MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8

Total Repeats: 1492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021224	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	501145340
2	NC_021224	CACCG	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	501145343
3	NC_021224	GTTGC	2	10	5365	5374	0 %	40 %	40 %	20 %	501145344
4	NC_021224	TTAAC	2	10	10054	10063	40 %	40 %	0 %	20 %	501145346
5	NC_021224	TCGTA	2	10	11462	11471	20 %	40 %	20 %	20 %	501145349
6	NC_021224	GACCA	2	10	11534	11543	40 %	0 %	20 %	40 %	501145349
7	NC_021224	GCTGA	2	10	11750	11759	20 %	20 %	40 %	20 %	501145349
8	NC_021224	CCTTG	2	10	12118	12127	0 %	40 %	20 %	40 %	501145349
9	NC_021224	AAAAC	2	10	17004	17013	80 %	0 %	0 %	20 %	501145353
10	NC_021224	TTCAC	2	10	20695	20704	20 %	40 %	0 %	40 %	501145355
11	NC_021224	GGCGT	2	10	25849	25858	0 %	20 %	60 %	20 %	501145359
12	NC_021224	TCAAA	2	10	28318	28327	60 %	20 %	0 %	20 %	501145360
13	NC_021224	TCCGC	2	10	30357	30366	0 %	20 %	20 %	60 %	501145361
14	NC_021224	CGCAC	2	10	31688	31697	20 %	0 %	20 %	60 %	501145362
15	NC_021224	TGATT	2	10	32051	32060	20 %	60 %	20 %	0 %	501145362
16	NC_021224	TTAGT	2	10	32215	32224	20 %	60 %	20 %	0 %	501145363
17	NC_021224	GAAAC	2	10	34318	34327	60 %	0 %	20 %	20 %	501145364
18	NC_021224	ACTGG	2	10	34446	34455	20 %	20 %	40 %	20 %	501145364
19	NC_021224	GGTTT	2	10	36699	36708	0 %	60 %	40 %	0 %	501145366
20	NC_021224	TGATT	2	10	37886	37895	20 %	60 %	20 %	0 %	501145368
21	NC_021224	TGATT	2	10	39447	39456	20 %	60 %	20 %	0 %	501145369
22	NC_021224	GTATG	2	10	43114	43123	20 %	40 %	40 %	0 %	501145372
23	NC_021224	ATGTC	2	10	43192	43201	20 %	40 %	20 %	20 %	501145372
24	NC_021224	TTGTT	2	10	47052	47061	0 %	80 %	20 %	0 %	501145375
25	NC_021224	GAAAT	2	10	48258	48267	60 %	20 %	20 %	0 %	501145376
26	NC_021224	TGCGG	2	10	51389	51398	0 %	20 %	60 %	20 %	501145380
27	NC_021224	GATTG	2	10	52258	52267	20 %	40 %	40 %	0 %	501145381
28	NC_021224	TTACA	2	10	56719	56728	40 %	40 %	0 %	20 %	501145383
29	NC_021224	GGCAA	2	10	57531	57540	40 %	0 %	40 %	20 %	501145384
30	NC_021224	GACCT	2	10	59038	59047	20 %	20 %	20 %	40 %	501145386
31	NC_021224	GATCA	2	10	59209	59218	40 %	20 %	20 %	20 %	501145386
32	NC_021224	GCTTG	2	10	64529	64538	0 %	40 %	40 %	20 %	501145391
33	NC_021224	ACTTC	2	10	64657	64666	20 %	40 %	0 %	40 %	501145391
34	NC_021224	AACGG	2	10	64874	64883	40 %	0 %	40 %	20 %	501145392
35	NC_021224	AGTTA	2	10	64906	64915	40 %	40 %	20 %	0 %	501145392
36	NC_021224	GCTTA	2	10	66884	66893	20 %	40 %	20 %	20 %	501145393
37	NC_021224	TTGAC	2	10	67133	67142	20 %	40 %	20 %	20 %	501145393
38	NC_021224	ATGCC	2	10	71663	71672	20 %	20 %	20 %	40 %	501145398
39	NC_021224	GTTAG	2	10	80494	80503	20 %	40 %	40 %	0 %	501145408
40	NC_021224	CTAAG	2	10	80924	80933	40 %	20 %	20 %	20 %	501145408
41	NC_021224	AGGTG	2	10	84278	84287	20 %	20 %	60 %	0 %	501145412
