MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	TCT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843591
2	NC_021517	AAG	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843591
3	NC_021517	AAG	2	6	174	179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843591
4	NC_021517	CTG	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843591
5	NC_021517	TGT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843591
6	NC_021517	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843591
7	NC_021517	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843591
8	NC_021517	AGC	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843591
9	NC_021517	CAA	2	6	481	486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843591
10	NC_021517	CCA	2	6	560	565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
11	NC_021517	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843591
12	NC_021517	CAC	2	6	628	633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
13	NC_021517	CCA	2	6	634	639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
14	NC_021517	CAT	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843591
15	NC_021517	GTA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843592
16	NC_021517	GTT	3	9	1745	1753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843592
17	NC_021517	GAT	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843592
18	NC_021517	AGA	2	6	1922	1927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843592
19	NC_021517	TAA	2	6	2112	2117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843592
20	NC_021517	AAT	2	6	2122	2127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843592
21	NC_021517	ATT	2	6	2653	2658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
22	NC_021517	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843593
23	NC_021517	ACC	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843593
24	NC_021517	ACA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843593
25	NC_021517	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
26	NC_021517	AGA	2	6	3126	3131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843593
27	NC_021517	AAG	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843593
28	NC_021517	CTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843593
29	NC_021517	ATT	2	6	3198	3203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
30	NC_021517	ATC	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843593
31	NC_021517	TTA	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
32	NC_021517	TAT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843595
33	NC_021517	CGT	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843595
34	NC_021517	TCT	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843595
35	NC_021517	TAT	2	6	4650	4655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843596
36	NC_021517	CAA	2	6	4664	4669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
37	NC_021517	AAT	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843596
38	NC_021517	TCA	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
39	NC_021517	ACA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
40	NC_021517	CTT	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843596
41	NC_021517	TGA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843596
42	NC_021517	ACT	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
43	NC_021517	CAA	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
44	NC_021517	GCG	2	6	5466	5471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843596
45	NC_021517	ATC	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
46	NC_021517	GAC	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843596
47	NC_021517	GAA	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
48	NC_021517	TGA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843596
49	NC_021517	AAG	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
50	NC_021517	ACT	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
51	NC_021517	TGG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843596
52	NC_021517	GAA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
53	NC_021517	TTG	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843597
54	NC_021517	CAT	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843598
55	NC_021517	GCG	2	6	6152	6157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843598
56	NC_021517	ATT	2	6	6192	6197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843598
57	NC_021517	TCC	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843598
58	NC_021517	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843599
59	NC_021517	AAC	2	6	6299	6304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843599
60	NC_021517	AAC	2	6	6345	6350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843599
61	NC_021517	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843599
62	NC_021517	AGC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843599
63	NC_021517	TCG	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843600
64	NC_021517	TCT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843600
65	NC_021517	TTG	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843600
66	NC_021517	CTT	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843601
67	NC_021517	TGC	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843601
68	NC_021517	GTG	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843602
69	NC_021517	ATT	2	6	7657	7662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
70	NC_021517	TGA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
71	NC_021517	AAG	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843602
72	NC_021517	CAA	2	6	8297	8302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
73	NC_021517	GAT	2	6	8468	8473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
74	NC_021517	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
75	NC_021517	ACT	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843602
76	NC_021517	GTT	2	6	8596	8601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843602
77	NC_021517	GTG	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843602
78	NC_021517	ACG	2	6	8674	8679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
79	NC_021517	TTA	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
80	NC_021517	ATT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
81	NC_021517	CAG	2	6	8828	8833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
82	NC_021517	CCA	2	6	8881	8886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843602
83	NC_021517	ACA	2	6	9018	9023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
84	NC_021517	GAT	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
85	NC_021517	ACA	2	6	9157	9162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
86	NC_021517	ACC	2	6	9249	9254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843602
87	NC_021517	ATG	2	6	9276	9281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
88	NC_021517	ACA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
89	NC_021517	TGA	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
90	NC_021517	AGC	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
91	NC_021517	GTA	2	6	9770	9775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843603
92	NC_021517	CCT	2	6	9972	9977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843603
93	NC_021517	GTT	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843603
94	NC_021517	TAT	2	6	10092	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843604
95	NC_021517	GCT	2	6	10098	10103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
96	NC_021517	TGC	2	6	10108	10113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
97	NC_021517	TGA	2	6	10153	10158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
98	NC_021517	TCT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843604
99	NC_021517	TGA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
100	NC_021517	TGA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
101	NC_021517	CTT	2	6	10280	10285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843604
102	NC_021517	TGC	2	6	10406	10411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
103	NC_021517	GGA	3	9	11183	11191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513843605
104	NC_021517	CTA	3	9	11203	11211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843605
105	NC_021517	GCG	2	6	11248	11253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843605
106	NC_021517	CCA	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
107	NC_021517	CCA	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
108	NC_021517	CGA	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843605
109	NC_021517	ACC	2	6	11292	11297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
110	NC_021517	CCA	2	6	11302	11307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
111	NC_021517	GTG	2	6	11308	11313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843605
112	NC_021517	CCA	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
113	NC_021517	CGA	2	6	11344	11349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843605
114	NC_021517	ACC	2	6	11361	11366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
115	NC_021517	GTG	2	6	11377	11382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843605
