MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656347
2	NC_021503	ATT	2	6	80	85	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656347
3	NC_021503	ATG	2	6	116	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
4	NC_021503	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656347
5	NC_021503	TTC	2	6	175	180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656347
6	NC_021503	AGA	2	6	192	197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656347
7	NC_021503	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656347
8	NC_021503	AGA	3	9	399	407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656347
9	NC_021503	ATT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656347
10	NC_021503	TTC	2	6	435	440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656347
11	NC_021503	AGA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656347
12	NC_021503	ATG	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
13	NC_021503	GCC	2	6	538	543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512656347
14	NC_021503	TGC	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656347
15	NC_021503	TAG	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
16	NC_021503	TGC	2	6	936	941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656347
17	NC_021503	CTA	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656347
18	NC_021503	ATT	2	6	1005	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656347
19	NC_021503	ATA	2	6	1025	1030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656347
20	NC_021503	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
21	NC_021503	GCA	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656347
22	NC_021503	ATG	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
23	NC_021503	TTC	2	6	1154	1159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656347
24	NC_021503	TCA	2	6	1205	1210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656347
25	NC_021503	GAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656347
26	NC_021503	GAT	2	6	1420	1425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
27	NC_021503	GAA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656347
28	NC_021503	TAA	2	6	1566	1571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656347
29	NC_021503	ACT	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656347
30	NC_021503	ACT	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656347
31	NC_021503	TAT	2	6	1863	1868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656347
32	NC_021503	TAG	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656347
33	NC_021503	AAC	2	6	2101	2106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656348
34	NC_021503	AAT	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656348
35	NC_021503	TGA	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656348
36	NC_021503	ACA	2	6	2566	2571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656348
37	NC_021503	CTA	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656349
38	NC_021503	ACT	2	6	2873	2878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656349
39	NC_021503	AGA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656349
40	NC_021503	TGA	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656349
41	NC_021503	ATC	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656349
42	NC_021503	TAA	2	6	2995	3000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656349
43	NC_021503	TCG	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656349
44	NC_021503	TAC	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656349
45	NC_021503	GTC	3	9	3132	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656349
46	NC_021503	TAT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656349
47	NC_021503	GAC	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656349
48	NC_021503	CAT	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656349
49	NC_021503	TAG	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656349
50	NC_021503	AAT	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656349
51	NC_021503	TAT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656349
52	NC_021503	TTG	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656350
53	NC_021503	CAA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656350
54	NC_021503	CTT	2	6	4350	4355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656350
55	NC_021503	TTG	2	6	4410	4415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656350
56	NC_021503	AAT	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656350
57	NC_021503	ATT	2	6	4666	4671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656351
58	NC_021503	ATC	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656351
59	NC_021503	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656351
60	NC_021503	AAT	2	6	4756	4761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656351
61	NC_021503	TAA	2	6	4815	4820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656351
62	NC_021503	ATC	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656351
63	NC_021503	TTA	3	9	4913	4921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656351
64	NC_021503	AAT	2	6	4977	4982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656351
65	NC_021503	AAT	2	6	5004	5009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656351
66	NC_021503	ATT	2	6	5032	5037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656351
67	NC_021503	TGA	3	9	5102	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656351
68	NC_021503	CTT	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656351
69	NC_021503	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656352
70	NC_021503	GAA	2	6	5438	5443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656352
71	NC_021503	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656352
72	NC_021503	AAT	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656352
73	NC_021503	TCA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656352
74	NC_021503	GTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656352
75	NC_021503	AGT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656352
76	NC_021503	TGG	2	6	5950	5955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512656352
77	NC_021503	ATC	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656353
78	NC_021503	TCT	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656353
79	NC_021503	CTT	3	9	6540	6548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656353
80	NC_021503	TAC	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656353
81	NC_021503	CAA	2	6	6816	6821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656353
82	NC_021503	AAG	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656353
83	NC_021503	ATC	2	6	6913	6918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656353
84	NC_021503	ATT	3	9	6925	6933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656353
85	NC_021503	AAG	2	6	7132	7137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656353
86	NC_021503	TTG	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656353
87	NC_021503	TGT	2	6	7264	7269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656353
88	NC_021503	ATC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656353
89	NC_021503	ACA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656353
90	NC_021503	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656353
91	NC_021503	TGT	2	6	7473	7478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656353
92	NC_021503	AAC	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656354
93	NC_021503	TGA	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656354
94	NC_021503	AAT	2	6	8488	8493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656354
95	NC_021503	ATG	2	6	8635	8640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656354
96	NC_021503	AAT	2	6	8689	8694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656354
97	NC_021503	TTG	2	6	8846	8851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656354
98	NC_021503	TGC	2	6	8895	8900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656354
99	NC_021503	ATT	3	9	8908	8916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656354
100	NC_021503	GCA	2	6	8928	8933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656354
101	NC_021503	ACA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656354
102	NC_021503	CTT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656354
103	NC_021503	ATC	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656354
104	NC_021503	GAA	2	6	9261	9266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656354
105	NC_021503	TAA	2	6	9303	9308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656355
106	NC_021503	GAA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656355
107	NC_021503	TAA	2	6	9384	9389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656355
