MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021721	CCTT	2	8	315486	315493	0 %	50 %	0 %	50 %	523512802
5002	NC_021721	GAC	2	6	315506	315511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512802
5003	NC_021721	ATT	2	6	315521	315526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512802
5004	NC_021721	TGA	2	6	315560	315565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512802
5005	NC_021721	ATC	2	6	315590	315595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512802
5006	NC_021721	ATA	2	6	315618	315623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512802
5007	NC_021721	GACGCT	2	12	315701	315712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523512803
5008	NC_021721	ATGT	2	8	315721	315728	25 %	50 %	25 %	0 %	523512803
5009	NC_021721	CAG	2	6	315804	315809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512803
5010	NC_021721	AAG	2	6	316006	316011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512803
5011	NC_021721	TTG	2	6	316016	316021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512803
5012	NC_021721	TAG	2	6	316125	316130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512803
5013	NC_021721	ATG	2	6	316225	316230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512803
5014	NC_021721	GCC	2	6	316264	316269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512803
5015	NC_021721	AGT	2	6	316315	316320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512803
5016	NC_021721	ATG	2	6	316324	316329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512803
5017	NC_021721	AAT	2	6	316347	316352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512803
5018	NC_021721	ATC	2	6	316440	316445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512803
5019	NC_021721	GGC	2	6	316563	316568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512803
5020	NC_021721	CGA	2	6	316583	316588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512803
5021	NC_021721	GCCA	2	8	316778	316785	25 %	0 %	25 %	50 %	523512803
5022	NC_021721	CAA	2	6	316790	316795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512803
5023	NC_021721	CAG	2	6	316832	316837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512803
5024	NC_021721	CCCAAT	2	12	316890	316901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	523512803
5025	NC_021721	GC	3	6	316912	316917	0 %	0 %	50 %	50 %	523512803
5026	NC_021721	ATA	2	6	316963	316968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512803
5027	NC_021721	CAA	2	6	316997	317002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512803
5028	NC_021721	ATG	2	6	317459	317464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512804
5029	NC_021721	TTG	2	6	317505	317510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512804
5030	NC_021721	TTA	2	6	317517	317522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512804
5031	NC_021721	GAT	2	6	317801	317806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512804
5032	NC_021721	A	7	7	317884	317890	100 %	0 %	0 %	0 %	523512804
5033	NC_021721	GAA	2	6	317947	317952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512805
5034	NC_021721	GAAA	2	8	317958	317965	75 %	0 %	25 %	0 %	523512805
5035	NC_021721	CA	3	6	317979	317984	50 %	0 %	0 %	50 %	523512805
5036	NC_021721	TAC	2	6	318051	318056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512805
5037	NC_021721	GCT	2	6	318468	318473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512806
5038	NC_021721	A	6	6	318489	318494	100 %	0 %	0 %	0 %	523512806
5039	NC_021721	GAAG	2	8	318552	318559	50 %	0 %	50 %	0 %	523512806
5040	NC_021721	AAC	2	6	318599	318604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512806
5041	NC_021721	ATT	2	6	318623	318628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512806
5042	NC_021721	TGA	2	6	318666	318671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512806
5043	NC_021721	ATG	3	9	318731	318739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512806
5044	NC_021721	ACGC	2	8	318793	318800	25 %	0 %	25 %	50 %	523512806
5045	NC_021721	TTG	2	6	318907	318912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512806
5046	NC_021721	AAC	2	6	318993	318998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512806
5047	NC_021721	TCAA	2	8	319064	319071	50 %	25 %	0 %	25 %	523512806
5048	NC_021721	TCA	2	6	319072	319077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512806
5049	NC_021721	GTT	2	6	319170	319175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512806
5050	NC_021721	GAT	2	6	319219	319224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512806
5051	NC_021721	AAT	2	6	319488	319493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512807
5052	NC_021721	A	6	6	319503	319508	100 %	0 %	0 %	0 %	523512807
5053	NC_021721	ACA	2	6	319525	319530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512807
5054	NC_021721	ATA	2	6	319544	319549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512807
5055	NC_021721	A	6	6	319553	319558	100 %	0 %	0 %	0 %	523512807
5056	NC_021721	CTTA	2	8	319578	319585	25 %	50 %	0 %	25 %	523512807
5057	NC_021721	CAA	2	6	319604	319609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512807
5058	NC_021721	TTG	2	6	319616	319621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512807
5059	NC_021721	GAA	2	6	319690	319695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512807
5060	NC_021721	GCC	2	6	319759	319764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512807
5061	NC_021721	AAG	2	6	319787	319792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512807
5062	NC_021721	TTGG	2	8	319812	319819	0 %	50 %	50 %	0 %	523512807
5063	NC_021721	TGG	2	6	319863	319868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512807
5064	NC_021721	AG	3	6	319893	319898	50 %	0 %	50 %	0 %	523512807
5065	NC_021721	GAG	2	6	319951	319956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523512807
5066	NC_021721	GAC	2	6	319963	319968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512807
5067	NC_021721	GCT	2	6	319971	319976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512807
5068	NC_021721	CCGA	2	8	320014	320021	25 %	0 %	25 %	50 %	523512807
