MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	ACC	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
2	NC_020824	ACC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279710
3	NC_020824	TAACTT	2	12	688	699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472279710
4	NC_020824	A	8	8	735	742	100 %	0 %	0 %	0 %	472279710
5	NC_020824	T	6	6	773	778	0 %	100 %	0 %	0 %	472279710
6	NC_020824	AGT	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279710
7	NC_020824	AGTA	2	8	860	867	50 %	25 %	25 %	0 %	472279710
8	NC_020824	TGT	2	6	895	900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279710
9	NC_020824	A	6	6	905	910	100 %	0 %	0 %	0 %	472279710
10	NC_020824	GAGT	2	8	1253	1260	25 %	25 %	50 %	0 %	472279711
11	NC_020824	TTCA	2	8	1324	1331	25 %	50 %	0 %	25 %	472279711
12	NC_020824	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279711
13	NC_020824	TTCC	2	8	1442	1449	0 %	50 %	0 %	50 %	472279711
14	NC_020824	AATT	2	8	1524	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	472279711
15	NC_020824	CAAG	2	8	1666	1673	50 %	0 %	25 %	25 %	472279711
16	NC_020824	A	8	8	2097	2104	100 %	0 %	0 %	0 %	472279712
17	NC_020824	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
18	NC_020824	TGCT	2	8	2127	2134	0 %	50 %	25 %	25 %	472279712
19	NC_020824	TGA	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279712
20	NC_020824	A	6	6	2238	2243	100 %	0 %	0 %	0 %	472279712
21	NC_020824	AAG	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279712
22	NC_020824	ATT	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279712
23	NC_020824	GAAAT	2	10	3008	3017	60 %	20 %	20 %	0 %	472279713
24	NC_020824	ATTT	2	8	3080	3087	25 %	75 %	0 %	0 %	472279713
25	NC_020824	T	7	7	3085	3091	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
26	NC_020824	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279713
27	NC_020824	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
28	NC_020824	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
29	NC_020824	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
30	NC_020824	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279713
31	NC_020824	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
32	NC_020824	T	6	6	3502	3507	0 %	100 %	0 %	0 %	472279713
33	NC_020824	AGA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
34	NC_020824	A	7	7	3621	3627	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
35	NC_020824	AGAAA	2	10	3681	3690	80 %	0 %	20 %	0 %	472279713
36	NC_020824	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	472279713
37	NC_020824	A	7	7	3868	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	472279713
38	NC_020824	CAAG	2	8	3883	3890	50 %	0 %	25 %	25 %	472279713
39	NC_020824	AAG	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279713
40	NC_020824	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
41	NC_020824	CAA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
42	NC_020824	GTTGAT	2	12	4061	4072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	472279714
43	NC_020824	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279714
44	NC_020824	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
45	NC_020824	GAT	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279714
46	NC_020824	GAC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279714
47	NC_020824	A	6	6	4154	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	472279714
48	NC_020824	AAAG	2	8	4225	4232	75 %	0 %	25 %	0 %	472279714
49	NC_020824	CAA	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279714
50	NC_020824	ACAA	2	8	4278	4285	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
51	NC_020824	GAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
52	NC_020824	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279714
53	NC_020824	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279714
54	NC_020824	ACAA	2	8	4374	4381	75 %	0 %	0 %	25 %	472279714
55	NC_020824	AACCTA	2	12	4413	4424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472279714
56	NC_020824	GTG	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279714
57	NC_020824	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
58	NC_020824	ATC	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279715
59	NC_020824	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
60	NC_020824	GTT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279715
61	NC_020824	TTC	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279715
62	NC_020824	CATC	2	8	5130	5137	25 %	25 %	0 %	50 %	472279715
63	NC_020824	TATT	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	472279716
64	NC_020824	T	6	6	5741	5746	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
65	NC_020824	A	6	6	5775	5780	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
66	NC_020824	TAA	3	9	5794	5802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
67	NC_020824	T	6	6	5827	5832	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
68	NC_020824	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
69	NC_020824	T	8	8	5981	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
70	NC_020824	CTG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279716
71	NC_020824	T	7	7	6004	6010	0 %	100 %	0 %	0 %	472279716
