MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021723	ATT	2	6	29253	29258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515625
502	NC_021723	TTA	2	6	29369	29374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515625
503	NC_021723	GAAA	2	8	29540	29547	75 %	0 %	25 %	0 %	523515626
504	NC_021723	AATT	2	8	29560	29567	50 %	50 %	0 %	0 %	523515626
505	NC_021723	TTG	2	6	29589	29594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515626
506	NC_021723	TCAA	2	8	29644	29651	50 %	25 %	0 %	25 %	523515626
507	NC_021723	TCG	2	6	29665	29670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515626
508	NC_021723	ATC	2	6	29778	29783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515626
509	NC_021723	ATC	2	6	29932	29937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515626
510	NC_021723	A	7	7	29942	29948	100 %	0 %	0 %	0 %	523515626
511	NC_021723	CTGAT	2	10	29953	29962	20 %	40 %	20 %	20 %	523515626
512	NC_021723	CCGG	2	8	30041	30048	0 %	0 %	50 %	50 %	523515626
513	NC_021723	GCG	2	6	30079	30084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515626
514	NC_021723	GCC	2	6	30145	30150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515626
515	NC_021723	ATG	2	6	30174	30179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515626
516	NC_021723	CAT	2	6	30236	30241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515626
517	NC_021723	GCA	2	6	30266	30271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515626
518	NC_021723	TGC	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515627
519	NC_021723	CAG	2	6	30528	30533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515627
520	NC_021723	TGC	2	6	30543	30548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515627
521	NC_021723	AAT	2	6	30549	30554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515627
522	NC_021723	TAA	2	6	30561	30566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515627
523	NC_021723	GCG	2	6	30579	30584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515627
524	NC_021723	GAT	2	6	30588	30593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515627
525	NC_021723	GCC	2	6	30606	30611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515627
526	NC_021723	GTG	2	6	30661	30666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515627
527	NC_021723	TTC	2	6	30715	30720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515627
528	NC_021723	GCA	3	9	30787	30795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515627
529	NC_021723	CTT	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515627
530	NC_021723	GAT	2	6	30942	30947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515627
531	NC_021723	CAAT	2	8	30986	30993	50 %	25 %	0 %	25 %	523515627
532	NC_021723	AGA	2	6	30994	30999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515627
533	NC_021723	AATCAG	2	12	31029	31040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523515627
534	NC_021723	GAG	2	6	31081	31086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523515627
535	NC_021723	AACC	2	8	31094	31101	50 %	0 %	0 %	50 %	523515627
536	NC_021723	TGG	2	6	31146	31151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515627
537	NC_021723	TAGCG	2	10	31203	31212	20 %	20 %	40 %	20 %	523515627
538	NC_021723	GTC	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515628
539	NC_021723	GGT	2	6	31599	31604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515628
540	NC_021723	CAG	2	6	31648	31653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515628
541	NC_021723	T	6	6	31665	31670	0 %	100 %	0 %	0 %	523515628
542	NC_021723	T	6	6	31680	31685	0 %	100 %	0 %	0 %	523515628
543	NC_021723	ATT	2	6	31764	31769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515628
544	NC_021723	TTA	2	6	31775	31780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515628
545	NC_021723	ATTT	2	8	31803	31810	25 %	75 %	0 %	0 %	523515628
546	NC_021723	GCGA	2	8	31829	31836	25 %	0 %	50 %	25 %	523515628
547	NC_021723	A	6	6	31840	31845	100 %	0 %	0 %	0 %	523515628
548	NC_021723	GGA	2	6	31869	31874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523515628
549	NC_021723	TTG	2	6	31901	31906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515628
550	NC_021723	TTAT	2	8	31910	31917	25 %	75 %	0 %	0 %	523515628
551	NC_021723	AAT	2	6	31990	31995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515628
552	NC_021723	CAAGA	2	10	32312	32321	60 %	0 %	20 %	20 %	523515629
553	NC_021723	GGC	2	6	32377	32382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515629
554	NC_021723	A	7	7	32450	32456	100 %	0 %	0 %	0 %	523515629
555	NC_021723	TGG	2	6	32512	32517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515629
556	NC_021723	TGG	2	6	32568	32573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515629
557	NC_021723	ATA	2	6	32682	32687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515629
558	NC_021723	TTG	2	6	32710	32715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515629
559	NC_021723	ATA	2	6	32760	32765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515629
560	NC_021723	TGT	2	6	32812	32817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515629
