MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI03

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021496	GCTC	2	8	2364	2371	0 %	25 %	25 %	50 %	512594171
2	NC_021496	CTTG	2	8	2535	2542	0 %	50 %	25 %	25 %	512594171
3	NC_021496	GTTC	2	8	2573	2580	0 %	50 %	25 %	25 %	512594172
4	NC_021496	TAGA	2	8	2871	2878	50 %	25 %	25 %	0 %	512594173
5	NC_021496	TAGT	2	8	3123	3130	25 %	50 %	25 %	0 %	512594174
6	NC_021496	CAAT	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	512594175
7	NC_021496	TCCG	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	512594175
8	NC_021496	ATTG	2	8	4748	4755	25 %	50 %	25 %	0 %	512594178
9	NC_021496	GGAA	2	8	4966	4973	50 %	0 %	50 %	0 %	512594178
10	NC_021496	TATT	2	8	5752	5759	25 %	75 %	0 %	0 %	512594178
11	NC_021496	TTTC	2	8	5883	5890	0 %	75 %	0 %	25 %	512594179
12	NC_021496	TGAT	2	8	6237	6244	25 %	50 %	25 %	0 %	512594179
13	NC_021496	TGGT	2	8	8470	8477	0 %	50 %	50 %	0 %	512594182
14	NC_021496	GCTT	2	8	8697	8704	0 %	50 %	25 %	25 %	512594182
15	NC_021496	TTGA	2	8	8880	8887	25 %	50 %	25 %	0 %	512594182
16	NC_021496	ATTG	2	8	9291	9298	25 %	50 %	25 %	0 %	512594182
17	NC_021496	CTTC	2	8	10126	10133	0 %	50 %	0 %	50 %	512594185
18	NC_021496	AGAT	2	8	10537	10544	50 %	25 %	25 %	0 %	512594186
19	NC_021496	AAAG	2	8	11825	11832	75 %	0 %	25 %	0 %	512594191
20	NC_021496	CAAA	2	8	12536	12543	75 %	0 %	0 %	25 %	512594192
21	NC_021496	ATTG	2	8	12646	12653	25 %	50 %	25 %	0 %	512594192
22	NC_021496	GACG	2	8	13438	13445	25 %	0 %	50 %	25 %	512594194
23	NC_021496	AAAC	2	8	13831	13838	75 %	0 %	0 %	25 %	512594194
24	NC_021496	TTTA	2	8	15106	15113	25 %	75 %	0 %	0 %	512594195
25	NC_021496	TGCT	2	8	15145	15152	0 %	50 %	25 %	25 %	512594195
26	NC_021496	GCCA	2	8	16127	16134	25 %	0 %	25 %	50 %	512594195
27	NC_021496	CTGA	2	8	16622	16629	25 %	25 %	25 %	25 %	512594196
28	NC_021496	TTGC	2	8	16738	16745	0 %	50 %	25 %	25 %	512594196
29	NC_021496	TTAG	2	8	17202	17209	25 %	50 %	25 %	0 %	512594198
30	NC_021496	ACTA	2	8	17232	17239	50 %	25 %	0 %	25 %	512594198
31	NC_021496	TTTA	2	8	17406	17413	25 %	75 %	0 %	0 %	512594198
32	NC_021496	AACG	2	8	18191	18198	50 %	0 %	25 %	25 %	512594200
33	NC_021496	GTTC	2	8	18314	18321	0 %	50 %	25 %	25 %	512594200
34	NC_021496	CCAT	2	8	18343	18350	25 %	25 %	0 %	50 %	512594200
35	NC_021496	CCAC	2	8	18401	18408	25 %	0 %	0 %	75 %	512594201
36	NC_021496	TTTG	2	8	18435	18442	0 %	75 %	25 %	0 %	512594201
37	NC_021496	TCAT	2	8	18520	18527	25 %	50 %	0 %	25 %	512594201
38	NC_021496	ACCA	2	8	18537	18544	50 %	0 %	0 %	50 %	512594201
39	NC_021496	GATA	2	8	18596	18603	50 %	25 %	25 %	0 %	512594201
40	NC_021496	TTTG	2	8	18631	18638	0 %	75 %	25 %	0 %	512594202
41	NC_021496	AGTT	2	8	18667	18674	25 %	50 %	25 %	0 %	512594202
42	NC_021496	TGGA	2	8	19298	19305	25 %	25 %	50 %	0 %	512594203
43	NC_021496	TATT	2	8	19815	19822	25 %	75 %	0 %	0 %	512594203
44	NC_021496	TGAT	2	8	20323	20330	25 %	50 %	25 %	0 %	512594203
45	NC_021496	ATCA	2	8	20893	20900	50 %	25 %	0 %	25 %	512594203
46	NC_021496	TTGA	2	8	21110	21117	25 %	50 %	25 %	0 %	512594203
47	NC_021496	GACT	2	8	21676	21683	25 %	25 %	25 %	25 %	512594203
