MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021723	TTGG	2	8	63097	63104	0 %	50 %	50 %	0 %	523515653
1002	NC_021723	ATC	2	6	63108	63113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515653
1003	NC_021723	TGA	2	6	63123	63128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515653
1004	NC_021723	CGG	3	9	63184	63192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515653
1005	NC_021723	ATGT	2	8	63209	63216	25 %	50 %	25 %	0 %	523515653
1006	NC_021723	ATC	2	6	63252	63257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515653
1007	NC_021723	GGT	2	6	63259	63264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515653
1008	NC_021723	AGC	2	6	63452	63457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515654
1009	NC_021723	AGAA	2	8	63483	63490	75 %	0 %	25 %	0 %	523515654
1010	NC_021723	ATGA	2	8	63500	63507	50 %	25 %	25 %	0 %	523515654
1011	NC_021723	AAG	2	6	63794	63799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515654
1012	NC_021723	CTG	2	6	63824	63829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515654
1013	NC_021723	TGA	2	6	63841	63846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515654
1014	NC_021723	AGC	2	6	64210	64215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515655
1015	NC_021723	TGA	2	6	64277	64282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1016	NC_021723	AGCCG	2	10	64359	64368	20 %	0 %	40 %	40 %	523515655
1017	NC_021723	GAT	2	6	64431	64436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1018	NC_021723	GTGA	2	8	64470	64477	25 %	25 %	50 %	0 %	523515655
1019	NC_021723	AGC	2	6	64478	64483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515655
1020	NC_021723	GCG	2	6	64510	64515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515655
1021	NC_021723	GCG	2	6	64533	64538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515655
1022	NC_021723	AGT	2	6	64606	64611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1023	NC_021723	AGCC	2	8	64616	64623	25 %	0 %	25 %	50 %	523515655
1024	NC_021723	GAA	2	6	64704	64709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515655
1025	NC_021723	GT	3	6	64774	64779	0 %	50 %	50 %	0 %	523515655
1026	NC_021723	GAT	2	6	64800	64805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1027	NC_021723	GAT	2	6	64995	65000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1028	NC_021723	GTA	2	6	65037	65042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515655
1029	NC_021723	GCA	2	6	65195	65200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515655
1030	NC_021723	CCGG	2	8	65202	65209	0 %	0 %	50 %	50 %	523515655
1031	NC_021723	CAG	2	6	65244	65249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515655
1032	NC_021723	AAT	2	6	65284	65289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515655
1033	NC_021723	A	6	6	65314	65319	100 %	0 %	0 %	0 %	523515655
1034	NC_021723	GGT	2	6	65322	65327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515655
1035	NC_021723	AGA	2	6	65350	65355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515655
1036	NC_021723	CCA	2	6	65441	65446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515655
1037	NC_021723	GAA	2	6	65969	65974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515656
1038	NC_021723	ATC	2	6	65988	65993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515656
1039	NC_021723	GAA	2	6	66160	66165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515656
1040	NC_021723	CTT	2	6	66241	66246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515656
1041	NC_021723	ACA	2	6	66260	66265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515656
1042	NC_021723	CG	3	6	66484	66489	0 %	0 %	50 %	50 %	523515657
1043	NC_021723	GCT	2	6	66518	66523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1044	NC_021723	GAT	2	6	66588	66593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1045	NC_021723	GTCA	2	8	66613	66620	25 %	25 %	25 %	25 %	523515657
1046	NC_021723	ATG	2	6	66677	66682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1047	NC_021723	CAGC	2	8	66684	66691	25 %	0 %	25 %	50 %	523515657
1048	NC_021723	ATC	2	6	66725	66730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515657
1049	NC_021723	GAT	2	6	66751	66756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1050	NC_021723	GAC	2	6	66769	66774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1051	NC_021723	GGC	2	6	66790	66795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515657
1052	NC_021723	ATG	2	6	66893	66898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1053	NC_021723	GAA	2	6	66904	66909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515657
1054	NC_021723	GT	3	6	66912	66917	0 %	50 %	50 %	0 %	523515657
1055	NC_021723	ATG	2	6	67007	67012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1056	NC_021723	ACG	2	6	67040	67045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1057	NC_021723	GAT	2	6	67066	67071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1058	NC_021723	ATG	2	6	67073	67078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1059	NC_021723	GCG	2	6	67079	67084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515657
1060	NC_021723	GTTC	2	8	67085	67092	0 %	50 %	25 %	25 %	523515657
1061	NC_021723	TCA	2	6	67163	67168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515657
1062	NC_021723	GCG	2	6	67170	67175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515657
1063	NC_021723	GCA	2	6	67229	67234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1064	NC_021723	CTT	2	6	67357	67362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515657
1065	NC_021723	TGC	2	6	67376	67381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1066	NC_021723	CGG	2	6	67443	67448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515657
1067	NC_021723	TTG	2	6	67477	67482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515657