42	NC_021224	GGGGC	2	10	87542	87551	0 %	0 %	80 %	20 %	501145415
43	NC_021224	GCACG	2	10	88791	88800	20 %	0 %	40 %	40 %	501145417
44	NC_021224	TGATT	2	10	94117	94126	20 %	60 %	20 %	0 %	501145423
45	NC_021224	TGGGA	2	10	96804	96813	20 %	20 %	60 %	0 %	501145426
46	NC_021224	TAAGC	2	10	98346	98355	40 %	20 %	20 %	20 %	501145428
47	NC_021224	GATCA	2	10	98393	98402	40 %	20 %	20 %	20 %	501145428
48	NC_021224	TTGAT	2	10	100117	100126	20 %	60 %	20 %	0 %	501145429
49	NC_021224	CACGT	2	10	100298	100307	20 %	20 %	20 %	40 %	501145430
50	NC_021224	GGCGG	2	10	100546	100555	0 %	0 %	80 %	20 %	501145430
51	NC_021224	CACGG	2	10	100840	100849	20 %	0 %	40 %	40 %	501145430
52	NC_021224	TTCAT	2	10	103497	103506	20 %	60 %	0 %	20 %	501145433
53	NC_021224	GGTTA	2	10	105643	105652	20 %	40 %	40 %	0 %	501145435
54	NC_021224	ATTGA	2	10	106977	106986	40 %	40 %	20 %	0 %	501145436
55	NC_021224	GCTGG	2	10	108495	108504	0 %	20 %	60 %	20 %	501145438
56	NC_021224	ACCGT	2	10	109201	109210	20 %	20 %	20 %	40 %	501145439
57	NC_021224	TCATT	2	10	111240	111249	20 %	60 %	0 %	20 %	501145440
58	NC_021224	AGCTA	2	10	112691	112700	40 %	20 %	20 %	20 %	501145441
59	NC_021224	TTCGA	2	10	117049	117058	20 %	40 %	20 %	20 %	501145448
60	NC_021224	ATGTT	2	10	117215	117224	20 %	60 %	20 %	0 %	501145448
61	NC_021224	CGGCG	2	10	119052	119061	0 %	0 %	60 %	40 %	501145450
62	NC_021224	CATGC	2	10	120237	120246	20 %	20 %	20 %	40 %	501145452
63	NC_021224	CAACC	2	10	120500	120509	40 %	0 %	0 %	60 %	501145452
64	NC_021224	ATCAA	2	10	121103	121112	60 %	20 %	0 %	20 %	501145453
65	NC_021224	CTTGG	2	10	121320	121329	0 %	40 %	40 %	20 %	501145453
66	NC_021224	TAATC	2	10	127143	127152	40 %	40 %	0 %	20 %	501145458
67	NC_021224	TCGAT	2	10	128341	128350	20 %	40 %	20 %	20 %	501145459
68	NC_021224	AAATT	2	10	128632	128641	60 %	40 %	0 %	0 %	501145459
69	NC_021224	GTACC	2	10	130425	130434	20 %	20 %	20 %	40 %	501145460
70	NC_021224	GAATT	2	10	131236	131245	40 %	40 %	20 %	0 %	501145461
71	NC_021224	AATCA	2	10	134418	134427	60 %	20 %	0 %	20 %	501145466
72	NC_021224	TAAAC	2	10	137074	137083	60 %	20 %	0 %	20 %	501145469
73	NC_021224	ATGAA	2	10	139637	139646	60 %	20 %	20 %	0 %	501145471
74	NC_021224	GGAAT	2	10	140147	140156	40 %	20 %	40 %	0 %	501145472
75	NC_021224	ATTAA	2	10	141682	141691	60 %	40 %	0 %	0 %	501145472
76	NC_021224	TGACG	2	10	142908	142917	20 %	20 %	40 %	20 %	501145474
77	NC_021224	TCACC	2	10	144510	144519	20 %	20 %	0 %	60 %	501145476
78	NC_021224	AACTA	2	10	145460	145469	60 %	20 %	0 %	20 %	501145477
79	NC_021224	GCAAA	2	10	145551	145560	60 %	0 %	20 %	20 %	501145477
80	NC_021224	ACCGA	2	10	145734	145743	40 %	0 %	20 %	40 %	501145477
81	NC_021224	TTTTA	2	10	147471	147480	20 %	80 %	0 %	0 %	501145480
82	NC_021224	TATCT	2	10	149404	149413	20 %	60 %	0 %	20 %	501145482
