
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630	NC_021825	TA	3	6	33479	33484	50 %	50 %	0 %	0 %	525877716
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