MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021233	GAA	2	6	39820	39825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148370
502	NC_021233	TGA	2	6	39836	39841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148370
503	NC_021233	AAG	2	6	39873	39878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148370
504	NC_021233	ACT	2	6	39908	39913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148370
505	NC_021233	TGG	2	6	39946	39951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148370
506	NC_021233	GAA	2	6	39991	39996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148370
507	NC_021233	TTG	2	6	40217	40222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148371
508	NC_021233	AC	3	6	40312	40317	50 %	0 %	0 %	50 %	501148371
509	NC_021233	TGAG	2	8	40378	40385	25 %	25 %	50 %	0 %	501148372
510	NC_021233	GCG	2	6	40417	40422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148372
511	NC_021233	CG	3	6	40443	40448	0 %	0 %	50 %	50 %	501148372
512	NC_021233	ATT	2	6	40457	40462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148372
513	NC_021233	ACTC	2	8	40464	40471	25 %	25 %	0 %	50 %	501148372
514	NC_021233	TCC	2	6	40495	40500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148372
515	NC_021233	A	6	6	40501	40506	100 %	0 %	0 %	0 %	501148372
516	NC_021233	GAA	2	6	40554	40559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148372
517	NC_021233	AAC	2	6	40610	40615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148372
518	NC_021233	A	6	6	40703	40708	100 %	0 %	0 %	0 %	501148372
519	NC_021233	A	6	6	40710	40715	100 %	0 %	0 %	0 %	501148372
520	NC_021233	GTT	2	6	40775	40780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148372
521	NC_021233	TCAA	2	8	40795	40802	50 %	25 %	0 %	25 %	501148372
522	NC_021233	AGC	2	6	40813	40818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148372
523	NC_021233	GTA	2	6	41238	41243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148373
524	NC_021233	T	6	6	41279	41284	0 %	100 %	0 %	0 %	501148373
525	NC_021233	TTG	2	6	41298	41303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148373
526	NC_021233	TAT	2	6	41351	41356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148374
527	NC_021233	GGC	2	6	41383	41388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148374
528	NC_021233	T	6	6	41392	41397	0 %	100 %	0 %	0 %	501148374
529	NC_021233	AGT	2	6	41419	41424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148374
530	NC_021233	ATTTT	2	10	41483	41492	20 %	80 %	0 %	0 %	501148374
531	NC_021233	T	7	7	41489	41495	0 %	100 %	0 %	0 %	501148374
532	NC_021233	CTT	2	6	41532	41537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148374
533	NC_021233	AAT	2	6	41587	41592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148374
534	NC_021233	TGAC	2	8	41825	41832	25 %	25 %	25 %	25 %	501148375
535	NC_021233	GTG	2	6	41912	41917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148375
536	NC_021233	ATT	2	6	41922	41927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148375
537	NC_021233	AAG	2	6	41936	41941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148375
538	NC_021233	GCC	2	6	41942	41947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148375
539	NC_021233	ATTT	2	8	41982	41989	25 %	75 %	0 %	0 %	501148375
540	NC_021233	AAAG	2	8	42051	42058	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
541	NC_021233	AGAA	2	8	42131	42138	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
542	NC_021233	CACACG	2	12	42224	42235	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	501148375
543	NC_021233	TAA	2	6	42318	42323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148375
544	NC_021233	TGGT	2	8	42364	42371	0 %	50 %	50 %	0 %	501148375
545	NC_021233	A	6	6	42382	42387	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
546	NC_021233	A	6	6	42389	42394	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
547	NC_021233	GGC	2	6	42404	42409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148375
548	NC_021233	GGC	2	6	42417	42422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148375
549	NC_021233	A	7	7	42446	42452	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
550	NC_021233	AC	3	6	42503	42508	50 %	0 %	0 %	50 %	501148375
551	NC_021233	GAAA	2	8	42544	42551	75 %	0 %	25 %	0 %	501148375
552	NC_021233	CAA	2	6	42562	42567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
553	NC_021233	AGT	2	6	42618	42623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
554	NC_021233	A	6	6	42673	42678	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
555	NC_021233	GAT	2	6	42733	42738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
556	NC_021233	GCG	2	6	42741	42746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148375
557	NC_021233	TTAA	2	8	42775	42782	50 %	50 %	0 %	0 %	501148375
558	NC_021233	ATT	2	6	42813	42818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148375
559	NC_021233	CAA	2	6	42829	42834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
560	NC_021233	A	7	7	42846	42852	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
561	NC_021233	TAAA	2	8	42866	42873	75 %	25 %	0 %	0 %	501148375
562	NC_021233	A	6	6	42892	42897	100 %	0 %	0 %	0 %	501148375
563	NC_021233	ACG	2	6	42939	42944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148375
564	NC_021233	AACG	2	8	43000	43007	50 %	0 %	25 %	25 %	501148375
565	NC_021233	TGA	2	6	43023	43028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
566	NC_021233	ATT	2	6	43044	43049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148375
567	NC_021233	TTA	2	6	43084	43089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148375
568	NC_021233	CAA	2	6	43093	43098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
569	NC_021233	TGA	2	6	43133	43138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
570	NC_021233	ATG	2	6	43142	43147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