48	NC_021496	ATTG	2	8	22012	22019	25 %	50 %	25 %	0 %	512594203
49	NC_021496	CTTG	2	8	22231	22238	0 %	50 %	25 %	25 %	512594203
50	NC_021496	CCAA	2	8	22911	22918	50 %	0 %	0 %	50 %	512594204
51	NC_021496	CATA	2	8	23631	23638	50 %	25 %	0 %	25 %	512594204
52	NC_021496	CCAG	2	8	24659	24666	25 %	0 %	25 %	50 %	512594204
53	NC_021496	ATCA	2	8	24797	24804	50 %	25 %	0 %	25 %	512594204
54	NC_021496	TGCC	2	8	25211	25218	0 %	25 %	25 %	50 %	512594204
55	NC_021496	ATTC	2	8	25381	25388	25 %	50 %	0 %	25 %	512594205
56	NC_021496	AATC	2	8	25663	25670	50 %	25 %	0 %	25 %	512594205
57	NC_021496	TAGG	2	8	25675	25682	25 %	25 %	50 %	0 %	512594205
58	NC_021496	GATG	2	8	26518	26525	25 %	25 %	50 %	0 %	512594206
59	NC_021496	AGCA	2	8	26623	26630	50 %	0 %	25 %	25 %	512594206
60	NC_021496	TCTG	2	8	26786	26793	0 %	50 %	25 %	25 %	512594206
61	NC_021496	AGTG	2	8	27024	27031	25 %	25 %	50 %	0 %	512594206
62	NC_021496	GAAA	2	8	27376	27383	75 %	0 %	25 %	0 %	512594206
63	NC_021496	TTGC	2	8	27783	27790	0 %	50 %	25 %	25 %	512594206
64	NC_021496	ATTG	2	8	27996	28003	25 %	50 %	25 %	0 %	512594206
65	NC_021496	TCTA	2	8	28513	28520	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
66	NC_021496	AAGC	2	8	28698	28705	50 %	0 %	25 %	25 %	512594206
67	NC_021496	CATT	2	8	29622	29629	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
68	NC_021496	TTCA	2	8	29842	29849	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
69	NC_021496	CATC	2	8	30483	30490	25 %	25 %	0 %	50 %	512594206
70	NC_021496	ATTT	2	8	30950	30957	25 %	75 %	0 %	0 %	512594207
71	NC_021496	CTTT	2	8	30989	30996	0 %	75 %	0 %	25 %	512594207
72	NC_021496	TACC	2	8	31760	31767	25 %	25 %	0 %	50 %	512594208
73	NC_021496	ATTT	2	8	32041	32048	25 %	75 %	0 %	0 %	512594208
74	NC_021496	CAAC	2	8	32626	32633	50 %	0 %	0 %	50 %	512594210
75	NC_021496	AGTA	2	8	32920	32927	50 %	25 %	25 %	0 %	512594211
76	NC_021496	ATGA	2	8	33455	33462	50 %	25 %	25 %	0 %	512594212
77	NC_021496	TGAT	2	8	33563	33570	25 %	50 %	25 %	0 %	512594212
78	NC_021496	GAAG	2	8	33660	33667	50 %	0 %	50 %	0 %	512594213
79	NC_021496	TTCT	2	8	34530	34537	0 %	75 %	0 %	25 %	512594213
80	NC_021496	TTAC	2	8	35457	35464	25 %	50 %	0 %	25 %	512594214
81	NC_021496	TTTG	2	8	35563	35570	0 %	75 %	25 %	0 %	512594215
82	NC_021496	AATC	2	8	36276	36283	50 %	25 %	0 %	25 %	512594215
83	NC_021496	ATTG	2	8	36412	36419	25 %	50 %	25 %	0 %	512594215
84	NC_021496	AATA	2	8	36536	36543	75 %	25 %	0 %	0 %	512594215
85	NC_021496	CAAC	2	8	37310	37317	50 %	0 %	0 %	50 %	512594216
86	NC_021496	AGCT	2	8	37382	37389	25 %	25 %	25 %	25 %	512594216
87	NC_021496	ATGA	2	8	38132	38139	50 %	25 %	25 %	0 %	512594216
88	NC_021496	CCAA	2	8	38399	38406	50 %	0 %	0 %	50 %	512594216
89	NC_021496	TTTC	2	8	38657	38664	0 %	75 %	0 %	25 %	512594216
90	NC_021496	GTTG	2	8	38850	38857	0 %	50 %	50 %	0 %	512594217
91	NC_021496	TTCT	2	8	38888	38895	0 %	75 %	0 %	25 %	512594217
92	NC_021496	GCTT	2	8	39484	39491	0 %	50 %	25 %	25 %	512594218
93	NC_021496	TTGC	2	8	39858	39865	0 %	50 %	25 %	25 %	512594218

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.