MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021235	ACCAC	2	10	1211	1220	40 %	0 %	0 %	60 %	501673813
2	NC_021235	CCCAA	2	10	9757	9766	40 %	0 %	0 %	60 %	501673820
3	NC_021235	AAAGA	2	10	9942	9951	80 %	0 %	20 %	0 %	501673820
4	NC_021235	CGGCG	2	10	13216	13225	0 %	0 %	60 %	40 %	501673824
5	NC_021235	GGGCT	2	10	18994	19003	0 %	20 %	60 %	20 %	501673828
6	NC_021235	TGGGG	2	10	21457	21466	0 %	20 %	80 %	0 %	501673831
7	NC_021235	AGCGA	2	10	25120	25129	40 %	0 %	40 %	20 %	501673836
8	NC_021235	CGGAC	2	10	26695	26704	20 %	0 %	40 %	40 %	501673837
9	NC_021235	TAGGA	2	10	31183	31192	40 %	20 %	40 %	0 %	501673840
10	NC_021235	GACAA	2	10	32226	32235	60 %	0 %	20 %	20 %	501673841
11	NC_021235	CGCCC	2	10	33137	33146	0 %	0 %	20 %	80 %	501673842
12	NC_021235	CAGGT	2	10	33210	33219	20 %	20 %	40 %	20 %	501673842
13	NC_021235	GGCTT	2	10	35206	35215	0 %	40 %	40 %	20 %	501673844
14	NC_021235	TTGGA	2	10	35604	35613	20 %	40 %	40 %	0 %	501673844
15	NC_021235	ACCCA	2	10	37012	37021	40 %	0 %	0 %	60 %	501673846
16	NC_021235	TGAAG	2	10	38744	38753	40 %	20 %	40 %	0 %	501673846
17	NC_021235	GCCCC	2	10	39616	39625	0 %	0 %	20 %	80 %	501673847
18	NC_021235	GTCCT	2	10	41500	41509	0 %	40 %	20 %	40 %	501673848
19	NC_021235	GCGAA	2	10	42643	42652	40 %	0 %	40 %	20 %	501673848
20	NC_021235	TGACC	2	10	44298	44307	20 %	20 %	20 %	40 %	501673848
21	NC_021235	GGCCT	2	10	44905	44914	0 %	20 %	40 %	40 %	501673848
22	NC_021235	GGCGA	2	10	47566	47575	20 %	0 %	60 %	20 %	501673849
23	NC_021235	GGCTT	2	10	47717	47726	0 %	40 %	40 %	20 %	501673849
24	NC_021235	CTGAC	2	10	47903	47912	20 %	20 %	20 %	40 %	501673849
25	NC_021235	GGTCA	2	10	48652	48661	20 %	20 %	40 %	20 %	501673849
26	NC_021235	CAATT	2	10	51054	51063	40 %	40 %	0 %	20 %	501673851
27	NC_021235	CCAAA	2	10	62765	62774	60 %	0 %	0 %	40 %	501673863
28	NC_021235	GACCT	2	10	63291	63300	20 %	20 %	20 %	40 %	501673864
29	NC_021235	GCGCC	2	10	63317	63326	0 %	0 %	40 %	60 %	501673864
30	NC_021235	CCGGG	2	10	63700	63709	0 %	0 %	60 %	40 %	501673864
31	NC_021235	CTGGG	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	501673864
32	NC_021235	GGTTT	2	10	64743	64752	0 %	60 %	40 %	0 %	501673865
33	NC_021235	GGCCT	2	10	64832	64841	0 %	20 %	40 %	40 %	501673865
34	NC_021235	AGCGA	2	10	66044	66053	40 %	0 %	40 %	20 %	501673865
35	NC_021235	AACGA	2	10	67672	67681	60 %	0 %	20 %	20 %	501673867
36	NC_021235	TTTGG	2	10	68613	68622	0 %	60 %	40 %	0 %	501673868
37	NC_021235	GGCCG	2	10	70971	70980	0 %	0 %	60 %	40 %	501673870
38	NC_021235	CCAGC	2	10	71828	71837	20 %	0 %	20 %	60 %	501673870
39	NC_021235	ACCAG	2	10	73232	73241	40 %	0 %	20 %	40 %	501673871
