MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021824	TCT	2	6	236284	236289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869974
4502	NC_021824	TA	3	6	236321	236326	50 %	50 %	0 %	0 %	525869974
4503	NC_021824	TGT	2	6	236341	236346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869974
4504	NC_021824	AT	3	6	236356	236361	50 %	50 %	0 %	0 %	525869974
4505	NC_021824	AGG	2	6	236709	236714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525869975
4506	NC_021824	ACT	2	6	236740	236745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869975
4507	NC_021824	CAA	2	6	236749	236754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869975
4508	NC_021824	TGA	2	6	236763	236768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869975
4509	NC_021824	GGAT	2	8	236787	236794	25 %	25 %	50 %	0 %	525869975
4510	NC_021824	CGCT	2	8	236825	236832	0 %	25 %	25 %	50 %	525869975
4511	NC_021824	TAA	2	6	236883	236888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869975
4512	NC_021824	GTCT	2	8	236922	236929	0 %	50 %	25 %	25 %	525869975
4513	NC_021824	CAA	2	6	236957	236962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869975
4514	NC_021824	CA	3	6	237010	237015	50 %	0 %	0 %	50 %	525869975
4515	NC_021824	GC	3	6	237034	237039	0 %	0 %	50 %	50 %	525869975
4516	NC_021824	GGT	2	6	237097	237102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525869975
4517	NC_021824	TAG	2	6	237134	237139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869975
4518	NC_021824	ATT	2	6	237142	237147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869975
4519	NC_021824	AATC	2	8	237199	237206	50 %	25 %	0 %	25 %	525869975
4520	NC_021824	AGC	2	6	237210	237215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869975
4521	NC_021824	TAA	2	6	237285	237290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869975
4522	NC_021824	AAC	2	6	237382	237387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869975
4523	NC_021824	TTGG	2	8	237395	237402	0 %	50 %	50 %	0 %	525869975
4524	NC_021824	ATC	2	6	237431	237436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869975
4525	NC_021824	AGA	2	6	237441	237446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869975
4526	NC_021824	GAT	2	6	237475	237480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869975
4527	NC_021824	A	7	7	237574	237580	100 %	0 %	0 %	0 %	525869975
4528	NC_021824	CG	3	6	237643	237648	0 %	0 %	50 %	50 %	525869975
4529	NC_021824	CTT	2	6	237692	237697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869975
4530	NC_021824	AGTA	2	8	237714	237721	50 %	25 %	25 %	0 %	525869975
4531	NC_021824	A	6	6	237762	237767	100 %	0 %	0 %	0 %	525869975
4532	NC_021824	CAC	2	6	237782	237787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869975
4533	NC_021824	AACTAG	2	12	237809	237820	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525869975
4534	NC_021824	TTG	2	6	237878	237883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869975
4535	NC_021824	AGA	2	6	237930	237935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869975
4536	NC_021824	CAA	2	6	238001	238006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869975
4537	NC_021824	TAT	2	6	238033	238038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869975
4538	NC_021824	ATT	2	6	238044	238049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869975
4539	NC_021824	AGAC	2	8	238101	238108	50 %	0 %	25 %	25 %	525869975
4540	NC_021824	GGAT	2	8	238120	238127	25 %	25 %	50 %	0 %	525869975
4541	NC_021824	TAAA	2	8	238150	238157	75 %	25 %	0 %	0 %	525869975
4542	NC_021824	CCAT	2	8	238216	238223	25 %	25 %	0 %	50 %	525869976
4543	NC_021824	GAA	2	6	238250	238255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869976
4544	NC_021824	TTCT	2	8	238342	238349	0 %	75 %	0 %	25 %	525869976
4545	NC_021824	ATA	2	6	238374	238379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869976
4546	NC_021824	CTA	2	6	238387	238392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869976
4547	NC_021824	TTA	2	6	238458	238463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525869976
4548	NC_021824	CTT	2	6	238516	238521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869976
4549	NC_021824	TGT	2	6	238548	238553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869976
4550	NC_021824	TCC	2	6	238680	238685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525869976
4551	NC_021824	TGA	2	6	238722	238727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869976
4552	NC_021824	AGC	2	6	238731	238736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869976
4553	NC_021824	CTT	2	6	238885	238890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869976
4554	NC_021824	CAG	2	6	238966	238971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869976
4555	NC_021824	AGT	2	6	239169	239174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869977
4556	NC_021824	CTT	2	6	239183	239188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869977
4557	NC_021824	TC	3	6	239266	239271	0 %	50 %	0 %	50 %	525869977
4558	NC_021824	TTC	2	6	239334	239339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869977
4559	NC_021824	ATA	2	6	239429	239434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869977
