MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp5

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021227	GTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
2	NC_021227	ATT	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
3	NC_021227	ATT	2	6	1214	1219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148293
4	NC_021227	TGA	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
5	NC_021227	AAT	2	6	1316	1321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
6	NC_021227	CTA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148293
7	NC_021227	GTC	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148293
8	NC_021227	AAT	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
9	NC_021227	ATA	2	6	1856	1861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
10	NC_021227	ATA	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
11	NC_021227	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
12	NC_021227	TGA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
13	NC_021227	GTT	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148293
14	NC_021227	GAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148293
15	NC_021227	AGT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148293
16	NC_021227	TAA	3	9	2649	2657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
17	NC_021227	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148293
18	NC_021227	TTA	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148294
19	NC_021227	ACA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148294
20	NC_021227	TCA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148294
21	NC_021227	GAA	2	6	3142	3147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148295
22	NC_021227	GGA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501148305
23	NC_021227	CCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
24	NC_021227	GAA	2	6	4480	4485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148305
25	NC_021227	GCC	2	6	4525	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
26	NC_021227	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148305
27	NC_021227	CTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
28	NC_021227	GGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
29	NC_021227	CTG	3	9	4699	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
30	NC_021227	CAC	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
31	NC_021227	GTG	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
32	NC_021227	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
33	NC_021227	TGA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
34	NC_021227	TGG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
35	NC_021227	TGG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
36	NC_021227	CGG	2	6	5333	5338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
37	NC_021227	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148305
38	NC_021227	CCA	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
39	NC_021227	TGG	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148305
40	NC_021227	ATC	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
41	NC_021227	TGA	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
42	NC_021227	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
43	NC_021227	GCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
44	NC_021227	CGA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
45	NC_021227	GCC	2	6	5657	5662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
46	NC_021227	ATG	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
47	NC_021227	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
48	NC_021227	CGA	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
49	NC_021227	AGC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
50	NC_021227	CAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
51	NC_021227	CGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
52	NC_021227	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
53	NC_021227	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
54	NC_021227	AGC	2	6	6239	6244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
55	NC_021227	AGC	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148305
56	NC_021227	GCT	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
57	NC_021227	CGC	2	6	6462	6467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
58	NC_021227	GAT	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
59	NC_021227	CAC	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
60	NC_021227	ACC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
61	NC_021227	GCT	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
62	NC_021227	TGA	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
63	NC_021227	GGC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
64	NC_021227	CAC	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148305
65	NC_021227	ATG	2	6	6728	6733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148305
66	NC_021227	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501148305
67	NC_021227	GCG	2	6	6881	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
68	NC_021227	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
69	NC_021227	CGG	2	6	7022	7027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501148305
70	NC_021227	CAT	2	6	7047	7052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148305
71	NC_021227	TTC	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148305
72	NC_021227	TGC	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148305
73	NC_021227	ATC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
74	NC_021227	CTA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148306
75	NC_021227	TCT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148307
76	NC_021227	CAA	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
77	NC_021227	CAT	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148307
78	NC_021227	AAC	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148307
79	NC_021227	AGA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148307
80	NC_021227	CTG	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
81	NC_021227	GTT	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
82	NC_021227	TGC	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
83	NC_021227	TGC	2	6	8603	8608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
84	NC_021227	GTT	2	6	8616	8621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
85	NC_021227	GTC	2	6	8626	8631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148296
86	NC_021227	TTG	2	6	8649	8654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
87	NC_021227	TGA	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148296
88	NC_021227	GTT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
89	NC_021227	TTG	2	6	8775	8780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148296
90	NC_021227	TGT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148297
91	NC_021227	GTC	2	6	8968	8973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148297
92	NC_021227	GCT	2	6	9054	9059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148297
93	NC_021227	CTT	2	6	9318	9323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148297
94	NC_021227	TGG	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148297
95	NC_021227	GTT	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148297
96	NC_021227	ATG	2	6	9636	9641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
97	NC_021227	TGA	2	6	9679	9684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
98	NC_021227	GCA	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148298
99	NC_021227	CTT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148298
100	NC_021227	GTC	2	6	9865	9870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148298
101	NC_021227	TGA	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148298
102	NC_021227	CCT	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148298
103	NC_021227	GCT	2	6	10050	10055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501148298
104	NC_021227	GTG	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148298
105	NC_021227	TGG	2	6	10471	10476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148299
106	NC_021227	CTT	2	6	10525	10530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148299
107	NC_021227	TCC	2	6	10651	10656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501148299
108	NC_021227	GTG	2	6	10697	10702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148299
109	NC_021227	CTT	2	6	10798	10803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148300
110	NC_021227	TCA	2	6	10951	10956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148300
111	NC_021227	TAT	2	6	11165	11170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148301
112	NC_021227	GTT	2	6	11568	11573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148301
113	NC_021227	TTG	2	6	11631	11636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148301
114	NC_021227	GGT	2	6	11706	11711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148308
115	NC_021227	AAG	2	6	11882	11887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501148308
116	NC_021227	TTG	2	6	11954	11959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148308
117	NC_021227	GAT	3	9	11965	11973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148308
118	NC_021227	TAT	2	6	12068	12073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148309
119	NC_021227	TGA	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148309
120	NC_021227	AGC	2	6	12086	12091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148309
121	NC_021227	CAA	3	9	12111	12119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501148309
122	NC_021227	TGG	2	6	12232	12237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148309
123	NC_021227	TCT	2	6	12563	12568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501148302
124	NC_021227	TAT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501148302
125	NC_021227	TGT	2	6	12628	12633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148302
126	NC_021227	ATG	2	6	12759	12764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148302
127	NC_021227	GGT	2	6	12874	12879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501148302
128	NC_021227	TAG	2	6	12908	12913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148302
129	NC_021227	CAT	2	6	13168	13173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148303
130	NC_021227	TAA	2	6	13230	13235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148303
131	NC_021227	ATC	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148303
132	NC_021227	GTT	2	6	15194	15199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148310
133	NC_021227	TCA	2	6	15274	15279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501148304
134	NC_021227	AAT	2	6	15410	15415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501148304
135	NC_021227	GTT	2	6	15455	15460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501148304
136	NC_021227	ACC	2	6	15470	15475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148304
137	NC_021227	ACC	2	6	15638	15643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501148304
138	NC_021227	CAG	2	6	15661	15666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501148304
139	NC_021227	ATG	2	6	15699	15704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501148304

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.