MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021721	TGA	2	6	219159	219164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512713
3502	NC_021721	TAA	2	6	219185	219190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512713
3503	NC_021721	AGC	2	6	219197	219202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512713
3504	NC_021721	CAA	2	6	219274	219279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512713
3505	NC_021721	ACC	2	6	219313	219318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512713
3506	NC_021721	GAA	2	6	219322	219327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512713
3507	NC_021721	GTC	2	6	219340	219345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512713
3508	NC_021721	ATCGAC	2	12	219376	219387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523512713
3509	NC_021721	TTG	2	6	219397	219402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512713
3510	NC_021721	TAA	2	6	219406	219411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512713
3511	NC_021721	ATTTTA	2	12	219479	219490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512713
3512	NC_021721	TTA	2	6	219628	219633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512714
3513	NC_021721	TTG	2	6	219755	219760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512714
3514	NC_021721	T	7	7	219907	219913	0 %	100 %	0 %	0 %	523512714
3515	NC_021721	GTT	2	6	219972	219977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512714
3516	NC_021721	CAG	2	6	220328	220333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512715
3517	NC_021721	A	6	6	220430	220435	100 %	0 %	0 %	0 %	523512715
3518	NC_021721	A	6	6	220726	220731	100 %	0 %	0 %	0 %	523512715
3519	NC_021721	AATT	2	8	220868	220875	50 %	50 %	0 %	0 %	523512715
3520	NC_021721	GGC	2	6	220903	220908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512715
3521	NC_021721	TGC	2	6	220923	220928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512715
3522	NC_021721	CAAA	2	8	220994	221001	75 %	0 %	0 %	25 %	523512715
3523	NC_021721	ATC	2	6	221064	221069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512716
3524	NC_021721	GAC	2	6	221092	221097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512716
3525	NC_021721	GTT	2	6	221104	221109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512716
3526	NC_021721	CAA	2	6	221110	221115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512716
3527	NC_021721	ACG	2	6	221194	221199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512716
3528	NC_021721	TTG	2	6	221215	221220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512716
3529	NC_021721	ATT	2	6	221227	221232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512716
3530	NC_021721	ATC	2	6	221263	221268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512716
3531	NC_021721	CG	3	6	221287	221292	0 %	0 %	50 %	50 %	523512716
3532	NC_021721	CTGGG	2	10	221302	221311	0 %	20 %	60 %	20 %	523512716
3533	NC_021721	GCCA	2	8	221319	221326	25 %	0 %	25 %	50 %	523512716
3534	NC_021721	GAC	3	9	221341	221349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512716
3535	NC_021721	GAA	2	6	221407	221412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512716
3536	NC_021721	CAA	2	6	221502	221507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512716
3537	NC_021721	AAG	2	6	221540	221545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512716
3538	NC_021721	ACT	2	6	221586	221591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512716
3539	NC_021721	GCC	2	6	221617	221622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512716
3540	NC_021721	AAG	2	6	221695	221700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512716
3541	NC_021721	CGA	2	6	221728	221733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512716
3542	NC_021721	AGA	3	9	221826	221834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512716
3543	NC_021721	GAC	2	6	221839	221844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512716
3544	NC_021721	ATC	2	6	221857	221862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512716
3545	NC_021721	GAAA	2	8	221871	221878	75 %	0 %	25 %	0 %	523512716
3546	NC_021721	AGG	2	6	221885	221890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512716
3547	NC_021721	ATC	2	6	221905	221910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512717
3548	NC_021721	GGC	2	6	221929	221934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512717
3549	NC_021721	ACC	3	9	221944	221952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512717
3550	NC_021721	AAG	2	6	221989	221994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512717
3551	NC_021721	ATG	2	6	222077	222082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512717
3552	NC_021721	GCCA	2	8	222150	222157	25 %	0 %	25 %	50 %	523512717
3553	NC_021721	CTGG	2	8	222166	222173	0 %	25 %	50 %	25 %	523512717
3554	NC_021721	GGA	2	6	222240	222245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512717
3555	NC_021721	TGAT	2	8	222263	222270	25 %	50 %	25 %	0 %	523512717
3556	NC_021721	GGTT	2	8	222392	222399	0 %	50 %	50 %	0 %	523512717
3557	NC_021721	GTT	2	6	222438	222443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512717
3558	NC_021721	ATG	2	6	222452	222457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512717
3559	NC_021721	AGG	2	6	222635	222640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512717
3560	NC_021721	GCTG	2	8	222642	222649	0 %	25 %	50 %	25 %	523512717
3561	NC_021721	GAATAA	2	12	222658	222669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	523512717
3562	NC_021721	AAT	2	6	222734	222739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512718
3563	NC_021721	GAA	2	6	222746	222751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512718
3564	NC_021721	TGA	2	6	222802	222807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512718
3565	NC_021721	CTGG	2	8	222824	222831	0 %	25 %	50 %	25 %	523512718
3566	NC_021721	CAAA	2	8	222838	222845	75 %	0 %	0 %	25 %	523512718
3567	NC_021721	ATT	2	6	222896	222901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512718
3568	NC_021721	TGGC	2	8	222933	222940	0 %	25 %	50 %	25 %	523512718
3569	NC_021721	TCCA	2	8	222952	222959	25 %	25 %	0 %	50 %	523512718
3570	NC_021721	ATG	2	6	222986	222991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512718
3571	NC_021721	CGC	2	6	223032	223037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512718
3572	NC_021721	ACT	2	6	223137	223142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512718
3573	NC_021721	GCA	2	6	223162	223167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512718
3574	NC_021721	CAAA	2	8	223171	223178	75 %	0 %	0 %	25 %	523512718
3575	NC_021721	AAG	2	6	223262	223267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512718
3576	NC_021721	CAAT	2	8	223269	223276	50 %	25 %	0 %	25 %	523512718
3577	NC_021721	CAA	2	6	223435	223440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512718
3578	NC_021721	AGGCAA	2	12	223441	223452	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	523512718
3579	NC_021721	ACTTC	2	10	223464	223473	20 %	40 %	0 %	40 %	523512718
3580	NC_021721	ACTA	2	8	223521	223528	50 %	25 %	0 %	25 %	523512718
3581	NC_021721	GAA	2	6	223765	223770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512719
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3583	NC_021721	TGA	2	6	223857	223862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512719
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3585	NC_021721	GTAGA	2	10	223910	223919	40 %	20 %	40 %	0 %	523512719
