MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 59506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021823	ATT	2	6	245352	245357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866025
5002	NC_021823	TGA	2	6	245407	245412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866025
5003	NC_021823	GTG	2	6	245436	245441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866025
5004	NC_021823	GAAC	2	8	245442	245449	50 %	0 %	25 %	25 %	525866025
5005	NC_021823	ATG	2	6	245511	245516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866025
5006	NC_021823	TAT	3	9	245528	245536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866025
5007	NC_021823	CAATAA	2	12	245665	245676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525866025
5008	NC_021823	TAA	2	6	245708	245713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866025
5009	NC_021823	AGC	2	6	245714	245719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866025
5010	NC_021823	GCA	2	6	245730	245735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866025
5011	NC_021823	A	6	6	245788	245793	100 %	0 %	0 %	0 %	525866026
5012	NC_021823	TCG	2	6	245813	245818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866026
5013	NC_021823	AAAT	3	12	245900	245911	75 %	25 %	0 %	0 %	525866026
5014	NC_021823	GTA	2	6	245948	245953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866026
5015	NC_021823	A	6	6	245983	245988	100 %	0 %	0 %	0 %	525866026
5016	NC_021823	ACA	2	6	246028	246033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866026
5017	NC_021823	GAT	2	6	246055	246060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866026
5018	NC_021823	AGT	2	6	246069	246074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866026
5019	NC_021823	GAT	2	6	246097	246102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866026
5020	NC_021823	ATGA	2	8	246127	246134	50 %	25 %	25 %	0 %	525866026
5021	NC_021823	TAA	2	6	246135	246140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866026
5022	NC_021823	CAG	2	6	246167	246172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866026
5023	NC_021823	GAT	2	6	246187	246192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866026
5024	NC_021823	ACAA	2	8	246239	246246	75 %	0 %	0 %	25 %	525866026
5025	NC_021823	ATCA	2	8	246802	246809	50 %	25 %	0 %	25 %	525868376
5026	NC_021823	ATA	3	9	246819	246827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868376
5027	NC_021823	GCAA	2	8	246833	246840	50 %	0 %	25 %	25 %	525868376
5028	NC_021823	TAT	2	6	246920	246925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868376
5029	NC_021823	TGA	2	6	246968	246973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868376
5030	NC_021823	AAC	2	6	246978	246983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868376
5031	NC_021823	AAC	2	6	247032	247037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868376
5032	NC_021823	AGT	2	6	247074	247079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868376
5033	NC_021823	T	6	6	247123	247128	0 %	100 %	0 %	0 %	525868376
5034	NC_021823	TAT	2	6	247291	247296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868377
5035	NC_021823	GTT	2	6	247335	247340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868377
5036	NC_021823	TACAAA	2	12	247377	247388	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525868377
5037	NC_021823	TTA	2	6	247392	247397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868377
5038	NC_021823	GTA	2	6	247465	247470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868377
5039	NC_021823	AGAAAA	2	12	247507	247518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525868377
5040	NC_021823	TGA	2	6	247700	247705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866027
5041	NC_021823	GGA	2	6	247715	247720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866027
5042	NC_021823	ATTT	2	8	247739	247746	25 %	75 %	0 %	0 %	525868378
5043	NC_021823	ATG	2	6	247816	247821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868378
5044	NC_021823	TAA	2	6	247826	247831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868378
5045	NC_021823	ATT	3	9	247896	247904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868378
5046	NC_021823	TGG	3	9	247914	247922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868378
5047	NC_021823	TAT	2	6	247924	247929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868378
5048	NC_021823	CAA	2	6	247967	247972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868378
5049	NC_021823	AAAC	2	8	247981	247988	75 %	0 %	0 %	25 %	525868378
5050	NC_021823	ATA	2	6	248066	248071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868378
5051	NC_021823	ATG	3	9	248098	248106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868378
5052	NC_021823	TTA	2	6	248114	248119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868378
5053	NC_021823	GTG	2	6	248141	248146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868378
5054	NC_021823	A	7	7	248198	248204	100 %	0 %	0 %	0 %	525868378
5055	NC_021823	TAT	2	6	248205	248210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868378
5056	NC_021823	A	7	7	248212	248218	100 %	0 %	0 %	0 %	525868378
5057	NC_021823	CT	3	6	248369	248374	0 %	50 %	0 %	50 %	525868379
5058	NC_021823	ATT	2	6	248395	248400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868379
5059	NC_021823	GA	3	6	248449	248454	50 %	0 %	50 %	0 %	525868379
5060	NC_021823	TTAG	2	8	248461	248468	25 %	50 %	25 %	0 %	525868379
5061	NC_021823	TGG	2	6	248564	248569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525868379
5062	NC_021823	T	6	6	248573	248578	0 %	100 %	0 %	0 %	525868379
5063	NC_021823	AAAT	2	8	248582	248589	75 %	25 %	0 %	0 %	525868379
5064	NC_021823	TGT	2	6	248831	248836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868380
5065	NC_021823	TCG	2	6	248846	248851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868380
5066	NC_021823	CAG	2	6	248875	248880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525868380
5067	NC_021823	GC	3	6	248891	248896	0 %	0 %	50 %	50 %	525868380
5068	NC_021823	ATG	2	6	248908	248913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868380