4560	NC_021824	TCC	2	6	239488	239493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525869977
4561	NC_021824	GAT	2	6	239625	239630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872279
4562	NC_021824	T	6	6	239630	239635	0 %	100 %	0 %	0 %	525872279
4563	NC_021824	GTAT	2	8	239636	239643	25 %	50 %	25 %	0 %	525872279
4564	NC_021824	GTTA	2	8	239688	239695	25 %	50 %	25 %	0 %	525872279
4565	NC_021824	TTATT	2	10	239732	239741	20 %	80 %	0 %	0 %	525872279
4566	NC_021824	TCG	2	6	239749	239754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872279
4567	NC_021824	T	7	7	239809	239815	0 %	100 %	0 %	0 %	525872279
4568	NC_021824	ATT	2	6	239823	239828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872279
4569	NC_021824	A	7	7	240060	240066	100 %	0 %	0 %	0 %	525872280
4570	NC_021824	TTG	2	6	240075	240080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872280
4571	NC_021824	T	6	6	240104	240109	0 %	100 %	0 %	0 %	525872280
4572	NC_021824	GAA	2	6	240141	240146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872280
4573	NC_021824	GAA	2	6	240152	240157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872280
4574	NC_021824	AGAAA	2	10	240158	240167	80 %	0 %	20 %	0 %	525872280
4575	NC_021824	ACT	2	6	240192	240197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872280
4576	NC_021824	TGA	2	6	240206	240211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872280
4577	NC_021824	ATT	2	6	240402	240407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872280
4578	NC_021824	ACA	2	6	240433	240438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872280
4579	NC_021824	AGA	2	6	240464	240469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872280
4580	NC_021824	GGA	2	6	240503	240508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525872280
4581	NC_021824	AAG	3	9	240520	240528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872280
4582	NC_021824	CAG	2	6	240529	240534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872280
4583	NC_021824	TGA	2	6	240557	240562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872280
4584	NC_021824	GAT	2	6	240576	240581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872280
4585	NC_021824	GAA	2	6	240648	240653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872280
4586	NC_021824	TGA	2	6	240815	240820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872280
4587	NC_021824	TAAA	2	8	240847	240854	75 %	25 %	0 %	0 %	525872280
4588	NC_021824	GTTAT	2	10	240889	240898	20 %	60 %	20 %	0 %	525872280
4589	NC_021824	ACG	2	6	241091	241096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869978
4590	NC_021824	CG	3	6	241095	241100	0 %	0 %	50 %	50 %	525869978
4591	NC_021824	T	6	6	241115	241120	0 %	100 %	0 %	0 %	525869978
4592	NC_021824	AGTA	2	8	241145	241152	50 %	25 %	25 %	0 %	525869978
4593	NC_021824	CAG	2	6	241156	241161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869978
4594	NC_021824	ACC	3	9	241247	241255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869978
4595	NC_021824	CAT	2	6	241273	241278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869978
4596	NC_021824	CTA	2	6	241300	241305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869978
4597	NC_021824	GTT	2	6	241309	241314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869978
4598	NC_021824	TAA	2	6	241369	241374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869978
4599	NC_021824	ACG	2	6	241424	241429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869978
4600	NC_021824	ATTA	2	8	241476	241483	50 %	50 %	0 %	0 %	525869979
4601	NC_021824	GTT	2	6	241507	241512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869979
4602	NC_021824	CCA	2	6	241536	241541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525869979
4603	NC_021824	T	6	6	241553	241558	0 %	100 %	0 %	0 %	525869979
4604	NC_021824	AAT	2	6	241560	241565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869979
4605	NC_021824	T	6	6	241581	241586	0 %	100 %	0 %	0 %	525869979
4606	NC_021824	GATA	2	8	241601	241608	50 %	25 %	25 %	0 %	525869979
4607	NC_021824	TAA	2	6	241613	241618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869979
4608	NC_021824	TTGT	2	8	241629	241636	0 %	75 %	25 %	0 %	525869979
4609	NC_021824	GTA	2	6	241691	241696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869979
4610	NC_021824	T	6	6	241712	241717	0 %	100 %	0 %	0 %	525869979
4611	NC_021824	TGA	3	9	241744	241752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869979
4612	NC_021824	GTTT	2	8	241792	241799	0 %	75 %	25 %	0 %	525869979
4613	NC_021824	T	6	6	241797	241802	0 %	100 %	0 %	0 %	525869979
4614	NC_021824	GAA	2	6	241807	241812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525869979
4615	NC_021824	GGC	2	6	242150	242155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525869980
4616	NC_021824	TAAT	2	8	242166	242173	50 %	50 %	0 %	0 %	525869980
4617	NC_021824	TAA	2	6	242191	242196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525869980
4618	NC_021824	ATC	2	6	242209	242214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869980
4619	NC_021824	GA	3	6	242217	242222	50 %	0 %	50 %	0 %	525869980
