MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021235	TGG	2	6	50737	50742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851
1003	NC_021235	G	6	6	50741	50746	0 %	0 %	100 %	0 %	501673851
1004	NC_021235	TGG	2	6	50771	50776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851
1005	NC_021235	TTGG	2	8	50805	50812	0 %	50 %	50 %	0 %	501673851
1006	NC_021235	GGC	2	6	50841	50846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673851
1007	NC_021235	CCA	2	6	50910	50915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1008	NC_021235	TGG	2	6	50926	50931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851
1009	NC_021235	GTG	2	6	50944	50949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851
1010	NC_021235	CGC	2	6	50958	50963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673851
1011	NC_021235	ACTT	2	8	50980	50987	25 %	50 %	0 %	25 %	501673851
1012	NC_021235	AAC	2	6	50988	50993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673851
1013	NC_021235	GCG	2	6	51001	51006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673851
1014	NC_021235	CAATT	2	10	51054	51063	40 %	40 %	0 %	20 %	501673851
1015	NC_021235	A	6	6	51072	51077	100 %	0 %	0 %	0 %	501673851
1016	NC_021235	CCCA	2	8	51092	51099	25 %	0 %	0 %	75 %	501673851
1017	NC_021235	ACC	2	6	51134	51139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1018	NC_021235	GTC	3	9	51145	51153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673851
1019	NC_021235	ACG	2	6	51155	51160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673851
1020	NC_021235	CCA	2	6	51198	51203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1021	NC_021235	TGG	2	6	51230	51235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851
1022	NC_021235	TGA	2	6	51273	51278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673851
1023	NC_021235	GGC	2	6	51285	51290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673851
1024	NC_021235	ACC	2	6	51302	51307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1025	NC_021235	CGG	2	6	51530	51535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673851
1026	NC_021235	ACC	2	6	51551	51556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1027	NC_021235	CGC	2	6	51567	51572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673851
1028	NC_021235	CCA	2	6	51573	51578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673851
1029	NC_021235	AAT	2	6	51610	51615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501673851
1030	NC_021235	ACCG	2	8	51664	51671	25 %	0 %	25 %	50 %	501673851
1031	NC_021235	GGTT	2	8	51731	51738	0 %	50 %	50 %	0 %	501673851
1032	NC_021235	ACT	2	6	51740	51745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673851
1033	NC_021235	TCT	2	6	52090	52095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673852
1034	NC_021235	CAG	2	6	52164	52169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673852
1035	NC_021235	GGC	2	6	52173	52178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673852
1036	NC_021235	TCG	2	6	52180	52185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673852
1037	NC_021235	TGGT	2	8	52193	52200	0 %	50 %	50 %	0 %	501673852
1038	NC_021235	AAG	2	6	52249	52254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673852
1039	NC_021235	GGT	2	6	52312	52317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673852
1040	NC_021235	TTG	2	6	52332	52337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501673852
1041	NC_021235	TGG	2	6	52351	52356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673852
1042	NC_021235	CTT	2	6	52377	52382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673852
1043	NC_021235	AAC	2	6	52391	52396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673852
1044	NC_021235	GAA	2	6	52505	52510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673853
1045	NC_021235	CGT	2	6	52579	52584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673853
1046	NC_021235	CAT	2	6	52712	52717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673853
1047	NC_021235	GCC	2	6	52767	52772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673853
1048	NC_021235	CAA	2	6	52778	52783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673853
1049	NC_021235	CGA	2	6	52816	52821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673853
1050	NC_021235	GTG	2	6	52845	52850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673853
1051	NC_021235	CGC	2	6	52918	52923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673853
1052	NC_021235	AGG	2	6	52977	52982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673853
1053	NC_021235	AAG	2	6	52998	53003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673853
1054	NC_021235	AGA	3	9	53008	53016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673853
1055	NC_021235	GAA	2	6	53064	53069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673853
