MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 59506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021823	ATAG	2	8	171503	171510	50 %	25 %	25 %	0 %	525865947
3502	NC_021823	CAT	2	6	171523	171528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865947
3503	NC_021823	AAC	2	6	171578	171583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865947
3504	NC_021823	GAT	2	6	171602	171607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865947
3505	NC_021823	T	7	7	171607	171613	0 %	100 %	0 %	0 %	525865947
3506	NC_021823	GCT	2	6	171615	171620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865947
3507	NC_021823	T	6	6	171620	171625	0 %	100 %	0 %	0 %	525865947
3508	NC_021823	ATC	2	6	171629	171634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865947
3509	NC_021823	AGT	2	6	171638	171643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865947
3510	NC_021823	TTG	2	6	171697	171702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865947
3511	NC_021823	T	6	6	171798	171803	0 %	100 %	0 %	0 %	525865947
3512	NC_021823	GCC	2	6	171887	171892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525865947
3513	NC_021823	AGAA	2	8	171893	171900	75 %	0 %	25 %	0 %	525865947
3514	NC_021823	GTT	2	6	171910	171915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865947
3515	NC_021823	GTT	2	6	171959	171964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865947
3516	NC_021823	TTG	2	6	171985	171990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865947
3517	NC_021823	TTC	2	6	172019	172024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865947
3518	NC_021823	CAC	3	9	172054	172062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865947
3519	NC_021823	T	7	7	172090	172096	0 %	100 %	0 %	0 %	525865947
3520	NC_021823	GCT	2	6	172162	172167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865948
3521	NC_021823	TCA	2	6	172180	172185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865948
3522	NC_021823	CTT	3	9	172220	172228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865948
3523	NC_021823	TCAT	2	8	172279	172286	25 %	50 %	0 %	25 %	525865948
3524	NC_021823	TCA	2	6	172309	172314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865948
3525	NC_021823	GGTG	2	8	172373	172380	0 %	25 %	75 %	0 %	525865948
3526	NC_021823	AGA	2	6	172401	172406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865948
3527	NC_021823	TTTG	2	8	172439	172446	0 %	75 %	25 %	0 %	525865948
3528	NC_021823	AGA	2	6	172470	172475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865948
3529	NC_021823	TTC	2	6	172566	172571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865948
3530	NC_021823	TCAG	2	8	172708	172715	25 %	25 %	25 %	25 %	525865948
3531	NC_021823	ATCG	2	8	172746	172753	25 %	25 %	25 %	25 %	525865948
3532	NC_021823	ATTA	2	8	172836	172843	50 %	50 %	0 %	0 %	525865948
3533	NC_021823	CATA	2	8	172859	172866	50 %	25 %	0 %	25 %	525865948
3534	NC_021823	AGT	2	6	172957	172962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865948
3535	NC_021823	CCAT	2	8	172966	172973	25 %	25 %	0 %	50 %	525865948
3536	NC_021823	ATA	2	6	172996	173001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865948
3537	NC_021823	GAT	2	6	173191	173196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865949
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3539	NC_021823	GAA	2	6	173241	173246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865949
3540	NC_021823	AG	3	6	173267	173272	50 %	0 %	50 %	0 %	525865949
3541	NC_021823	CGATG	2	10	173278	173287	20 %	20 %	40 %	20 %	525865949
3542	NC_021823	CGG	2	6	173326	173331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865949
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3544	NC_021823	ATG	2	6	173468	173473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865949
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3550	NC_021823	TTA	2	6	173703	173708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865949
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3552	NC_021823	ATT	2	6	173734	173739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865949
3553	NC_021823	AAAGCA	2	12	173782	173793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525865950
3554	NC_021823	TGC	2	6	173837	173842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865950
3555	NC_021823	AGA	2	6	173955	173960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865950
3556	NC_021823	A	7	7	174007	174013	100 %	0 %	0 %	0 %	525865951
3557	NC_021823	AAT	2	6	174015	174020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865951
3558	NC_021823	AGG	2	6	174147	174152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525865951
3559	NC_021823	GTTG	2	8	174325	174332	0 %	50 %	50 %	0 %	525865951
3560	NC_021823	AAG	2	6	174357	174362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865951
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3562	NC_021823	ACG	2	6	174630	174635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865952
3563	NC_021823	TAT	2	6	174641	174646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865952
3564	NC_021823	TAA	2	6	174659	174664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865952
3565	NC_021823	GTT	2	6	174789	174794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865952
3566	NC_021823	CG	4	8	174891	174898	0 %	0 %	50 %	50 %	525865952
3567	NC_021823	CGGG	2	8	174907	174914	0 %	0 %	75 %	25 %	525865952
3568	NC_021823	CGC	2	6	174921	174926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525865952
