MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021235	CCG	2	6	264386	264391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674044
4502	NC_021235	T	6	6	264405	264410	0 %	100 %	0 %	0 %	501674044
4503	NC_021235	CAC	2	6	264456	264461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674044
4504	NC_021235	GAC	2	6	264465	264470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674044
4505	NC_021235	TGA	2	6	264487	264492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674044
4506	NC_021235	GTG	2	6	264502	264507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674044
4507	NC_021235	AACA	2	8	264588	264595	75 %	0 %	0 %	25 %	501674044
4508	NC_021235	CCG	2	6	264602	264607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674044
4509	NC_021235	AAAC	2	8	264646	264653	75 %	0 %	0 %	25 %	501674044
4510	NC_021235	AACG	2	8	264783	264790	50 %	0 %	25 %	25 %	501674044
4511	NC_021235	GCC	2	6	264840	264845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674044
4512	NC_021235	TCG	2	6	264848	264853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674044
4513	NC_021235	CTA	2	6	264887	264892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674044
4514	NC_021235	AGA	2	6	264923	264928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674044
4515	NC_021235	GCC	2	6	264971	264976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674044
4516	NC_021235	GTG	2	6	265001	265006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674044
4517	NC_021235	CCTT	2	8	265030	265037	0 %	50 %	0 %	50 %	501674044
4518	NC_021235	A	6	6	265038	265043	100 %	0 %	0 %	0 %	501674044
4519	NC_021235	CGGG	2	8	265116	265123	0 %	0 %	75 %	25 %	501674044
4520	NC_021235	G	8	8	265121	265128	0 %	0 %	100 %	0 %	501674044
4521	NC_021235	GCCA	2	8	265144	265151	25 %	0 %	25 %	50 %	501674044
4522	NC_021235	AAC	2	6	265185	265190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674044
4523	NC_021235	CCGTT	2	10	265208	265217	0 %	40 %	20 %	40 %	501674044
4524	NC_021235	G	6	6	265244	265249	0 %	0 %	100 %	0 %	501674044
4525	NC_021235	CA	3	6	265250	265255	50 %	0 %	0 %	50 %	501674044
4526	NC_021235	CGG	2	6	265266	265271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674044
4527	NC_021235	TCG	2	6	265324	265329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674044
4528	NC_021235	GTG	2	6	265344	265349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674044
4529	NC_021235	CCG	2	6	265382	265387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674044
4530	NC_021235	GAG	2	6	265480	265485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501674045
4531	NC_021235	GCT	2	6	265513	265518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674045
4532	NC_021235	GATC	2	8	265608	265615	25 %	25 %	25 %	25 %	501674045
4533	NC_021235	TAC	2	6	265651	265656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674045
4534	NC_021235	TCA	2	6	265727	265732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674045
4535	NC_021235	TCG	2	6	265733	265738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674045
4536	NC_021235	TTG	2	6	265745	265750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674045
4537	NC_021235	ACT	2	6	265782	265787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674045
4538	NC_021235	CTT	2	6	265824	265829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674045
4539	NC_021235	GCCG	2	8	265836	265843	0 %	0 %	50 %	50 %	501674045
4540	NC_021235	TTGG	2	8	265900	265907	0 %	50 %	50 %	0 %	501674045
4541	NC_021235	TAC	2	6	265930	265935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674045
4542	NC_021235	ATG	2	6	265985	265990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674045
4543	NC_021235	ATT	2	6	265995	266000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501674045
4544	NC_021235	AAT	2	6	266097	266102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674046
4545	NC_021235	TCTT	2	8	266137	266144	0 %	75 %	0 %	25 %	501674046
4546	NC_021235	ACC	2	6	266187	266192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674046
4547	NC_021235	ATTT	2	8	266222	266229	25 %	75 %	0 %	0 %	501674046
4548	NC_021235	ACG	2	6	266337	266342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674046
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4551	NC_021235	TTC	2	6	266515	266520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674046
4552	NC_021235	TCA	2	6	266527	266532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674046
4553	NC_021235	TCT	3	9	266539	266547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674046
4554	NC_021235	ATG	3	9	266550	266558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674046
4555	NC_021235	GGCGGT	2	12	266574	266585	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	501674046
4556	NC_021235	TGA	2	6	266593	266598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674046
4557	NC_021235	AAGACC	2	12	266607	266618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	501674046
4558	NC_021235	GAA	4	12	266670	266681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674046
4559	NC_021235	GAA	2	6	266714	266719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674046
4560	NC_021235	AAG	2	6	266724	266729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674046
4561	NC_021235	TTC	2	6	266838	266843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674046
4562	NC_021235	GTTGGG	2	12	266877	266888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674046