108	NC_021503	CAA	2	6	9393	9398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656355
109	NC_021503	AAC	2	6	9465	9470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656355
110	NC_021503	TGA	2	6	9489	9494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656355
111	NC_021503	CAA	2	6	9531	9536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656355
112	NC_021503	GAT	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656355
113	NC_021503	TAT	2	6	9555	9560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656355
114	NC_021503	AGA	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656355
115	NC_021503	TTC	2	6	9655	9660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656355
116	NC_021503	ATG	2	6	9668	9673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656355
117	NC_021503	GAT	2	6	9676	9681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656355
118	NC_021503	TAA	2	6	10437	10442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656356
119	NC_021503	TAA	2	6	10452	10457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656356
120	NC_021503	TGA	2	6	10533	10538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656356
121	NC_021503	AGA	2	6	10599	10604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656356
122	NC_021503	ATG	2	6	10787	10792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656357
123	NC_021503	AAT	2	6	10831	10836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656357
124	NC_021503	TAG	2	6	10978	10983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656357
125	NC_021503	GGC	2	6	11197	11202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512656357
126	NC_021503	AAG	2	6	11217	11222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656357
127	NC_021503	TTG	2	6	11340	11345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656357
128	NC_021503	ATT	2	6	11368	11373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656357
129	NC_021503	AAG	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656357
130	NC_021503	AGA	2	6	11416	11421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656357
131	NC_021503	TTG	2	6	11526	11531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656357
132	NC_021503	CAT	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656357
133	NC_021503	GAA	2	6	11600	11605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656357
134	NC_021503	AAG	2	6	11627	11632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656357
135	NC_021503	CAA	2	6	11673	11678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656357
136	NC_021503	GTT	2	6	11723	11728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656357
137	NC_021503	GTT	2	6	11810	11815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656357
138	NC_021503	GGT	2	6	11900	11905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512656357
139	NC_021503	AGT	2	6	11908	11913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656357
140	NC_021503	GTG	2	6	11995	12000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512656357
141	NC_021503	ATA	2	6	12078	12083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656358
142	NC_021503	TTG	2	6	12117	12122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656358
143	NC_021503	ATG	4	12	12294	12305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656358
144	NC_021503	TGG	2	6	12310	12315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512656358
145	NC_021503	ATG	2	6	12332	12337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656358
146	NC_021503	TCA	2	6	12338	12343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656358
147	NC_021503	TAT	3	9	14900	14908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656360
148	NC_021503	TTA	2	6	14929	14934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656360
149	NC_021503	CAT	2	6	14972	14977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656360
150	NC_021503	CTT	2	6	15023	15028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656360
151	NC_021503	ATA	2	6	15370	15375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656361
152	NC_021503	CCA	2	6	15409	15414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656361
153	NC_021503	CAA	2	6	15444	15449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656361
154	NC_021503	CAA	2	6	15738	15743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656362
155	NC_021503	ACA	2	6	15910	15915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656362
156	NC_021503	ACA	2	6	15931	15936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656362
157	NC_021503	AGA	2	6	16456	16461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656363
158	NC_021503	TGA	2	6	16482	16487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656363
159	NC_021503	AGA	2	6	16490	16495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656363
160	NC_021503	ACA	2	6	16523	16528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656363
161	NC_021503	GGC	2	6	16536	16541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512656363
162	NC_021503	GCA	2	6	16615	16620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656363
163	NC_021503	GCT	2	6	16848	16853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656364
164	NC_021503	TAC	2	6	16872	16877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656364
165	NC_021503	CTC	2	6	16926	16931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512656364
166	NC_021503	ATT	2	6	17043	17048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656364
167	NC_021503	CAA	2	6	17115	17120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656364
168	NC_021503	GTA	2	6	17241	17246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656364
169	NC_021503	AGG	2	6	17345	17350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512656364
170	NC_021503	TGG	2	6	17487	17492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512656364
171	NC_021503	CAA	2	6	17556	17561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656364
172	NC_021503	GAA	2	6	17589	17594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656364
173	NC_021503	GCA	2	6	17625	17630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656364
174	NC_021503	CAT	2	6	18020	18025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656365
175	NC_021503	AAG	2	6	18079	18084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656365
176	NC_021503	ATC	2	6	18124	18129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656365
177	NC_021503	ATG	2	6	18256	18261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656365
178	NC_021503	TGA	2	6	18326	18331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656365
179	NC_021503	ACA	2	6	18383	18388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656365
180	NC_021503	TAT	3	9	18568	18576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656365
181	NC_021503	ATG	2	6	18700	18705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656365
182	NC_021503	CAG	2	6	18727	18732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656365
183	NC_021503	CAG	2	6	19024	19029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656365
184	NC_021503	ATG	2	6	19120	19125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656365
185	NC_021503	CAT	2	6	19164	19169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656365
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187	NC_021503	ATT	2	6	19322	19327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656365
188	NC_021503	ATG	2	6	19333	19338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656365
189	NC_021503	GTT	2	6	19365	19370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656365
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201	NC_021503	ATT	2	6	20121	20126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656365
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247	NC_021503	GTT	2	6	25465	25470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656372
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250	NC_021503	CAT	2	6	25582	25587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656372
251	NC_021503	ATT	2	6	25607	25612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656372
252	NC_021503	TTG	2	6	25678	25683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656372
253	NC_021503	CAT	3	9	25756	25764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656372
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255	NC_021503	TAC	3	9	25849	25857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656372
256	NC_021503	TAA	2	6	25886	25891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656372
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259	NC_021503	CTG	2	6	26269	26274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656373
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380	NC_021503	TTG	2	6	35865	35870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656382
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