MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021824	TAG	2	6	261911	261916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870013
5002	NC_021824	T	6	6	261939	261944	0 %	100 %	0 %	0 %	525870013
5003	NC_021824	AGT	2	6	262051	262056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870013
5004	NC_021824	CGA	2	6	262105	262110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870013
5005	NC_021824	TAA	2	6	262160	262165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870013
5006	NC_021824	GAT	2	6	262206	262211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870013
5007	NC_021824	AGT	2	6	262305	262310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870013
5008	NC_021824	GTTT	2	8	262340	262347	0 %	75 %	25 %	0 %	525870013
5009	NC_021824	CT	3	6	262358	262363	0 %	50 %	0 %	50 %	525870013
5010	NC_021824	TCT	2	6	262412	262417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870013
5011	NC_021824	TGC	2	6	262437	262442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870013
5012	NC_021824	TTACTG	2	12	262448	262459	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525870013
5013	NC_021824	TTA	2	6	262561	262566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870014
5014	NC_021824	TG	3	6	262662	262667	0 %	50 %	50 %	0 %	525870014
5015	NC_021824	CGCA	2	8	262711	262718	25 %	0 %	25 %	50 %	525870014
5016	NC_021824	CTG	2	6	262806	262811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870014
5017	NC_021824	ACGAAT	2	12	262846	262857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525870014
5018	NC_021824	T	6	6	262857	262862	0 %	100 %	0 %	0 %	525870014
5019	NC_021824	CCT	2	6	263343	263348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525870015
5020	NC_021824	TTC	2	6	263381	263386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870015
5021	NC_021824	ACA	2	6	263430	263435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870015
5022	NC_021824	CGT	2	6	263639	263644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870015
5023	NC_021824	CAT	2	6	263666	263671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870015
5024	NC_021824	AAAT	2	8	263751	263758	75 %	25 %	0 %	0 %	525870015
5025	NC_021824	TAC	2	6	263789	263794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870015
5026	NC_021824	TAAA	2	8	263797	263804	75 %	25 %	0 %	0 %	525870015
5027	NC_021824	AAC	2	6	263883	263888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870015
5028	NC_021824	CCA	2	6	263906	263911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870015
5029	NC_021824	AAAAT	2	10	263923	263932	80 %	20 %	0 %	0 %	525870015
5030	NC_021824	ATA	2	6	263939	263944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870015
5031	NC_021824	TTCG	2	8	263961	263968	0 %	50 %	25 %	25 %	525870015
5032	NC_021824	GTT	2	6	264063	264068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870016
5033	NC_021824	ATTA	2	8	264109	264116	50 %	50 %	0 %	0 %	525870016
5034	NC_021824	TTA	2	6	264207	264212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870016
5035	NC_021824	AAG	2	6	264236	264241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870016
5036	NC_021824	AAC	2	6	264256	264261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870016
5037	NC_021824	ATA	2	6	264280	264285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870016
5038	NC_021824	ATA	2	6	264297	264302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870016
5039	NC_021824	TA	3	6	264322	264327	50 %	50 %	0 %	0 %	525870016
5040	NC_021824	GT	3	6	264336	264341	0 %	50 %	50 %	0 %	525870016
5041	NC_021824	GAT	2	6	264345	264350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870016
5042	NC_021824	ATT	2	6	264379	264384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870016
5043	NC_021824	AAT	2	6	264442	264447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870016
5044	NC_021824	CGT	2	6	264510	264515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870016
5045	NC_021824	AAG	2	6	264536	264541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870016
5046	NC_021824	A	6	6	264570	264575	100 %	0 %	0 %	0 %	525870016
5047	NC_021824	TA	3	6	264618	264623	50 %	50 %	0 %	0 %	525870016
5048	NC_021824	GAA	2	6	264712	264717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870016
5049	NC_021824	TAA	2	6	264735	264740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870016
5050	NC_021824	TTA	2	6	264836	264841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870016
5051	NC_021824	TGT	2	6	264847	264852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870016
5052	NC_021824	CATAT	2	10	264910	264919	40 %	40 %	0 %	20 %	525870016
5053	NC_021824	ACA	2	6	264926	264931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870016
5054	NC_021824	CAAC	2	8	264984	264991	50 %	0 %	0 %	50 %	525870016
5055	NC_021824	T	7	7	265099	265105	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5056	NC_021824	T	6	6	265174	265179	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5057	NC_021824	TGA	2	6	265188	265193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870017
5058	NC_021824	T	6	6	265291	265296	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5059	NC_021824	TGA	2	6	265361	265366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870017
5060	NC_021824	TTG	2	6	265496	265501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870017
5061	NC_021824	GTT	2	6	265510	265515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870017
5062	NC_021824	GTT	2	6	265556	265561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870017
5063	NC_021824	CTT	2	6	265641	265646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870017
5064	NC_021824	TCAT	2	8	265673	265680	25 %	50 %	0 %	25 %	525870017
5065	NC_021824	TAAT	3	12	265694	265705	50 %	50 %	0 %	0 %	525870017
5066	NC_021824	GC	3	6	265741	265746	0 %	0 %	50 %	50 %	525870017
5067	NC_021824	ACC	2	6	265804	265809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870017
5068	NC_021824	CTT	2	6	265833	265838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870017
5069	NC_021824	AGT	2	6	265845	265850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870017
5070	NC_021824	T	6	6	265876	265881	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5071	NC_021824	T	6	6	265917	265922	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5072	NC_021824	TCGA	2	8	265963	265970	25 %	25 %	25 %	25 %	525870017
5073	NC_021824	TCT	2	6	265988	265993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870017
5074	NC_021824	TAC	2	6	266020	266025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870017
5075	NC_021824	T	7	7	266071	266077	0 %	100 %	0 %	0 %	525870017
5076	NC_021824	ACA	2	6	266129	266134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870017
5077	NC_021824	ATT	3	9	266156	266164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870017
5078	NC_021824	TTC	2	6	266171	266176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870017