40	NC_021235	ACTTT	2	10	73443	73452	20 %	60 %	0 %	20 %	501673872
41	NC_021235	TGATC	2	10	76348	76357	20 %	40 %	20 %	20 %	501673875
42	NC_021235	TGCGG	2	10	77469	77478	0 %	20 %	60 %	20 %	501673875
43	NC_021235	AAAGA	2	10	80742	80751	80 %	0 %	20 %	0 %	501673878
44	NC_021235	TTCCG	2	10	83443	83452	0 %	40 %	20 %	40 %	501673879
45	NC_021235	GCCGT	2	10	83941	83950	0 %	20 %	40 %	40 %	501673879
46	NC_021235	GCTAG	2	10	84340	84349	20 %	20 %	40 %	20 %	501673880
47	NC_021235	GCTTT	2	10	84547	84556	0 %	60 %	20 %	20 %	501673880
48	NC_021235	AGTTC	2	10	87159	87168	20 %	40 %	20 %	20 %	501673882
49	NC_021235	CTTGG	2	10	94506	94515	0 %	40 %	40 %	20 %	501673887
50	NC_021235	GGAAA	2	10	96912	96921	60 %	0 %	40 %	0 %	501673889
51	NC_021235	AAGCC	2	10	97133	97142	40 %	0 %	20 %	40 %	501673889
52	NC_021235	TTGGA	2	10	97932	97941	20 %	40 %	40 %	0 %	501673890
53	NC_021235	CCGCC	2	10	98654	98663	0 %	0 %	20 %	80 %	501673891
54	NC_021235	GGAAG	2	10	105336	105345	40 %	0 %	60 %	0 %	501673898
55	NC_021235	GGACA	2	10	109765	109774	40 %	0 %	40 %	20 %	501673904
56	NC_021235	GTTTA	2	10	113883	113892	20 %	60 %	20 %	0 %	501673908
57	NC_021235	ATCTA	2	10	114921	114930	40 %	40 %	0 %	20 %	501673908
58	NC_021235	TACAT	2	10	119158	119167	40 %	40 %	0 %	20 %	501673912
59	NC_021235	AAAGA	2	10	127129	127138	80 %	0 %	20 %	0 %	501673921
60	NC_021235	ATCAA	2	10	127478	127487	60 %	20 %	0 %	20 %	501673922
61	NC_021235	GATGG	2	10	128337	128346	20 %	20 %	60 %	0 %	501673923
62	NC_021235	TCAAA	2	10	129110	129119	60 %	20 %	0 %	20 %	501673925
63	NC_021235	GCGCT	2	10	129168	129177	0 %	20 %	40 %	40 %	501673925
64	NC_021235	GCTAG	2	10	132455	132464	20 %	20 %	40 %	20 %	501673928
65	NC_021235	GCTTT	2	10	132662	132671	0 %	60 %	20 %	20 %	501673928
66	NC_021235	GGGAA	2	10	135847	135856	40 %	0 %	60 %	0 %	501673931
67	NC_021235	GCTGG	2	10	137069	137078	0 %	20 %	60 %	20 %	501673931
68	NC_021235	CCGGA	2	10	140237	140246	20 %	0 %	40 %	40 %	501673934
69	NC_021235	CGATT	2	10	143069	143078	20 %	40 %	20 %	20 %	501673936
70	NC_021235	AACCA	2	10	143130	143139	60 %	0 %	0 %	40 %	501673936
71	NC_021235	CGGTA	2	10	143708	143717	20 %	20 %	40 %	20 %	501673937
72	NC_021235	CGAAC	2	10	146938	146947	40 %	0 %	20 %	40 %	501673941
73	NC_021235	GGCCA	2	10	147665	147674	20 %	0 %	40 %	40 %	501673941
74	NC_021235	CACCC	2	10	147677	147686	20 %	0 %	0 %	80 %	501673941
75	NC_021235	ACACG	2	10	149912	149921	40 %	0 %	20 %	40 %	501673943
76	NC_021235	GAGAA	2	10	150935	150944	60 %	0 %	40 %	0 %	501673944
77	NC_021235	GCTAG	2	10	153102	153111	20 %	20 %	40 %	20 %	501673946
78	NC_021235	GCTTT	2	10	153309	153318	0 %	60 %	20 %	20 %	501673946
