MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021725	ATG	2	6	32865	32870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
502	NC_021725	TCG	2	6	32985	32990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
503	NC_021725	TGC	2	6	32995	33000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
504	NC_021725	CAT	2	6	33010	33015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518495
505	NC_021725	CAA	2	6	33022	33027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518495
506	NC_021725	TGA	2	6	33064	33069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518495
507	NC_021725	TCA	2	6	33159	33164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518495
508	NC_021725	TTC	2	6	33183	33188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518495
509	NC_021725	TGC	2	6	33216	33221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
510	NC_021725	GTG	2	6	33288	33293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518495
511	NC_021725	AGCC	2	8	33319	33326	25 %	0 %	25 %	50 %	523518495
512	NC_021725	GTC	2	6	33345	33350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518495
513	NC_021725	AAAAC	2	10	33378	33387	80 %	0 %	0 %	20 %	523518495
514	NC_021725	ATCC	2	8	33479	33486	25 %	25 %	0 %	50 %	523518495
515	NC_021725	TGA	2	6	33589	33594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518495
516	NC_021725	AT	3	6	33639	33644	50 %	50 %	0 %	0 %	523518495
517	NC_021725	ATG	2	6	33819	33824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518496
518	NC_021725	AAT	2	6	33837	33842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518496
519	NC_021725	CGG	2	6	33843	33848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518496
520	NC_021725	GCG	2	6	33876	33881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518496
521	NC_021725	TTG	2	6	33882	33887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518496
522	NC_021725	ATT	2	6	33995	34000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518496
523	NC_021725	TTA	2	6	34020	34025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518496
524	NC_021725	ATGAC	2	10	34060	34069	40 %	20 %	20 %	20 %	523518496
525	NC_021725	TCA	2	6	34096	34101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518496
526	NC_021725	CA	3	6	34100	34105	50 %	0 %	0 %	50 %	523518496
527	NC_021725	AGC	2	6	34115	34120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518496
528	NC_021725	ATT	2	6	34125	34130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518496
529	NC_021725	GTCC	2	8	34167	34174	0 %	25 %	25 %	50 %	523518496
530	NC_021725	CAGACG	2	12	34179	34190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518496
531	NC_021725	TTA	2	6	34241	34246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518496
532	NC_021725	GAAA	2	8	34412	34419	75 %	0 %	25 %	0 %	523518497
533	NC_021725	TTG	2	6	34461	34466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518497
534	NC_021725	GCC	2	6	34484	34489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518497
535	NC_021725	TCAA	2	8	34516	34523	50 %	25 %	0 %	25 %	523518497
536	NC_021725	ATC	2	6	34650	34655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518497
537	NC_021725	ATC	2	6	34804	34809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518497
538	NC_021725	A	7	7	34814	34820	100 %	0 %	0 %	0 %	523518497
539	NC_021725	CTGAT	2	10	34825	34834	20 %	40 %	20 %	20 %	523518497
540	NC_021725	GGC	2	6	34835	34840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518497
541	NC_021725	CCGG	2	8	34913	34920	0 %	0 %	50 %	50 %	523518497
542	NC_021725	GCG	2	6	34951	34956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518497
543	NC_021725	GCC	2	6	35017	35022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518497
544	NC_021725	ATG	2	6	35046	35051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518497
545	NC_021725	CAT	2	6	35108	35113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518497
546	NC_021725	GCA	2	6	35138	35143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518497
547	NC_021725	GTG	2	6	35255	35260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518498
548	NC_021725	T	6	6	35275	35280	0 %	100 %	0 %	0 %	523518498
549	NC_021725	TGC	2	6	35283	35288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518498
550	NC_021725	CTTA	2	8	35328	35335	25 %	50 %	0 %	25 %	523518498
551	NC_021725	TTA	2	6	35426	35431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518498
552	NC_021725	CAT	2	6	35492	35497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518498
553	NC_021725	GCC	2	6	35758	35763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518499
554	NC_021725	TGC	2	6	35778	35783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518499
555	NC_021725	AAT	2	6	35784	35789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518499
556	NC_021725	TAA	2	6	35796	35801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518499
557	NC_021725	GCG	2	6	35814	35819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518499
558	NC_021725	GAT	2	6	35823	35828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518499
559	NC_021725	GTG	2	6	35896	35901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518499
560	NC_021725	TTC	2	6	35950	35955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518499
561	NC_021725	GCA	2	6	36022	36027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518499
562	NC_021725	CTT	2	6	36083	36088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518499
563	NC_021725	CGC	2	6	36171	36176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518499
564	NC_021725	GAT	2	6	36177	36182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518499
565	NC_021725	CAAT	2	8	36221	36228	50 %	25 %	0 %	25 %	523518499
566	NC_021725	AGA	2	6	36229	36234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518499
567	NC_021725	TAC	2	6	36248	36253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518499
568	NC_021725	AATCAG	2	12	36264	36275	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523518499
569	NC_021725	GAG	2	6	36316	36321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523518499
570	NC_021725	AACC	2	8	36329	36336	50 %	0 %	0 %	50 %	523518499
571	NC_021725	TGG	2	6	36381	36386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518499
572	NC_021725	GTC	2	6	36808	36813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518500