5069	NC_021721	TTG	2	6	320119	320124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512807
5070	NC_021721	CGG	2	6	320188	320193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512807
5071	NC_021721	CTG	2	6	320237	320242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512807
5072	NC_021721	CAGC	2	8	320314	320321	25 %	0 %	25 %	50 %	523512807
5073	NC_021721	GCCA	2	8	320322	320329	25 %	0 %	25 %	50 %	523512807
5074	NC_021721	AGA	2	6	320330	320335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512807
5075	NC_021721	GGC	2	6	320455	320460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512807
5076	NC_021721	TC	3	6	320469	320474	0 %	50 %	0 %	50 %	523512807
5077	NC_021721	GAA	2	6	320502	320507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512807
5078	NC_021721	ACC	2	6	320539	320544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512807
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5080	NC_021721	TGC	2	6	320571	320576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512807
5081	NC_021721	CGG	2	6	320678	320683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512807
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5086	NC_021721	TCA	2	6	321022	321027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512808
5087	NC_021721	GTC	2	6	321035	321040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512808
5088	NC_021721	GGC	2	6	321234	321239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512808
5089	NC_021721	TTG	2	6	321243	321248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512808
5090	NC_021721	ACCG	2	8	321254	321261	25 %	0 %	25 %	50 %	523512808
5091	NC_021721	GAC	2	6	321282	321287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512808
5092	NC_021721	TTA	2	6	321322	321327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512808
5093	NC_021721	GTG	2	6	321444	321449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512808
5094	NC_021721	TGA	2	6	321620	321625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512808
5095	NC_021721	GT	3	6	321674	321679	0 %	50 %	50 %	0 %	523512808
5096	NC_021721	TTCAAG	2	12	321771	321782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523512808
5097	NC_021721	GC	3	6	321792	321797	0 %	0 %	50 %	50 %	523512808
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5101	NC_021721	AC	3	6	321968	321973	50 %	0 %	0 %	50 %	523512808
5102	NC_021721	GC	3	6	321987	321992	0 %	0 %	50 %	50 %	523512808
5103	NC_021721	TCC	2	6	322043	322048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523512809
5104	NC_021721	CCG	2	6	322130	322135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512809
5105	NC_021721	CGC	2	6	322224	322229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512809
5106	NC_021721	TC	3	6	322314	322319	0 %	50 %	0 %	50 %	523512809
5107	NC_021721	CAT	2	6	322377	322382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512809
5108	NC_021721	GCGT	2	8	322422	322429	0 %	25 %	50 %	25 %	523512809
5109	NC_021721	TGAT	2	8	322438	322445	25 %	50 %	25 %	0 %	523512809
5110	NC_021721	AATC	2	8	322467	322474	50 %	25 %	0 %	25 %	523512809
5111	NC_021721	CAGC	2	8	322737	322744	25 %	0 %	25 %	50 %	523512809
5112	NC_021721	CCG	2	6	322831	322836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512809
5113	NC_021721	TGGG	2	8	322964	322971	0 %	25 %	75 %	0 %	523512809
5114	NC_021721	ACC	2	6	322976	322981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512809
5115	NC_021721	AGGCA	2	10	322999	323008	40 %	0 %	40 %	20 %	523512809
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5118	NC_021721	T	7	7	323082	323088	0 %	100 %	0 %	0 %	523512809
5119	NC_021721	TCCAG	2	10	323282	323291	20 %	20 %	20 %	40 %	523512810
5120	NC_021721	GTCTTC	2	12	323299	323310	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	523512810
5121	NC_021721	T	6	6	323338	323343	0 %	100 %	0 %	0 %	523512810
5122	NC_021721	CAGC	2	8	323403	323410	25 %	0 %	25 %	50 %	523512810
5123	NC_021721	TGG	2	6	323488	323493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512810
5124	NC_021721	GAA	2	6	323530	323535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512810
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5145	NC_021721	CAT	2	6	324967	324972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512811
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5154	NC_021721	TTG	2	6	325758	325763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512813
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5161	NC_021721	TCA	2	6	326038	326043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512813
5162	NC_021721	GCA	2	6	326071	326076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512813
5163	NC_021721	AGTC	2	8	326087	326094	25 %	25 %	25 %	25 %	523512813
5164	NC_021721	CTG	2	6	326141	326146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512813
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5182	NC_021721	TCA	2	6	327063	327068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512814
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5229	NC_021721	ATTAT	2	10	330670	330679	40 %	60 %	0 %	0 %	523512816
5230	NC_021721	A	6	6	330690	330695	100 %	0 %	0 %	0 %	523512816
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5234	NC_021721	A	6	6	331158	331163	100 %	0 %	0 %	0 %	523512816
5235	NC_021721	AAG	2	6	331229	331234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523512816
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5243	NC_021721	CATCA	2	10	331987	331996	40 %	20 %	0 %	40 %	523512817
5244	NC_021721	CTT	2	6	332032	332037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523512817
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5337	NC_021721	ATC	2	6	338299	338304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512824
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5362	NC_021721	GTC	2	6	339786	339791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512826
5363	NC_021721	GCT	2	6	339806	339811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512826
5364	NC_021721	A	7	7	339867	339873	100 %	0 %	0 %	0 %	523512826
5365	NC_021721	GCG	2	6	339900	339905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512826
