MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8

Total Repeats: 48914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021224	CGC	2	6	28597	28602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145360
502	NC_021224	AAG	2	6	28635	28640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145360
503	NC_021224	GCG	2	6	28727	28732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145360
504	NC_021224	CGC	2	6	28807	28812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145360
505	NC_021224	TGAT	2	8	28860	28867	25 %	50 %	25 %	0 %	501145360
506	NC_021224	CAA	2	6	28973	28978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145360
507	NC_021224	CAG	2	6	28979	28984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145360
508	NC_021224	ACGA	2	8	29112	29119	50 %	0 %	25 %	25 %	501145360
509	NC_021224	GATT	2	8	29262	29269	25 %	50 %	25 %	0 %	501145361
510	NC_021224	ATG	2	6	29282	29287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145361
511	NC_021224	GAT	2	6	29296	29301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145361
512	NC_021224	CTA	2	6	29382	29387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
513	NC_021224	TTA	2	6	29418	29423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145361
514	NC_021224	TGG	2	6	29436	29441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
515	NC_021224	TGG	2	6	29445	29450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
516	NC_021224	TTG	2	6	29564	29569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145361
517	NC_021224	AAT	2	6	29578	29583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145361
518	NC_021224	TTTA	2	8	29626	29633	25 %	75 %	0 %	0 %	501145361
519	NC_021224	CGTG	2	8	29661	29668	0 %	25 %	50 %	25 %	501145361
520	NC_021224	GGT	2	6	29704	29709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
521	NC_021224	ATT	2	6	29764	29769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145361
522	NC_021224	CAG	2	6	29793	29798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145361
523	NC_021224	ATC	2	6	29801	29806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
524	NC_021224	GTC	2	6	29842	29847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145361
525	NC_021224	TAC	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
526	NC_021224	CATT	3	12	30026	30037	25 %	50 %	0 %	25 %	501145361
527	NC_021224	TGG	2	6	30058	30063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
528	NC_021224	ATT	2	6	30146	30151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145361
529	NC_021224	TGGC	2	8	30171	30178	0 %	25 %	50 %	25 %	501145361
530	NC_021224	GGA	2	6	30276	30281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501145361
531	NC_021224	ACT	2	6	30317	30322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
532	NC_021224	GCG	2	6	30329	30334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145361
533	NC_021224	TCCGC	2	10	30357	30366	0 %	20 %	20 %	60 %	501145361
534	NC_021224	ATT	2	6	30373	30378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145361
535	NC_021224	TGG	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
536	NC_021224	ACG	2	6	30454	30459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145361
537	NC_021224	ACT	2	6	30555	30560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
538	NC_021224	TGA	2	6	30597	30602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145361
539	NC_021224	TGA	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145361
540	NC_021224	G	7	7	30615	30621	0 %	0 %	100 %	0 %	501145361
541	NC_021224	ACT	2	6	30823	30828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145361
542	NC_021224	GTG	2	6	30866	30871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
543	NC_021224	GTG	2	6	30926	30931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145361
544	NC_021224	AGT	2	6	31307	31312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145362
545	NC_021224	T	6	6	31314	31319	0 %	100 %	0 %	0 %	501145362
546	NC_021224	TGGA	2	8	31324	31331	25 %	25 %	50 %	0 %	501145362
547	NC_021224	AGT	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145362
548	NC_021224	TGA	2	6	31453	31458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145362
549	NC_021224	ACG	2	6	31461	31466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145362
550	NC_021224	TTA	2	6	31601	31606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145362
551	NC_021224	TAA	2	6	31607	31612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145362
552	NC_021224	CAGA	2	8	31670	31677	50 %	0 %	25 %	25 %	501145362
553	NC_021224	CGCAC	2	10	31688	31697	20 %	0 %	20 %	60 %	501145362
554	NC_021224	GCG	2	6	31749	31754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145362
555	NC_021224	TAA	2	6	31796	31801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145362
556	NC_021224	CG	3	6	31991	31996	0 %	0 %	50 %	50 %	501145362
557	NC_021224	ACA	2	6	32011	32016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145362
558	NC_021224	CGG	2	6	32021	32026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145362
559	NC_021224	TGATT	2	10	32051	32060	20 %	60 %	20 %	0 %	501145362
560	NC_021224	TTAGT	2	10	32215	32224	20 %	60 %	20 %	0 %	501145363
561	NC_021224	GCC	2	6	32279	32284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145363
562	NC_021224	GCC	2	6	32351	32356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145363
563	NC_021224	AGT	2	6	32475	32480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145363
564	NC_021224	T	6	6	32516	32521	0 %	100 %	0 %	0 %	501145363
565	NC_021224	AGCC	2	8	32547	32554	25 %	0 %	25 %	50 %	501145363
566	NC_021224	GTT	2	6	32555	32560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145363
567	NC_021224	AAT	2	6	32628	32633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145363
568	NC_021224	TAGC	2	8	32649	32656	25 %	25 %	25 %	25 %	501145363
569	NC_021224	ATCC	2	8	32722	32729	25 %	25 %	0 %	50 %	501145363
570	NC_021224	TGC	2	6	32869	32874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145363
571	NC_021224	TGA	2	6	33007	33012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
572	NC_021224	GTC	2	6	33139	33144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145364
573	NC_021224	CA	3	6	33158	33163	50 %	0 %	0 %	50 %	501145364