571	NC_021233	CTA	2	6	43183	43188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148375
572	NC_021233	AGC	2	6	43208	43213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148375
573	NC_021233	GCAA	2	8	43422	43429	50 %	0 %	25 %	25 %	501148375
574	NC_021233	CCA	2	6	43432	43437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148375
575	NC_021233	CAA	2	6	43462	43467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
576	NC_021233	TTAT	2	8	43476	43483	25 %	75 %	0 %	0 %	501148375
577	NC_021233	AGCTT	2	10	43490	43499	20 %	40 %	20 %	20 %	501148375
578	NC_021233	ATC	2	6	43514	43519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148375
579	NC_021233	ATG	2	6	43541	43546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
580	NC_021233	T	6	6	43561	43566	0 %	100 %	0 %	0 %	501148375
581	NC_021233	CGA	2	6	43586	43591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148375
582	NC_021233	CAA	2	6	43636	43641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148375
583	NC_021233	GAC	2	6	43648	43653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148375
584	NC_021233	TGA	2	6	43770	43775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148375
585	NC_021233	A	6	6	43896	43901	100 %	0 %	0 %	0 %	501148376
586	NC_021233	A	6	6	44231	44236	100 %	0 %	0 %	0 %	501148376
587	NC_021233	CGCCAG	2	12	44299	44310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	501148376
588	NC_021233	ACT	2	6	44350	44355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148376
589	NC_021233	TGA	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148376
590	NC_021233	ACC	2	6	44468	44473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148376
591	NC_021233	A	6	6	44497	44502	100 %	0 %	0 %	0 %	501148376
592	NC_021233	GAA	2	6	44507	44512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148376
593	NC_021233	CGA	2	6	44544	44549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148376
594	NC_021233	CAA	2	6	44582	44587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148376
595	NC_021233	TAT	2	6	46036	46041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148377
596	NC_021233	TGC	2	6	46073	46078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148377
597	NC_021233	AAT	2	6	46127	46132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148377
598	NC_021233	GCTAA	2	10	46209	46218	40 %	20 %	20 %	20 %	501148378
599	NC_021233	TCA	2	6	46219	46224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148378
600	NC_021233	AAT	2	6	46355	46360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148378
601	NC_021233	GTT	2	6	46400	46405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148378
602	NC_021233	ACC	2	6	46415	46420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148378
603	NC_021233	ACC	2	6	46559	46564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148378
604	NC_021233	CAG	2	6	46582	46587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148378
605	NC_021233	ATG	2	6	46620	46625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148378
606	NC_021233	T	7	7	47286	47292	0 %	100 %	0 %	0 %	501148379
607	NC_021233	CAA	2	6	47394	47399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148379
608	NC_021233	CGA	2	6	47435	47440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148379
609	NC_021233	TTC	2	6	47443	47448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148379
610	NC_021233	ATT	2	6	47594	47599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148380
611	NC_021233	AAC	2	6	47604	47609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148380
612	NC_021233	TCA	2	6	47668	47673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148380
613	NC_021233	TGA	2	6	47700	47705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148380
614	NC_021233	TAT	2	6	47726	47731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148380
615	NC_021233	TTTAA	2	10	47937	47946	40 %	60 %	0 %	0 %	501148381
616	NC_021233	AGT	2	6	47971	47976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148381
617	NC_021233	AAT	2	6	48038	48043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148381
618	NC_021233	ATC	2	6	48074	48079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148381
619	NC_021233	CTT	2	6	48103	48108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148381
620	NC_021233	GGC	2	6	48142	48147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148381
621	NC_021233	CTA	2	6	48165	48170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148381
622	NC_021233	TAA	2	6	48251	48256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148381
623	NC_021233	TCT	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148381
624	NC_021233	AT	3	6	48311	48316	50 %	50 %	0 %	0 %	501148381
625	NC_021233	A	6	6	48321	48326	100 %	0 %	0 %	0 %	501148381
626	NC_021233	CGT	3	9	48479	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148382
627	NC_021233	TAC	2	6	48565	48570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148382
628	NC_021233	TTAG	2	8	48708	48715	25 %	50 %	25 %	0 %	501148382
629	NC_021233	GTC	2	6	48735	48740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148382
630	NC_021233	CGAT	2	8	48780	48787	25 %	25 %	25 %	25 %	501148382
631	NC_021233	TAA	2	6	48794	48799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148382
632	NC_021233	ATC	2	6	48873	48878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148382
633	NC_021233	GATT	2	8	48909	48916	25 %	50 %	25 %	0 %	501148382
634	NC_021233	TAG	2	6	49024	49029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148382
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636	NC_021233	TTG	2	6	49210	49215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148382
637	NC_021233	TTCG	2	8	49288	49295	0 %	50 %	25 %	25 %	501148382
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661	NC_021233	AGAT	2	8	50814	50821	50 %	25 %	25 %	0 %	501148385
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