MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 621

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021226	CTC	2	6	31234	31239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501145267
502	NC_021226	TG	3	6	31289	31294	0 %	50 %	50 %	0 %	501145267
503	NC_021226	T	7	7	31322	31328	0 %	100 %	0 %	0 %	501145267
504	NC_021226	AT	3	6	31343	31348	50 %	50 %	0 %	0 %	501145267
505	NC_021226	AATCAA	2	12	31566	31577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	501145268
506	NC_021226	AAC	2	6	31616	31621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145268
507	NC_021226	T	6	6	31627	31632	0 %	100 %	0 %	0 %	501145268
508	NC_021226	GC	3	6	31835	31840	0 %	0 %	50 %	50 %	501145268
509	NC_021226	CAT	2	6	31876	31881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145269
510	NC_021226	TAG	2	6	31884	31889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145269
511	NC_021226	CTA	2	6	31897	31902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145269
512	NC_021226	TCA	2	6	31966	31971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145269
513	NC_021226	CAC	2	6	31972	31977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145269
514	NC_021226	TCA	2	6	31993	31998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145269
515	NC_021226	CCA	2	6	32305	32310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145269
516	NC_021226	AAT	2	6	32327	32332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145269
517	NC_021226	TTGA	2	8	32333	32340	25 %	50 %	25 %	0 %	501145269
518	NC_021226	ACC	2	6	32346	32351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145269
519	NC_021226	AG	3	6	32462	32467	50 %	0 %	50 %	0 %	501145269
520	NC_021226	CGC	2	6	32692	32697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145270
521	NC_021226	GCT	2	6	32868	32873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145270
522	NC_021226	AGA	2	6	32879	32884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145270
523	NC_021226	AT	3	6	32936	32941	50 %	50 %	0 %	0 %	501145270
524	NC_021226	AAG	2	6	33097	33102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145270
525	NC_021226	CCGA	2	8	33147	33154	25 %	0 %	25 %	50 %	501145270
526	NC_021226	GAA	2	6	33156	33161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145270
527	NC_021226	TGA	2	6	33163	33168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145270
528	NC_021226	TCGC	2	8	33169	33176	0 %	25 %	25 %	50 %	501145270
529	NC_021226	A	6	6	33192	33197	100 %	0 %	0 %	0 %	501145270
530	NC_021226	CAA	2	6	33376	33381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145271
531	NC_021226	ATG	2	6	33384	33389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145271
532	NC_021226	AGC	2	6	33393	33398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145271
533	NC_021226	A	7	7	33450	33456	100 %	0 %	0 %	0 %	501145271
534	NC_021226	A	6	6	33460	33465	100 %	0 %	0 %	0 %	501145271
535	NC_021226	A	6	6	33512	33517	100 %	0 %	0 %	0 %	501145271
536	NC_021226	TGA	2	6	33675	33680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145271
537	NC_021226	AAT	2	6	33761	33766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145271
538	NC_021226	ATC	2	6	33806	33811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145271
539	NC_021226	GAAA	2	8	33922	33929	75 %	0 %	25 %	0 %	501145271
540	NC_021226	ACATCC	2	12	33987	33998	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	501145271
541	NC_021226	AGA	2	6	34045	34050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145271
542	NC_021226	AAT	2	6	34052	34057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145271
543	NC_021226	TTC	2	6	34112	34117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145271
544	NC_021226	A	6	6	34178	34183	100 %	0 %	0 %	0 %	501145271
545	NC_021226	GAA	2	6	34192	34197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145271
546	NC_021226	TGA	2	6	34206	34211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145271
547	NC_021226	TGA	2	6	34219	34224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145271
548	NC_021226	CGTT	2	8	34236	34243	0 %	50 %	25 %	25 %	501145271
549	NC_021226	TTG	2	6	34431	34436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145271
550	NC_021226	GCA	2	6	34528	34533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145271
551	NC_021226	ACG	2	6	34629	34634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145271
552	NC_021226	ACA	2	6	34665	34670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145271
553	NC_021226	ATT	2	6	34689	34694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145271
554	NC_021226	ATC	2	6	34697	34702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145271
555	NC_021226	CTT	2	6	34780	34785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145271
556	NC_021226	GAA	2	6	34801	34806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145271
557	NC_021226	GATG	2	8	34819	34826	25 %	25 %	50 %	0 %	501145271
558	NC_021226	GCA	2	6	34841	34846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145271
559	NC_021226	TGA	2	6	34927	34932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145271
560	NC_021226	TGA	2	6	34974	34979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145272
561	NC_021226	ATT	2	6	34992	34997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145272
562	NC_021226	CTG	2	6	35048	35053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145272