5069	NC_021823	TGC	2	6	248933	248938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868380
5070	NC_021823	TGC	2	6	248945	248950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868380
5071	NC_021823	TTG	2	6	249010	249015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868380
5072	NC_021823	ATC	2	6	249034	249039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868380
5073	NC_021823	GTT	2	6	249045	249050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868380
5074	NC_021823	A	7	7	249051	249057	100 %	0 %	0 %	0 %	525868380
5075	NC_021823	GCC	2	6	249071	249076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525868380
5076	NC_021823	AAG	2	6	249112	249117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868380
5077	NC_021823	CTAA	2	8	249144	249151	50 %	25 %	0 %	25 %	525868380
5078	NC_021823	CAA	2	6	249270	249275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868380
5079	NC_021823	AT	3	6	249322	249327	50 %	50 %	0 %	0 %	525868380
5080	NC_021823	TCA	2	6	249353	249358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868380
5081	NC_021823	AAC	2	6	249427	249432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868380
5082	NC_021823	AGG	2	6	249458	249463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525868380
5083	NC_021823	GAACT	2	10	249663	249672	40 %	20 %	20 %	20 %	525868381
5084	NC_021823	TGA	2	6	249723	249728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868381
5085	NC_021823	AAT	2	6	249761	249766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868381
5086	NC_021823	ATTTT	2	10	249770	249779	20 %	80 %	0 %	0 %	525868381
5087	NC_021823	TA	3	6	249801	249806	50 %	50 %	0 %	0 %	525868381
5088	NC_021823	CTGG	2	8	249893	249900	0 %	25 %	50 %	25 %	525868381
5089	NC_021823	TAT	2	6	249908	249913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868381
5090	NC_021823	ACA	2	6	249962	249967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525868381
5091	NC_021823	TTA	2	6	250046	250051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868381
5092	NC_021823	AT	3	6	250075	250080	50 %	50 %	0 %	0 %	525868381
5093	NC_021823	AGA	2	6	250105	250110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868381
5094	NC_021823	ATT	2	6	250134	250139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868381
5095	NC_021823	GAT	2	6	250157	250162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868381
5096	NC_021823	AGA	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868381
5097	NC_021823	GA	3	6	250234	250239	50 %	0 %	50 %	0 %	525868381
5098	NC_021823	GAAG	2	8	250277	250284	50 %	0 %	50 %	0 %	525868381
5099	NC_021823	TTA	2	6	250290	250295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868381
5100	NC_021823	TTA	2	6	250417	250422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868382
5101	NC_021823	A	6	6	250448	250453	100 %	0 %	0 %	0 %	525868382
5102	NC_021823	TAA	2	6	250662	250667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868382
5103	NC_021823	CAT	2	6	250713	250718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525868382
5104	NC_021823	CTG	2	6	250868	250873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525868382
5105	NC_021823	GTT	2	6	250875	250880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525868382
5106	NC_021823	CATTAA	2	12	250919	250930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525868382
5107	NC_021823	ATA	2	6	250946	250951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868382
5108	NC_021823	TGA	2	6	251004	251009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868382
5109	NC_021823	AAT	2	6	251021	251026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525868382
5110	NC_021823	T	6	6	251174	251179	0 %	100 %	0 %	0 %	525866028
5111	NC_021823	GTT	2	6	251182	251187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866028
5112	NC_021823	GGT	2	6	251211	251216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866028
5113	NC_021823	ATC	2	6	251240	251245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866028
5114	NC_021823	AAT	2	6	251251	251256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866028
5115	NC_021823	ACC	2	6	251263	251268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866028
5116	NC_021823	A	6	6	251272	251277	100 %	0 %	0 %	0 %	525866028
5117	NC_021823	A	6	6	251293	251298	100 %	0 %	0 %	0 %	525866028
5118	NC_021823	GGC	2	6	251362	251367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525866028
5119	NC_021823	GTG	2	6	251380	251385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866028
5120	NC_021823	ACAA	2	8	251396	251403	75 %	0 %	0 %	25 %	525866028
5121	NC_021823	AAG	2	6	251483	251488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866028
5122	NC_021823	CGG	2	6	251553	251558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525866028
5123	NC_021823	GAT	2	6	251569	251574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866028
5124	NC_021823	GCGAT	2	10	251582	251591	20 %	20 %	40 %	20 %	525866028
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5126	NC_021823	GCGA	2	8	251716	251723	25 %	0 %	50 %	25 %	525866028
5127	NC_021823	ATCT	2	8	251765	251772	25 %	50 %	0 %	25 %	525866028
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5130	NC_021823	GAT	2	6	251932	251937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866028
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5243	NC_021823	AAG	2	6	257691	257696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866035
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5493	NC_021823	TGCT	2	8	268338	268345	0 %	50 %	25 %	25 %	525866042
5494	NC_021823	ATT	2	6	268400	268405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866042
5495	NC_021823	ATT	2	6	268436	268441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866042
5496	NC_021823	GTTT	2	8	268443	268450	0 %	75 %	25 %	0 %	525866042
5497	NC_021823	A	6	6	268467	268472	100 %	0 %	0 %	0 %	525866042
5498	NC_021823	A	8	8	268480	268487	100 %	0 %	0 %	0 %	525866042
5499	NC_021823	GTT	2	6	268508	268513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866042
5500	NC_021823	GAA	2	6	268538	268543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866042

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