574	NC_021224	GTC	2	6	33190	33195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145364
575	NC_021224	CGTCAT	2	12	33251	33262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	501145364
576	NC_021224	GA	3	6	33301	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	501145364
577	NC_021224	GC	3	6	33324	33329	0 %	0 %	50 %	50 %	501145364
578	NC_021224	T	6	6	33383	33388	0 %	100 %	0 %	0 %	501145364
579	NC_021224	AAT	2	6	33390	33395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145364
580	NC_021224	TGA	2	6	33619	33624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
581	NC_021224	TCG	2	6	33629	33634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145364
582	NC_021224	AGC	2	6	33690	33695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
583	NC_021224	TTC	2	6	33769	33774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145364
584	NC_021224	CGAT	2	8	33893	33900	25 %	25 %	25 %	25 %	501145364
585	NC_021224	GTA	2	6	33954	33959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
586	NC_021224	TAT	2	6	34010	34015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145364
587	NC_021224	AGTG	2	8	34046	34053	25 %	25 %	50 %	0 %	501145364
588	NC_021224	TCA	2	6	34066	34071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145364
589	NC_021224	GTT	2	6	34172	34177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145364
590	NC_021224	CGGT	2	8	34188	34195	0 %	25 %	50 %	25 %	501145364
591	NC_021224	GCA	2	6	34312	34317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
592	NC_021224	GAAAC	2	10	34318	34327	60 %	0 %	20 %	20 %	501145364
593	NC_021224	ACTGG	2	10	34446	34455	20 %	20 %	40 %	20 %	501145364
594	NC_021224	GAC	2	6	34515	34520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
595	NC_021224	GTT	2	6	34589	34594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145364
596	NC_021224	TAGT	2	8	34634	34641	25 %	50 %	25 %	0 %	501145364
597	NC_021224	TGA	2	6	34668	34673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
598	NC_021224	AGC	2	6	34704	34709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
599	NC_021224	GAT	2	6	34733	34738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
600	NC_021224	ACG	2	6	34777	34782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
601	NC_021224	GTC	2	6	34939	34944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145364
602	NC_021224	TGTT	2	8	34993	35000	0 %	75 %	25 %	0 %	501145364
603	NC_021224	TGA	2	6	35017	35022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
604	NC_021224	TTC	2	6	35074	35079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145364
605	NC_021224	TGG	2	6	35083	35088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145364
606	NC_021224	GTG	2	6	35101	35106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145364
607	NC_021224	CTT	2	6	35219	35224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145364
608	NC_021224	ATT	2	6	35229	35234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145364
609	NC_021224	GTA	2	6	35256	35261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
610	NC_021224	CTA	2	6	35306	35311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145364
611	NC_021224	CGA	2	6	35405	35410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
612	NC_021224	AGC	2	6	35451	35456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145364
613	NC_021224	GAT	2	6	35570	35575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145364
614	NC_021224	TAA	2	6	35612	35617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145364
615	NC_021224	TCA	2	6	36071	36076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145365
616	NC_021224	TTGA	2	8	36088	36095	25 %	50 %	25 %	0 %	501145365
617	NC_021224	TGC	2	6	36139	36144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145365
618	NC_021224	GTT	2	6	36289	36294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145365
619	NC_021224	GAC	2	6	36302	36307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145365
620	NC_021224	TTC	2	6	36324	36329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145365
621	NC_021224	GT	3	6	36451	36456	0 %	50 %	50 %	0 %	501145365
622	NC_021224	TAA	2	6	36654	36659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145366
623	NC_021224	GAA	2	6	36661	36666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145366
624	NC_021224	GGTTT	2	10	36699	36708	0 %	60 %	40 %	0 %	501145366
625	NC_021224	ATG	2	6	36804	36809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145366
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627	NC_021224	TTG	2	6	37060	37065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145367
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755	NC_021224	AGC	2	6	43446	43451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145372
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759	NC_021224	ATA	2	6	43560	43565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145372
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865	NC_021224	ACG	2	6	50293	50298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145378
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870	NC_021224	AACG	2	8	51349	51356	50 %	0 %	25 %	25 %	501145380
871	NC_021224	TGCGG	2	10	51389	51398	0 %	20 %	60 %	20 %	501145380
872	NC_021224	A	6	6	51416	51421	100 %	0 %	0 %	0 %	501145380
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874	NC_021224	TTGT	2	8	51442	51449	0 %	75 %	25 %	0 %	501145380
875	NC_021224	A	7	7	51493	51499	100 %	0 %	0 %	0 %	501145380
876	NC_021224	TATT	2	8	51594	51601	25 %	75 %	0 %	0 %	501145380
877	NC_021224	CTG	2	6	51642	51647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145380
878	NC_021224	GGAC	2	8	51782	51789	25 %	0 %	50 %	25 %	501145381
879	NC_021224	ACC	2	6	52042	52047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145381
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881	NC_021224	AAC	2	6	52127	52132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145381
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998	NC_021224	GTG	2	6	59068	59073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145386
999	NC_021224	TG	3	6	59078	59083	0 %	50 %	50 %	0 %	501145386
1000	NC_021224	GATCA	2	10	59209	59218	40 %	20 %	20 %	20 %	501145386

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