561	NC_021723	GAA	2	6	32858	32863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515629
562	NC_021723	GTC	2	6	32982	32987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515630
563	NC_021723	TAA	2	6	33027	33032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515630
564	NC_021723	AGA	2	6	33080	33085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515630
565	NC_021723	AGC	2	6	33132	33137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515630
566	NC_021723	AAT	2	6	33200	33205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515630
567	NC_021723	T	6	6	33234	33239	0 %	100 %	0 %	0 %	523515630
568	NC_021723	T	6	6	33410	33415	0 %	100 %	0 %	0 %	523515631
569	NC_021723	A	6	6	33453	33458	100 %	0 %	0 %	0 %	523515631
570	NC_021723	TTG	2	6	33567	33572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515632
571	NC_021723	AAG	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515632
572	NC_021723	GAT	2	6	33601	33606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515632
573	NC_021723	GGT	2	6	33907	33912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515632
574	NC_021723	TGA	2	6	34015	34020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515632
575	NC_021723	TCA	2	6	34048	34053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515632
576	NC_021723	GGC	2	6	34057	34062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515632
577	NC_021723	TGA	2	6	34075	34080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515632
578	NC_021723	GATT	2	8	34120	34127	25 %	50 %	25 %	0 %	523515632
579	NC_021723	GAT	2	6	34139	34144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515632
580	NC_021723	ATC	2	6	34185	34190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515632
581	NC_021723	GAA	2	6	34201	34206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515632
582	NC_021723	GCAG	2	8	34243	34250	25 %	0 %	50 %	25 %	523515632
583	NC_021723	AGA	2	6	34287	34292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515632
584	NC_021723	AGC	2	6	34394	34399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515632
585	NC_021723	GCG	2	6	34538	34543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515632
586	NC_021723	CTGG	2	8	34549	34556	0 %	25 %	50 %	25 %	523515632
587	NC_021723	T	6	6	34592	34597	0 %	100 %	0 %	0 %	523515632
588	NC_021723	CAC	2	6	34606	34611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515632
589	NC_021723	TGG	2	6	34692	34697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515632
590	NC_021723	CG	3	6	34778	34783	0 %	0 %	50 %	50 %	523515632
591	NC_021723	TGC	2	6	34899	34904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515632
592	NC_021723	GGC	2	6	34955	34960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515632
593	NC_021723	CCG	2	6	35201	35206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515633
594	NC_021723	TTAT	2	8	35336	35343	25 %	75 %	0 %	0 %	523515633
595	NC_021723	TTC	2	6	35350	35355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515633
596	NC_021723	GGCTGG	2	12	35393	35404	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523515633
597	NC_021723	TTGCG	2	10	35460	35469	0 %	40 %	40 %	20 %	523515633
598	NC_021723	CG	3	6	35485	35490	0 %	0 %	50 %	50 %	523515633
599	NC_021723	ATC	2	6	35494	35499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515633
600	NC_021723	GAC	2	6	35512	35517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515633
601	NC_021723	ACC	2	6	35518	35523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515633
602	NC_021723	ATT	2	6	35593	35598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515633
603	NC_021723	GCG	2	6	35617	35622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515633
604	NC_021723	ATT	2	6	35655	35660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515633
605	NC_021723	CAT	2	6	37343	37348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515634
606	NC_021723	T	6	6	37361	37366	0 %	100 %	0 %	0 %	523515634
607	NC_021723	TCT	2	6	37441	37446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515634
608	NC_021723	T	6	6	37446	37451	0 %	100 %	0 %	0 %	523515634
609	NC_021723	TTA	2	6	37462	37467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515634
610	NC_021723	CAT	2	6	37477	37482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515634
611	NC_021723	GAG	2	6	37499	37504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523515634
612	NC_021723	AAAT	2	8	37507	37514	75 %	25 %	0 %	0 %	523515634
613	NC_021723	ATA	2	6	37871	37876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515635
614	NC_021723	ATG	2	6	37947	37952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515635
615	NC_021723	TTA	2	6	38022	38027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515635
616	NC_021723	A	6	6	38665	38670	100 %	0 %	0 %	0 %	523515636
617	NC_021723	TCA	2	6	38721	38726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515636
618	NC_021723	TCG	2	6	38742	38747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515636
619	NC_021723	TAT	2	6	38884	38889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515637