79	NC_021235	AAAGC	2	10	155077	155086	60 %	0 %	20 %	20 %	501673948
80	NC_021235	CGGGG	2	10	156121	156130	0 %	0 %	80 %	20 %	501673948
81	NC_021235	GCAAG	2	10	159940	159949	40 %	0 %	40 %	20 %	501673952
82	NC_021235	CTAAA	2	10	161810	161819	60 %	20 %	0 %	20 %	501673954
83	NC_021235	AATTT	2	10	163461	163470	40 %	60 %	0 %	0 %	501673955
84	NC_021235	GTCAG	2	10	166568	166577	20 %	20 %	40 %	20 %	501673958
85	NC_021235	TTGAA	2	10	173617	173626	40 %	40 %	20 %	0 %	501673960
86	NC_021235	ACCAC	2	10	178821	178830	40 %	0 %	0 %	60 %	501673966
87	NC_021235	GCCAA	2	10	180913	180922	40 %	0 %	20 %	40 %	501673971
88	NC_021235	TTGGG	2	10	182522	182531	0 %	40 %	60 %	0 %	501673972
89	NC_021235	GACCC	2	10	184010	184019	20 %	0 %	20 %	60 %	501673973
90	NC_021235	CTTTG	2	10	184240	184249	0 %	60 %	20 %	20 %	501673973
91	NC_021235	ACGCC	2	10	191565	191574	20 %	0 %	20 %	60 %	501673979
92	NC_021235	ACGAC	2	10	201931	201940	40 %	0 %	20 %	40 %	501673984
93	NC_021235	GGACC	2	10	203577	203586	20 %	0 %	40 %	40 %	501673988
94	NC_021235	AAAGC	2	10	208051	208060	60 %	0 %	20 %	20 %	501673992
95	NC_021235	CTAGC	2	10	208258	208267	20 %	20 %	20 %	40 %	501673992
96	NC_021235	GGACC	2	10	208670	208679	20 %	0 %	40 %	40 %	501673993
97	NC_021235	TTGGT	2	10	211898	211907	0 %	60 %	40 %	0 %	501673995
98	NC_021235	ACCGG	2	10	212354	212363	20 %	0 %	40 %	40 %	501673995
99	NC_021235	CACGA	2	10	214623	214632	40 %	0 %	20 %	40 %	501673998
100	NC_021235	AGGTC	2	10	219428	219437	20 %	20 %	40 %	20 %	501674002
101	NC_021235	CGGTC	2	10	220112	220121	0 %	20 %	40 %	40 %	501674002
102	NC_021235	AAGCT	2	10	223486	223495	40 %	20 %	20 %	20 %	501674005
103	NC_021235	CGGCG	2	10	223734	223743	0 %	0 %	60 %	40 %	501674005
104	NC_021235	CGGGG	2	10	223930	223939	0 %	0 %	80 %	20 %	501674006
105	NC_021235	GACCC	2	10	226837	226846	20 %	0 %	20 %	60 %	501674008
106	NC_021235	AACCG	2	10	228277	228286	40 %	0 %	20 %	40 %	501674009
107	NC_021235	AGTGG	2	10	230739	230748	20 %	20 %	60 %	0 %	501674012
108	NC_021235	CAAGC	2	10	233041	233050	40 %	0 %	20 %	40 %	501674014
109	NC_021235	CGGCT	2	10	235192	235201	0 %	20 %	40 %	40 %	501674016
110	NC_021235	GGGAA	2	10	235979	235988	40 %	0 %	60 %	0 %	501674017
111	NC_021235	TTAAT	2	10	240196	240205	40 %	60 %	0 %	0 %	501674020
112	NC_021235	AATTG	2	10	242094	242103	40 %	40 %	20 %	0 %	501674022
113	NC_021235	TGATA	2	10	242116	242125	40 %	40 %	20 %	0 %	501674022
114	NC_021235	GCCGG	2	10	243297	243306	0 %	0 %	60 %	40 %	501674024
115	NC_021235	CCAAC	2	10	243488	243497	40 %	0 %	0 %	60 %	501674024
116	NC_021235	CGTAC	2	10	244042	244051	20 %	20 %	20 %	40 %	501674024
117	NC_021235	AAAGC	2	10	249366	249375	60 %	0 %	20 %	20 %	501674028
