MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI03

Total Repeats: 729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021496	AAG	2	6	27119	27124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594206
502	NC_021496	ATC	2	6	27164	27169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
503	NC_021496	TGA	2	6	27179	27184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
504	NC_021496	CAT	2	6	27312	27317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
505	NC_021496	GAAA	2	8	27376	27383	75 %	0 %	25 %	0 %	512594206
506	NC_021496	CCA	2	6	27404	27409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
507	NC_021496	ATT	2	6	27478	27483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
508	NC_021496	AAC	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594206
509	NC_021496	TCC	2	6	27569	27574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594206
510	NC_021496	GCC	2	6	27586	27591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512594206
511	NC_021496	GTTTA	2	10	27604	27613	20 %	60 %	20 %	0 %	512594206
512	NC_021496	CAC	2	6	27711	27716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
513	NC_021496	CAT	2	6	27774	27779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
514	NC_021496	TTGC	2	8	27783	27790	0 %	50 %	25 %	25 %	512594206
515	NC_021496	ATT	2	6	27832	27837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
516	NC_021496	TGT	2	6	27971	27976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
517	NC_021496	ATTG	2	8	27996	28003	25 %	50 %	25 %	0 %	512594206
518	NC_021496	GCG	2	6	28030	28035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512594206
519	NC_021496	TGCAG	2	10	28052	28061	20 %	20 %	40 %	20 %	512594206
520	NC_021496	TTGAC	2	10	28108	28117	20 %	40 %	20 %	20 %	512594206
521	NC_021496	GCA	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
522	NC_021496	CAA	2	6	28263	28268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594206
523	NC_021496	TGC	2	6	28420	28425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594206
524	NC_021496	GTT	3	9	28490	28498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
525	NC_021496	TCTA	2	8	28513	28520	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
526	NC_021496	AAGC	2	8	28698	28705	50 %	0 %	25 %	25 %	512594206
527	NC_021496	AGC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
528	NC_021496	CAG	2	6	28797	28802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
529	NC_021496	A	6	6	28846	28851	100 %	0 %	0 %	0 %	512594206
530	NC_021496	TGG	2	6	28868	28873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512594206
531	NC_021496	ACG	2	6	28894	28899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
532	NC_021496	TAG	2	6	28941	28946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
533	NC_021496	ACC	2	6	28960	28965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594206
534	NC_021496	TAA	2	6	28974	28979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594206
535	NC_021496	CGAGT	2	10	29010	29019	20 %	20 %	40 %	20 %	512594206
536	NC_021496	TCA	2	6	29166	29171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
537	NC_021496	TAT	2	6	29172	29177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
538	NC_021496	CTT	2	6	29184	29189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
539	NC_021496	CTT	2	6	29220	29225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
540	NC_021496	TCA	2	6	29309	29314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594206
541	NC_021496	TTA	2	6	29558	29563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594206
542	NC_021496	CATT	2	8	29622	29629	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
543	NC_021496	AGC	2	6	29719	29724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
544	NC_021496	TGAAAC	2	12	29752	29763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512594206
545	NC_021496	TTGAA	2	10	29779	29788	40 %	40 %	20 %	0 %	512594206
546	NC_021496	GAT	2	6	29798	29803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
547	NC_021496	TTCA	2	8	29842	29849	25 %	50 %	0 %	25 %	512594206
548	NC_021496	GTT	2	6	29946	29951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
549	NC_021496	AAG	2	6	29962	29967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512594206
550	NC_021496	CTT	2	6	30096	30101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
551	NC_021496	CTT	2	6	30124	30129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
552	NC_021496	AGC	2	6	30160	30165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
553	NC_021496	TGT	3	9	30170	30178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
554	NC_021496	CAG	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
555	NC_021496	TTG	2	6	30277	30282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
556	NC_021496	GCT	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594206
557	NC_021496	CTT	2	6	30366	30371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
558	NC_021496	CTT	2	6	30388	30393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
559	NC_021496	GTT	2	6	30444	30449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594206
560	NC_021496	CATC	2	8	30483	30490	25 %	25 %	0 %	50 %	512594206
561	NC_021496	GCA	2	6	30521	30526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594206
562	NC_021496	CTT	2	6	30558	30563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594206
563	NC_021496	GAT	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594206
564	NC_021496	ATTT	2	8	30950	30957	25 %	75 %	0 %	0 %	512594207
