MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021721	GAT	2	6	98622	98627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512593
1502	NC_021721	GCG	2	6	98676	98681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512593
1503	NC_021721	TGA	2	6	98708	98713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512593
1504	NC_021721	ATC	2	6	98721	98726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512593
1505	NC_021721	GATT	2	8	98761	98768	25 %	50 %	25 %	0 %	523512593
1506	NC_021721	CCG	2	6	98794	98799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512593
1507	NC_021721	T	7	7	98903	98909	0 %	100 %	0 %	0 %	523512593
1508	NC_021721	TTTC	2	8	98982	98989	0 %	75 %	0 %	25 %	523512594
1509	NC_021721	AACG	2	8	99057	99064	50 %	0 %	25 %	25 %	523512594
1510	NC_021721	CGG	2	6	99110	99115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512594
1511	NC_021721	GGT	2	6	99141	99146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512594
1512	NC_021721	TG	3	6	99173	99178	0 %	50 %	50 %	0 %	523512594
1513	NC_021721	A	6	6	99215	99220	100 %	0 %	0 %	0 %	523512594
1514	NC_021721	GCT	2	6	99688	99693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512594
1515	NC_021721	AGG	2	6	99723	99728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512594
1516	NC_021721	CAT	2	6	99748	99753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512594
1517	NC_021721	ATTGA	2	10	99772	99781	40 %	40 %	20 %	0 %	523512594
1518	NC_021721	CGA	2	6	99803	99808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512594
1519	NC_021721	CAA	2	6	99847	99852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512594
1520	NC_021721	GTT	2	6	99976	99981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512595
1521	NC_021721	TGG	2	6	100019	100024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512595
1522	NC_021721	GTCT	2	8	100047	100054	0 %	50 %	25 %	25 %	523512595
1523	NC_021721	GAC	2	6	100125	100130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1524	NC_021721	GAT	2	6	100132	100137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512595
1525	NC_021721	CTG	2	6	100169	100174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1526	NC_021721	ATA	2	6	100235	100240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512595
1527	NC_021721	CGA	2	6	100343	100348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1528	NC_021721	TGA	2	6	100464	100469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512595
1529	NC_021721	GAC	2	6	100486	100491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1530	NC_021721	CGG	2	6	100520	100525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512595
1531	NC_021721	GAA	2	6	100603	100608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512595
1532	NC_021721	AAG	2	6	100630	100635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512595
1533	NC_021721	GAA	2	6	100717	100722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512595
1534	NC_021721	TCGAAG	2	12	100730	100741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523512595
1535	NC_021721	GAT	2	6	100759	100764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512595
1536	NC_021721	GTT	2	6	100798	100803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512595
1537	NC_021721	GAC	2	6	100807	100812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1538	NC_021721	GCA	2	6	100853	100858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1539	NC_021721	TTC	2	6	100906	100911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512595
1540	NC_021721	GCT	2	6	100948	100953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512595
1541	NC_021721	GATG	2	8	100980	100987	25 %	25 %	50 %	0 %	523512595
1542	NC_021721	A	7	7	101024	101030	100 %	0 %	0 %	0 %	523512596
1543	NC_021721	ATC	2	6	101036	101041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512596
1544	NC_021721	AGG	2	6	101049	101054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512596
1545	NC_021721	CGA	2	6	101065	101070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512596
1546	NC_021721	T	6	6	101078	101083	0 %	100 %	0 %	0 %	523512596
1547	NC_021721	TGG	2	6	101237	101242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512597
1548	NC_021721	GCC	2	6	101257	101262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512597
1549	NC_021721	GCT	2	6	101386	101391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512597
1550	NC_021721	CGC	2	6	101409	101414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512597
1551	NC_021721	GCT	2	6	101515	101520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512597
1552	NC_021721	TAT	2	6	101947	101952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512598
1553	NC_021721	TGG	2	6	101989	101994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512598
1554	NC_021721	AGC	2	6	102025	102030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512598
1555	NC_021721	GAA	2	6	102047	102052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512598
1556	NC_021721	TGT	2	6	102061	102066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512598
1557	NC_021721	CTA	2	6	102094	102099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512598
1558	NC_021721	GTT	2	6	102128	102133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512598
1559	NC_021721	TCT	2	6	102170	102175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512598
1560	NC_021721	TGA	2	6	102181	102186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512598
1561	NC_021721	ATG	2	6	102234	102239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512598
1562	NC_021721	GCC	2	6	102286	102291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512598
1563	NC_021721	CTG	2	6	102303	102308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512599
1564	NC_021721	GAT	2	6	102362	102367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512599
1565	NC_021721	CAAAA	2	10	102446	102455	80 %	0 %	0 %	20 %	523512599
1566	NC_021721	AGC	2	6	102469	102474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512599
1567	NC_021721	ATT	2	6	102477	102482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512599
1568	NC_021721	AT	3	6	102524	102529	50 %	50 %	0 %	0 %	523512599
