MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Thunder Bay

Total Repeats: 64558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_021350	CAA	2	6	3452052	3452057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509152348
64502	NC_021350	TCT	2	6	3452086	3452091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509152348
64503	NC_021350	AAT	2	6	3452100	3452105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509152348
64504	NC_021350	T	6	6	3452105	3452110	0 %	100 %	0 %	0 %	509152348
64505	NC_021350	GTA	2	6	3452111	3452116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	509152348
64506	NC_021350	CAT	2	6	3452132	3452137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509152348
64507	NC_021350	AGC	2	6	3452172	3452177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509152348
64508	NC_021350	ACAT	2	8	3452182	3452189	50 %	25 %	0 %	25 %	509152348
64509	NC_021350	GTAA	2	8	3452192	3452199	50 %	25 %	25 %	0 %	509152348
64510	NC_021350	TTC	2	6	3452205	3452210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509152348
64511	NC_021350	ATTT	2	8	3452220	3452227	25 %	75 %	0 %	0 %	509152348
64512	NC_021350	T	7	7	3452225	3452231	0 %	100 %	0 %	0 %	509152348
64513	NC_021350	CTG	2	6	3452387	3452392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509152348
64514	NC_021350	TTAA	2	8	3452404	3452411	50 %	50 %	0 %	0 %	509152348
64515	NC_021350	ATT	2	6	3452520	3452525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509152348
64516	NC_021350	TA	3	6	3452531	3452536	50 %	50 %	0 %	0 %	509152348
64517	NC_021350	CAA	2	6	3452666	3452671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509152348
64518	NC_021350	ATTT	2	8	3452686	3452693	25 %	75 %	0 %	0 %	509152348
64519	NC_021350	CAA	2	6	3452702	3452707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509152349
64520	NC_021350	TAT	2	6	3452774	3452779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509152349
64521	NC_021350	ACCAG	2	10	3452797	3452806	40 %	0 %	20 %	40 %	509152349
64522	NC_021350	ATA	2	6	3452834	3452839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509152349
64523	NC_021350	CAT	2	6	3452850	3452855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509152349
64524	NC_021350	GAA	2	6	3452933	3452938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	509152349
64525	NC_021350	CTG	2	6	3452951	3452956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509152349
64526	NC_021350	GCC	2	6	3453069	3453074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	509152349
64527	NC_021350	ATC	2	6	3453135	3453140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	509152349
64528	NC_021350	CAA	2	6	3453281	3453286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	509152349
64529	NC_021350	ATA	2	6	3453314	3453319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	509152349
64530	NC_021350	TCT	2	6	3453436	3453441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509152349
64531	NC_021350	GGCT	2	8	3453460	3453467	0 %	25 %	50 %	25 %	509152349
64532	NC_021350	A	6	6	3453550	3453555	100 %	0 %	0 %	0 %	509152349
64533	NC_021350	GTT	2	6	3453560	3453565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509152349
64534	NC_021350	ACC	2	6	3453579	3453584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	509152349
64535	NC_021350	CATCCA	2	12	3453590	3453601	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	509152349
64536	NC_021350	AACT	2	8	3453626	3453633	50 %	25 %	0 %	25 %	509152349
64537	NC_021350	T	6	6	3453646	3453651	0 %	100 %	0 %	0 %	509152349
64538	NC_021350	TCT	2	6	3453709	3453714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509152349
64539	NC_021350	T	6	6	3453831	3453836	0 %	100 %	0 %	0 %	509152349
64540	NC_021350	AAAATC	2	12	3453927	3453938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	509152349
64541	NC_021350	CTGG	2	8	3453996	3454003	0 %	25 %	50 %	25 %	509152349
64542	NC_021350	AG	3	6	3454016	3454021	50 %	0 %	50 %	0 %	509152349
64543	NC_021350	T	6	6	3454090	3454095	0 %	100 %	0 %	0 %	509152349
64544	NC_021350	GCT	2	6	3454149	3454154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509152349
64545	NC_021350	ATT	2	6	3454204	3454209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	509152349
64546	NC_021350	TCT	2	6	3454250	3454255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	509152349
64547	NC_021350	GTT	2	6	3454265	3454270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	509152349
64548	NC_021350	AAGCGC	2	12	3454317	3454328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509152349
64549	NC_021350	AT	3	6	3454330	3454335	50 %	50 %	0 %	0 %	509152349
64550	NC_021350	CGT	2	6	3454345	3454350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	509152349
64551	NC_021350	ATTTA	2	10	3454619	3454628	40 %	60 %	0 %	0 %	509152350
64552	NC_021350	CAG	2	6	3454690	3454695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509152350
64553	NC_021350	T	8	8	3454768	3454775	0 %	100 %	0 %	0 %	509152350
64554	NC_021350	T	7	7	3454849	3454855	0 %	100 %	0 %	0 %	509152350
64555	NC_021350	AAATCA	2	12	3454872	3454883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	509152350
64556	NC_021350	T	9	9	3454884	3454892	0 %	100 %	0 %	0 %	509152350
64557	NC_021350	T	6	6	3454907	3454912	0 %	100 %	0 %	0 %	509152350
64558	NC_021350	ACG	2	6	3454955	3454960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	509152351

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.