MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 49051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_021514	AGT	2	6	3040970	3040975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842659
49002	NC_021514	TCG	2	6	3041008	3041013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842659
49003	NC_021514	T	6	6	3041053	3041058	0 %	100 %	0 %	0 %	513842659
49004	NC_021514	CTT	2	6	3041111	3041116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842659
49005	NC_021514	AAAT	2	8	3041124	3041131	75 %	25 %	0 %	0 %	513842659
49006	NC_021514	ATT	2	6	3041135	3041140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49007	NC_021514	TAT	2	6	3041170	3041175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49008	NC_021514	ATT	2	6	3041180	3041185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49009	NC_021514	TAT	2	6	3041251	3041256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49010	NC_021514	AGT	2	6	3041311	3041316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842659
49011	NC_021514	TAA	2	6	3041365	3041370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842659
49012	NC_021514	CGT	2	6	3041390	3041395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842659
49013	NC_021514	GCC	2	6	3041436	3041441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842659
49014	NC_021514	TTA	2	6	3041520	3041525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49015	NC_021514	TTA	2	6	3041544	3041549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49016	NC_021514	TTA	2	6	3041565	3041570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49017	NC_021514	GTT	2	6	3041622	3041627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842659
49018	NC_021514	GCC	2	6	3041638	3041643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842659
49019	NC_021514	CTT	2	6	3041750	3041755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842659
49020	NC_021514	CAA	2	6	3041770	3041775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842659
49021	NC_021514	TTA	2	6	3041778	3041783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842659
49022	NC_021514	CCG	2	6	3041832	3041837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842659
49023	NC_021514	TCGA	2	8	3041844	3041851	25 %	25 %	25 %	25 %	513842659
49024	NC_021514	GTC	2	6	3041865	3041870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842659
49025	NC_021514	GAA	2	6	3041934	3041939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842659
49026	NC_021514	AGC	2	6	3041956	3041961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842659
49027	NC_021514	TAA	3	9	3041966	3041974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842659
49028	NC_021514	CAC	2	6	3041981	3041986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842659
49029	NC_021514	TTGC	2	8	3042010	3042017	0 %	50 %	25 %	25 %	513842659
49030	NC_021514	CG	3	6	3042755	3042760	0 %	0 %	50 %	50 %	513842660
49031	NC_021514	GCTT	2	8	3042801	3042808	0 %	50 %	25 %	25 %	513842660
49032	NC_021514	TAA	2	6	3042848	3042853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842660
49033	NC_021514	AAT	2	6	3042935	3042940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842660
49034	NC_021514	CGC	2	6	3043031	3043036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842660
49035	NC_021514	GTA	2	6	3043052	3043057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842660
49036	NC_021514	GAAC	2	8	3043088	3043095	50 %	0 %	25 %	25 %	513842660
49037	NC_021514	CTT	2	6	3043211	3043216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842660
49038	NC_021514	CTT	2	6	3043265	3043270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842660
49039	NC_021514	CTT	2	6	3043297	3043302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842660
49040	NC_021514	ATC	2	6	3043332	3043337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842660
49041	NC_021514	GAT	2	6	3043358	3043363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842660
49042	NC_021514	GAT	2	6	3043376	3043381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842660
49043	NC_021514	AAT	2	6	3043421	3043426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842660
49044	NC_021514	GAT	2	6	3043445	3043450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842660
49045	NC_021514	TAC	2	6	3043495	3043500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842660
49046	NC_021514	CAG	2	6	3043595	3043600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842661
49047	NC_021514	TGAT	2	8	3043723	3043730	25 %	50 %	25 %	0 %	513842661
49048	NC_021514	TCT	2	6	3043777	3043782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842661
49049	NC_021514	ACCG	2	8	3043784	3043791	25 %	0 %	25 %	50 %	513842661
49050	NC_021514	TTG	2	6	3043883	3043888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842661
49051	NC_021514	T	7	7	3043901	3043907	0 %	100 %	0 %	0 %	513842661

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.