MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021517	AGCG	2	8	29925	29932	25 %	0 %	50 %	25 %	513843623
502	NC_021517	TCG	2	6	29993	29998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843623
503	NC_021517	TCT	2	6	30257	30262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843623
504	NC_021517	TAA	2	6	30366	30371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843623
505	NC_021517	ATA	2	6	30447	30452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843623
506	NC_021517	GAT	2	6	30474	30479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843623
507	NC_021517	TGA	2	6	30589	30594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843623
508	NC_021517	TTG	2	6	30634	30639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843623
509	NC_021517	ATT	2	6	30656	30661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843623
510	NC_021517	T	6	6	30727	30732	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
511	NC_021517	ACC	2	6	30775	30780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843623
512	NC_021517	TG	3	6	30841	30846	0 %	50 %	50 %	0 %	513843623
513	NC_021517	TTC	2	6	30884	30889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843623
514	NC_021517	TCT	2	6	30896	30901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843623
515	NC_021517	T	8	8	30993	31000	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
516	NC_021517	TGG	2	6	31056	31061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843623
517	NC_021517	AAC	2	6	31096	31101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843623
518	NC_021517	TCA	2	6	31103	31108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843623
519	NC_021517	T	6	6	31111	31116	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
520	NC_021517	TGTT	2	8	31147	31154	0 %	75 %	25 %	0 %	513843623
521	NC_021517	T	6	6	31153	31158	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
522	NC_021517	CGAT	2	8	31160	31167	25 %	25 %	25 %	25 %	513843623
523	NC_021517	TTC	2	6	31213	31218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843623
524	NC_021517	CAA	2	6	31224	31229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843623
525	NC_021517	CGG	2	6	31242	31247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843623
526	NC_021517	ATTTT	2	10	31274	31283	20 %	80 %	0 %	0 %	513843623
527	NC_021517	CAA	2	6	31311	31316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843623
528	NC_021517	TTG	2	6	31421	31426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843623
529	NC_021517	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
530	NC_021517	TAT	2	6	31449	31454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843623
531	NC_021517	GTT	2	6	31470	31475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843623
532	NC_021517	TTC	2	6	31477	31482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843623
533	NC_021517	TCG	2	6	31511	31516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843623
534	NC_021517	T	7	7	31560	31566	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
535	NC_021517	AAC	2	6	31615	31620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843623
536	NC_021517	GAT	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843624
537	NC_021517	ATT	2	6	32199	32204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843624
538	NC_021517	ATT	2	6	32231	32236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843624
539	NC_021517	CTA	2	6	32251	32256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843624
540	NC_021517	ATT	3	9	32312	32320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843624
541	NC_021517	CAT	2	6	32321	32326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843624
542	NC_021517	ATT	2	6	32371	32376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843624
543	NC_021517	TGA	2	6	32419	32424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843624
544	NC_021517	T	6	6	32539	32544	0 %	100 %	0 %	0 %	513843624
545	NC_021517	GAC	2	6	32557	32562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843624
546	NC_021517	GTC	2	6	32568	32573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843624
547	NC_021517	TAA	2	6	32680	32685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843624
548	NC_021517	TTGA	2	8	32687	32694	25 %	50 %	25 %	0 %	513843624
549	NC_021517	ATC	2	6	32700	32705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843624
550	NC_021517	TTAA	2	8	32708	32715	50 %	50 %	0 %	0 %	513843624
551	NC_021517	TCG	2	6	32840	32845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843624
552	NC_021517	ATT	2	6	32863	32868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843624
553	NC_021517	GAA	3	9	33392	33400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843625
554	NC_021517	CAC	2	6	33448	33453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843625
555	NC_021517	TTG	2	6	33468	33473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843625
556	NC_021517	AAC	2	6	33512	33517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843625
557	NC_021517	ACC	2	6	33536	33541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843625
558	NC_021517	GTT	2	6	33582	33587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843625
559	NC_021517	TAA	2	6	33619	33624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843625
560	NC_021517	GCACA	2	10	33699	33708	40 %	0 %	20 %	40 %	513843625
561	NC_021517	ACA	2	6	33767	33772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843625
562	NC_021517	AGT	2	6	33777	33782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843625
563	NC_021517	AAG	2	6	33885	33890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843626
564	NC_021517	ACT	2	6	33963	33968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843626
565	NC_021517	AC	3	6	34098	34103	50 %	0 %	0 %	50 %	513843626
566	NC_021517	ACG	2	6	34122	34127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843626
567	NC_021517	ACA	2	6	34129	34134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843626
568	NC_021517	GTC	2	6	34160	34165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843626
569	NC_021517	TGA	2	6	34192	34197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843626
570	NC_021517	AATT	2	8	34224	34231	50 %	50 %	0 %	0 %	513843626
571	NC_021517	A	7	7	34436	34442	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
572	NC_021517	TGA	2	6	34473	34478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843626
573	NC_021517	A	6	6	34589	34594	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
574	NC_021517	A	6	6	34608	34613	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
575	NC_021517	ACA	2	6	34767	34772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843626
576	NC_021517	A	6	6	34793	34798	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
577	NC_021517	ATT	2	6	34914	34919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843627
578	NC_021517	TGA	3	9	34970	34978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843627
579	NC_021517	TGAT	2	8	35044	35051	25 %	50 %	25 %	0 %	513843627