5366	NC_021721	ATT	2	6	339939	339944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512826
5367	NC_021721	CAC	2	6	340021	340026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512826
5368	NC_021721	AGC	2	6	340112	340117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512826
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5370	NC_021721	ATGG	2	8	340464	340471	25 %	25 %	50 %	0 %	523512827
5371	NC_021721	GGC	2	6	340496	340501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512827
5372	NC_021721	TCA	2	6	340534	340539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512827
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5374	NC_021721	CGG	2	6	340650	340655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512828
5375	NC_021721	TTA	2	6	340690	340695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512828
5376	NC_021721	T	6	6	340717	340722	0 %	100 %	0 %	0 %	523512828
5377	NC_021721	GTT	3	9	340749	340757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512828
5378	NC_021721	GAC	2	6	340820	340825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523512828
5379	NC_021721	TGA	2	6	340838	340843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512828
5380	NC_021721	GAT	2	6	340979	340984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512828
5381	NC_021721	CTG	2	6	341034	341039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512828
5382	NC_021721	TAT	2	6	341048	341053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512828
5383	NC_021721	TATT	2	8	341059	341066	25 %	75 %	0 %	0 %	523512828
5384	NC_021721	GCG	2	6	341121	341126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512828
5385	NC_021721	CGG	2	6	341161	341166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512828
5386	NC_021721	GCAT	2	8	341182	341189	25 %	25 %	25 %	25 %	523512828
5387	NC_021721	CAA	2	6	341194	341199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523512828
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5389	NC_021721	T	6	6	341372	341377	0 %	100 %	0 %	0 %	523512828
5390	NC_021721	GAT	2	6	341433	341438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512828
5391	NC_021721	AATG	2	8	341444	341451	50 %	25 %	25 %	0 %	523512828
5392	NC_021721	TTA	2	6	341456	341461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523512828
5393	NC_021721	TTGA	2	8	341562	341569	25 %	50 %	25 %	0 %	523512828
5394	NC_021721	GTT	2	6	341624	341629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512828
5395	NC_021721	CAAG	2	8	341639	341646	50 %	0 %	25 %	25 %	523512828
5396	NC_021721	TTGCTG	2	12	341694	341705	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523512828
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5399	NC_021721	TGA	2	6	341980	341985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512828
5400	NC_021721	ATC	2	6	341988	341993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512828
5401	NC_021721	TCA	2	6	342022	342027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512828
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5403	NC_021721	GCT	2	6	342520	342525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512829
5404	NC_021721	ATC	2	6	342526	342531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512829
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5407	NC_021721	ATGAA	2	10	342575	342584	60 %	20 %	20 %	0 %	523512829
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5420	NC_021721	TCA	2	6	345995	346000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512831
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5436	NC_021721	GCG	2	6	346933	346938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512831
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5439	NC_021721	TGG	2	6	347318	347323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512832
5440	NC_021721	CGG	2	6	347448	347453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512832
5441	NC_021721	TGTC	2	8	347462	347469	0 %	50 %	25 %	25 %	523512832
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5452	NC_021721	ATC	2	6	348091	348096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512832
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5480	NC_021721	ATC	2	6	350029	350034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523512834
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5482	NC_021721	CGGC	2	8	350123	350130	0 %	0 %	50 %	50 %	523512834
5483	NC_021721	ACAG	2	8	350163	350170	50 %	0 %	25 %	25 %	523512834
5484	NC_021721	GCGG	2	8	350274	350281	0 %	0 %	75 %	25 %	523512834
5485	NC_021721	TAA	2	6	350720	350725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523512835
5486	NC_021721	CAC	2	6	350755	350760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512835
5487	NC_021721	TCG	2	6	350762	350767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512835
5488	NC_021721	TCAA	2	8	350780	350787	50 %	25 %	0 %	25 %	523512835
5489	NC_021721	TTGCTT	2	12	350860	350871	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	523512835
5490	NC_021721	CTG	2	6	351005	351010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512835
5491	NC_021721	TGC	2	6	351047	351052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523512835
5492	NC_021721	GCC	2	6	351058	351063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523512835
5493	NC_021721	GGC	2	6	351331	351336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523512835
5494	NC_021721	TGG	2	6	351408	351413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523512835
5495	NC_021721	GTT	2	6	351523	351528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512835
5496	NC_021721	AGT	2	6	351608	351613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523512835
5497	NC_021721	TGT	2	6	351753	351758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512835
5498	NC_021721	TTGAA	2	10	351766	351775	40 %	40 %	20 %	0 %	523512835
5499	NC_021721	ACC	2	6	351781	351786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523512835
5500	NC_021721	GTT	2	6	351801	351806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523512835

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