83	NC_021224	CAACG	2	10	152457	152466	40 %	0 %	20 %	40 %	501145484
84	NC_021224	ATTGG	3	15	153955	153969	20 %	40 %	40 %	0 %	501145485
85	NC_021224	TTAAC	2	10	156319	156328	40 %	40 %	0 %	20 %	501145487
86	NC_021224	GTTGT	2	10	156432	156441	0 %	60 %	40 %	0 %	501145487
87	NC_021224	AGGTC	2	10	157685	157694	20 %	20 %	40 %	20 %	501145488
88	NC_021224	GATCG	2	10	158570	158579	20 %	20 %	40 %	20 %	501145489
89	NC_021224	TTCGT	2	10	172232	172241	0 %	60 %	20 %	20 %	501145497
90	NC_021224	TCTGG	2	10	172415	172424	0 %	40 %	40 %	20 %	501145497
91	NC_021224	GGTTA	2	10	176856	176865	20 %	40 %	40 %	0 %	501145500
92	NC_021224	AACTG	2	10	178562	178571	40 %	20 %	20 %	20 %	501145501
93	NC_021224	GGCGT	2	10	186474	186483	0 %	20 %	60 %	20 %	501145505
94	NC_021224	TGTGA	2	10	186573	186582	20 %	40 %	40 %	0 %	501145505
95	NC_021224	TTTGG	2	10	187633	187642	0 %	60 %	40 %	0 %	501145506
96	NC_021224	ATCTG	2	10	189504	189513	20 %	40 %	20 %	20 %	501145507
97	NC_021224	AACCC	2	10	200000	200009	40 %	0 %	0 %	60 %	501145519
98	NC_021224	AACTT	2	10	202232	202241	40 %	40 %	0 %	20 %	501145521
99	NC_021224	TCCAA	2	10	204540	204549	40 %	20 %	0 %	40 %	501145526
100	NC_021224	AGGAC	2	10	204687	204696	40 %	0 %	40 %	20 %	501145526
101	NC_021224	AGTTG	2	10	205424	205433	20 %	40 %	40 %	0 %	501145527
102	NC_021224	TTGTG	2	10	205702	205711	0 %	60 %	40 %	0 %	501145527
103	NC_021224	TAAAT	2	10	206509	206518	60 %	40 %	0 %	0 %	501145527
104	NC_021224	ACTTG	2	10	207530	207539	20 %	40 %	20 %	20 %	501145529
105	NC_021224	TACGT	2	10	208027	208036	20 %	40 %	20 %	20 %	501145530
106	NC_021224	AAAAT	2	10	210308	210317	80 %	20 %	0 %	0 %	501145532
107	NC_021224	CTTTG	2	10	213087	213096	0 %	60 %	20 %	20 %	501145536
108	NC_021224	ACCAT	2	10	216341	216350	40 %	20 %	0 %	40 %	501145538
109	NC_021224	ATGCA	2	10	221541	221550	40 %	20 %	20 %	20 %	501145541
110	NC_021224	GGCGC	2	10	227089	227098	0 %	0 %	60 %	40 %	501145549
111	NC_021224	AGCGC	2	10	231168	231177	20 %	0 %	40 %	40 %	501145553
112	NC_021224	TCTAT	2	10	233804	233813	20 %	60 %	0 %	20 %	501145555
113	NC_021224	GGTCA	2	10	238154	238163	20 %	20 %	40 %	20 %	501145560
114	NC_021224	GTGAC	2	10	238443	238452	20 %	20 %	40 %	20 %	501145560
115	NC_021224	TAATT	2	10	238864	238873	40 %	60 %	0 %	0 %	501145560
116	NC_021224	GTGCA	2	10	246275	246284	20 %	20 %	40 %	20 %	501145565
117	NC_021224	AATAT	2	10	246476	246485	60 %	40 %	0 %	0 %	501145565
118	NC_021224	GTGAC	2	10	248856	248865	20 %	20 %	40 %	20 %	501145568
119	NC_021224	ACAAT	2	10	249594	249603	60 %	20 %	0 %	20 %	501145569
120	NC_021224	TAAGA	2	10	257073	257082	60 %	20 %	20 %	0 %	501145577
121	NC_021224	CTGGC	2	10	259071	259080	0 %	20 %	40 %	40 %	501145580
122	NC_021224	CCGTT	2	10	260772	260781	0 %	40 %	20 %	40 %	501145581
123	NC_021224	AACGG	2	10	261795	261804	40 %	0 %	40 %	20 %	501145583
