MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	CGAA	2	8	121	128	50 %	0 %	25 %	25 %	501148329
2	NC_021233	CAA	2	6	201	206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148329
3	NC_021233	A	6	6	321	326	100 %	0 %	0 %	0 %	501148329
4	NC_021233	CTA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148329
5	NC_021233	AATC	2	8	500	507	50 %	25 %	0 %	25 %	501148329
6	NC_021233	ATG	2	6	536	541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148329
7	NC_021233	TTA	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148329
8	NC_021233	ATCG	2	8	629	636	25 %	25 %	25 %	25 %	501148329
9	NC_021233	GAC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148329
10	NC_021233	ACTA	2	8	700	707	50 %	25 %	0 %	25 %	501148329
11	NC_021233	GTA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148329
12	NC_021233	ACG	3	9	929	937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148329
13	NC_021233	AGC	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148330
14	NC_021233	CTTT	2	8	1486	1493	0 %	75 %	0 %	25 %	501148330
15	NC_021233	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148330
16	NC_021233	CAT	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148330
17	NC_021233	AC	3	6	1604	1609	50 %	0 %	0 %	50 %	501148330
18	NC_021233	TG	3	6	1679	1684	0 %	50 %	50 %	0 %	501148330
19	NC_021233	CGG	2	6	1707	1712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148330
20	NC_021233	CGG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148330
21	NC_021233	GCC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148330
22	NC_021233	GTT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148330
23	NC_021233	ATCA	2	8	2022	2029	50 %	25 %	0 %	25 %	501148330
24	NC_021233	CGG	2	6	2116	2121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148331
25	NC_021233	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148331
26	NC_021233	TTC	2	6	2249	2254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148331
27	NC_021233	CGT	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
28	NC_021233	GCT	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
29	NC_021233	GCT	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148331
30	NC_021233	GAC	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148331
31	NC_021233	GATG	2	8	2575	2582	25 %	25 %	50 %	0 %	501148331
32	NC_021233	CAA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148331
33	NC_021233	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148331
34	NC_021233	TTCTA	2	10	2664	2673	20 %	60 %	0 %	20 %	501148331
35	NC_021233	TGG	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148331
36	NC_021233	AGA	3	9	2718	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148331
37	NC_021233	TAT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148332
38	NC_021233	GTC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148332
39	NC_021233	GGA	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148332
40	NC_021233	A	7	7	2959	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	501148332
41	NC_021233	GCA	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148332
42	NC_021233	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	501148332
43	NC_021233	GCT	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148332
44	NC_021233	AAGG	2	8	3096	3103	50 %	0 %	50 %	0 %	501148332
45	NC_021233	GTT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148332
46	NC_021233	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148332
47	NC_021233	GCCCTG	2	12	3201	3212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	501148332
48	NC_021233	TGA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148332
49	NC_021233	GTG	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148332
50	NC_021233	CAG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148332
51	NC_021233	AACA	2	8	3403	3410	75 %	0 %	0 %	25 %	501148332
52	NC_021233	CAC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148332
53	NC_021233	GAG	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148333
54	NC_021233	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
55	NC_021233	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
56	NC_021233	ATC	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148333
57	NC_021233	TTA	2	6	3557	3562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
58	NC_021233	AAG	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
59	NC_021233	CAG	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
60	NC_021233	ACCT	2	8	3675	3682	25 %	25 %	0 %	50 %	501148333
61	NC_021233	ACG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
62	NC_021233	CCA	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148333
63	NC_021233	AGTTAA	2	12	3763	3774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	501148333
64	NC_021233	CAA	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
65	NC_021233	CAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
66	NC_021233	GCCA	2	8	3950	3957	25 %	0 %	25 %	50 %	501148333
67	NC_021233	ATT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148333
68	NC_021233	AGC	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
69	NC_021233	GCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148333
70	NC_021233	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
71	NC_021233	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
72	NC_021233	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148333
73	NC_021233	TAA	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148333
74	NC_021233	AAG	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148333
75	NC_021233	TGG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148334
76	NC_021233	ACC	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148334
77	NC_021233	GCATG	2	10	4722	4731	20 %	20 %	40 %	20 %	501148334
78	NC_021233	TCGC	2	8	4773	4780	0 %	25 %	25 %	50 %	501148334
79	NC_021233	T	7	7	4968	4974	0 %	100 %	0 %	0 %	501148335
80	NC_021233	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148335
81	NC_021233	AATT	2	8	5187	5194	50 %	50 %	0 %	0 %	501148335
82	NC_021233	TTG	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148335
83	NC_021233	TCA	2	6	5475	5480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
84	NC_021233	AAT	2	6	5490	5495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148336
85	NC_021233	ATT	2	6	5508	5513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148336
86	NC_021233	TCT	2	6	5514	5519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148336
87	NC_021233	TTC	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148336
88	NC_021233	TCA	2	6	5553	5558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
89	NC_021233	TAA	2	6	5600	5605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148336
90	NC_021233	ACT	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148336