563	NC_021226	TTA	2	6	35115	35120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145272
564	NC_021226	GATC	2	8	35143	35150	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
565	NC_021226	TTC	2	6	35168	35173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145272
566	NC_021226	TCTTTA	2	12	35178	35189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	501145272
567	NC_021226	TCT	2	6	35265	35270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145272
568	NC_021226	ATC	2	6	35345	35350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145272
569	NC_021226	CGG	2	6	35370	35375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145272
570	NC_021226	TCG	2	6	35393	35398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145272
571	NC_021226	GCT	2	6	35423	35428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145272
572	NC_021226	TCT	2	6	35502	35507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145272
573	NC_021226	GAA	2	6	35509	35514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145272
574	NC_021226	AGA	2	6	35548	35553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145272
575	NC_021226	A	6	6	35558	35563	100 %	0 %	0 %	0 %	501145272
576	NC_021226	ACTTC	2	10	35580	35589	20 %	40 %	0 %	40 %	501145272
577	NC_021226	TGT	2	6	35707	35712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145272
578	NC_021226	TGC	2	6	35721	35726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145272
579	NC_021226	GAA	2	6	35732	35737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145272
580	NC_021226	CGA	2	6	35776	35781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145272
581	NC_021226	TCGTGG	2	12	35784	35795	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	501145272
582	NC_021226	GAA	2	6	35804	35809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145272
583	NC_021226	AAC	2	6	35836	35841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145272
584	NC_021226	CAAA	2	8	35850	35857	75 %	0 %	0 %	25 %	501145272
585	NC_021226	TGA	2	6	35949	35954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145272
586	NC_021226	A	6	6	35978	35983	100 %	0 %	0 %	0 %	501145272
587	NC_021226	CTT	2	6	36109	36114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145272
588	NC_021226	GATC	2	8	36147	36154	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
589	NC_021226	GGC	3	9	36194	36202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145272
590	NC_021226	CTT	2	6	36220	36225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145272
591	NC_021226	ATC	2	6	36386	36391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145272
592	NC_021226	ATC	2	6	36398	36403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145272
593	NC_021226	TCA	2	6	36420	36425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145272
594	NC_021226	CGAT	2	8	36462	36469	25 %	25 %	25 %	25 %	501145272
595	NC_021226	GCT	2	6	36506	36511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145272
596	NC_021226	GAA	2	6	36527	36532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145272
597	NC_021226	GCA	2	6	36537	36542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145272
598	NC_021226	CAT	2	6	37038	37043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145273
599	NC_021226	TAG	2	6	37046	37051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145273
600	NC_021226	CTA	2	6	37059	37064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145273
601	NC_021226	TCA	2	6	37128	37133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145273
602	NC_021226	CAC	2	6	37134	37139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145273
603	NC_021226	TCA	2	6	37155	37160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145273
604	NC_021226	CCA	2	6	37467	37472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145273
605	NC_021226	AAT	2	6	37489	37494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145273
606	NC_021226	TTGA	2	8	37495	37502	25 %	50 %	25 %	0 %	501145273
607	NC_021226	ACC	2	6	37508	37513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145273
608	NC_021226	AG	3	6	37624	37629	50 %	0 %	50 %	0 %	501145273
609	NC_021226	ATT	2	6	38406	38411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145274
610	NC_021226	CGGC	2	8	38443	38450	0 %	0 %	50 %	50 %	501145274
611	NC_021226	AAT	2	6	38524	38529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145274
612	NC_021226	CAT	2	6	38553	38558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145274
613	NC_021226	CCAAG	2	10	38559	38568	40 %	0 %	20 %	40 %	501145274
614	NC_021226	GCT	2	6	38569	38574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145274
615	NC_021226	TCA	2	6	38989	38994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145275
616	NC_021226	CTG	2	6	39028	39033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145275
617	NC_021226	TGG	2	6	39050	39055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145275
618	NC_021226	TGG	2	6	39218	39223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145275
619	NC_021226	AAC	2	6	39234	39239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145275
620	NC_021226	ATT	2	6	39279	39284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145275
621	NC_021226	GAT	3	9	39413	39421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145275

< Previous 12Next >