4563	NC_021235	ATC	2	6	266940	266945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674046
4564	NC_021235	TGA	2	6	266951	266956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674046
4565	NC_021235	CGC	2	6	266973	266978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674046
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4567	NC_021235	ACG	2	6	267004	267009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674046
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4569	NC_021235	CT	3	6	267118	267123	0 %	50 %	0 %	50 %	501674046
4570	NC_021235	GGCCG	2	10	267127	267136	0 %	0 %	60 %	40 %	501674046
4571	NC_021235	TTGG	2	8	267153	267160	0 %	50 %	50 %	0 %	501674046
4572	NC_021235	GCC	2	6	267303	267308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674046
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4574	NC_021235	CGC	2	6	267344	267349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674046
4575	NC_021235	GGCC	2	8	267385	267392	0 %	0 %	50 %	50 %	501674046
4576	NC_021235	CAC	2	6	267412	267417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674046
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4580	NC_021235	CGG	2	6	267527	267532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674046
4581	NC_021235	CAT	2	6	267539	267544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674046
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4583	NC_021235	GGT	2	6	267612	267617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674046
4584	NC_021235	GCC	2	6	267621	267626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674046
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4586	NC_021235	ATCA	2	8	267787	267794	50 %	25 %	0 %	25 %	501674046
4587	NC_021235	CGG	2	6	267811	267816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674046
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4589	NC_021235	CAT	2	6	267875	267880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674046
4590	NC_021235	CTG	2	6	267921	267926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674046
4591	NC_021235	AGA	3	9	267986	267994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674046
4592	NC_021235	TGG	2	6	267997	268002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674046
4593	NC_021235	AAC	2	6	268015	268020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674046
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4598	NC_021235	GAA	2	6	268196	268201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674046
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4601	NC_021235	ACT	2	6	268331	268336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674047
4602	NC_021235	GAA	2	6	268402	268407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674047
4603	NC_021235	CCA	2	6	268410	268415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674047
4604	NC_021235	TCG	2	6	268553	268558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674047
4605	NC_021235	TGA	2	6	268752	268757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674047
4606	NC_021235	TTA	2	6	268764	268769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501674047
4607	NC_021235	CGA	2	6	268884	268889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674047
4608	NC_021235	ACG	2	6	268909	268914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674047
4609	NC_021235	GGGAA	2	10	268949	268958	40 %	0 %	60 %	0 %	501674047
4610	NC_021235	GAC	2	6	269089	269094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674047
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4612	NC_021235	GAATG	2	10	269292	269301	40 %	20 %	40 %	0 %	501674048
4613	NC_021235	AAG	2	6	269387	269392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674048
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4618	NC_021235	CGA	2	6	269557	269562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674048
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4621	NC_021235	CAA	2	6	269656	269661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674048
4622	NC_021235	A	6	6	269698	269703	100 %	0 %	0 %	0 %	501674048
4623	NC_021235	GAC	2	6	269735	269740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674048
4624	NC_021235	GGGCAG	2	12	269781	269792	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	501674048
4625	NC_021235	GAAG	2	8	269860	269867	50 %	0 %	50 %	0 %	501674048
4626	NC_021235	GCCA	2	8	269870	269877	25 %	0 %	25 %	50 %	501674048
4627	NC_021235	CTG	2	6	269916	269921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674048
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4631	NC_021235	ACT	2	6	270018	270023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674048
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4635	NC_021235	TGG	2	6	270099	270104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674048
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4642	NC_021235	TGG	2	6	270342	270347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674049
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4659	NC_021235	GGAAC	2	10	271232	271241	40 %	0 %	40 %	20 %	501674049
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4661	NC_021235	TGG	2	6	271275	271280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674049
4662	NC_021235	GCTG	2	8	271345	271352	0 %	25 %	50 %	25 %	501674049
4663	NC_021235	TGG	2	6	271379	271384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674049