116	NC_021517	CCA	2	6	11407	11412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
117	NC_021517	CGA	2	6	11413	11418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843605
118	NC_021517	ACC	2	6	11430	11435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
119	NC_021517	CCA	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
120	NC_021517	GTG	2	6	11446	11451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843605
121	NC_021517	CCA	2	6	11476	11481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
122	NC_021517	CGA	2	6	11482	11487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843605
123	NC_021517	ACC	3	9	11499	11507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843605
124	NC_021517	CCG	2	6	11530	11535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843605
125	NC_021517	CGG	2	6	11683	11688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843606
126	NC_021517	AAC	2	6	11781	11786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
127	NC_021517	TAT	2	6	11846	11851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843606
128	NC_021517	GCC	2	6	11853	11858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843606
129	NC_021517	ATC	2	6	12165	12170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843606
130	NC_021517	CGA	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843606
131	NC_021517	TCT	2	6	12315	12320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843606
132	NC_021517	CAA	2	6	12677	12682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
133	NC_021517	GGC	2	6	12789	12794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843606
134	NC_021517	ATG	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843606
135	NC_021517	TGC	2	6	12893	12898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843606
136	NC_021517	GAT	2	6	12936	12941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843606
137	NC_021517	GCC	2	6	12948	12953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843606
138	NC_021517	CTA	2	6	13028	13033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843606
139	NC_021517	GCG	2	6	13078	13083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843606
140	NC_021517	GGC	2	6	13098	13103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843606
141	NC_021517	TGG	2	6	13108	13113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843606
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143	NC_021517	CGC	2	6	13145	13150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843606
144	NC_021517	ACA	2	6	13222	13227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
145	NC_021517	TCT	2	6	13285	13290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843606
146	NC_021517	TGT	2	6	13343	13348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843606
147	NC_021517	ACA	2	6	13369	13374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
148	NC_021517	CCA	2	6	13375	13380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843606
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150	NC_021517	CAG	2	6	13566	13571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843606
151	NC_021517	GAT	2	6	13665	13670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843606
152	NC_021517	CAA	2	6	13718	13723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
153	NC_021517	ACA	2	6	13744	13749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
154	NC_021517	ACG	2	6	13762	13767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843606
155	NC_021517	TAA	2	6	13859	13864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843606
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159	NC_021517	GTG	2	6	14368	14373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843606
160	NC_021517	ACG	2	6	14409	14414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843606
161	NC_021517	GCC	2	6	14649	14654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843606
162	NC_021517	ACG	2	6	14823	14828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843606
163	NC_021517	AGA	2	6	14917	14922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843606
164	NC_021517	AAC	2	6	14937	14942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843606
165	NC_021517	GGC	2	6	14981	14986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843606
166	NC_021517	ACT	2	6	15025	15030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843606
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169	NC_021517	TGG	2	6	15164	15169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843606
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187	NC_021517	TGA	2	6	16166	16171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843607
188	NC_021517	TGA	2	6	16223	16228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843607
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217	NC_021517	TGA	2	6	19930	19935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843612
218	NC_021517	TAT	2	6	19953	19958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843612
219	NC_021517	CTT	2	6	20040	20045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843612
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221	NC_021517	ATT	2	6	20093	20098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843612
222	NC_021517	TGA	2	6	20171	20176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843612
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233	NC_021517	AAT	3	9	21592	21600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843614
234	NC_021517	CAT	2	6	21664	21669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843614
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238	NC_021517	TGA	2	6	21753	21758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843614
239	NC_021517	TAA	2	6	21939	21944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843614
240	NC_021517	TAG	2	6	21956	21961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843614
241	NC_021517	TGC	2	6	21980	21985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843614
242	NC_021517	CAA	2	6	22091	22096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843614
243	NC_021517	GAT	3	9	22162	22170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843614
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246	NC_021517	TTA	2	6	22299	22304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843615
247	NC_021517	GAT	2	6	22353	22358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843615
248	NC_021517	TTG	2	6	22477	22482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843615
249	NC_021517	TTG	2	6	22620	22625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843615
250	NC_021517	ATT	2	6	22646	22651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843615
251	NC_021517	AGA	2	6	22760	22765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843615
252	NC_021517	TGA	2	6	22798	22803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843615
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254	NC_021517	GTG	2	6	22972	22977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843615
255	NC_021517	TAT	2	6	23191	23196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843615
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379	NC_021517	ATC	2	6	35700	35705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843627
380	NC_021517	GAC	2	6	35822	35827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843627
381	NC_021517	TTA	2	6	35882	35887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843627
382	NC_021517	AGA	2	6	35903	35908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843627
383	NC_021517	CGA	2	6	35909	35914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843627
384	NC_021517	TAC	2	6	36072	36077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843628
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389	NC_021517	GAA	2	6	36318	36323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843628
390	NC_021517	TGG	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843628
391	NC_021517	AAT	2	6	36435	36440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843628
392	NC_021517	TTC	2	6	36610	36615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843628
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399	NC_021517	CGA	3	9	36965	36973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843628
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402	NC_021517	TCA	2	6	37260	37265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
403	NC_021517	TGA	2	6	37275	37280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843629
404	NC_021517	AAT	2	6	37370	37375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843629
405	NC_021517	AAC	2	6	37427	37432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843629
406	NC_021517	AAG	2	6	37439	37444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843629
407	NC_021517	TAC	2	6	37475	37480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
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411	NC_021517	GAT	2	6	37670	37675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843629
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432	NC_021517	AAT	2	6	38594	38599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843630

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.