1056	NC_021235	CGT	2	6	53141	53146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673853
1057	NC_021235	CCA	2	6	53158	53163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673853
1058	NC_021235	TGG	2	6	53173	53178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673853
1059	NC_021235	TGG	2	6	53187	53192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673853
1060	NC_021235	GCTT	2	8	53223	53230	0 %	50 %	25 %	25 %	501673853
1061	NC_021235	GGT	2	6	53272	53277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673853
1062	NC_021235	TCGG	2	8	53333	53340	0 %	25 %	50 %	25 %	501673853
1063	NC_021235	GAC	2	6	53381	53386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673853
1064	NC_021235	ACG	2	6	53404	53409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673853
1065	NC_021235	GTG	2	6	53448	53453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673853
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1067	NC_021235	GGC	2	6	53646	53651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673854
1068	NC_021235	CGT	2	6	53657	53662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673854
1069	NC_021235	GAT	2	6	53667	53672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673854
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1071	NC_021235	TCA	2	6	53720	53725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673854
1072	NC_021235	GTGG	2	8	53727	53734	0 %	25 %	75 %	0 %	501673854
1073	NC_021235	CGGT	2	8	53816	53823	0 %	25 %	50 %	25 %	501673854
1074	NC_021235	CCG	2	6	53890	53895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673854
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1076	NC_021235	CCG	2	6	53963	53968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673854
1077	NC_021235	TGA	2	6	53974	53979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673854
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1081	NC_021235	GAT	2	6	54201	54206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673854
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1083	NC_021235	TTTA	2	8	54264	54271	25 %	75 %	0 %	0 %	501673854
1084	NC_021235	GTTC	2	8	54290	54297	0 %	50 %	25 %	25 %	501673854
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1088	NC_021235	ACC	2	6	54574	54579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673855
1089	NC_021235	GACC	2	8	54602	54609	25 %	0 %	25 %	50 %	501673855
1090	NC_021235	CGG	2	6	54619	54624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673855
1091	NC_021235	AGTC	2	8	54682	54689	25 %	25 %	25 %	25 %	501673855
1092	NC_021235	CTT	2	6	54695	54700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673855
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1094	NC_021235	CTT	2	6	54731	54736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673855
1095	NC_021235	CGG	2	6	54753	54758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673855
1096	NC_021235	GGC	2	6	54824	54829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673855
1097	NC_021235	CTG	2	6	54843	54848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673855
1098	NC_021235	GCT	2	6	54890	54895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673855
1099	NC_021235	G	6	6	54925	54930	0 %	0 %	100 %	0 %	501673855
1100	NC_021235	CCG	2	6	54943	54948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673855
1101	NC_021235	GCC	2	6	54966	54971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673855
1102	NC_021235	TAG	2	6	55074	55079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673856
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1104	NC_021235	CCA	2	6	55189	55194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673856
1105	NC_021235	TGG	2	6	55341	55346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673856
1106	NC_021235	ATC	2	6	55365	55370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673856
1107	NC_021235	GCGG	2	8	55448	55455	0 %	0 %	75 %	25 %	501673856
1108	NC_021235	GCG	2	6	55476	55481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673856
1109	NC_021235	TGG	2	6	55555	55560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673856
1110	NC_021235	CGG	2	6	55615	55620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673856
1111	NC_021235	AAG	2	6	55623	55628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673856
1112	NC_021235	GTT	2	6	55639	55644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501673856
1113	NC_021235	TTGA	2	8	55739	55746	25 %	50 %	25 %	0 %	501673856
1114	NC_021235	GTA	3	9	55859	55867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673856
1115	NC_021235	TTC	2	6	55895	55900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673856
1116	NC_021235	CA	3	6	55997	56002	50 %	0 %	0 %	50 %	501673856
1117	NC_021235	TCA	2	6	56025	56030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673856
1118	NC_021235	AAG	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673857