124	NC_021224	AGTGA	2	10	262488	262497	40 %	20 %	40 %	0 %	501145584
125	NC_021224	GCCTT	2	10	263606	263615	0 %	40 %	20 %	40 %	501145585
126	NC_021224	AAGTT	2	10	264017	264026	40 %	40 %	20 %	0 %	501145585
127	NC_021224	GAATT	2	10	265051	265060	40 %	40 %	20 %	0 %	501145586
128	NC_021224	CGTTA	2	10	265455	265464	20 %	40 %	20 %	20 %	501145587
129	NC_021224	AATTA	2	10	265902	265911	60 %	40 %	0 %	0 %	501145587
130	NC_021224	GGCGT	2	10	266580	266589	0 %	20 %	60 %	20 %	501145588
131	NC_021224	AAGTC	2	10	267197	267206	40 %	20 %	20 %	20 %	501145589
132	NC_021224	TAAGT	2	10	269627	269636	40 %	40 %	20 %	0 %	501145589
133	NC_021224	ACGAA	2	10	271188	271197	60 %	0 %	20 %	20 %	501145589
134	NC_021224	AATAA	2	10	271204	271213	80 %	20 %	0 %	0 %	501145589
135	NC_021224	TTACG	2	10	273774	273783	20 %	40 %	20 %	20 %	501145591
136	NC_021224	GTACC	2	10	274230	274239	20 %	20 %	20 %	40 %	501145591
137	NC_021224	CAAGC	2	10	275849	275858	40 %	0 %	20 %	40 %	501145592
138	NC_021224	ATCAC	2	10	284793	284802	40 %	20 %	0 %	40 %	501145601
139	NC_021224	ACATT	2	10	287412	287421	40 %	40 %	0 %	20 %	501145603
140	NC_021224	TTCGT	2	10	293461	293470	0 %	60 %	20 %	20 %	501145609
141	NC_021224	AGATG	2	10	296856	296865	40 %	20 %	40 %	0 %	501145613
142	NC_021224	GTTTG	2	10	298957	298966	0 %	60 %	40 %	0 %	501145617
143	NC_021224	ACGAA	2	10	299471	299480	60 %	0 %	20 %	20 %	501145618
144	NC_021224	AATCC	2	10	302486	302495	40 %	20 %	0 %	40 %	501145620
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146	NC_021224	ACTGG	2	10	303977	303986	20 %	20 %	40 %	20 %	501145621
147	NC_021224	ACCAA	2	10	304878	304887	60 %	0 %	0 %	40 %	501145622
148	NC_021224	ATAAA	2	10	305194	305203	80 %	20 %	0 %	0 %	501145622
149	NC_021224	GTTTG	2	10	306130	306139	0 %	60 %	40 %	0 %	501145623
150	NC_021224	AACGA	2	10	308740	308749	60 %	0 %	20 %	20 %	501145625
151	NC_021224	TTCCA	2	10	308912	308921	20 %	40 %	0 %	40 %	501145625
152	NC_021224	TCGAA	2	10	309075	309084	40 %	20 %	20 %	20 %	501145625
153	NC_021224	ACGCT	2	10	311084	311093	20 %	20 %	20 %	40 %	501145628
154	NC_021224	AGGGT	2	10	311271	311280	20 %	20 %	60 %	0 %	501145628
155	NC_021224	GACCT	2	10	313878	313887	20 %	20 %	20 %	40 %	501145631
156	NC_021224	GATTT	2	10	315678	315687	20 %	60 %	20 %	0 %	501145633
157	NC_021224	TTGCC	2	10	318325	318334	0 %	40 %	20 %	40 %	501145637
158	NC_021224	CGGGG	2	10	318830	318839	0 %	0 %	80 %	20 %	501145637
159	NC_021224	TTGCA	2	10	328742	328751	20 %	40 %	20 %	20 %	501145645
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161	NC_021224	GGCTG	2	10	329845	329854	0 %	20 %	60 %	20 %	501145646
162	NC_021224	CCACG	2	10	336027	336036	20 %	0 %	20 %	60 %	501145653
163	NC_021224	GATCG	2	10	337557	337566	20 %	20 %	40 %	20 %	501145654
164	NC_021224	CGAGC	2	10	337660	337669	20 %	0 %	40 %	40 %	501145654
165	NC_021224	AGGGC	2	10	338188	338197	20 %	0 %	60 %	20 %	501145655