72	NC_020824	CAA	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279716
73	NC_020824	TTA	2	6	6073	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279716
74	NC_020824	GAAT	2	8	6089	6096	50 %	25 %	25 %	0 %	472279716
75	NC_020824	A	7	7	6128	6134	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
76	NC_020824	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279716
77	NC_020824	A	6	6	6249	6254	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
78	NC_020824	A	8	8	6269	6276	100 %	0 %	0 %	0 %	472279716
79	NC_020824	GCG	2	6	6448	6453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279717
80	NC_020824	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
81	NC_020824	ACC	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
82	NC_020824	TCA	3	9	6598	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
83	NC_020824	TAA	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
84	NC_020824	TAA	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
85	NC_020824	GTT	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
86	NC_020824	CTTCC	2	10	6749	6758	0 %	40 %	0 %	60 %	472279717
87	NC_020824	TTA	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
88	NC_020824	T	6	6	6813	6818	0 %	100 %	0 %	0 %	472279717
89	NC_020824	TCT	2	6	6835	6840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
90	NC_020824	CAT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
91	NC_020824	AGT	2	6	6966	6971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
92	NC_020824	CTTT	2	8	6997	7004	0 %	75 %	0 %	25 %	472279717
93	NC_020824	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279717
94	NC_020824	GTT	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
95	NC_020824	CAG	2	6	7124	7129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
96	NC_020824	TCT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
97	NC_020824	TTG	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
98	NC_020824	AAAG	2	8	7194	7201	75 %	0 %	25 %	0 %	472279717
99	NC_020824	ATTGA	2	10	7308	7317	40 %	40 %	20 %	0 %	472279717
100	NC_020824	TCCA	2	8	7361	7368	25 %	25 %	0 %	50 %	472279717
101	NC_020824	CAA	2	6	7382	7387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
102	NC_020824	TAC	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279717
103	NC_020824	ATCAAC	2	12	7530	7541	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	472279717
104	NC_020824	CTTG	2	8	7619	7626	0 %	50 %	25 %	25 %	472279717
105	NC_020824	TTC	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279717
106	NC_020824	GCT	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279717
107	NC_020824	AGC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
108	NC_020824	TAA	2	6	7884	7889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
109	NC_020824	CAG	2	6	7910	7915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
110	NC_020824	AGG	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279717
111	NC_020824	AAT	2	6	8037	8042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
112	NC_020824	ATA	2	6	8106	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
113	NC_020824	ACTG	2	8	8143	8150	25 %	25 %	25 %	25 %	472279717
114	NC_020824	TGT	2	6	8242	8247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
115	NC_020824	CCA	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279717
116	NC_020824	AAAC	2	8	8285	8292	75 %	0 %	0 %	25 %	472279717
117	NC_020824	CAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
118	NC_020824	ATA	2	6	8317	8322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279717
119	NC_020824	T	7	7	8364	8370	0 %	100 %	0 %	0 %	472279717
120	NC_020824	CAG	3	9	8381	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279717
121	NC_020824	TAG	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279717
122	NC_020824	ATT	2	6	8458	8463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
123	NC_020824	AAC	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279717
124	NC_020824	TTA	2	6	8497	8502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279717
125	NC_020824	TTG	2	6	8668	8673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
126	NC_020824	CATA	2	8	8706	8713	50 %	25 %	0 %	25 %	472279717
127	NC_020824	TGT	2	6	8728	8733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279717
128	NC_020824	TCA	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279718
129	NC_020824	ATAA	2	8	9142	9149	75 %	25 %	0 %	0 %	472279718
130	NC_020824	CAA	2	6	9273	9278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279718
131	NC_020824	T	6	6	9319	9324	0 %	100 %	0 %	0 %	472279718
132	NC_020824	T	7	7	9331	9337	0 %	100 %	0 %	0 %	472279718
133	NC_020824	AGTC	2	8	9400	9407	25 %	25 %	25 %	25 %	472279719
134	NC_020824	CTT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279719
135	NC_020824	T	6	6	9446	9451	0 %	100 %	0 %	0 %	472279719
136	NC_020824	ATT	2	6	9500	9505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279719
137	NC_020824	TAAC	2	8	9514	9521	50 %	25 %	0 %	25 %	472279719
138	NC_020824	TA	3	6	9530	9535	50 %	50 %	0 %	0 %	472279719
139	NC_020824	TAA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279719

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.