620	NC_021723	ATTTTC	2	12	38909	38920	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523515637
621	NC_021723	A	6	6	38928	38933	100 %	0 %	0 %	0 %	523515637
622	NC_021723	CTG	2	6	38978	38983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515637
623	NC_021723	GATT	2	8	39074	39081	25 %	50 %	25 %	0 %	523515637
624	NC_021723	AGCC	2	8	39147	39154	25 %	0 %	25 %	50 %	523515637
625	NC_021723	ATA	2	6	39199	39204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515637
626	NC_021723	TTTGCC	2	12	39309	39320	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	523515637
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756	NC_021723	AGC	3	9	48285	48293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515642
757	NC_021723	GAA	2	6	48354	48359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515642
758	NC_021723	GAA	2	6	48442	48447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515642
759	NC_021723	CTT	2	6	48452	48457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515642
760	NC_021723	GCA	2	6	48517	48522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515642
761	NC_021723	AAT	2	6	48584	48589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515642
762	NC_021723	CTTA	2	8	48917	48924	25 %	50 %	0 %	25 %	523515643
763	NC_021723	CTT	2	6	48957	48962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515643
764	NC_021723	CGG	2	6	49004	49009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515643
765	NC_021723	TGC	2	6	49016	49021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515643
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769	NC_021723	CG	3	6	49324	49329	0 %	0 %	50 %	50 %	523515643
770	NC_021723	CGC	2	6	49454	49459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515643
771	NC_021723	TCA	2	6	49492	49497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515643
772	NC_021723	TTAA	2	8	49534	49541	50 %	50 %	0 %	0 %	523515643
773	NC_021723	CG	3	6	49645	49650	0 %	0 %	50 %	50 %	523515644
774	NC_021723	TTA	2	6	49658	49663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515644
775	NC_021723	TGT	2	6	49691	49696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515644
776	NC_021723	GGCT	2	8	49761	49768	0 %	25 %	50 %	25 %	523515644
777	NC_021723	TGA	2	6	49803	49808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515644
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779	NC_021723	TTGA	2	8	49957	49964	25 %	50 %	25 %	0 %	523515644
780	NC_021723	ATC	2	6	49990	49995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515644
781	NC_021723	CGA	2	6	50001	50006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515644
782	NC_021723	GCA	2	6	50031	50036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515644
783	NC_021723	CGAT	2	8	50037	50044	25 %	25 %	25 %	25 %	523515644
784	NC_021723	TCA	2	6	50157	50162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515644
785	NC_021723	GGC	2	6	50194	50199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515644
786	NC_021723	CGC	2	6	50257	50262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515644
787	NC_021723	TAG	2	6	50300	50305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515644
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789	NC_021723	GTT	2	6	50406	50411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515644
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792	NC_021723	CTT	2	6	50559	50564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515644
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865	NC_021723	CAT	2	6	54563	54568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515647
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872	NC_021723	GTC	2	6	55033	55038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515648
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877	NC_021723	TGG	2	6	55308	55313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515648
878	NC_021723	AAC	2	6	55336	55341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515648
879	NC_021723	GCA	2	6	55359	55364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515648
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881	NC_021723	TG	3	6	55399	55404	0 %	50 %	50 %	0 %	523515648
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991	NC_021723	ACA	2	6	61807	61812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515652
992	NC_021723	GTTG	2	8	61887	61894	0 %	50 %	50 %	0 %	523515652
993	NC_021723	TTG	2	6	62130	62135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515652
994	NC_021723	CGC	2	6	62312	62317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515652
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996	NC_021723	TGAC	2	8	62568	62575	25 %	25 %	25 %	25 %	523515652
997	NC_021723	TCA	2	6	62590	62595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515652
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999	NC_021723	CTG	2	6	63018	63023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515653
1000	NC_021723	ACG	2	6	63044	63049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515653

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