166	NC_021224	TGTCT	2	10	339949	339958	0 %	60 %	20 %	20 %	501145656
167	NC_021224	TGATT	2	10	340147	340156	20 %	60 %	20 %	0 %	501145656
168	NC_021224	TGGTT	2	10	343474	343483	0 %	60 %	40 %	0 %	501145658
169	NC_021224	AGTGA	2	10	343584	343593	40 %	20 %	40 %	0 %	501145658
170	NC_021224	CCCGG	2	10	343733	343742	0 %	0 %	40 %	60 %	501145658
171	NC_021224	CAACG	2	10	345079	345088	40 %	0 %	20 %	40 %	501145659
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173	NC_021224	GTTAA	2	10	349878	349887	40 %	40 %	20 %	0 %	501145662
174	NC_021224	AGGAT	2	10	350494	350503	40 %	20 %	40 %	0 %	501145663
175	NC_021224	TAATA	2	10	351080	351089	60 %	40 %	0 %	0 %	501145663
176	NC_021224	ATCAT	2	10	353975	353984	40 %	40 %	0 %	20 %	501145665
177	NC_021224	CAAAA	2	10	356898	356907	80 %	0 %	0 %	20 %	501145668
178	NC_021224	AGTTT	2	10	358892	358901	20 %	60 %	20 %	0 %	501145671
179	NC_021224	GTTCT	2	10	361191	361200	0 %	60 %	20 %	20 %	501145673
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181	NC_021224	AGCAG	2	10	367705	367714	40 %	0 %	40 %	20 %	501145680
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198	NC_021224	TAATT	2	10	391815	391824	40 %	60 %	0 %	0 %	501145710
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201	NC_021224	CTTTG	2	10	394892	394901	0 %	60 %	20 %	20 %	501145713
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238	NC_021224	TATTT	2	10	453648	453657	20 %	80 %	0 %	0 %	501145762
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244	NC_021224	GCGAT	2	10	474389	474398	20 %	20 %	40 %	20 %	501145777
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246	NC_021224	TACGT	2	10	482574	482583	20 %	40 %	20 %	20 %	501145785
247	NC_021224	CCGTT	2	10	488162	488171	0 %	40 %	20 %	40 %	501145789
248	NC_021224	CTGGA	2	10	488426	488435	20 %	20 %	40 %	20 %	501145789
249	NC_021224	GTACC	2	10	488725	488734	20 %	20 %	20 %	40 %	501145789
250	NC_021224	CGGCC	2	10	490558	490567	0 %	0 %	40 %	60 %	501145790
251	NC_021224	AATTA	2	10	490667	490676	60 %	40 %	0 %	0 %	501145790
252	NC_021224	AATTA	2	10	491482	491491	60 %	40 %	0 %	0 %	501145791
253	NC_021224	GTTTT	2	10	496088	496097	0 %	80 %	20 %	0 %	501145795
254	NC_021224	AAACG	2	10	497548	497557	60 %	0 %	20 %	20 %	501145797
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256	NC_021224	TGATG	2	10	501822	501831	20 %	40 %	40 %	0 %	501145800
257	NC_021224	TTGAT	2	10	502263	502272	20 %	60 %	20 %	0 %	501145801
258	NC_021224	AACTT	2	10	504653	504662	40 %	40 %	0 %	20 %	501145803
259	NC_021224	GGCCC	2	10	504679	504688	0 %	0 %	40 %	60 %	501145803
260	NC_021224	TGGTC	2	10	506426	506435	0 %	40 %	40 %	20 %	501145806
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262	NC_021224	AATCC	2	10	509375	509384	40 %	20 %	0 %	40 %	501145809
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