1569	NC_021721	TTC	2	6	102537	102542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512599
1570	NC_021721	TATG	2	8	102658	102665	25 %	50 %	25 %	0 %	523512599
1571	NC_021721	TAA	2	6	102704	102709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512599
1572	NC_021721	A	6	6	102774	102779	100 %	0 %	0 %	0 %	523512599
1573	NC_021721	TAC	2	6	102805	102810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512599
1574	NC_021721	TA	3	6	102814	102819	50 %	50 %	0 %	0 %	523512599
1575	NC_021721	CCG	2	6	102829	102834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512599
1576	NC_021721	T	6	6	102851	102856	0 %	100 %	0 %	0 %	523512599
1577	NC_021721	ATTTC	2	10	102972	102981	20 %	60 %	0 %	20 %	523512599
1578	NC_021721	TTC	2	6	103041	103046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512599
1579	NC_021721	GAA	2	6	103124	103129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512599
1580	NC_021721	TTGA	2	8	103138	103145	25 %	50 %	25 %	0 %	523512599
1581	NC_021721	CTGA	2	8	103629	103636	25 %	25 %	25 %	25 %	523512600
1582	NC_021721	TAA	2	6	103649	103654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512600
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1584	NC_021721	T	7	7	103840	103846	0 %	100 %	0 %	0 %	523512600
1585	NC_021721	T	6	6	103849	103854	0 %	100 %	0 %	0 %	523512600
1586	NC_021721	T	6	6	103915	103920	0 %	100 %	0 %	0 %	523512600
1587	NC_021721	ATT	2	6	103923	103928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512600
1588	NC_021721	AAG	2	6	103930	103935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512600
1589	NC_021721	ACC	2	6	103966	103971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512600
1590	NC_021721	ATG	3	9	103988	103996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512600
1591	NC_021721	CACGAT	2	12	104058	104069	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523512600
1592	NC_021721	TCA	2	6	104105	104110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512600
1593	NC_021721	ACG	2	6	104215	104220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512600
1594	NC_021721	GGTA	2	8	104236	104243	25 %	25 %	50 %	0 %	523512600
1595	NC_021721	GAA	2	6	104280	104285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512600
1596	NC_021721	TAC	2	6	104423	104428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512600
1597	NC_021721	TTC	2	6	104462	104467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512600
1598	NC_021721	CTT	2	6	104482	104487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512600
1599	NC_021721	AAGA	2	8	104662	104669	75 %	0 %	25 %	0 %	523512600
1600	NC_021721	TAAA	2	8	104834	104841	75 %	25 %	0 %	0 %	523512600
1601	NC_021721	GA	3	6	104916	104921	50 %	0 %	50 %	0 %	523512600
1602	NC_021721	AGAA	2	8	104937	104944	75 %	0 %	25 %	0 %	523512600
1603	NC_021721	T	6	6	104979	104984	0 %	100 %	0 %	0 %	523512600
1604	NC_021721	A	8	8	105029	105036	100 %	0 %	0 %	0 %	523512600
1605	NC_021721	GTG	2	6	105053	105058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512600
1606	NC_021721	TTGC	2	8	105076	105083	0 %	50 %	25 %	25 %	523512600
1607	NC_021721	A	6	6	105094	105099	100 %	0 %	0 %	0 %	523512600
1608	NC_021721	GTAT	2	8	105107	105114	25 %	50 %	25 %	0 %	523512600
1609	NC_021721	TTTG	2	8	105167	105174	0 %	75 %	25 %	0 %	523512600
1610	NC_021721	ATT	2	6	105202	105207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512600
1611	NC_021721	T	6	6	105916	105921	0 %	100 %	0 %	0 %	523512601
1612	NC_021721	GATC	2	8	106014	106021	25 %	25 %	25 %	25 %	523512601
1613	NC_021721	ATG	2	6	106061	106066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512601
1614	NC_021721	CATG	2	8	106071	106078	25 %	25 %	25 %	25 %	523512601
1615	NC_021721	AAAT	3	12	106115	106126	75 %	25 %	0 %	0 %	523512601
1616	NC_021721	ATG	2	6	106145	106150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512601
1617	NC_021721	TGC	2	6	106166	106171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512601
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1619	NC_021721	CAA	2	6	106224	106229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512601
1620	NC_021721	TGA	2	6	106245	106250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512601
1621	NC_021721	AGA	2	6	106352	106357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512601
1622	NC_021721	TTG	2	6	106382	106387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512601
1623	NC_021721	GTT	2	6	106404	106409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512601
1624	NC_021721	TGG	2	6	106410	106415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512601
1625	NC_021721	CAT	2	6	106574	106579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512602
1626	NC_021721	TTA	2	6	106683	106688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512602
1627	NC_021721	GTT	2	6	106743	106748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512602
1628	NC_021721	T	7	7	106759	106765	0 %	100 %	0 %	0 %	523512602
1629	NC_021721	GAA	2	6	107119	107124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512603
1630	NC_021721	ATGCGA	2	12	107165	107176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523512603
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1632	NC_021721	TGC	2	6	107259	107264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512603
1633	NC_021721	T	6	6	107292	107297	0 %	100 %	0 %	0 %	523512603
1634	NC_021721	AAG	2	6	107373	107378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512603
1635	NC_021721	GCA	2	6	107529	107534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512603
1636	NC_021721	AGA	2	6	107662	107667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512603
1637	NC_021721	CA	3	6	107716	107721	50 %	0 %	0 %	50 %	523512603
1638	NC_021721	GAT	2	6	107729	107734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512603
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1640	NC_021721	CTG	2	6	107837	107842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512603
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1642	NC_021721	GGC	2	6	108026	108031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512603
