MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	TTCTA	2	10	2664	2673	20 %	60 %	0 %	20 %	501148331
2	NC_021233	GCATG	2	10	4722	4731	20 %	20 %	40 %	20 %	501148334
3	NC_021233	CAAGT	2	10	6095	6104	40 %	20 %	20 %	20 %	501148337
4	NC_021233	GCTAC	2	10	6272	6281	20 %	20 %	20 %	40 %	501148338
5	NC_021233	GCTAA	2	10	10176	10185	40 %	20 %	20 %	20 %	501148340
6	NC_021233	GAACA	2	10	11080	11089	60 %	0 %	20 %	20 %	501148341
7	NC_021233	TTTTC	2	10	11124	11133	0 %	80 %	0 %	20 %	501148341
8	NC_021233	TTTGT	2	10	11580	11589	0 %	80 %	20 %	0 %	501148341
9	NC_021233	TCAAA	2	10	14306	14315	60 %	20 %	0 %	20 %	501148343
10	NC_021233	ACTGG	2	10	15903	15912	20 %	20 %	40 %	20 %	501148345
11	NC_021233	AATTT	2	10	19961	19970	40 %	60 %	0 %	0 %	501148347
12	NC_021233	CAAAT	2	10	21096	21105	60 %	20 %	0 %	20 %	501148349
13	NC_021233	CAGAT	2	10	21494	21503	40 %	20 %	20 %	20 %	501148349
14	NC_021233	TCATA	2	10	25539	25548	40 %	40 %	0 %	20 %	501148353
15	NC_021233	ATTGG	2	10	26103	26112	20 %	40 %	40 %	0 %	501148354
16	NC_021233	AGAAA	2	10	26228	26237	80 %	0 %	20 %	0 %	501148354
17	NC_021233	CCAGT	2	10	29020	29029	20 %	20 %	20 %	40 %	501148358
18	NC_021233	TGGCT	2	10	29785	29794	0 %	40 %	40 %	20 %	501148359
19	NC_021233	ATGGA	2	10	30004	30013	40 %	20 %	40 %	0 %	501148359
20	NC_021233	AGTCA	2	10	31472	31481	40 %	20 %	20 %	20 %	501148360
21	NC_021233	ATTTA	2	10	32851	32860	40 %	60 %	0 %	0 %	501148363
22	NC_021233	GCTTC	2	10	33074	33083	0 %	40 %	20 %	40 %	501148363
23	NC_021233	GTTGA	2	10	34637	34646	20 %	40 %	40 %	0 %	501148365
24	NC_021233	CAAAT	2	10	35257	35266	60 %	20 %	0 %	20 %	501148366
25	NC_021233	ACTGA	2	10	37751	37760	40 %	20 %	20 %	20 %	501148369
26	NC_021233	AATTC	2	10	38183	38192	40 %	40 %	0 %	20 %	501148369
27	NC_021233	CCAAT	2	10	38540	38549	40 %	20 %	0 %	40 %	501148369
28	NC_021233	TAAAA	2	10	39300	39309	80 %	20 %	0 %	0 %	501148370
29	NC_021233	AAAAC	2	10	39603	39612	80 %	0 %	0 %	20 %	501148370
30	NC_021233	ATTTT	2	10	41483	41492	20 %	80 %	0 %	0 %	501148374
31	NC_021233	AGCTT	2	10	43490	43499	20 %	40 %	20 %	20 %	501148375
32	NC_021233	GCTAA	2	10	46209	46218	40 %	20 %	20 %	20 %	501148378
33	NC_021233	TTTAA	2	10	47937	47946	40 %	60 %	0 %	0 %	501148381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.