MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 1254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021519	CAA	2	6	56677	56682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844387
1002	NC_021519	TGGT	2	8	56695	56702	0 %	50 %	50 %	0 %	513844387
1003	NC_021519	AGA	2	6	56766	56771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844387
1004	NC_021519	TTG	2	6	56773	56778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844387
1005	NC_021519	GCTT	2	8	56920	56927	0 %	50 %	25 %	25 %	513844387
1006	NC_021519	TGG	2	6	56960	56965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844387
1007	NC_021519	TA	3	6	56975	56980	50 %	50 %	0 %	0 %	513844387
1008	NC_021519	AAAT	2	8	57047	57054	75 %	25 %	0 %	0 %	513844388
1009	NC_021519	GAA	2	6	57070	57075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844388
1010	NC_021519	A	6	6	57074	57079	100 %	0 %	0 %	0 %	513844388
1011	NC_021519	TTG	2	6	57147	57152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844388
1012	NC_021519	TAT	2	6	57161	57166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844388
1013	NC_021519	GTG	2	6	57211	57216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844388
1014	NC_021519	AAGG	2	8	57241	57248	50 %	0 %	50 %	0 %	513844388
1015	NC_021519	CCA	2	6	57256	57261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844388
1016	NC_021519	GTG	2	6	57273	57278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844388
1017	NC_021519	GCAAT	2	10	57290	57299	40 %	20 %	20 %	20 %	513844388
1018	NC_021519	GGC	2	6	57866	57871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844389
1019	NC_021519	GCC	2	6	57899	57904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844389
1020	NC_021519	TTCGT	2	10	57919	57928	0 %	60 %	20 %	20 %	513844389
1021	NC_021519	GTA	2	6	57932	57937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844389
1022	NC_021519	CTT	2	6	57947	57952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844389
1023	NC_021519	AAG	2	6	58023	58028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844389
1024	NC_021519	TCG	2	6	58061	58066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844389
1025	NC_021519	TGG	2	6	58116	58121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844389
1026	NC_021519	TTG	2	6	58260	58265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844389
1027	NC_021519	TCT	2	6	58435	58440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844389
1028	NC_021519	AAT	2	6	58754	58759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844390
1029	NC_021519	TCT	2	6	58823	58828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844390
1030	NC_021519	TCT	2	6	58839	58844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844390
1031	NC_021519	CTT	2	6	58855	58860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844390
1032	NC_021519	TTTC	2	8	58947	58954	0 %	75 %	0 %	25 %	513844390
1033	NC_021519	AAG	2	6	59010	59015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844390
1034	NC_021519	ATT	2	6	59017	59022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844390
1035	NC_021519	AAT	2	6	59023	59028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844390
1036	NC_021519	AGC	2	6	59110	59115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844390
1037	NC_021519	AAT	2	6	59129	59134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844390
1038	NC_021519	GAC	2	6	59857	59862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844391
1039	NC_021519	CCAG	2	8	59883	59890	25 %	0 %	25 %	50 %	513844391
1040	NC_021519	GGC	2	6	59905	59910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844391
1041	NC_021519	ATG	2	6	60030	60035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844391
1042	NC_021519	ACC	2	6	60080	60085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844391
1043	NC_021519	GGT	2	6	60127	60132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844391
1044	NC_021519	TTA	2	6	60140	60145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844391
1045	NC_021519	ATT	2	6	60161	60166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844391
1046	NC_021519	AAG	2	6	60345	60350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844391
1047	NC_021519	CAGAC	2	10	60353	60362	40 %	0 %	20 %	40 %	513844391
1048	NC_021519	TTA	2	6	60413	60418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844391
1049	NC_021519	TA	3	6	60474	60479	50 %	50 %	0 %	0 %	513844391
1050	NC_021519	TTAA	2	8	60668	60675	50 %	50 %	0 %	0 %	513844391
1051	NC_021519	TGCGAG	2	12	60763	60774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	513844391
1052	NC_021519	GCG	2	6	60785	60790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844391
1053	NC_021519	GGC	2	6	60874	60879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844391
1054	NC_021519	ATT	2	6	60901	60906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844391
1055	NC_021519	A	6	6	60912	60917	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
1056	NC_021519	CGC	2	6	60936	60941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844391
1057	NC_021519	ATT	2	6	60986	60991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844391
1058	NC_021519	AGT	2	6	61000	61005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844391
1059	NC_021519	CAAT	2	8	61170	61177	50 %	25 %	0 %	25 %	513844391
1060	NC_021519	ACC	2	6	61274	61279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844391
1061	NC_021519	CGA	2	6	61281	61286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844391
1062	NC_021519	GCG	2	6	61373	61378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844391
1063	NC_021519	CGG	2	6	61445	61450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844391
1064	NC_021519	GAA	2	6	61465	61470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844391
1065	NC_021519	A	6	6	61592	61597	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
1066	NC_021519	AAG	2	6	61653	61658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844391
1067	NC_021519	TGG	2	6	61701	61706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844391
1068	NC_021519	CAA	2	6	61709	61714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844391
1069	NC_021519	ACA	2	6	61729	61734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844391
1070	NC_021519	GCC	2	6	61742	61747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844391
1071	NC_021519	AAC	2	6	61887	61892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844391