5079	NC_021824	ATT	2	6	266341	266346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870018
5080	NC_021824	CTA	2	6	266353	266358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870018
5081	NC_021824	GCA	2	6	266397	266402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5082	NC_021824	AGA	2	6	266438	266443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870018
5083	NC_021824	TAG	2	6	266446	266451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870018
5084	NC_021824	GCA	2	6	266472	266477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5085	NC_021824	CAA	2	6	266491	266496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870018
5086	NC_021824	TAC	2	6	266657	266662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870018
5087	NC_021824	TTC	2	6	266687	266692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870018
5088	NC_021824	GTT	2	6	266726	266731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870018
5089	NC_021824	GCT	2	6	266763	266768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5090	NC_021824	TGA	2	6	266791	266796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870018
5091	NC_021824	AGA	2	6	266804	266809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870018
5092	NC_021824	ACT	2	6	266826	266831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870018
5093	NC_021824	TGC	2	6	266840	266845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5094	NC_021824	GATT	2	8	266847	266854	25 %	50 %	25 %	0 %	525870018
5095	NC_021824	GTC	2	6	267041	267046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5096	NC_021824	TTCTT	2	10	267051	267060	0 %	80 %	0 %	20 %	525870018
5097	NC_021824	TGTT	2	8	267119	267126	0 %	75 %	25 %	0 %	525870018
5098	NC_021824	TGC	2	6	267151	267156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5099	NC_021824	GTC	2	6	267158	267163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870018
5100	NC_021824	CTA	2	6	267178	267183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870018
5101	NC_021824	TAA	2	6	267185	267190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870018
5102	NC_021824	T	6	6	267227	267232	0 %	100 %	0 %	0 %	525870018
5103	NC_021824	GCT	2	6	267740	267745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870019
5104	NC_021824	AAGA	2	8	267767	267774	75 %	0 %	25 %	0 %	525870019
5105	NC_021824	ATCG	2	8	267797	267804	25 %	25 %	25 %	25 %	525870019
5106	NC_021824	ATG	2	6	267821	267826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870019
5107	NC_021824	TGG	2	6	267847	267852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870019
5108	NC_021824	CGT	2	6	267887	267892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870019
5109	NC_021824	A	6	6	267953	267958	100 %	0 %	0 %	0 %	525870019
5110	NC_021824	AAC	2	6	267964	267969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870019
5111	NC_021824	GAA	2	6	268109	268114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870019
5112	NC_021824	GTT	2	6	268175	268180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870019
5113	NC_021824	GTA	2	6	268286	268291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870019
5114	NC_021824	GCT	2	6	268295	268300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870019
5115	NC_021824	CAA	2	6	268302	268307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870019
5116	NC_021824	AGA	2	6	268325	268330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870019
5117	NC_021824	A	6	6	268361	268366	100 %	0 %	0 %	0 %	525870019
5118	NC_021824	GCT	2	6	268388	268393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870019
5119	NC_021824	CAA	2	6	268446	268451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870019
5120	NC_021824	CTG	2	6	268467	268472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870019
5121	NC_021824	AT	3	6	268546	268551	50 %	50 %	0 %	0 %	525870019
5122	NC_021824	TGAAGA	2	12	268603	268614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525870019
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5245	NC_021824	CGT	2	6	274951	274956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870025
5246	NC_021824	CTT	2	6	274987	274992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870025
5247	NC_021824	TAA	2	6	275027	275032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870025
5248	NC_021824	TTA	2	6	275055	275060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870025
5249	NC_021824	TTC	2	6	275102	275107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870026
5250	NC_021824	TTCG	2	8	275112	275119	0 %	50 %	25 %	25 %	525870026
5251	NC_021824	GTT	2	6	275193	275198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870026
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5254	NC_021824	CTT	2	6	275365	275370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870026
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5262	NC_021824	CTG	2	6	275632	275637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870026
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5269	NC_021824	CTG	2	6	275843	275848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870027
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5274	NC_021824	CACT	2	8	276170	276177	25 %	25 %	0 %	50 %	525870027
5275	NC_021824	TA	3	6	276203	276208	50 %	50 %	0 %	0 %	525870027
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5279	NC_021824	GTTTT	2	10	276437	276446	0 %	80 %	20 %	0 %	525870027
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5285	NC_021824	AT	3	6	276628	276633	50 %	50 %	0 %	0 %	525870028
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5359	NC_021824	T	7	7	280642	280648	0 %	100 %	0 %	0 %	525870032
5360	NC_021824	TAT	2	6	280662	280667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870032
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5368	NC_021824	GAT	2	6	280942	280947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870032
5369	NC_021824	T	6	6	280947	280952	0 %	100 %	0 %	0 %	525870032
5370	NC_021824	CAG	2	6	280977	280982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870032
5371	NC_021824	CAT	3	9	280986	280994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870032
5372	NC_021824	TGAT	2	8	281045	281052	25 %	50 %	25 %	0 %	525870032
5373	NC_021824	TGC	2	6	281069	281074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870032
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5377	NC_021824	TCG	2	6	281204	281209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870032
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5379	NC_021824	T	6	6	281288	281293	0 %	100 %	0 %	0 %	525870032
5380	NC_021824	ATC	2	6	281294	281299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870032
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5386	NC_021824	A	6	6	281560	281565	100 %	0 %	0 %	0 %	525870032
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5470	NC_021824	T	6	6	285979	285984	0 %	100 %	0 %	0 %	525870036
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