MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021235	AACG	2	8	25657	25664	50 %	0 %	25 %	25 %	501673836
502	NC_021235	GTGG	2	8	25683	25690	0 %	25 %	75 %	0 %	501673836
503	NC_021235	GAA	2	6	25693	25698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673836
504	NC_021235	T	6	6	25714	25719	0 %	100 %	0 %	0 %	501673836
505	NC_021235	CGA	2	6	25755	25760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673836
506	NC_021235	CGC	2	6	25908	25913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673836
507	NC_021235	ACC	2	6	25943	25948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673836
508	NC_021235	ATTT	2	8	25950	25957	25 %	75 %	0 %	0 %	501673836
509	NC_021235	GTA	2	6	25968	25973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673836
510	NC_021235	ACA	2	6	26487	26492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673837
511	NC_021235	GAT	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673837
512	NC_021235	T	6	6	26543	26548	0 %	100 %	0 %	0 %	501673837
513	NC_021235	TTC	2	6	26637	26642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673837
514	NC_021235	CCA	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673837
515	NC_021235	ATC	2	6	26679	26684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673837
516	NC_021235	CGGAC	2	10	26695	26704	20 %	0 %	40 %	40 %	501673837
517	NC_021235	G	6	6	26720	26725	0 %	0 %	100 %	0 %	501673837
518	NC_021235	GCCT	2	8	26731	26738	0 %	25 %	25 %	50 %	501673837
519	NC_021235	CGTGAT	2	12	26765	26776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	501673837
520	NC_021235	GCC	2	6	26826	26831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
521	NC_021235	GAT	2	6	26900	26905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673837
522	NC_021235	ACG	2	6	26923	26928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673837
523	NC_021235	GCC	2	6	26988	26993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
524	NC_021235	AAG	2	6	27039	27044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673837
525	NC_021235	CGT	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673837
526	NC_021235	GCC	2	6	27087	27092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
527	NC_021235	TTTA	2	8	27110	27117	25 %	75 %	0 %	0 %	501673837
528	NC_021235	TTC	2	6	27261	27266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673837
529	NC_021235	CGG	2	6	27301	27306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673837
530	NC_021235	CAC	2	6	27332	27337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673837
531	NC_021235	CCG	2	6	27349	27354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
532	NC_021235	GCC	2	6	27390	27395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
533	NC_021235	CAAT	2	8	27399	27406	50 %	25 %	0 %	25 %	501673837
534	NC_021235	CGC	2	6	27407	27412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673837
535	NC_021235	TTC	2	6	27513	27518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673837
536	NC_021235	CTGC	2	8	27665	27672	0 %	25 %	25 %	50 %	501673837
537	NC_021235	CCT	2	6	27694	27699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501673837
538	NC_021235	GGC	2	6	27720	27725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673837
539	NC_021235	CAC	2	6	27785	27790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673837
540	NC_021235	GAC	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
541	NC_021235	AGA	2	6	27884	27889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673838
542	NC_021235	T	6	6	27948	27953	0 %	100 %	0 %	0 %	501673838
543	NC_021235	GAA	2	6	27954	27959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673838
544	NC_021235	TGG	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673838
545	NC_021235	GAT	2	6	28067	28072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673838
546	NC_021235	GCG	2	6	28172	28177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
547	NC_021235	GGC	2	6	28212	28217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
548	NC_021235	CGG	2	6	28252	28257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
549	NC_021235	TGG	2	6	28270	28275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673838
550	NC_021235	CTG	2	6	28300	28305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673838
551	NC_021235	ACG	2	6	28366	28371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
552	NC_021235	AAGC	2	8	28399	28406	50 %	0 %	25 %	25 %	501673838
553	NC_021235	CTG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673838
554	NC_021235	GACC	2	8	28493	28500	25 %	0 %	25 %	50 %	501673838
555	NC_021235	ACC	2	6	28605	28610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673838
556	NC_021235	TGG	2	6	28639	28644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673838
557	NC_021235	CGG	2	6	28645	28650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
558	NC_021235	ACG	2	6	28687	28692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
559	NC_021235	TGG	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673838
560	NC_021235	GTCA	2	8	28710	28717	25 %	25 %	25 %	25 %	501673838
561	NC_021235	GTG	2	6	28746	28751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673838
562	NC_021235	CTA	2	6	28814	28819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673838
563	NC_021235	CGG	2	6	28874	28879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
564	NC_021235	CTGC	2	8	28907	28914	0 %	25 %	25 %	50 %	501673838
565	NC_021235	TAC	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673838