573	NC_021725	GGT	2	6	36834	36839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518500
574	NC_021725	CAG	2	6	36883	36888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518500
575	NC_021725	T	6	6	36900	36905	0 %	100 %	0 %	0 %	523518500
576	NC_021725	T	6	6	36915	36920	0 %	100 %	0 %	0 %	523518500
577	NC_021725	ATT	2	6	36999	37004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518500
578	NC_021725	TTA	2	6	37010	37015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518500
579	NC_021725	ATTT	2	8	37038	37045	25 %	75 %	0 %	0 %	523518500
580	NC_021725	GCGA	2	8	37064	37071	25 %	0 %	50 %	25 %	523518500
581	NC_021725	A	6	6	37075	37080	100 %	0 %	0 %	0 %	523518500
582	NC_021725	GGA	2	6	37104	37109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523518500
583	NC_021725	TTG	2	6	37136	37141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518500
584	NC_021725	TTAT	2	8	37145	37152	25 %	75 %	0 %	0 %	523518500
585	NC_021725	TTG	2	6	37187	37192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518500
586	NC_021725	AAT	2	6	37225	37230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518500
587	NC_021725	GGC	2	6	37599	37604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518501
588	NC_021725	A	7	7	37672	37678	100 %	0 %	0 %	0 %	523518501
589	NC_021725	TTCA	2	8	37721	37728	25 %	50 %	0 %	25 %	523518501
590	NC_021725	TGG	2	6	37734	37739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518501
591	NC_021725	TGG	2	6	37790	37795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518501
592	NC_021725	ATA	2	6	37904	37909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518501
593	NC_021725	TTG	2	6	37932	37937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518501
594	NC_021725	ATA	2	6	37982	37987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518501
595	NC_021725	TGT	2	6	38034	38039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518501
596	NC_021725	GAA	2	6	38080	38085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518501
597	NC_021725	GTC	2	6	38204	38209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518502
598	NC_021725	TAA	2	6	38249	38254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518502
599	NC_021725	AGA	2	6	38302	38307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518502
600	NC_021725	AGC	2	6	38354	38359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518502
601	NC_021725	ATT	2	6	38375	38380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518502
602	NC_021725	AAT	2	6	38422	38427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518502
603	NC_021725	T	6	6	38456	38461	0 %	100 %	0 %	0 %	523518502
604	NC_021725	TTG	2	6	38790	38795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518503
605	NC_021725	AAG	2	6	38798	38803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518503
606	NC_021725	GAT	2	6	38824	38829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
607	NC_021725	GGT	2	6	39130	39135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518503
608	NC_021725	TGA	2	6	39238	39243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
609	NC_021725	TCA	2	6	39271	39276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518503
610	NC_021725	GGC	2	6	39280	39285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518503
611	NC_021725	TGA	2	6	39298	39303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
612	NC_021725	GATT	2	8	39343	39350	25 %	50 %	25 %	0 %	523518503
613	NC_021725	GAT	2	6	39362	39367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518503
614	NC_021725	ATC	2	6	39408	39413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518503
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616	NC_021725	GCAG	2	8	39466	39473	25 %	0 %	50 %	25 %	523518503
617	NC_021725	AGA	2	6	39510	39515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518503
618	NC_021725	AGC	2	6	39617	39622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518503
619	NC_021725	GCG	2	6	39761	39766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518503
620	NC_021725	CTGG	2	8	39772	39779	0 %	25 %	50 %	25 %	523518503
621	NC_021725	T	6	6	39815	39820	0 %	100 %	0 %	0 %	523518503
622	NC_021725	CAC	2	6	39829	39834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518503
623	NC_021725	TGG	2	6	39915	39920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518503
624	NC_021725	CG	3	6	40001	40006	0 %	0 %	50 %	50 %	523518503
625	NC_021725	TGC	2	6	40122	40127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518503
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627	NC_021725	CCG	2	6	40423	40428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518504
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631	NC_021725	CG	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	523518504
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662	NC_021725	AT	3	6	45080	45085	50 %	50 %	0 %	0 %	523518506
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740	NC_021725	AAG	2	6	50630	50635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518510
741	NC_021725	AAAC	2	8	50691	50698	75 %	0 %	0 %	25 %	523518510
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745	NC_021725	TTGG	2	8	51345	51352	0 %	50 %	50 %	0 %	523518510
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749	NC_021725	TCAA	2	8	51707	51714	50 %	25 %	0 %	25 %	523518510
750	NC_021725	CAC	2	6	51721	51726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518510
751	NC_021725	AGC	2	6	51783	51788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518510
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753	NC_021725	GTG	2	6	51948	51953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518510
754	NC_021725	GAC	2	6	52012	52017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518510
755	NC_021725	CAG	2	6	52049	52054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518510
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785	NC_021725	ACCA	2	8	53849	53856	50 %	0 %	0 %	50 %	523518510
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880	NC_021725	TCT	2	6	58835	58840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518514
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999	NC_021725	TGC	2	6	66342	66347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518520
1000	NC_021725	CGG	2	6	66358	66363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518520

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