4620	NC_021824	TCG	2	6	242315	242320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869980
4621	NC_021824	CTT	2	6	242574	242579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869980
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4623	NC_021824	CCGT	2	8	242781	242788	0 %	25 %	25 %	50 %	525869980
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4747	NC_021824	T	6	6	248740	248745	0 %	100 %	0 %	0 %	525869987
4748	NC_021824	CAA	2	6	248766	248771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869987
4749	NC_021824	TGT	2	6	248800	248805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869987
4750	NC_021824	GTA	2	6	248847	248852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525869987
4751	NC_021824	TCA	2	6	249001	249006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869988
4752	NC_021824	CTGTA	2	10	249035	249044	20 %	40 %	20 %	20 %	525869988
4753	NC_021824	GAAC	2	8	249075	249082	50 %	0 %	25 %	25 %	525869988
4754	NC_021824	TTC	2	6	249095	249100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
4755	NC_021824	TCT	2	6	249135	249140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
4756	NC_021824	GTTAA	2	10	249177	249186	40 %	40 %	20 %	0 %	525869988
4757	NC_021824	AGAA	2	8	249206	249213	75 %	0 %	25 %	0 %	525869988
4758	NC_021824	CTT	2	6	249235	249240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869988
4759	NC_021824	CAG	2	6	249406	249411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869988
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4762	NC_021824	TAAT	2	8	249519	249526	50 %	50 %	0 %	0 %	525869988
4763	NC_021824	TAC	2	6	249539	249544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869988
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4765	NC_021824	TCA	2	6	249582	249587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869988
4766	NC_021824	T	6	6	249608	249613	0 %	100 %	0 %	0 %	525869988
4767	NC_021824	GTT	2	6	249630	249635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525869988
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4769	NC_021824	CTG	2	6	249703	249708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869988
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4771	NC_021824	ACG	2	6	249734	249739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869988
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4776	NC_021824	GCT	2	6	250051	250056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869989
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4783	NC_021824	T	6	6	250436	250441	0 %	100 %	0 %	0 %	525869990
4784	NC_021824	ACG	2	6	250468	250473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525869990
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4824	NC_021824	GC	3	6	252818	252823	0 %	0 %	50 %	50 %	525869994
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4830	NC_021824	CAATA	2	10	253122	253131	60 %	20 %	0 %	20 %	525869994
4831	NC_021824	TTGA	2	8	253257	253264	25 %	50 %	25 %	0 %	525869994
4832	NC_021824	T	6	6	253266	253271	0 %	100 %	0 %	0 %	525869994
4833	NC_021824	AAC	2	6	253314	253319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525869994
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4835	NC_021824	ATGTA	2	10	253352	253361	40 %	40 %	20 %	0 %	525869994
4836	NC_021824	T	6	6	253393	253398	0 %	100 %	0 %	0 %	525869994
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4839	NC_021824	GCT	2	6	253462	253467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525869994
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4843	NC_021824	CTT	2	6	253627	253632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869995
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4848	NC_021824	CTT	2	6	254090	254095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869996
4849	NC_021824	ACTT	2	8	254112	254119	25 %	50 %	0 %	25 %	525869996
4850	NC_021824	ATC	2	6	254125	254130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525869996
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4859	NC_021824	CTT	2	6	254616	254621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525869997
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4990	NC_021824	TAAT	2	8	261295	261302	50 %	50 %	0 %	0 %	525870012
4991	NC_021824	TTTCAC	2	12	261391	261402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525870012
4992	NC_021824	TTC	2	6	261512	261517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870012
4993	NC_021824	AGA	2	6	261527	261532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870012
4994	NC_021824	ACG	2	6	261554	261559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870012
4995	NC_021824	ACC	2	6	261614	261619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870012
4996	NC_021824	CCA	2	6	261696	261701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870012
4997	NC_021824	T	6	6	261717	261722	0 %	100 %	0 %	0 %	525870012
4998	NC_021824	CAA	3	9	261772	261780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870012
4999	NC_021824	TAAG	2	8	261853	261860	50 %	25 %	25 %	0 %	525870012
5000	NC_021824	ATT	2	6	261899	261904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870013

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