565	NC_021496	T	7	7	30955	30961	0 %	100 %	0 %	0 %	512594207
566	NC_021496	CTTT	2	8	30989	30996	0 %	75 %	0 %	25 %	512594207
567	NC_021496	T	6	6	31047	31052	0 %	100 %	0 %	0 %	512594207
568	NC_021496	TCT	2	6	31058	31063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594207
569	NC_021496	ATC	2	6	31075	31080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594207
570	NC_021496	GA	3	6	31103	31108	50 %	0 %	50 %	0 %	512594207
571	NC_021496	ACT	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594207
572	NC_021496	TTA	2	6	31247	31252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512594207
573	NC_021496	TCT	2	6	31272	31277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594207
574	NC_021496	CTG	2	6	31424	31429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512594208
575	NC_021496	AGTCTG	2	12	31502	31513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512594208
576	NC_021496	ATC	2	6	31551	31556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594208
577	NC_021496	TCT	2	6	31592	31597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594208
578	NC_021496	CTT	2	6	31620	31625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594208
579	NC_021496	TACC	2	8	31760	31767	25 %	25 %	0 %	50 %	512594208
580	NC_021496	TGT	2	6	31793	31798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594208
581	NC_021496	GTT	2	6	31854	31859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594208
582	NC_021496	T	6	6	32019	32024	0 %	100 %	0 %	0 %	512594208
583	NC_021496	ATTT	2	8	32041	32048	25 %	75 %	0 %	0 %	512594208
584	NC_021496	CAG	2	6	32082	32087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512594209
585	NC_021496	AAT	2	6	32100	32105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594209
586	NC_021496	A	6	6	32247	32252	100 %	0 %	0 %	0 %	512594209
587	NC_021496	TGG	2	6	32340	32345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512594209
588	NC_021496	TGT	2	6	32376	32381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594209
589	NC_021496	CAT	2	6	32449	32454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594209
590	NC_021496	CTT	2	6	32465	32470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594210
591	NC_021496	CTT	2	6	32525	32530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594210
592	NC_021496	CAT	2	6	32582	32587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594210
593	NC_021496	ATC	2	6	32602	32607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594210
594	NC_021496	CAAC	2	8	32626	32633	50 %	0 %	0 %	50 %	512594210
595	NC_021496	TTG	2	6	32799	32804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594210
596	NC_021496	TTAGT	2	10	32813	32822	20 %	60 %	20 %	0 %	512594210
597	NC_021496	T	6	6	32838	32843	0 %	100 %	0 %	0 %	512594210
598	NC_021496	ACC	2	6	32893	32898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512594211
599	NC_021496	T	6	6	32910	32915	0 %	100 %	0 %	0 %	512594211
600	NC_021496	AGTA	2	8	32920	32927	50 %	25 %	25 %	0 %	512594211
601	NC_021496	ATC	2	6	32944	32949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594211
602	NC_021496	TAG	2	6	32955	32960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594211
603	NC_021496	CAA	2	6	32967	32972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594211
604	NC_021496	AAT	3	9	33043	33051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594211
605	NC_021496	TTC	2	6	33175	33180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594211
606	NC_021496	TCC	2	6	33249	33254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512594212
607	NC_021496	AAT	2	6	33293	33298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594212
608	NC_021496	CAA	2	6	33316	33321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512594212
609	NC_021496	ATA	2	6	33359	33364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594212
610	NC_021496	CAT	3	9	33415	33423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594212
611	NC_021496	CAT	2	6	33436	33441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594212
612	NC_021496	ATGA	2	8	33455	33462	50 %	25 %	25 %	0 %	512594212
613	NC_021496	ATC	2	6	33500	33505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594212
614	NC_021496	TCA	2	6	33510	33515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594212
615	NC_021496	TGAT	2	8	33563	33570	25 %	50 %	25 %	0 %	512594212
616	NC_021496	TTC	2	6	33583	33588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594212
617	NC_021496	TTG	2	6	33639	33644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594213
618	NC_021496	GAAG	2	8	33660	33667	50 %	0 %	50 %	0 %	512594213
619	NC_021496	CAT	2	6	33683	33688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594213
620	NC_021496	GCACCG	2	12	33748	33759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512594213
621	NC_021496	AGT	2	6	33772	33777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512594213
622	NC_021496	ATA	2	6	33825	33830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594213
623	NC_021496	GTT	2	6	34035	34040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512594213
624	NC_021496	TCA	2	6	34057	34062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512594213
625	NC_021496	CTT	2	6	34080	34085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594213
626	NC_021496	AAT	2	6	34107	34112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512594213
627	NC_021496	CTT	2	6	34137	34142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512594213
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