3569	NC_021823	TGA	2	6	174928	174933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865952
3570	NC_021823	CTG	2	6	174985	174990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865952
3571	NC_021823	AG	3	6	175032	175037	50 %	0 %	50 %	0 %	525865952
3572	NC_021823	ACG	2	6	175053	175058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865952
3573	NC_021823	ATT	2	6	175059	175064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865952
3574	NC_021823	ATT	2	6	175075	175080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865952
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3576	NC_021823	ATT	2	6	175116	175121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865952
3577	NC_021823	TTGA	2	8	175134	175141	25 %	50 %	25 %	0 %	525865952
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3580	NC_021823	TAA	2	6	175352	175357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865952
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3583	NC_021823	TAT	2	6	175435	175440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
3584	NC_021823	GCG	2	6	175459	175464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865953
3585	NC_021823	AACC	2	8	175470	175477	50 %	0 %	0 %	50 %	525865953
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3588	NC_021823	TAT	2	6	175539	175544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
3589	NC_021823	ATG	2	6	175624	175629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865953
3590	NC_021823	TTA	2	6	175634	175639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
3591	NC_021823	GAA	2	6	175699	175704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865953
3592	NC_021823	ATT	3	9	175732	175740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
3593	NC_021823	CATT	2	8	175827	175834	25 %	50 %	0 %	25 %	525865953
3594	NC_021823	TAT	2	6	175848	175853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
3595	NC_021823	CTT	2	6	175857	175862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865953
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3597	NC_021823	TTA	2	6	175895	175900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865953
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3601	NC_021823	A	6	6	176333	176338	100 %	0 %	0 %	0 %	525868370
3602	NC_021823	TGG	2	6	176366	176371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868370
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3605	NC_021823	ATG	2	6	176449	176454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865954
3606	NC_021823	TAAA	2	8	176471	176478	75 %	25 %	0 %	0 %	525865954
3607	NC_021823	TAA	2	6	176580	176585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865954
3608	NC_021823	A	6	6	176596	176601	100 %	0 %	0 %	0 %	525865954
3609	NC_021823	ATC	2	6	176687	176692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865954
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3612	NC_021823	AGG	2	6	176735	176740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525865954
3613	NC_021823	TTA	2	6	176758	176763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865954
3614	NC_021823	AAG	2	6	176780	176785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865954
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3618	NC_021823	AAG	2	6	176954	176959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865954
3619	NC_021823	TCC	2	6	177001	177006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525865954
3620	NC_021823	TTG	2	6	177035	177040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865954
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3622	NC_021823	CTA	2	6	177259	177264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865954
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3737	NC_021823	T	7	7	182893	182899	0 %	100 %	0 %	0 %	525865963
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3743	NC_021823	AGATG	2	10	183232	183241	40 %	20 %	40 %	0 %	525865963
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3863	NC_021823	A	6	6	188685	188690	100 %	0 %	0 %	0 %	525865968
3864	NC_021823	TCG	2	6	188739	188744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865968
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3988	NC_021823	CTG	2	6	195446	195451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865975
3989	NC_021823	TGCTGA	2	12	195507	195518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525865975
3990	NC_021823	TTC	2	6	195519	195524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865975
3991	NC_021823	CAA	2	6	195526	195531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865975
3992	NC_021823	TGA	2	6	195546	195551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865975
3993	NC_021823	CAAT	2	8	195633	195640	50 %	25 %	0 %	25 %	525865975
3994	NC_021823	GCT	2	6	195688	195693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865975
3995	NC_021823	CAAAC	2	10	195758	195767	60 %	0 %	0 %	40 %	525865975
3996	NC_021823	AATT	2	8	195785	195792	50 %	50 %	0 %	0 %	525865975
3997	NC_021823	TAA	2	6	195799	195804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865975
3998	NC_021823	GTT	2	6	196084	196089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865976
3999	NC_021823	CGA	2	6	196096	196101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865976
4000	NC_021823	GAT	2	6	196120	196125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865976

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