MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021824	TGT	2	6	26603	26608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869785
502	NC_021824	TGG	3	9	27161	27169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525869786
503	NC_021824	TGC	2	6	27185	27190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869786
504	NC_021824	ATA	2	6	27225	27230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869786
505	NC_021824	AT	3	6	27281	27286	50 %	50 %	0 %	0 %	525869786
506	NC_021824	CTG	2	6	27307	27312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869786
507	NC_021824	TAA	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869786
508	NC_021824	CAA	2	6	27345	27350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869786
509	NC_021824	ATC	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869786
510	NC_021824	GAA	2	6	27437	27442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869786
511	NC_021824	TTA	3	9	27466	27474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869786
512	NC_021824	CATT	2	8	27545	27552	25 %	50 %	0 %	25 %	525869786
513	NC_021824	TCA	2	6	27556	27561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869786
514	NC_021824	GTC	2	6	27583	27588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869786
515	NC_021824	TCG	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869786
516	NC_021824	AAG	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869786
517	NC_021824	TCA	2	6	27850	27855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869786
518	NC_021824	GTTTC	2	10	27865	27874	0 %	60 %	20 %	20 %	525869786
519	NC_021824	GTAAA	2	10	27997	28006	60 %	20 %	20 %	0 %	525869786
520	NC_021824	TAA	2	6	28046	28051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869786
521	NC_021824	AAC	2	6	28117	28122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869786
522	NC_021824	AATG	2	8	28205	28212	50 %	25 %	25 %	0 %	525869787
523	NC_021824	TAG	2	6	28252	28257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869787
524	NC_021824	TTCG	2	8	28284	28291	0 %	50 %	25 %	25 %	525869787
525	NC_021824	A	7	7	28364	28370	100 %	0 %	0 %	0 %	525869787
526	NC_021824	ATG	2	6	28387	28392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869787
527	NC_021824	CAG	2	6	28414	28419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869787
528	NC_021824	GGT	2	6	28425	28430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525869787
529	NC_021824	TCA	2	6	28519	28524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869787
530	NC_021824	ATT	2	6	28579	28584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869787
531	NC_021824	AGC	2	6	28598	28603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869787
532	NC_021824	GAA	2	6	28608	28613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869787
533	NC_021824	AAG	2	6	28619	28624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869787
534	NC_021824	GAT	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869787
535	NC_021824	CG	3	6	28723	28728	0 %	0 %	50 %	50 %	525869787
536	NC_021824	TTA	2	6	28744	28749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869787
537	NC_021824	AC	3	6	28807	28812	50 %	0 %	0 %	50 %	525869787
538	NC_021824	T	7	7	28823	28829	0 %	100 %	0 %	0 %	525869787
539	NC_021824	TAA	2	6	28833	28838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869787
540	NC_021824	TA	4	8	28907	28914	50 %	50 %	0 %	0 %	525869788
541	NC_021824	TTC	2	6	28926	28931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869788
542	NC_021824	CAAA	2	8	28970	28977	75 %	0 %	0 %	25 %	525869788
543	NC_021824	TCG	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869788
544	NC_021824	ATC	2	6	29034	29039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869788
545	NC_021824	ATT	2	6	29082	29087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869788
546	NC_021824	CGGT	2	8	29158	29165	0 %	25 %	50 %	25 %	525869789
547	NC_021824	CGG	2	6	29295	29300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869789
548	NC_021824	CCA	2	6	29321	29326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869789
549	NC_021824	AAT	2	6	30550	30555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869790
550	NC_021824	GCA	2	6	30608	30613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869790
551	NC_021824	GTA	2	6	30623	30628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869790
552	NC_021824	AGT	2	6	30805	30810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869790
553	NC_021824	CAAAC	2	10	30834	30843	60 %	0 %	0 %	40 %	525869790
554	NC_021824	GAA	2	6	30886	30891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869790
555	NC_021824	TTG	2	6	30894	30899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869790
556	NC_021824	TAC	2	6	30904	30909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869790
557	NC_021824	GAA	2	6	30953	30958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869790
558	NC_021824	GAA	2	6	31079	31084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869790
559	NC_021824	A	6	6	31088	31093	100 %	0 %	0 %	0 %	525869790
560	NC_021824	ATC	2	6	31153	31158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869790
561	NC_021824	TTTA	2	8	31254	31261	25 %	75 %	0 %	0 %	525869790
562	NC_021824	AAC	2	6	31268	31273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869790