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4734	NC_021235	ATA	2	6	283934	283939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674054
4735	NC_021235	ATA	2	6	283946	283951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674054
4736	NC_021235	TAG	3	9	283959	283967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674054
4737	NC_021235	ACA	2	6	283969	283974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674054
4738	NC_021235	TAC	2	6	283989	283994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674054
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4741	NC_021235	TAC	2	6	284037	284042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674054
4742	NC_021235	TAC	2	6	284049	284054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674054
4743	NC_021235	ACT	2	6	284101	284106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674054
4744	NC_021235	GCT	2	6	284129	284134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674055
4745	NC_021235	AGA	2	6	284191	284196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674055
4746	NC_021235	AAG	2	6	285727	285732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674056
4747	NC_021235	TAA	2	6	285743	285748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674056
4748	NC_021235	GGT	2	6	285829	285834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674056
4749	NC_021235	AAAG	2	8	285941	285948	75 %	0 %	25 %	0 %	501674056
4750	NC_021235	ATGG	2	8	285974	285981	25 %	25 %	50 %	0 %	501674056
4751	NC_021235	ATG	2	6	286013	286018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674056
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4753	NC_021235	TAC	2	6	286074	286079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674056
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4755	NC_021235	TA	3	6	286154	286159	50 %	50 %	0 %	0 %	501674056
4756	NC_021235	ATG	2	6	286214	286219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674056
4757	NC_021235	TGA	2	6	286317	286322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674056
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4759	NC_021235	TAG	2	6	286470	286475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674057
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4761	NC_021235	A	7	7	286498	286504	100 %	0 %	0 %	0 %	501674057
4762	NC_021235	TAG	2	6	286566	286571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674057
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4765	NC_021235	TAA	2	6	286680	286685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674057
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4770	NC_021235	TCT	2	6	287012	287017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674058
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4772	NC_021235	TAAG	2	8	287811	287818	50 %	25 %	25 %	0 %	501674059
4773	NC_021235	CTT	2	6	287830	287835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674059
4774	NC_021235	GTG	2	6	287875	287880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674059
4775	NC_021235	CCAA	2	8	287889	287896	50 %	0 %	0 %	50 %	501674059
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4778	NC_021235	CGC	2	6	287975	287980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674059
4779	NC_021235	T	7	7	288135	288141	0 %	100 %	0 %	0 %	501674059
4780	NC_021235	AAG	2	6	288337	288342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674060
4781	NC_021235	TAG	2	6	288365	288370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674060
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4785	NC_021235	TGC	2	6	288495	288500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674060
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4849	NC_021235	CGG	2	6	290952	290957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674061
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4851	NC_021235	GTT	2	6	291157	291162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674061
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4853	NC_021235	GCG	2	6	291214	291219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674061
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4863	NC_021235	TCT	2	6	291696	291701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674061
4864	NC_021235	GAA	2	6	291710	291715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674061
4865	NC_021235	AAC	2	6	291747	291752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674061
4866	NC_021235	GCC	2	6	291785	291790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674061
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4873	NC_021235	CTGG	2	8	291985	291992	0 %	25 %	50 %	25 %	501674061
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4885	NC_021235	ATTT	2	8	292494	292501	25 %	75 %	0 %	0 %	501674062
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4933	NC_021235	TGA	2	6	295853	295858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674066
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4938	NC_021235	GAC	2	6	296066	296071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674066
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4985	NC_021235	CGC	2	6	298929	298934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674068
4986	NC_021235	TGG	2	6	298943	298948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674068
4987	NC_021235	GCG	2	6	298951	298956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674068
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