MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 1457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	GCAAG	2	10	3836	3845	40 %	0 %	40 %	20 %	523518469
2	NC_021725	GATCG	2	10	4026	4035	20 %	20 %	40 %	20 %	523518469
3	NC_021725	GAAAA	2	10	7758	7767	80 %	0 %	20 %	0 %	523518471
4	NC_021725	GCAAC	2	10	10342	10351	40 %	0 %	20 %	40 %	523518472
5	NC_021725	ATCAA	2	10	11690	11699	60 %	20 %	0 %	20 %	523518472
6	NC_021725	GCAAC	2	10	12348	12357	40 %	0 %	20 %	40 %	523518474
7	NC_021725	ATCAA	2	10	13696	13705	60 %	20 %	0 %	20 %	523518474
8	NC_021725	CCGGT	2	10	19081	19090	0 %	20 %	40 %	40 %	523518483
9	NC_021725	TTGAT	2	10	23110	23119	20 %	60 %	20 %	0 %	523518488
10	NC_021725	GTTGC	2	10	24458	24467	0 %	40 %	40 %	20 %	523518488
11	NC_021725	TGGTG	2	10	27147	27156	0 %	40 %	60 %	0 %	523518490
12	NC_021725	AACTG	2	10	29806	29815	40 %	20 %	20 %	20 %	523518492
13	NC_021725	GATGC	2	10	30056	30065	20 %	20 %	40 %	20 %	523518492
14	NC_021725	GAATA	2	10	30527	30536	60 %	20 %	20 %	0 %	523518494
15	NC_021725	AAAAC	2	10	33378	33387	80 %	0 %	0 %	20 %	523518495
16	NC_021725	ATGAC	2	10	34060	34069	40 %	20 %	20 %	20 %	523518496
17	NC_021725	CTGAT	2	10	34825	34834	20 %	40 %	20 %	20 %	523518497
18	NC_021725	GATCG	2	10	48732	48741	20 %	20 %	40 %	20 %	523518509
19	NC_021725	AAAGC	2	10	50168	50177	60 %	0 %	20 %	20 %	523518510
20	NC_021725	AGACA	2	10	53155	53164	60 %	0 %	20 %	20 %	523518510
21	NC_021725	AGCCA	2	10	53362	53371	40 %	0 %	20 %	40 %	523518510
22	NC_021725	ACAGT	2	10	53838	53847	40 %	20 %	20 %	20 %	523518510
23	NC_021725	CATCG	2	10	57155	57164	20 %	20 %	20 %	40 %	523518513
24	NC_021725	AGCCC	2	10	60184	60193	20 %	0 %	20 %	60 %	523518515
25	NC_021725	TTGGC	2	10	60267	60276	0 %	40 %	40 %	20 %	523518515
26	NC_021725	CCGAT	2	10	63494	63503	20 %	20 %	20 %	40 %	523518517
27	NC_021725	GGCGT	2	10	65971	65980	0 %	20 %	60 %	20 %	523518519
28	NC_021725	AAGTG	2	10	67348	67357	40 %	20 %	40 %	0 %	523518520
29	NC_021725	CATAG	2	10	72955	72964	40 %	20 %	20 %	20 %	523518525
30	NC_021725	TCAAG	2	10	73320	73329	40 %	20 %	20 %	20 %	523518526
31	NC_021725	TCGAG	2	10	74203	74212	20 %	20 %	40 %	20 %	523518527
32	NC_021725	CTGAG	2	10	77271	77280	20 %	20 %	40 %	20 %	523518530
33	NC_021725	TTGGA	2	10	77753	77762	20 %	40 %	40 %	0 %	523518530
34	NC_021725	AATGG	2	10	79528	79537	40 %	20 %	40 %	0 %	523518531
35	NC_021725	GATCC	2	10	82160	82169	20 %	20 %	20 %	40 %	523518534
36	NC_021725	GTGGC	2	10	83501	83510	0 %	20 %	60 %	20 %	523518536
37	NC_021725	GCCAA	2	10	84436	84445	40 %	0 %	20 %	40 %	523518537
38	NC_021725	AGTTC	2	10	84670	84679	20 %	40 %	20 %	20 %	523518538
39	NC_021725	AAACC	2	10	84898	84907	60 %	0 %	0 %	40 %	523518538
40	NC_021725	AGATC	2	10	86912	86921	40 %	20 %	20 %	20 %	523518540
41	NC_021725	CGTTT	2	10	90283	90292	0 %	60 %	20 %	20 %	523518543
42	NC_021725	TGGGA	2	10	93987	93996	20 %	20 %	60 %	0 %	523518547