118	NC_021235	CTAGC	2	10	249573	249582	20 %	20 %	20 %	40 %	501674028
119	NC_021235	CTTGT	2	10	250679	250688	0 %	60 %	20 %	20 %	501674030
120	NC_021235	GCCGA	2	10	252454	252463	20 %	0 %	40 %	40 %	501674032
121	NC_021235	GGGCC	2	10	255314	255323	0 %	0 %	60 %	40 %	501674034
122	NC_021235	AACGA	2	10	256753	256762	60 %	0 %	20 %	20 %	501674036
123	NC_021235	CTACC	2	10	257010	257019	20 %	20 %	0 %	60 %	501674036
124	NC_021235	CTAGG	2	10	257282	257291	20 %	20 %	40 %	20 %	501674036
125	NC_021235	GGGAT	2	10	261641	261650	20 %	20 %	60 %	0 %	501674040
126	NC_021235	TCCCG	2	10	263910	263919	0 %	20 %	20 %	60 %	501674043
127	NC_021235	CCGTT	2	10	265208	265217	0 %	40 %	20 %	40 %	501674044
128	NC_021235	GGCCG	2	10	267127	267136	0 %	0 %	60 %	40 %	501674046
129	NC_021235	GGGAA	2	10	268949	268958	40 %	0 %	60 %	0 %	501674047
130	NC_021235	GAATG	2	10	269292	269301	40 %	20 %	40 %	0 %	501674048
131	NC_021235	GGAAC	2	10	271232	271241	40 %	0 %	40 %	20 %	501674049
132	NC_021235	AACCA	2	10	288448	288457	60 %	0 %	0 %	40 %	501674060
133	NC_021235	TTAAT	2	10	289217	289226	40 %	60 %	0 %	0 %	501674060
134	NC_021235	CTAGC	2	10	289766	289775	20 %	20 %	20 %	40 %	501674060
135	NC_021235	AACCA	2	10	290942	290951	60 %	0 %	0 %	40 %	501674061
136	NC_021235	CCACG	2	10	294361	294370	20 %	0 %	20 %	60 %	501674064
137	NC_021235	CGGAC	2	10	294903	294912	20 %	0 %	40 %	40 %	501674064
138	NC_021235	GTCGG	2	10	295282	295291	0 %	20 %	60 %	20 %	501674065
139	NC_021235	ACCGG	2	10	299129	299138	20 %	0 %	40 %	40 %	501674068
140	NC_021235	ACGGG	2	10	300545	300554	20 %	0 %	60 %	20 %	501674069
141	NC_021235	AAGCA	2	10	301203	301212	60 %	0 %	20 %	20 %	501674070
142	NC_021235	TTTGC	2	10	303966	303975	0 %	60 %	20 %	20 %	501674071
143	NC_021235	CCGGA	2	10	304566	304575	20 %	0 %	40 %	40 %	501674072
144	NC_021235	AGCCA	2	10	309186	309195	40 %	0 %	20 %	40 %	501674076
145	NC_021235	GCCCA	2	10	310889	310898	20 %	0 %	20 %	60 %	501674078
146	NC_021235	GGCCC	2	10	312214	312223	0 %	0 %	40 %	60 %	501674081
147	NC_021235	AAATT	2	10	312444	312453	60 %	40 %	0 %	0 %	501674081
148	NC_021235	CGAAC	2	10	313651	313660	40 %	0 %	20 %	40 %	501674082
149	NC_021235	ATGGA	2	10	315755	315764	40 %	20 %	40 %	0 %	501674083
150	NC_021235	GATGA	2	10	316118	316127	40 %	20 %	40 %	0 %	501674083
151	NC_021235	GGGAA	2	10	319575	319584	40 %	0 %	60 %	0 %	501674087
152	NC_021235	GGATC	2	10	321374	321383	20 %	20 %	40 %	20 %	501674089
153	NC_021235	GGCCG	2	10	326638	326647	0 %	0 %	60 %	40 %	501674095
154	NC_021235	TACGT	2	10	330579	330588	20 %	40 %	20 %	20 %	501674098
155	NC_021235	TCACC	2	10	331607	331616	20 %	20 %	0 %	60 %	501674098