563	NC_021824	ATA	3	9	31329	31337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869790
564	NC_021824	T	6	6	31367	31372	0 %	100 %	0 %	0 %	525869790
565	NC_021824	AAC	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869790
566	NC_021824	AAG	2	6	31452	31457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869790
567	NC_021824	A	6	6	31503	31508	100 %	0 %	0 %	0 %	525869790
568	NC_021824	ATA	2	6	31551	31556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869790
569	NC_021824	A	6	6	31797	31802	100 %	0 %	0 %	0 %	525869790
570	NC_021824	ACTA	2	8	31808	31815	50 %	25 %	0 %	25 %	525869790
571	NC_021824	AC	3	6	31959	31964	50 %	0 %	0 %	50 %	525869790
572	NC_021824	CCAA	2	8	32036	32043	50 %	0 %	0 %	50 %	525869790
573	NC_021824	AC	3	6	32163	32168	50 %	0 %	0 %	50 %	525869790
574	NC_021824	AC	3	6	32367	32372	50 %	0 %	0 %	50 %	525869790
575	NC_021824	CCAA	2	8	32444	32451	50 %	0 %	0 %	50 %	525869790
576	NC_021824	AAG	2	6	32712	32717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869790
577	NC_021824	A	6	6	32726	32731	100 %	0 %	0 %	0 %	525869790
578	NC_021824	AAAAC	2	10	32739	32748	80 %	0 %	0 %	20 %	525869790
579	NC_021824	AAAC	2	8	32767	32774	75 %	0 %	0 %	25 %	525869790
580	NC_021824	AGCA	2	8	32779	32786	50 %	0 %	25 %	25 %	525869790
581	NC_021824	A	6	6	32801	32806	100 %	0 %	0 %	0 %	525869790
582	NC_021824	CAAA	2	8	32807	32814	75 %	0 %	0 %	25 %	525869790
583	NC_021824	CAA	2	6	32837	32842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869790
584	NC_021824	AAAT	2	8	32920	32927	75 %	25 %	0 %	0 %	525869790
585	NC_021824	GAA	2	6	33096	33101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869791
586	NC_021824	A	6	6	33131	33136	100 %	0 %	0 %	0 %	525869791
587	NC_021824	TCCG	2	8	33139	33146	0 %	25 %	25 %	50 %	525869791
588	NC_021824	CA	3	6	33188	33193	50 %	0 %	0 %	50 %	525869791
589	NC_021824	ACT	2	6	33215	33220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869791
590	NC_021824	A	6	6	33289	33294	100 %	0 %	0 %	0 %	525869791
591	NC_021824	GTT	2	6	33312	33317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869791
592	NC_021824	T	6	6	33322	33327	0 %	100 %	0 %	0 %	525869791
593	NC_021824	A	6	6	33437	33442	100 %	0 %	0 %	0 %	525869792
594	NC_021824	TGA	2	6	33510	33515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869792
595	NC_021824	TAT	2	6	33530	33535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869792
596	NC_021824	TTC	2	6	33599	33604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869792
597	NC_021824	TGATG	2	10	33648	33657	20 %	40 %	40 %	0 %	525869792
598	NC_021824	TGA	2	6	33705	33710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869792
599	NC_021824	CGA	2	6	33726	33731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869792
600	NC_021824	CA	3	6	33853	33858	50 %	0 %	0 %	50 %	525869792
601	NC_021824	GAT	2	6	33865	33870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869792
602	NC_021824	TTG	2	6	33872	33877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869792
603	NC_021824	ACG	2	6	33923	33928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869792
604	NC_021824	TTAA	2	8	33935	33942	50 %	50 %	0 %	0 %	525869792
605	NC_021824	TCC	2	6	33971	33976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525869793
606	NC_021824	TTTC	2	8	33990	33997	0 %	75 %	0 %	25 %	525869793
607	NC_021824	GAAC	2	8	34040	34047	50 %	0 %	25 %	25 %	525869793
608	NC_021824	TCA	2	6	34076	34081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869793
609	NC_021824	CATC	2	8	34111	34118	25 %	25 %	0 %	50 %	525869793
610	NC_021824	AAG	2	6	34177	34182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869793
611	NC_021824	AAT	2	6	34198	34203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869793
612	NC_021824	CTT	2	6	34248	34253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869793
613	NC_021824	CAA	2	6	34263	34268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869793
614	NC_021824	TCT	2	6	34283	34288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869793
615	NC_021824	CCG	2	6	34310	34315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525869793
616	NC_021824	TGC	2	6	34352	34357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869793
617	NC_021824	TAA	2	6	34413	34418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869793
618	NC_021824	ATA	2	6	34496	34501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869793
619	NC_021824	ATCTTC	2	12	34510	34521	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525869793
620	NC_021824	ATATG	2	10	34535	34544	40 %	40 %	20 %	0 %	525869793
621	NC_021824	CTT	2	6	34626	34631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869793
622	NC_021824	AAT	2	6	34720	34725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869793
623	NC_021824	TCGG	2	8	34733	34740	0 %	25 %	50 %	25 %	525869793
624	NC_021824	TGTT	2	8	34762	34769	0 %	75 %	25 %	0 %	525869793
625	NC_021824	GC	3	6	34858	34863	0 %	0 %	50 %	50 %	525869793
626	NC_021824	AAATCG	2	12	34965	34976	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525869793
627	NC_021824	TTG	2	6	35037	35042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869793
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629	NC_021824	TCAT	2	8	35108	35115	25 %	50 %	0 %	25 %	525869793
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