1072	NC_021519	A	6	6	61949	61954	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
1073	NC_021519	TTTGAT	2	12	61994	62005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	513844391
1074	NC_021519	AGT	3	9	62013	62021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844391
1075	NC_021519	ATT	2	6	62349	62354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844392
1076	NC_021519	ACT	2	6	62481	62486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844392
1077	NC_021519	CAG	2	6	62490	62495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844392
1078	NC_021519	GTG	2	6	62532	62537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844392
1079	NC_021519	CG	3	6	62621	62626	0 %	0 %	50 %	50 %	513844392
1080	NC_021519	TTA	2	6	62634	62639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844392
1081	NC_021519	CGGC	2	8	62683	62690	0 %	0 %	50 %	50 %	513844392
1082	NC_021519	TGG	2	6	62695	62700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844392
1083	NC_021519	ATG	2	6	63004	63009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844392
1084	NC_021519	TTGA	2	8	63024	63031	25 %	50 %	25 %	0 %	513844392
1085	NC_021519	TGG	2	6	63082	63087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844392
1086	NC_021519	TCAATT	2	12	63179	63190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	513844392
1087	NC_021519	AGT	2	6	63221	63226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844392
1088	NC_021519	AAG	2	6	63300	63305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844393
1089	NC_021519	GGCGG	2	10	63322	63331	0 %	0 %	80 %	20 %	513844393
1090	NC_021519	G	6	6	63452	63457	0 %	0 %	100 %	0 %	513844394
1091	NC_021519	AATT	2	8	63485	63492	50 %	50 %	0 %	0 %	513844394
1092	NC_021519	A	6	6	63523	63528	100 %	0 %	0 %	0 %	513844394
1093	NC_021519	GCAA	2	8	63570	63577	50 %	0 %	25 %	25 %	513844394
1094	NC_021519	CAG	2	6	63646	63651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844394
1095	NC_021519	TGA	2	6	63741	63746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844394
1096	NC_021519	AAC	3	9	63899	63907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844394
1097	NC_021519	AGC	2	6	63915	63920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844394
1098	NC_021519	TTTG	2	8	64014	64021	0 %	75 %	25 %	0 %	513844394
1099	NC_021519	TTG	2	6	64038	64043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844395
1100	NC_021519	TGG	2	6	64132	64137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844395
1101	NC_021519	AAAC	2	8	64154	64161	75 %	0 %	0 %	25 %	513844395
1102	NC_021519	C	7	7	64180	64186	0 %	0 %	0 %	100 %	513844395
1103	NC_021519	CCT	2	6	64248	64253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513844395
1104	NC_021519	TGA	2	6	64379	64384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844395
1105	NC_021519	AGCC	2	8	64450	64457	25 %	0 %	25 %	50 %	513844395
1106	NC_021519	ACG	2	6	64494	64499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844395
1107	NC_021519	ATC	2	6	64507	64512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844395
1108	NC_021519	CGG	2	6	64542	64547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844395
1109	NC_021519	GT	3	6	64576	64581	0 %	50 %	50 %	0 %	513844395
1110	NC_021519	ACG	2	6	64656	64661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844395
1111	NC_021519	TTA	2	6	64728	64733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844395
1112	NC_021519	GAA	2	6	64841	64846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844395
1113	NC_021519	ATG	2	6	64864	64869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844395
1114	NC_021519	GTTC	2	8	64981	64988	0 %	50 %	25 %	25 %	513844395
1115	NC_021519	AAC	2	6	65032	65037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844395
1116	NC_021519	TTA	2	6	65121	65126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844395
1117	NC_021519	ATG	2	6	65218	65223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844395
1118	NC_021519	TGA	2	6	65273	65278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844395
1119	NC_021519	CAT	2	6	65303	65308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844395
1120	NC_021519	TAT	2	6	65309	65314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844395
1121	NC_021519	GAC	2	6	65315	65320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844395
1122	NC_021519	CAA	3	9	65349	65357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844395
1123	NC_021519	AAC	2	6	65380	65385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844395
1124	NC_021519	GTG	2	6	65406	65411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844395
1125	NC_021519	GAA	2	6	65423	65428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844395
1126	NC_021519	ATT	2	6	65469	65474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844395
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1232	NC_021519	CGA	2	6	72474	72479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844400
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1235	NC_021519	GGC	2	6	72876	72881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844401
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1239	NC_021519	T	6	6	73258	73263	0 %	100 %	0 %	0 %	513844401
1240	NC_021519	GAAT	2	8	73266	73273	50 %	25 %	25 %	0 %	513844401
1241	NC_021519	ATG	2	6	73303	73308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844401
1242	NC_021519	GAAGCC	2	12	73438	73449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844401
1243	NC_021519	ATTCA	2	10	73551	73560	40 %	40 %	0 %	20 %	513844401
1244	NC_021519	TGG	2	6	73561	73566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844401
1245	NC_021519	GCT	2	6	73586	73591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844401
1246	NC_021519	GTT	2	6	73619	73624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844401
1247	NC_021519	CGATAA	2	12	73669	73680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513844401
1248	NC_021519	T	7	7	73796	73802	0 %	100 %	0 %	0 %	513844402
1249	NC_021519	AGCC	2	8	73829	73836	25 %	0 %	25 %	50 %	513844402
1250	NC_021519	TTGGC	2	10	73884	73893	0 %	40 %	40 %	20 %	513844402
1251	NC_021519	GGC	2	6	73949	73954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844402
1252	NC_021519	TA	3	6	73969	73974	50 %	50 %	0 %	0 %	513844402
1253	NC_021519	TGA	2	6	73978	73983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844402
1254	NC_021519	TGTTT	2	10	73984	73993	0 %	80 %	20 %	0 %	513844402

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