156	NC_021235	CCAAC	2	10	332838	332847	40 %	0 %	0 %	60 %	501674099
157	NC_021235	TGAAG	2	10	333277	333286	40 %	20 %	40 %	0 %	501674099
158	NC_021235	GCAAA	2	10	334190	334199	60 %	0 %	20 %	20 %	501674099
159	NC_021235	AGCGG	2	10	338397	338406	20 %	0 %	60 %	20 %	501674102
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161	NC_021235	GGGAA	2	10	345326	345335	40 %	0 %	60 %	0 %	501674110
162	NC_021235	CGGCT	2	10	345923	345932	0 %	20 %	40 %	40 %	501674111
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164	NC_021235	CAGTG	2	10	347190	347199	20 %	20 %	40 %	20 %	501674113
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166	NC_021235	CGGCT	2	10	347733	347742	0 %	20 %	40 %	40 %	501674113
167	NC_021235	CACCC	2	10	347863	347872	20 %	0 %	0 %	80 %	501674114
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169	NC_021235	TTTGT	2	10	349089	349098	0 %	80 %	20 %	0 %	501674116
170	NC_021235	TGGGT	2	10	349468	349477	0 %	40 %	60 %	0 %	501674116
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173	NC_021235	AACGT	2	10	356364	356373	40 %	20 %	20 %	20 %	501674121
174	NC_021235	TGGCA	2	10	357043	357052	20 %	20 %	40 %	20 %	501674122
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177	NC_021235	GCAAA	2	10	367292	367301	60 %	0 %	20 %	20 %	501674131
178	NC_021235	GTCAA	2	10	371455	371464	40 %	20 %	20 %	20 %	501674137
179	NC_021235	TCACC	2	10	371734	371743	20 %	20 %	0 %	60 %	501674137
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199	NC_021235	GGTTA	2	10	405878	405887	20 %	40 %	40 %	0 %	501674172
200	NC_021235	GGATC	2	10	405962	405971	20 %	20 %	40 %	20 %	501674172
201	NC_021235	TGGGT	2	10	408627	408636	0 %	40 %	60 %	0 %	501674174
202	NC_021235	CCCGT	2	10	408671	408680	0 %	20 %	20 %	60 %	501674174
203	NC_021235	CCGGG	2	10	410785	410794	0 %	0 %	60 %	40 %	501674176
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212	NC_021235	CCATG	2	10	422166	422175	20 %	20 %	20 %	40 %	501674185
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230	NC_021235	GAAAA	2	10	460340	460349	80 %	0 %	20 %	0 %	501674207
231	NC_021235	TCGAT	2	10	464199	464208	20 %	40 %	20 %	20 %	501674210
232	NC_021235	CACGG	2	10	470236	470245	20 %	0 %	40 %	40 %	501674218
233	NC_021235	TTAAT	2	10	470404	470413	40 %	60 %	0 %	0 %	501674219
234	NC_021235	GGGGT	2	10	476841	476850	0 %	20 %	80 %	0 %	501674224
235	NC_021235	GCTAG	2	10	482464	482473	20 %	20 %	40 %	20 %	501674229
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237	NC_021235	AATGA	2	10	485097	485106	60 %	20 %	20 %	0 %	501674231
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242	NC_021235	TTGGG	2	10	490870	490879	0 %	40 %	60 %	0 %	501674237