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3589	NC_021721	TGT	2	6	224255	224260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512720
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3591	NC_021721	CGA	2	6	224326	224331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512720
3592	NC_021721	AAG	2	6	224422	224427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512720
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3597	NC_021721	GAT	3	9	224706	224714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512720
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3600	NC_021721	GCTA	2	8	224778	224785	25 %	25 %	25 %	25 %	523512720
3601	NC_021721	CTT	2	6	224807	224812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512720
3602	NC_021721	ATT	2	6	224883	224888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512720
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3604	NC_021721	CAT	2	6	225029	225034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512720
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3606	NC_021721	AACA	2	8	225167	225174	75 %	0 %	0 %	25 %	523512721
3607	NC_021721	TGA	2	6	225201	225206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512721
3608	NC_021721	GTC	2	6	225207	225212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512721
3609	NC_021721	CGG	2	6	225227	225232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512721
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3611	NC_021721	ATG	2	6	225308	225313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512721
3612	NC_021721	AT	3	6	225315	225320	50 %	50 %	0 %	0 %	523512721
3613	NC_021721	CGG	2	6	225348	225353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512721
3614	NC_021721	CGG	2	6	225362	225367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512721
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3619	NC_021721	TATG	2	8	225564	225571	25 %	50 %	25 %	0 %	523512721
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3621	NC_021721	AGC	2	6	225613	225618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512721
3622	NC_021721	TCT	2	6	225659	225664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512721
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3624	NC_021721	GCA	2	6	225687	225692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512721
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3632	NC_021721	ATC	2	6	226427	226432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512722
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3635	NC_021721	TTC	2	6	226589	226594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512722
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3643	NC_021721	AAGG	2	8	226862	226869	50 %	0 %	50 %	0 %	523512722
3644	NC_021721	TGC	2	6	226927	226932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512722
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3649	NC_021721	CGGTGT	2	12	227233	227244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523512722
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3651	NC_021721	ATG	2	6	227265	227270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512722
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3662	NC_021721	TTG	2	6	228050	228055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512723
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3729	NC_021721	GAT	2	6	231130	231135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512726
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3733	NC_021721	TGCA	2	8	231422	231429	25 %	25 %	25 %	25 %	523512726
3734	NC_021721	A	6	6	231466	231471	100 %	0 %	0 %	0 %	523512726
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3739	NC_021721	A	6	6	231703	231708	100 %	0 %	0 %	0 %	523512726
3740	NC_021721	ACC	2	6	231799	231804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512726
3741	NC_021721	CTT	2	6	231825	231830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512726
3742	NC_021721	TTC	2	6	231859	231864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512726
3743	NC_021721	GCT	2	6	232158	232163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512727
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3745	NC_021721	GCA	2	6	232394	232399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512727
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3750	NC_021721	GCT	2	6	232914	232919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512728
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3754	NC_021721	GTT	2	6	233061	233066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512728
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3761	NC_021721	TGC	2	6	233381	233386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512728
3762	NC_021721	ACC	2	6	233394	233399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512728
3763	NC_021721	GAT	2	6	233454	233459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512728
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3768	NC_021721	GCT	2	6	233613	233618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512728
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3862	NC_021721	GCCGAT	2	12	239884	239895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523512733
3863	NC_021721	ATT	2	6	239917	239922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512733
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3871	NC_021721	CTGG	2	8	240455	240462	0 %	25 %	50 %	25 %	523512733
3872	NC_021721	TTCT	2	8	240468	240475	0 %	75 %	0 %	25 %	523512733
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3882	NC_021721	CATGAT	2	12	241143	241154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523512734
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3982	NC_021721	TTG	2	6	246846	246851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512739
3983	NC_021721	TTA	2	6	246881	246886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512739
3984	NC_021721	GAC	2	6	246902	246907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512739
3985	NC_021721	CGA	2	6	246922	246927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512739
3986	NC_021721	AAC	2	6	247030	247035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512739
3987	NC_021721	AATGAC	2	12	247054	247065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523512739
3988	NC_021721	GCT	2	6	247084	247089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512739
3989	NC_021721	CAG	2	6	247193	247198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512739
3990	NC_021721	T	6	6	247228	247233	0 %	100 %	0 %	0 %	523512739
3991	NC_021721	ATG	2	6	247323	247328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512739
3992	NC_021721	ATT	2	6	247334	247339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512739
3993	NC_021721	AGCCAA	2	12	247360	247371	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	523512739
3994	NC_021721	GAA	2	6	247396	247401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512739
3995	NC_021721	TCAG	2	8	247429	247436	25 %	25 %	25 %	25 %	523512739
3996	NC_021721	GGC	2	6	247635	247640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512740
3997	NC_021721	TACG	2	8	247659	247666	25 %	25 %	25 %	25 %	523512740
3998	NC_021721	ATG	2	6	247671	247676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512740
3999	NC_021721	AAG	2	6	247825	247830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512740
4000	NC_021721	CAT	2	6	247851	247856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512740

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