1068	NC_021723	CAC	2	6	67539	67544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515657
1069	NC_021723	GCG	2	6	67586	67591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515657
1070	NC_021723	GTT	2	6	67677	67682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515657
1071	NC_021723	GCA	2	6	67763	67768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1072	NC_021723	ATTG	2	8	67803	67810	25 %	50 %	25 %	0 %	523515657
1073	NC_021723	GAT	2	6	67870	67875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1074	NC_021723	TGC	2	6	67950	67955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1075	NC_021723	AGCA	2	8	67975	67982	50 %	0 %	25 %	25 %	523515657
1076	NC_021723	TGCTAT	2	12	67986	67997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523515657
1077	NC_021723	CCG	2	6	68354	68359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515657
1078	NC_021723	CTTTTT	2	12	68391	68402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	523515657
1079	NC_021723	GTC	2	6	68419	68424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1080	NC_021723	AAT	2	6	68505	68510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515657
1081	NC_021723	TTGGA	2	10	68537	68546	20 %	40 %	40 %	0 %	523515657
1082	NC_021723	GTT	2	6	68569	68574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515657
1083	NC_021723	TGA	2	6	68640	68645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1084	NC_021723	CG	3	6	68651	68656	0 %	0 %	50 %	50 %	523515657
1085	NC_021723	GAA	2	6	68752	68757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515657
1086	NC_021723	ACG	2	6	68908	68913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1087	NC_021723	TGC	2	6	68923	68928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1088	NC_021723	GCT	2	6	68957	68962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1089	NC_021723	TCCCGA	2	12	68997	69008	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	523515657
1090	NC_021723	ATG	3	9	69077	69085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1091	NC_021723	AAGA	2	8	69098	69105	75 %	0 %	25 %	0 %	523515657
1092	NC_021723	GAT	2	6	69157	69162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1093	NC_021723	AATGAA	2	12	69169	69180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	523515657
1094	NC_021723	T	6	6	69201	69206	0 %	100 %	0 %	0 %	523515657
1095	NC_021723	ATC	2	6	69235	69240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515657
1096	NC_021723	CG	3	6	69306	69311	0 %	0 %	50 %	50 %	523515657
1097	NC_021723	GCT	2	6	69384	69389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1098	NC_021723	TGA	2	6	69426	69431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515657
1099	NC_021723	TGAT	2	8	69470	69477	25 %	50 %	25 %	0 %	523515657
1100	NC_021723	CG	3	6	69478	69483	0 %	0 %	50 %	50 %	523515657
1101	NC_021723	GTC	2	6	69505	69510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515657
1102	NC_021723	TTC	2	6	69592	69597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515657
1103	NC_021723	CCA	2	6	69666	69671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515657
1104	NC_021723	AGA	2	6	69687	69692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515657
1105	NC_021723	CTT	2	6	69739	69744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515658
1106	NC_021723	TGC	2	6	69860	69865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515658
1107	NC_021723	CACGC	2	10	69909	69918	20 %	0 %	20 %	60 %	523515658
1108	NC_021723	TGA	2	6	69944	69949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515658
1109	NC_021723	GCA	2	6	69970	69975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515658
1110	NC_021723	TTG	2	6	70011	70016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515658
1111	NC_021723	GCA	2	6	70060	70065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515658
1112	NC_021723	ATC	2	6	70095	70100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515658
1113	NC_021723	GAA	2	6	70137	70142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515658
1114	NC_021723	ATA	2	6	70147	70152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515658
1115	NC_021723	TCT	2	6	70177	70182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515658
1116	NC_021723	TGC	2	6	70224	70229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515658
1117	NC_021723	AATGG	2	10	70312	70321	40 %	20 %	40 %	0 %	523515658
1118	NC_021723	AAT	2	6	70563	70568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515659
1119	NC_021723	A	6	6	70571	70576	100 %	0 %	0 %	0 %	523515659
1120	NC_021723	GT	3	6	70650	70655	0 %	50 %	50 %	0 %	523515659
1121	NC_021723	GAT	2	6	70659	70664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515659
1122	NC_021723	GGT	2	6	70683	70688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515659
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1124	NC_021723	CTG	2	6	70766	70771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515659
1125	NC_021723	GCC	2	6	70821	70826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515659
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1241	NC_021723	AAC	2	6	77599	77604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515667
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1243	NC_021723	AGATC	2	10	77697	77706	40 %	20 %	20 %	20 %	523515667
1244	NC_021723	GCA	2	6	77714	77719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515667
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1248	NC_021723	CGA	2	6	77802	77807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515667
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1499	NC_021723	GTA	2	6	94223	94228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515684
1500	NC_021723	TGGA	2	8	94291	94298	25 %	25 %	50 %	0 %	523515684

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