MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-3 DNA

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020826	CAA	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279728
2	NC_020826	ACC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279728
3	NC_020826	GGC	2	6	483	488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279728
4	NC_020826	TTC	2	6	550	555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279728
5	NC_020826	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279728
6	NC_020826	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279728
7	NC_020826	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279728
8	NC_020826	GTC	2	6	1441	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279729
9	NC_020826	ATC	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279729
10	NC_020826	CTG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279729
11	NC_020826	TTG	2	6	1593	1598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279729
12	NC_020826	AAT	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279729
13	NC_020826	GTT	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279729
14	NC_020826	AAT	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279729
15	NC_020826	ATT	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
16	NC_020826	AAT	2	6	2458	2463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
17	NC_020826	CAT	2	6	2535	2540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
18	NC_020826	GGA	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279730
19	NC_020826	TAA	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
20	NC_020826	TCA	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
21	NC_020826	ATT	2	6	2822	2827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
22	NC_020826	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
23	NC_020826	TTC	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
24	NC_020826	AAC	2	6	3016	3021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279730
25	NC_020826	CAT	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
26	NC_020826	TTA	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
27	NC_020826	TCT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
28	NC_020826	ATA	2	6	3438	3443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279730
29	NC_020826	ATC	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
30	NC_020826	CAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279730
31	NC_020826	TCA	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
32	NC_020826	TTC	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
33	NC_020826	ATT	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
34	NC_020826	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279730
35	NC_020826	TTA	2	6	3947	3952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
36	NC_020826	GTC	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279730
37	NC_020826	TAT	2	6	4032	4037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279730
38	NC_020826	CTG	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279730
39	NC_020826	CCG	3	9	4056	4064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279730
40	NC_020826	TCA	2	6	4097	4102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279730
41	NC_020826	GCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279731
42	NC_020826	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279731
43	NC_020826	ATC	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279731
44	NC_020826	ATT	2	6	4747	4752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279731
45	NC_020826	AAT	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279731
46	NC_020826	AAG	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279731
47	NC_020826	CAA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279732
48	NC_020826	TAA	2	6	5171	5176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279732
49	NC_020826	GTC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279732
50	NC_020826	CAT	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279732
51	NC_020826	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279732
52	NC_020826	TCA	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279732
53	NC_020826	TGT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279732
54	NC_020826	TTC	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279732
55	NC_020826	TAT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
56	NC_020826	TTA	2	6	5644	5649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
57	NC_020826	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279732
58	NC_020826	AAT	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279732
59	NC_020826	AAG	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279732
60	NC_020826	TTA	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279734
61	NC_020826	CAG	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279734
62	NC_020826	TGC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279734
63	NC_020826	GTT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279734
64	NC_020826	CAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279734
65	NC_020826	TGC	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279734
66	NC_020826	GAA	2	6	6941	6946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279734
67	NC_020826	ATT	2	6	6949	6954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279734
68	NC_020826	AAT	2	6	7007	7012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279734
69	NC_020826	GAA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279734
70	NC_020826	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279734
71	NC_020826	GCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
72	NC_020826	TCA	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
73	NC_020826	ATT	2	6	7426	7431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
74	NC_020826	TGG	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279735
75	NC_020826	TGC	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
76	NC_020826	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
77	NC_020826	TTA	2	6	7790	7795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
78	NC_020826	AAT	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279735
79	NC_020826	CAT	2	6	7956	7961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
80	NC_020826	TAT	2	6	8068	8073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279735
81	NC_020826	GAA	2	6	8312	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279735
82	NC_020826	TGC	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
83	NC_020826	ACA	2	6	8403	8408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
84	NC_020826	CAG	2	6	8494	8499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279735
85	NC_020826	CAA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
86	NC_020826	TTG	2	6	8571	8576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279735
87	NC_020826	TGC	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
88	NC_020826	GGC	2	6	8663	8668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279735
89	NC_020826	GCT	2	6	8720	8725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
90	NC_020826	CAA	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
91	NC_020826	TGC	2	6	8794	8799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279735
92	NC_020826	ACT	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279735
93	NC_020826	ATG	2	6	8931	8936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279735
94	NC_020826	GTA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279735
95	NC_020826	TAA	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279735
96	NC_020826	ACA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279735
97	NC_020826	CAT	2	6	9220	9225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
98	NC_020826	AAT	2	6	9296	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279736
99	NC_020826	TCA	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
100	NC_020826	GAA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279736
101	NC_020826	ACT	2	6	9543	9548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279736
102	NC_020826	ATT	2	6	9550	9555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279736
103	NC_020826	TTA	2	6	9784	9789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279736
104	NC_020826	AAC	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279737
105	NC_020826	GCG	2	6	10304	10309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279737
106	NC_020826	GTT	2	6	10315	10320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279737
107	NC_020826	CCA	2	6	10331	10336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279737
108	NC_020826	TAA	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279738
109	NC_020826	GTA	2	6	10677	10682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279738
110	NC_020826	AGA	2	6	10766	10771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279738
111	NC_020826	CTT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279739
112	NC_020826	TAT	2	6	11912	11917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279739
113	NC_020826	AAC	2	6	12029	12034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
114	NC_020826	AAT	2	6	12053	12058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
115	NC_020826	AGC	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279740
116	NC_020826	TAA	2	6	12188	12193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
117	NC_020826	TAC	2	6	12224	12229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279740
118	NC_020826	TAA	2	6	12292	12297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
119	NC_020826	ACA	2	6	12351	12356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
120	NC_020826	GAT	2	6	12393	12398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279740
121	NC_020826	AGC	2	6	12413	12418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279740
122	NC_020826	CAA	2	6	12653	12658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279740
123	NC_020826	AAT	2	6	12659	12664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
124	NC_020826	CCA	2	6	12727	12732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279740
125	NC_020826	TAT	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279740
126	NC_020826	TAA	2	6	13066	13071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279740
127	NC_020826	TAG	2	6	13234	13239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279740
128	NC_020826	TAA	2	6	13486	13491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279741
129	NC_020826	ATC	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279741
130	NC_020826	AGT	2	6	13695	13700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279741
131	NC_020826	TAA	2	6	13731	13736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279741
132	NC_020826	GAA	2	6	13782	13787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279741
133	NC_020826	AAT	2	6	13825	13830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279741
134	NC_020826	ATT	2	6	13996	14001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279741
135	NC_020826	ATT	2	6	14210	14215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279741
136	NC_020826	TTA	2	6	14250	14255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279741
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143	NC_020826	TCA	2	6	14687	14692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279741
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153	NC_020826	CAT	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279742
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163	NC_020826	TAA	2	6	15981	15986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279743
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250	NC_020826	GTT	2	6	23497	23502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279748
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252	NC_020826	CGG	2	6	23878	23883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279749
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371	NC_020826	AAT	2	6	35197	35202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.