43	NC_021725	GAAAA	2	10	94801	94810	80 %	0 %	20 %	0 %	523518549
44	NC_021725	GAATC	2	10	96056	96065	40 %	20 %	20 %	20 %	523518549
45	NC_021725	ATCGC	2	10	99378	99387	20 %	20 %	20 %	40 %	523518551
46	NC_021725	GTTTT	2	10	106126	106135	0 %	80 %	20 %	0 %	523518560
47	NC_021725	CGAAG	2	10	106848	106857	40 %	0 %	40 %	20 %	523518560
48	NC_021725	CCCAT	2	10	106864	106873	20 %	20 %	0 %	60 %	523518560
49	NC_021725	AGTCG	2	10	107002	107011	20 %	20 %	40 %	20 %	523518560
50	NC_021725	GCTTG	2	10	110811	110820	0 %	40 %	40 %	20 %	523518563
51	NC_021725	GTTTC	2	10	111743	111752	0 %	60 %	20 %	20 %	523518564
52	NC_021725	TGGGC	2	10	119262	119271	0 %	20 %	60 %	20 %	523518573
53	NC_021725	AGGGC	2	10	119315	119324	20 %	0 %	60 %	20 %	523518573
54	NC_021725	GCTTT	2	10	119969	119978	0 %	60 %	20 %	20 %	523518573
55	NC_021725	TAACG	2	10	123253	123262	40 %	20 %	20 %	20 %	523518576
56	NC_021725	CCTTG	2	10	123761	123770	0 %	40 %	20 %	40 %	523518577
57	NC_021725	TCTTT	2	10	126143	126152	0 %	80 %	0 %	20 %	523518580
58	NC_021725	ATTGT	2	10	127709	127718	20 %	60 %	20 %	0 %	523518581
59	NC_021725	AGCTG	2	10	131608	131617	20 %	20 %	40 %	20 %	523518585
60	NC_021725	AAAAC	2	10	132562	132571	80 %	0 %	0 %	20 %	523518586
61	NC_021725	CGTGG	2	10	138095	138104	0 %	20 %	60 %	20 %	523518590
62	NC_021725	ACCGC	2	10	140463	140472	20 %	0 %	20 %	60 %	523518592
63	NC_021725	GCATC	2	10	141892	141901	20 %	20 %	20 %	40 %	523518593
64	NC_021725	AGGCT	2	10	142145	142154	20 %	20 %	40 %	20 %	523518593
65	NC_021725	GAATC	2	10	142718	142727	40 %	20 %	20 %	20 %	523518594
66	NC_021725	TGGCG	2	10	142913	142922	0 %	20 %	60 %	20 %	523518594
67	NC_021725	AATCA	2	10	144451	144460	60 %	20 %	0 %	20 %	523518595
68	NC_021725	TTTTC	2	10	144768	144777	0 %	80 %	0 %	20 %	523518595
69	NC_021725	GTTTG	2	10	145508	145517	0 %	60 %	40 %	0 %	523518596
70	NC_021725	GGTCA	2	10	146023	146032	20 %	20 %	40 %	20 %	523518597
71	NC_021725	CAGCT	2	10	146246	146255	20 %	20 %	20 %	40 %	523518597
72	NC_021725	CAGCA	2	10	148826	148835	40 %	0 %	20 %	40 %	523518598
73	NC_021725	GGGAT	2	10	150150	150159	20 %	20 %	60 %	0 %	523518599
74	NC_021725	CTCAA	2	10	152297	152306	40 %	20 %	0 %	40 %	523518600
75	NC_021725	GTGCC	2	10	153906	153915	0 %	20 %	40 %	40 %	523518602
76	NC_021725	TAATT	2	10	157490	157499	40 %	60 %	0 %	0 %	523518605
77	NC_021725	ATCGG	2	10	158479	158488	20 %	20 %	40 %	20 %	523518606
78	NC_021725	GTTCG	2	10	160008	160017	0 %	40 %	40 %	20 %	523518608
79	NC_021725	CGGTG	2	10	160967	160976	0 %	20 %	60 %	20 %	523518609
80	NC_021725	TGCTG	2	10	170514	170523	0 %	40 %	40 %	20 %	523518620
81	NC_021725	ACGCT	2	10	170551	170560	20 %	20 %	20 %	40 %	523518620
82	NC_021725	ATTGC	2	10	172773	172782	20 %	40 %	20 %	20 %	523518622
83	NC_021725	GCAAT	2	10	174589	174598	40 %	20 %	20 %	20 %	523518624