91	NC_021233	GAT	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148336
92	NC_021233	AT	3	6	5791	5796	50 %	50 %	0 %	0 %	501148336
93	NC_021233	TTGG	2	8	5900	5907	0 %	50 %	50 %	0 %	501148337
94	NC_021233	T	6	6	5912	5917	0 %	100 %	0 %	0 %	501148337
95	NC_021233	ATC	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148337
96	NC_021233	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148337
97	NC_021233	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148337
98	NC_021233	AGC	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148337
99	NC_021233	ATT	3	9	6085	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148337
100	NC_021233	CAAGT	2	10	6095	6104	40 %	20 %	20 %	20 %	501148337
101	NC_021233	CAA	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148338
102	NC_021233	GCTAC	2	10	6272	6281	20 %	20 %	20 %	40 %	501148338
103	NC_021233	GAGT	2	8	6285	6292	25 %	25 %	50 %	0 %	501148338
104	NC_021233	TTCA	2	8	6356	6363	25 %	50 %	0 %	25 %	501148338
105	NC_021233	GCT	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148338
106	NC_021233	TTCC	2	8	6474	6481	0 %	50 %	0 %	50 %	501148338
107	NC_021233	AATT	2	8	6556	6563	50 %	50 %	0 %	0 %	501148338
108	NC_021233	CAAG	2	8	6698	6705	50 %	0 %	25 %	25 %	501148338
109	NC_021233	T	6	6	9302	9307	0 %	100 %	0 %	0 %	501148339
110	NC_021233	TTC	2	6	9320	9325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148339
111	NC_021233	AGT	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148339
112	NC_021233	TTGCTG	2	12	9446	9457	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	501148339
113	NC_021233	GT	3	6	9569	9574	0 %	50 %	50 %	0 %	501148339
114	NC_021233	TTAC	2	8	9603	9610	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
115	NC_021233	TAC	2	6	9619	9624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148339
116	NC_021233	A	6	6	9627	9632	100 %	0 %	0 %	0 %	501148339
117	NC_021233	CAT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148339
118	NC_021233	GCTT	2	8	9673	9680	0 %	50 %	25 %	25 %	501148339
119	NC_021233	CTTA	2	8	9698	9705	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
120	NC_021233	TACT	2	8	9708	9715	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
121	NC_021233	GTT	2	6	9778	9783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148339
122	NC_021233	TTAC	2	8	9801	9808	25 %	50 %	0 %	25 %	501148339
123	NC_021233	GCTAA	2	10	10176	10185	40 %	20 %	20 %	20 %	501148340
124	NC_021233	TCA	2	6	10186	10191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148340
125	NC_021233	AAT	2	6	10322	10327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148340
126	NC_021233	GTT	2	6	10367	10372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148340
127	NC_021233	ACC	2	6	10382	10387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148340
128	NC_021233	ACC	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148340
129	NC_021233	CAG	2	6	10549	10554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148340
130	NC_021233	ATG	2	6	10587	10592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148340
131	NC_021233	ATC	2	6	11034	11039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148341
132	NC_021233	GAACA	2	10	11080	11089	60 %	0 %	20 %	20 %	501148341
133	NC_021233	T	6	6	11116	11121	0 %	100 %	0 %	0 %	501148341
134	NC_021233	TTTTC	2	10	11124	11133	0 %	80 %	0 %	20 %	501148341
135	NC_021233	TCC	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148341
136	NC_021233	CAG	2	6	11208	11213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148341
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138	NC_021233	TTA	2	6	11405	11410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148341
139	NC_021233	CTT	2	6	11484	11489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148341
140	NC_021233	AAC	2	6	11491	11496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148341
141	NC_021233	TTTGT	2	10	11580	11589	0 %	80 %	20 %	0 %	501148341
142	NC_021233	CCA	2	6	11621	11626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
143	NC_021233	TGA	2	6	11644	11649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148341
144	NC_021233	CCA	2	6	11726	11731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
145	NC_021233	TTG	2	6	11830	11835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148341
146	NC_021233	CAC	2	6	11844	11849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148341
147	NC_021233	TTA	2	6	11855	11860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148341
148	NC_021233	CCT	2	6	13347	13352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148342
149	NC_021233	AATA	2	8	13410	13417	75 %	25 %	0 %	0 %	501148342
150	NC_021233	ATCTTT	2	12	13525	13536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501148342
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153	NC_021233	ATG	2	6	13591	13596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148342
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157	NC_021233	T	7	7	13757	13763	0 %	100 %	0 %	0 %	501148342
158	NC_021233	GGT	2	6	14201	14206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148343
159	NC_021233	CGG	2	6	14215	14220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148343
160	NC_021233	GTA	2	6	14223	14228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148343
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162	NC_021233	AAC	2	6	14264	14269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148343
163	NC_021233	ATA	2	6	14298	14303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148343
164	NC_021233	TCAAA	2	10	14306	14315	60 %	20 %	0 %	20 %	501148343
165	NC_021233	GTA	2	6	14349	14354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148343
166	NC_021233	GAA	2	6	14419	14424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148343
167	NC_021233	TA	3	6	14433	14438	50 %	50 %	0 %	0 %	501148343
168	NC_021233	TAA	2	6	14458	14463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148343
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175	NC_021233	AAG	2	6	14750	14755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148343
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177	NC_021233	A	6	6	14774	14779	100 %	0 %	0 %	0 %	501148343
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210	NC_021233	T	6	6	19968	19973	0 %	100 %	0 %	0 %	501148347
211	NC_021233	AAT	2	6	20065	20070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148347
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242	NC_021233	AAT	2	6	22661	22666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148351
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259	NC_021233	TAA	2	6	23624	23629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148351
260	NC_021233	GACA	2	8	23894	23901	50 %	0 %	25 %	25 %	501148351
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