MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	TAA	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
2	NC_021515	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
3	NC_021515	TGC	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842866
4	NC_021515	ACA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842866
5	NC_021515	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
6	NC_021515	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
7	NC_021515	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
8	NC_021515	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
9	NC_021515	AAG	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
10	NC_021515	TCA	2	6	883	888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
11	NC_021515	AGG	2	6	906	911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513842866
12	NC_021515	ACC	2	6	924	929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842866
13	NC_021515	AGA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
14	NC_021515	CTT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842866
15	NC_021515	TTA	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
16	NC_021515	TAT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842866
17	NC_021515	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842866
18	NC_021515	AAT	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
19	NC_021515	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842866
20	NC_021515	TAA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842866
21	NC_021515	AAG	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842866
22	NC_021515	CTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
23	NC_021515	TTC	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
24	NC_021515	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842867
25	NC_021515	GTT	2	6	3384	3389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867
26	NC_021515	ATT	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
27	NC_021515	AAG	2	6	3488	3493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842867
28	NC_021515	CAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842867
29	NC_021515	TAC	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
30	NC_021515	ATC	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842867
31	NC_021515	ATT	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842867
32	NC_021515	GTT	2	6	3706	3711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.