84	NC_021725	GCGTG	2	10	177579	177588	0 %	20 %	60 %	20 %	523518629
85	NC_021725	GAAGA	2	10	177811	177820	60 %	0 %	40 %	0 %	523518629
86	NC_021725	CAAAC	2	10	179026	179035	60 %	0 %	0 %	40 %	523518630
87	NC_021725	AATTT	2	10	179762	179771	40 %	60 %	0 %	0 %	523518630
88	NC_021725	GGCAA	3	15	180843	180857	40 %	0 %	40 %	20 %	523518631
89	NC_021725	AATCA	2	10	181637	181646	60 %	20 %	0 %	20 %	523518632
90	NC_021725	TTGGT	2	10	183288	183297	0 %	60 %	40 %	0 %	523518635
91	NC_021725	TCACT	2	10	186524	186533	20 %	40 %	0 %	40 %	523518639
92	NC_021725	TTCAT	2	10	188075	188084	20 %	60 %	0 %	20 %	523518640
93	NC_021725	TCGAC	2	10	188552	188561	20 %	20 %	20 %	40 %	523518640
94	NC_021725	CAAGC	2	10	191562	191571	40 %	0 %	20 %	40 %	523518643
95	NC_021725	CACAA	2	10	196504	196513	60 %	0 %	0 %	40 %	523518648
96	NC_021725	AATAA	2	10	196953	196962	80 %	20 %	0 %	0 %	523518649
97	NC_021725	GTGAT	2	10	198130	198139	20 %	40 %	40 %	0 %	523518649
98	NC_021725	TGGTC	2	10	199360	199369	0 %	40 %	40 %	20 %	523518651
99	NC_021725	TTCGG	2	10	201572	201581	0 %	40 %	40 %	20 %	523518652
100	NC_021725	GGCCG	2	10	202420	202429	0 %	0 %	60 %	40 %	523518653
101	NC_021725	ATGCG	2	10	204596	204605	20 %	20 %	40 %	20 %	523518655
102	NC_021725	GCCGA	2	10	205186	205195	20 %	0 %	40 %	40 %	523518656
103	NC_021725	CCGTT	2	10	205259	205268	0 %	40 %	20 %	40 %	523518656
104	NC_021725	GCAAC	2	10	206854	206863	40 %	0 %	20 %	40 %	523518658
105	NC_021725	ATCAA	2	10	208202	208211	60 %	20 %	0 %	20 %	523518658
106	NC_021725	TTGTT	2	10	210410	210419	0 %	80 %	20 %	0 %	523518662
107	NC_021725	CAGCC	2	10	216563	216572	20 %	0 %	20 %	60 %	523518667
108	NC_021725	GCTAT	2	10	217760	217769	20 %	40 %	20 %	20 %	523518668
109	NC_021725	GACGG	2	10	218127	218136	20 %	0 %	60 %	20 %	523518669
110	NC_021725	TTATT	2	10	218314	218323	20 %	80 %	0 %	0 %	523518669
111	NC_021725	CAGAT	2	10	220050	220059	40 %	20 %	20 %	20 %	523518671
112	NC_021725	TCTTT	2	10	224565	224574	0 %	80 %	0 %	20 %	523518676
113	NC_021725	CAAAG	2	10	230224	230233	60 %	0 %	20 %	20 %	523518682
114	NC_021725	TTCAT	2	10	230843	230852	20 %	60 %	0 %	20 %	523518683
115	NC_021725	TGAGG	2	10	230956	230965	20 %	20 %	60 %	0 %	523518684
116	NC_021725	TGATC	2	10	233564	233573	20 %	40 %	20 %	20 %	523518689
117	NC_021725	GTTGC	2	10	238363	238372	0 %	40 %	40 %	20 %	523518697
118	NC_021725	AGAGA	2	10	243562	243571	60 %	0 %	40 %	0 %	523518705
119	NC_021725	CGATT	2	10	244006	244015	20 %	40 %	20 %	20 %	523518706
120	NC_021725	AAAGC	2	10	251751	251760	60 %	0 %	20 %	20 %	523518715
121	NC_021725	TCCGG	2	10	251828	251837	0 %	20 %	40 %	40 %	523518715
122	NC_021725	CGAAC	2	10	251924	251933	40 %	0 %	20 %	40 %	523518715
123	NC_021725	GGTTT	2	10	253070	253079	0 %	60 %	40 %	0 %	523518716
124	NC_021725	ACGGT	2	10	255813	255822	20 %	20 %	40 %	20 %	523518720
125	NC_021725	ACCGT	2	10	258835	258844	20 %	20 %	20 %	40 %	523518723