243	NC_021235	TTAAG	2	10	491550	491559	40 %	40 %	20 %	0 %	501674238
244	NC_021235	TTTCA	2	10	493173	493182	20 %	60 %	0 %	20 %	501674240
245	NC_021235	AAAGC	2	10	494413	494422	60 %	0 %	20 %	20 %	501674241
246	NC_021235	CTAGC	2	10	494620	494629	20 %	20 %	20 %	40 %	501674241
247	NC_021235	GATTC	2	10	496304	496313	20 %	40 %	20 %	20 %	501674243
248	NC_021235	ATTTA	2	10	498796	498805	40 %	60 %	0 %	0 %	501674245
249	NC_021235	GGTAA	2	10	500885	500894	40 %	20 %	40 %	0 %	501674247
250	NC_021235	AAGCC	2	10	501149	501158	40 %	0 %	20 %	40 %	501674247
251	NC_021235	CGCTA	2	10	501695	501704	20 %	20 %	20 %	40 %	501674248
252	NC_021235	GGAAC	2	10	501932	501941	40 %	0 %	40 %	20 %	501674248
253	NC_021235	CAACC	2	10	510082	510091	40 %	0 %	0 %	60 %	501674256
254	NC_021235	TTTGG	2	10	518042	518051	0 %	60 %	40 %	0 %	501674263
255	NC_021235	AAGAA	2	10	525419	525428	80 %	0 %	20 %	0 %	501674270
256	NC_021235	GGCTG	2	10	525510	525519	0 %	20 %	60 %	20 %	501674270
257	NC_021235	AAATC	2	10	526094	526103	60 %	20 %	0 %	20 %	501674271
258	NC_021235	TTCGG	2	10	528159	528168	0 %	40 %	40 %	20 %	501674273
259	NC_021235	GACGG	2	10	528645	528654	20 %	0 %	60 %	20 %	501674273
260	NC_021235	GATGG	2	10	530235	530244	20 %	20 %	60 %	0 %	501674275
261	NC_021235	GGACC	2	10	533623	533632	20 %	0 %	40 %	40 %	501674279
262	NC_021235	GGACG	2	10	534185	534194	20 %	0 %	60 %	20 %	501674280
263	NC_021235	AGCCC	2	10	537282	537291	20 %	0 %	20 %	60 %	501674283
264	NC_021235	CGATT	2	10	537365	537374	20 %	40 %	20 %	20 %	501674283
265	NC_021235	TAAGC	2	10	537877	537886	40 %	20 %	20 %	20 %	501674284
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378	NC_021235	ACGGG	2	10	779436	779445	20 %	0 %	60 %	20 %	501674525
379	NC_021235	ACCAC	2	10	779783	779792	40 %	0 %	0 %	60 %	501674525
380	NC_021235	CCAAG	2	10	782662	782671	40 %	0 %	20 %	40 %	501674527
381	NC_021235	CAAGC	2	10	782744	782753	40 %	0 %	20 %	40 %	501674527
382	NC_021235	GGACC	2	10	784660	784669	20 %	0 %	40 %	40 %	501674527
383	NC_021235	GAACT	2	10	784736	784745	40 %	20 %	20 %	20 %	501674527
384	NC_021235	AGTTC	2	10	785233	785242	20 %	40 %	20 %	20 %	501674527
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387	NC_021235	TCGGG	2	10	792145	792154	0 %	20 %	60 %	20 %	501674533
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389	NC_021235	GACCG	2	10	796017	796026	20 %	0 %	40 %	40 %	501674535
390	NC_021235	AGACT	2	10	797069	797078	40 %	20 %	20 %	20 %	501674535
391	NC_021235	CGGGG	2	10	797242	797251	0 %	0 %	80 %	20 %	501674536
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