1643	NC_021721	GGT	3	9	108037	108045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512603
1644	NC_021721	GGC	2	6	108077	108082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512603
1645	NC_021721	TGT	2	6	108175	108180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512603
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1647	NC_021721	GCAA	2	8	108376	108383	50 %	0 %	25 %	25 %	523512603
1648	NC_021721	CTG	2	6	108395	108400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512603
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1651	NC_021721	ATC	2	6	108476	108481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512603
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1654	NC_021721	TGC	2	6	108697	108702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512603
1655	NC_021721	GCA	2	6	108872	108877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512603
1656	NC_021721	TGT	2	6	108894	108899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512603
1657	NC_021721	TCA	2	6	108927	108932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512603
1658	NC_021721	CCGC	2	8	108963	108970	0 %	0 %	25 %	75 %	523512603
1659	NC_021721	TCA	2	6	108996	109001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512603
1660	NC_021721	GCG	3	9	109014	109022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512603
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1662	NC_021721	A	6	6	109100	109105	100 %	0 %	0 %	0 %	523512603
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1668	NC_021721	GAAAA	2	10	109316	109325	80 %	0 %	20 %	0 %	523512604
1669	NC_021721	GAGGCT	2	12	109328	109339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523512604
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1671	NC_021721	GTT	2	6	109370	109375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512604
1672	NC_021721	CAAAG	2	10	109382	109391	60 %	0 %	20 %	20 %	523512604
1673	NC_021721	GTT	2	6	109408	109413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512604
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1732	NC_021721	GAT	2	6	112347	112352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512606
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1742	NC_021721	CAG	2	6	113524	113529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512607
1743	NC_021721	GCC	2	6	113638	113643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512607
1744	NC_021721	GGCC	2	8	113675	113682	0 %	0 %	50 %	50 %	523512607
1745	NC_021721	GGC	2	6	113803	113808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512607
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1747	NC_021721	GCA	2	6	113844	113849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512607
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1843	NC_021721	TGA	2	6	118334	118339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512611
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1850	NC_021721	GCGA	2	8	118606	118613	25 %	0 %	50 %	25 %	523512612
1851	NC_021721	ATC	2	6	118638	118643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512612
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1860	NC_021721	A	6	6	119267	119272	100 %	0 %	0 %	0 %	523512612
1861	NC_021721	TGA	2	6	119275	119280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512612
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1864	NC_021721	GCA	2	6	119360	119365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512612
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1866	NC_021721	GCA	2	6	119434	119439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512612
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1893	NC_021721	TCA	2	6	120561	120566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512612
1894	NC_021721	GCC	2	6	120685	120690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512612
1895	NC_021721	TGG	2	6	120767	120772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512612
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1975	NC_021721	A	8	8	125064	125071	100 %	0 %	0 %	0 %	523512615
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1978	NC_021721	TCA	2	6	125101	125106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512615
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1980	NC_021721	TCA	2	6	125125	125130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512615
1981	NC_021721	CG	3	6	125145	125150	0 %	0 %	50 %	50 %	523512615
1982	NC_021721	GTT	2	6	125153	125158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512615
1983	NC_021721	TTG	2	6	125173	125178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512615
1984	NC_021721	GC	3	6	125344	125349	0 %	0 %	50 %	50 %	523512615
1985	NC_021721	T	6	6	125351	125356	0 %	100 %	0 %	0 %	523512615
1986	NC_021721	GGA	2	6	125357	125362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512615
1987	NC_021721	CTG	2	6	125400	125405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512615
1988	NC_021721	AAG	2	6	125419	125424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512615
1989	NC_021721	TTA	2	6	125533	125538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512615
1990	NC_021721	GTG	2	6	125575	125580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512615
1991	NC_021721	TGG	2	6	125621	125626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512615
1992	NC_021721	CAAGT	2	10	125666	125675	40 %	20 %	20 %	20 %	523512615
1993	NC_021721	CAGC	2	8	125740	125747	25 %	0 %	25 %	50 %	523512615
1994	NC_021721	TCT	2	6	125869	125874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512615
1995	NC_021721	GCC	2	6	125901	125906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512615
1996	NC_021721	GTG	2	6	126051	126056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512615
1997	NC_021721	GCC	2	6	126090	126095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512615
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1999	NC_021721	ATC	2	6	126133	126138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512615
2000	NC_021721	ATT	2	6	126163	126168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512615

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