126	NC_021725	GCATC	2	10	258950	258959	20 %	20 %	20 %	40 %	523518723
127	NC_021725	CGGTT	2	10	263152	263161	0 %	40 %	40 %	20 %	523518727
128	NC_021725	AAATG	2	10	267121	267130	60 %	20 %	20 %	0 %	523518730
129	NC_021725	AGTCA	2	10	267222	267231	40 %	20 %	20 %	20 %	523518730
130	NC_021725	GGTTA	2	10	272273	272282	20 %	40 %	40 %	0 %	523518736
131	NC_021725	AATCT	2	10	272657	272666	40 %	40 %	0 %	20 %	523518736
132	NC_021725	TTTGA	2	10	274412	274421	20 %	60 %	20 %	0 %	523518738
133	NC_021725	CCGGT	2	10	274809	274818	0 %	20 %	40 %	40 %	523518738
134	NC_021725	CATTT	2	10	282298	282307	20 %	60 %	0 %	20 %	523518746
135	NC_021725	AAAGA	2	10	285146	285155	80 %	0 %	20 %	0 %	523518748
136	NC_021725	GTGGA	2	10	285366	285375	20 %	20 %	60 %	0 %	523518748
137	NC_021725	GACCA	2	10	286496	286505	40 %	0 %	20 %	40 %	523518750
138	NC_021725	AGCTT	2	10	287397	287406	20 %	40 %	20 %	20 %	523518750
139	NC_021725	CGGCA	2	10	290036	290045	20 %	0 %	40 %	40 %	523518752
140	NC_021725	TGATG	2	10	290603	290612	20 %	40 %	40 %	0 %	523518753
141	NC_021725	GGGAT	2	10	290618	290627	20 %	20 %	60 %	0 %	523518753
142	NC_021725	AATGA	2	10	294404	294413	60 %	20 %	20 %	0 %	523518758
143	NC_021725	AGGTG	2	10	296638	296647	20 %	20 %	60 %	0 %	523518759
144	NC_021725	ATTCG	2	10	303223	303232	20 %	40 %	20 %	20 %	523518761
145	NC_021725	GGAAT	2	10	303273	303282	40 %	20 %	40 %	0 %	523518761
146	NC_021725	GATGG	2	10	305316	305325	20 %	20 %	60 %	0 %	523518764
147	NC_021725	GAGGT	2	10	308332	308341	20 %	20 %	60 %	0 %	523518767
148	NC_021725	ACGCA	2	10	312246	312255	40 %	0 %	20 %	40 %	523518772
149	NC_021725	GGATG	2	10	313655	313664	20 %	20 %	60 %	0 %	523518773
150	NC_021725	CAAGC	2	10	315456	315465	40 %	0 %	20 %	40 %	523518775
151	NC_021725	CAAAC	2	10	321613	321622	60 %	0 %	0 %	40 %	523518779
152	NC_021725	GCATT	2	10	321776	321785	20 %	40 %	20 %	20 %	523518779
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154	NC_021725	CAAAA	2	10	324602	324611	80 %	0 %	0 %	20 %	523518782
155	NC_021725	GCCAA	2	10	329349	329358	40 %	0 %	20 %	40 %	523518785
156	NC_021725	TTTCG	2	10	331293	331302	0 %	60 %	20 %	20 %	523518786
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159	NC_021725	ATGTT	2	10	337084	337093	20 %	60 %	20 %	0 %	523518791
160	NC_021725	TCAGG	2	10	337206	337215	20 %	20 %	40 %	20 %	523518791
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163	NC_021725	TTTGA	2	10	340145	340154	20 %	60 %	20 %	0 %	523518793
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165	NC_021725	GTTGG	2	10	342053	342062	0 %	40 %	60 %	0 %	523518797
166	NC_021725	AATCC	2	10	347181	347190	40 %	20 %	0 %	40 %	523518802
167	NC_021725	GTCTG	2	10	352520	352529	0 %	40 %	40 %	20 %	523518807
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171	NC_021725	AACGA	2	10	361692	361701	60 %	0 %	20 %	20 %	523518816