580	NC_021517	CG	3	6	35088	35093	0 %	0 %	50 %	50 %	513843627
581	NC_021517	CAAC	2	8	35113	35120	50 %	0 %	0 %	50 %	513843627
582	NC_021517	CCA	2	6	35210	35215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843627
583	NC_021517	ACT	2	6	35275	35280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843627
584	NC_021517	CA	3	6	35579	35584	50 %	0 %	0 %	50 %	513843627
585	NC_021517	TAG	2	6	35587	35592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843627
586	NC_021517	AAC	2	6	35593	35598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843627
587	NC_021517	TCT	2	6	35623	35628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843627
588	NC_021517	CTA	2	6	35663	35668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843627
589	NC_021517	ATC	2	6	35700	35705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843627
590	NC_021517	GAC	2	6	35822	35827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843627
591	NC_021517	TTA	2	6	35882	35887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843627
592	NC_021517	AGA	2	6	35903	35908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843627
593	NC_021517	CGA	2	6	35909	35914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843627
594	NC_021517	AATG	2	8	35928	35935	50 %	25 %	25 %	0 %	513843627
595	NC_021517	CATG	2	8	35941	35948	25 %	25 %	25 %	25 %	513843627
596	NC_021517	TAC	2	6	36072	36077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843628
597	NC_021517	AAC	2	6	36130	36135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843628
598	NC_021517	CAC	2	6	36137	36142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843628
599	NC_021517	TTGG	2	8	36149	36156	0 %	50 %	50 %	0 %	513843628
600	NC_021517	CAA	2	6	36213	36218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843628
601	NC_021517	CAA	2	6	36312	36317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843628
602	NC_021517	GAA	2	6	36318	36323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843628
603	NC_021517	TGG	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843628
604	NC_021517	AAT	2	6	36435	36440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843628
605	NC_021517	A	8	8	36502	36509	100 %	0 %	0 %	0 %	513843628
606	NC_021517	TC	3	6	36576	36581	0 %	50 %	0 %	50 %	513843628
607	NC_021517	TACC	2	8	36587	36594	25 %	25 %	0 %	50 %	513843628
608	NC_021517	TTC	2	6	36610	36615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843628
609	NC_021517	GCA	2	6	36701	36706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843628
610	NC_021517	CTA	2	6	36800	36805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843628
611	NC_021517	GCTA	2	8	36843	36850	25 %	25 %	25 %	25 %	513843628
612	NC_021517	TGA	2	6	36892	36897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843628
613	NC_021517	GCA	2	6	36930	36935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843628
614	NC_021517	AAC	2	6	36936	36941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843628
615	NC_021517	GAA	2	6	36954	36959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843628
616	NC_021517	CGA	3	9	36965	36973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843628
617	NC_021517	CAT	2	6	37027	37032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
618	NC_021517	AGTC	2	8	37149	37156	25 %	25 %	25 %	25 %	513843629
619	NC_021517	AC	3	6	37191	37196	50 %	0 %	0 %	50 %	513843629
620	NC_021517	GAA	2	6	37205	37210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843629
621	NC_021517	GGAA	2	8	37245	37252	50 %	0 %	50 %	0 %	513843629
622	NC_021517	TCA	2	6	37260	37265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
623	NC_021517	TGA	2	6	37275	37280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843629
624	NC_021517	AAT	2	6	37370	37375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843629
625	NC_021517	AAC	2	6	37427	37432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843629
626	NC_021517	AAG	2	6	37439	37444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843629
627	NC_021517	TAC	2	6	37475	37480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
628	NC_021517	CTT	2	6	37486	37491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843629
629	NC_021517	TCA	2	6	37542	37547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843629
630	NC_021517	CGA	2	6	37561	37566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843629
631	NC_021517	ACCT	2	8	37580	37587	25 %	25 %	0 %	50 %	513843629
632	NC_021517	A	6	6	37635	37640	100 %	0 %	0 %	0 %	513843629
633	NC_021517	A	6	6	37646	37651	100 %	0 %	0 %	0 %	513843629
634	NC_021517	TGGA	2	8	37652	37659	25 %	25 %	50 %	0 %	513843629
635	NC_021517	GAT	2	6	37670	37675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843629
636	NC_021517	CTC	2	6	37676	37681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843629
637	NC_021517	GAA	2	6	37703	37708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843629
638	NC_021517	CAA	2	6	37765	37770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843629
639	NC_021517	TGA	2	6	37839	37844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843629
640	NC_021517	TCT	2	6	37878	37883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843629
641	NC_021517	T	6	6	38008	38013	0 %	100 %	0 %	0 %	513843630
642	NC_021517	GTT	2	6	38022	38027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843630
643	NC_021517	CGC	2	6	38091	38096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843630
644	NC_021517	CAA	2	6	38108	38113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843630
645	NC_021517	TCA	2	6	38115	38120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843630
646	NC_021517	ATC	2	6	38151	38156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843630
647	NC_021517	TTG	2	6	38237	38242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843630
648	NC_021517	TCAA	2	8	38250	38257	50 %	25 %	0 %	25 %	513843630
649	NC_021517	TCA	2	6	38271	38276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843630
650	NC_021517	ACA	2	6	38278	38283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843630
651	NC_021517	TAA	2	6	38302	38307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843630
652	NC_021517	AAT	2	6	38358	38363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843630
653	NC_021517	TCA	2	6	38365	38370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843630
654	NC_021517	CTG	2	6	38447	38452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843630
655	NC_021517	GTA	2	6	38495	38500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843630
656	NC_021517	TTA	2	6	38529	38534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843630
657	NC_021517	GTC	2	6	38544	38549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843630
658	NC_021517	AAT	2	6	38594	38599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843630
659	NC_021517	TGGT	2	8	38609	38616	0 %	50 %	50 %	0 %	513843630
660	NC_021517	CAAAT	2	10	39167	39176	60 %	20 %	0 %	20 %	513843631
661	NC_021517	A	6	6	39203	39208	100 %	0 %	0 %	0 %	513843631

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