1119	NC_021235	GTT	2	6	56328	56333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501673857
1120	NC_021235	G	7	7	56346	56352	0 %	0 %	100 %	0 %	501673857
1121	NC_021235	TCCG	2	8	56408	56415	0 %	25 %	25 %	50 %	501673857
1122	NC_021235	ACC	2	6	56433	56438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673857
1123	NC_021235	GAA	2	6	56484	56489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673857
1124	NC_021235	GACC	2	8	56501	56508	25 %	0 %	25 %	50 %	501673857
1125	NC_021235	ACC	2	6	56566	56571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673857
1126	NC_021235	ACC	2	6	56622	56627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673857
1127	NC_021235	AAG	2	6	56628	56633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673857
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1243	NC_021235	CGCC	2	8	64055	64062	0 %	0 %	25 %	75 %	501673864
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1251	NC_021235	AGA	2	6	64460	64465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673864
1252	NC_021235	TGA	2	6	64466	64471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673864
1253	NC_021235	AGCG	2	8	64509	64516	25 %	0 %	50 %	25 %	501673864
1254	NC_021235	TGA	2	6	64534	64539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673864
1255	NC_021235	GAC	2	6	64560	64565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673864
1256	NC_021235	GGC	2	6	64577	64582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673864
1257	NC_021235	AAT	2	6	64585	64590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501673864
1258	NC_021235	TTC	2	6	64595	64600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673865
1259	NC_021235	GGTTT	2	10	64743	64752	0 %	60 %	40 %	0 %	501673865
1260	NC_021235	TTA	2	6	64767	64772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501673865
1261	NC_021235	T	6	6	64784	64789	0 %	100 %	0 %	0 %	501673865
1262	NC_021235	CAC	2	6	64795	64800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673865
1263	NC_021235	GGCCT	2	10	64832	64841	0 %	20 %	40 %	40 %	501673865
1264	NC_021235	GAC	3	9	64844	64852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673865
1265	NC_021235	AAC	2	6	64871	64876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673865
1266	NC_021235	CGA	2	6	64966	64971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673865
1267	NC_021235	TAC	2	6	65033	65038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673865
1268	NC_021235	CGGG	2	8	65042	65049	0 %	0 %	75 %	25 %	501673865
1269	NC_021235	CTA	2	6	65104	65109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673865
1270	NC_021235	CTT	2	6	65179	65184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673865
1271	NC_021235	CTT	3	9	65209	65217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673865
1272	NC_021235	CTT	2	6	65254	65259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673865
1273	NC_021235	CCGG	2	8	65266	65273	0 %	0 %	50 %	50 %	501673865
1274	NC_021235	TGGC	2	8	65327	65334	0 %	25 %	50 %	25 %	501673865
1275	NC_021235	GCGG	2	8	65338	65345	0 %	0 %	75 %	25 %	501673865
1276	NC_021235	GAC	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673865
1277	NC_021235	CGC	2	6	65395	65400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673865
1278	NC_021235	GTG	2	6	65429	65434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673865
1279	NC_021235	GCC	2	6	65453	65458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673865
1280	NC_021235	TAA	2	6	65503	65508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501673865
1281	NC_021235	CCGG	2	8	65551	65558	0 %	0 %	50 %	50 %	501673865
1282	NC_021235	GGC	2	6	65580	65585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673865
1283	NC_021235	GGC	2	6	65719	65724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673865
1284	NC_021235	GGT	2	6	65737	65742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673865
1285	NC_021235	TGG	2	6	65799	65804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673865
1286	NC_021235	GGT	2	6	65866	65871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673865
1287	NC_021235	GCC	2	6	66017	66022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673865
1288	NC_021235	AGCGA	2	10	66044	66053	40 %	0 %	40 %	20 %	501673865
1289	NC_021235	GCA	2	6	66061	66066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673865
1290	NC_021235	GAA	2	6	66497	66502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673866
1291	NC_021235	CGT	2	6	66524	66529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673866
1292	NC_021235	GGTT	2	8	66552	66559	0 %	50 %	50 %	0 %	501673866
1293	NC_021235	TGGT	2	8	66610	66617	0 %	50 %	50 %	0 %	501673866
1294	NC_021235	GAAA	2	8	66644	66651	75 %	0 %	25 %	0 %	501673866
1295	NC_021235	CAAC	2	8	66713	66720	50 %	0 %	0 %	50 %	501673866
1296	NC_021235	CTT	2	6	66776	66781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673866