172	NC_021725	CCGGC	2	10	362332	362341	0 %	0 %	40 %	60 %	523518817
173	NC_021725	CTCGA	2	10	364258	364267	20 %	20 %	20 %	40 %	523518819
174	NC_021725	AGCGG	2	10	369336	369345	20 %	0 %	60 %	20 %	523518824
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177	NC_021725	CGCAA	2	10	377686	377695	40 %	0 %	20 %	40 %	523518833
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243	NC_021725	GTGAC	2	10	487794	487803	20 %	20 %	40 %	20 %	523518940
244	NC_021725	GATTT	2	10	488289	488298	20 %	60 %	20 %	0 %	523518941
245	NC_021725	TGGCG	2	10	488472	488481	0 %	20 %	60 %	20 %	523518941
246	NC_021725	GATTT	2	10	490532	490541	20 %	60 %	20 %	0 %	523518944
247	NC_021725	TGCCG	2	10	493580	493589	0 %	20 %	40 %	40 %	523518947
248	NC_021725	AAGCA	2	10	495674	495683	60 %	0 %	20 %	20 %	523518951
249	NC_021725	GCATT	2	10	499884	499893	20 %	40 %	20 %	20 %	523518955
250	NC_021725	GCATC	2	10	501219	501228	20 %	20 %	20 %	40 %	523518956
251	NC_021725	GTGAT	2	10	501370	501379	20 %	40 %	40 %	0 %	523518956
252	NC_021725	AAGGT	2	10	502259	502268	40 %	20 %	40 %	0 %	523518957
253	NC_021725	TTCAG	2	10	507733	507742	20 %	40 %	20 %	20 %	523518961
254	NC_021725	GTTGC	2	10	509588	509597	0 %	40 %	40 %	20 %	523518963
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256	NC_021725	TTTGG	2	10	513129	513138	0 %	60 %	40 %	0 %	523518966
257	NC_021725	TTGGC	2	10	513985	513994	0 %	40 %	40 %	20 %	523518968
258	NC_021725	CACGC	2	10	514206	514215	20 %	0 %	20 %	60 %	523518968
259	NC_021725	GTGCA	2	10	514762	514771	20 %	20 %	40 %	20 %	523518969
260	NC_021725	TGGGT	2	10	516818	516827	0 %	40 %	60 %	0 %	523518971
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262	NC_021725	CAAAC	2	10	525443	525452	60 %	0 %	0 %	40 %	523518983
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373	NC_021725	TCTAA	2	10	749536	749545	40 %	40 %	0 %	20 %	523519201
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376	NC_021725	ATGAA	2	10	754297	754306	60 %	20 %	20 %	0 %	523519206
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378	NC_021725	TTGAT	2	10	762895	762904	20 %	60 %	20 %	0 %	523519213
379	NC_021725	TGACC	2	10	767180	767189	20 %	20 %	20 %	40 %	523519216
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382	NC_021725	CGAGA	2	10	772138	772147	40 %	0 %	40 %	20 %	523519220
383	NC_021725	CAATT	2	10	772391	772400	40 %	40 %	0 %	20 %	523519221
384	NC_021725	GATGG	2	10	778523	778532	20 %	20 %	60 %	0 %	523519229
385	NC_021725	CCAAA	2	10	778701	778710	60 %	0 %	0 %	40 %	523519229
386	NC_021725	AATGC	2	10	783987	783996	40 %	20 %	20 %	20 %	523519234
387	NC_021725	AGAAC	2	10	787289	787298	60 %	0 %	20 %	20 %	523519239
388	NC_021725	ATCAT	2	10	790703	790712	40 %	40 %	0 %	20 %	523519245
389	NC_021725	GCCGA	2	10	790762	790771	20 %	0 %	40 %	40 %	523519245
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