566	NC_021235	ACC	2	6	28972	28977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673838
567	NC_021235	GAA	2	6	29088	29093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673838
568	NC_021235	CCT	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501673838
569	NC_021235	GC	3	6	29199	29204	0 %	0 %	50 %	50 %	501673838
570	NC_021235	ACT	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501673838
571	NC_021235	ACA	2	6	29284	29289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673838
572	NC_021235	AAC	2	6	29295	29300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673838
573	NC_021235	CGG	2	6	29409	29414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
574	NC_021235	ACA	2	6	29434	29439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673838
575	NC_021235	ACG	2	6	29482	29487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
576	NC_021235	CTT	2	6	29489	29494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673838
577	NC_021235	CAAC	2	8	29546	29553	50 %	0 %	0 %	50 %	501673838
578	NC_021235	CAAG	2	8	29591	29598	50 %	0 %	25 %	25 %	501673838
579	NC_021235	CGA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
580	NC_021235	GCC	2	6	29730	29735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673838
581	NC_021235	CGA	2	6	29744	29749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
582	NC_021235	ACA	2	6	29803	29808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673838
583	NC_021235	CGA	2	6	29816	29821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673838
584	NC_021235	GAA	2	6	29927	29932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673838
585	NC_021235	CTG	2	6	30015	30020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673838
586	NC_021235	GCG	2	6	30074	30079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673838
587	NC_021235	CCGC	2	8	30279	30286	0 %	0 %	25 %	75 %	501673839
588	NC_021235	GGAT	2	8	30375	30382	25 %	25 %	50 %	0 %	501673839
589	NC_021235	AGGC	2	8	30402	30409	25 %	0 %	50 %	25 %	501673839
590	NC_021235	CCA	2	6	30412	30417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673839
591	NC_021235	GAA	2	6	30434	30439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673839
592	NC_021235	CCA	2	6	30453	30458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501673839
593	NC_021235	CTT	2	6	30529	30534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501673839
594	NC_021235	GCC	2	6	30548	30553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673839
595	NC_021235	AGA	2	6	30619	30624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673839
596	NC_021235	GGT	2	6	30637	30642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673839
597	NC_021235	GCC	3	9	30692	30700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673839
598	NC_021235	GCC	2	6	30761	30766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673839
599	NC_021235	CGGC	2	8	30774	30781	0 %	0 %	50 %	50 %	501673839
600	NC_021235	GCG	2	6	30824	30829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673839
601	NC_021235	GCG	2	6	30978	30983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673840
602	NC_021235	GTTA	2	8	30993	31000	25 %	50 %	25 %	0 %	501673840
603	NC_021235	GAA	2	6	31032	31037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501673840
604	NC_021235	GTT	2	6	31038	31043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501673840
605	NC_021235	AGG	2	6	31087	31092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501673840
606	NC_021235	AGC	2	6	31128	31133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673840
607	NC_021235	TAGGA	2	10	31183	31192	40 %	20 %	40 %	0 %	501673840
608	NC_021235	ACG	2	6	31198	31203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673840
609	NC_021235	TGA	2	6	31235	31240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501673840
610	NC_021235	GC	3	6	31297	31302	0 %	0 %	50 %	50 %	501673840
611	NC_021235	TAGG	2	8	31317	31324	25 %	25 %	50 %	0 %	501673840
612	NC_021235	AAC	2	6	31345	31350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501673840
613	NC_021235	CGA	2	6	31463	31468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501673840
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615	NC_021235	A	6	6	31636	31641	100 %	0 %	0 %	0 %	501673840
616	NC_021235	TTAG	2	8	31684	31691	25 %	50 %	25 %	0 %	501673841
617	NC_021235	CGG	2	6	31717	31722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673841
618	NC_021235	GTC	2	6	31757	31762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501673841
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621	NC_021235	GCC	2	6	31836	31841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501673841
622	NC_021235	GGT	2	6	31910	31915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673841
623	NC_021235	GGC	2	6	31967	31972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673841
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625	NC_021235	GGT	2	6	32036	32041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673841
626	NC_021235	TGG	2	6	32121	32126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673841
627	NC_021235	GACAA	2	10	32226	32235	60 %	0 %	20 %	20 %	501673841
628	NC_021235	GGC	2	6	32363	32368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501673841
629	NC_021235	GGCG	2	8	32404	32411	0 %	0 %	75 %	25 %	501673841
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1000	NC_021235	GTG	2	6	50683	50688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501673851

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