1297	NC_021235	TCA	2	6	66835	66840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673866
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1300	NC_021235	ACG	2	6	66916	66921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673866
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1302	NC_021235	GAA	2	6	67028	67033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673866
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1313	NC_021235	CCTG	2	8	67311	67318	0 %	25 %	25 %	50 %	501673866
1314	NC_021235	ATT	2	6	67372	67377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501673867
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1316	NC_021235	TGGT	2	8	67481	67488	0 %	50 %	50 %	0 %	501673867
1317	NC_021235	CAA	2	6	67597	67602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673867
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1319	NC_021235	GGT	2	6	67683	67688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673867
1320	NC_021235	AGG	2	6	67733	67738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673867
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1322	NC_021235	G	7	7	67816	67822	0 %	0 %	100 %	0 %	501673867
1323	NC_021235	GAC	2	6	67911	67916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673867
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1326	NC_021235	GTGG	2	8	68110	68117	0 %	25 %	75 %	0 %	501673867
1327	NC_021235	GCC	2	6	68125	68130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673867
1328	NC_021235	TCT	2	6	68195	68200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673867
1329	NC_021235	ATC	2	6	68224	68229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673867
1330	NC_021235	CGA	2	6	68295	68300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673867
1331	NC_021235	TGA	2	6	68334	68339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673867
1332	NC_021235	TGA	2	6	68400	68405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673867
1333	NC_021235	G	6	6	68540	68545	0 %	0 %	100 %	0 %	501673868
1334	NC_021235	GGC	2	6	68591	68596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673868
1335	NC_021235	TTTGG	2	10	68613	68622	0 %	60 %	40 %	0 %	501673868
1336	NC_021235	GGT	2	6	68635	68640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673868
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1339	NC_021235	CAAGTC	2	12	68780	68791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501673868
1340	NC_021235	CTA	2	6	68844	68849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673868
1341	NC_021235	ATC	2	6	68858	68863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673868
1342	NC_021235	ATTG	2	8	68929	68936	25 %	50 %	25 %	0 %	501673868
1343	NC_021235	CAA	2	6	69013	69018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673868
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1349	NC_021235	CAC	2	6	69490	69495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673869
1350	NC_021235	C	6	6	69497	69502	0 %	0 %	0 %	100 %	501673869
1351	NC_021235	GCC	2	6	69544	69549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673869
1352	NC_021235	GCC	2	6	69568	69573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673869
1353	NC_021235	GAG	2	6	69649	69654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673869
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1359	NC_021235	CCTG	2	8	69902	69909	0 %	25 %	25 %	50 %	501673869
1360	NC_021235	ATT	2	6	69934	69939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501673869
1361	NC_021235	GCC	2	6	70045	70050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673869
1362	NC_021235	AGG	2	6	70067	70072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673869
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1364	NC_021235	AGG	2	6	70169	70174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673869
1365	NC_021235	CGAC	2	8	70229	70236	25 %	0 %	25 %	50 %	501673869
1366	NC_021235	CAC	3	9	70255	70263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673869
1367	NC_021235	CGA	2	6	70290	70295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673869
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1369	NC_021235	ACC	2	6	70327	70332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673869
1370	NC_021235	TCT	2	6	70336	70341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673869
1371	NC_021235	T	6	6	70384	70389	0 %	100 %	0 %	0 %	501673869
1372	NC_021235	TTCA	2	8	70701	70708	25 %	50 %	0 %	25 %	501673870
1373	NC_021235	ACC	2	6	70720	70725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673870
1374	NC_021235	GGA	2	6	70865	70870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673870
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1376	NC_021235	ACC	2	6	70915	70920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673870
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