MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	CGGT	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	472279655
2	NC_020822	ATTC	2	8	1486	1493	25 %	50 %	0 %	25 %	472279655
3	NC_020822	TTTA	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
4	NC_020822	TGAT	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	472279656
5	NC_020822	TCTA	2	8	2640	2647	25 %	50 %	0 %	25 %	472279656
6	NC_020822	ATTT	2	8	2657	2664	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
7	NC_020822	TATT	2	8	2727	2734	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
8	NC_020822	ATGG	2	8	3861	3868	25 %	25 %	50 %	0 %	472279658
9	NC_020822	CTCG	2	8	4044	4051	0 %	25 %	25 %	50 %	472279658
10	NC_020822	AATC	2	8	4521	4528	50 %	25 %	0 %	25 %	472279658
11	NC_020822	TAAG	2	8	4793	4800	50 %	25 %	25 %	0 %	472279659
12	NC_020822	GAGC	2	8	4841	4848	25 %	0 %	50 %	25 %	472279659
13	NC_020822	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	472279659
14	NC_020822	TTGA	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	472279659
15	NC_020822	TTTG	2	8	7711	7718	0 %	75 %	25 %	0 %	472279661
16	NC_020822	TTTC	2	8	7969	7976	0 %	75 %	0 %	25 %	472279662
17	NC_020822	GCAA	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	472279662
18	NC_020822	AACA	2	8	9187	9194	75 %	0 %	0 %	25 %	472279663
19	NC_020822	TAAG	2	8	11169	11176	50 %	25 %	25 %	0 %	472279667
20	NC_020822	AAAG	2	8	11279	11286	75 %	0 %	25 %	0 %	472279667
21	NC_020822	AAAG	2	8	12390	12397	75 %	0 %	25 %	0 %	472279670
22	NC_020822	AGAA	2	8	12470	12477	75 %	0 %	25 %	0 %	472279670
23	NC_020822	GCAA	2	8	12656	12663	50 %	0 %	25 %	25 %	472279670
24	NC_020822	TGGT	2	8	12703	12710	0 %	50 %	50 %	0 %	472279670
25	NC_020822	AACA	2	8	13310	13317	75 %	0 %	0 %	25 %	472279670
26	NC_020822	AGTT	2	8	13421	13428	25 %	50 %	25 %	0 %	472279670
27	NC_020822	ATTA	2	8	14029	14036	50 %	50 %	0 %	0 %	472279670
28	NC_020822	AGCA	2	8	15377	15384	50 %	0 %	25 %	25 %	472279671
29	NC_020822	GAGT	2	8	16825	16832	25 %	25 %	50 %	0 %	472279672
30	NC_020822	ATTT	2	8	16835	16842	25 %	75 %	0 %	0 %	472279672
31	NC_020822	CTGT	2	8	17068	17075	0 %	50 %	25 %	25 %	472279672
32	NC_020822	CTGA	2	8	17247	17254	25 %	25 %	25 %	25 %	472279673
33	NC_020822	CCTT	2	8	17644	17651	0 %	50 %	0 %	50 %	472279673
34	NC_020822	GGGT	2	8	17832	17839	0 %	25 %	75 %	0 %	472279673
35	NC_020822	TAAG	2	8	17859	17866	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
36	NC_020822	ATAG	2	8	18072	18079	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
37	NC_020822	AGAT	2	8	18375	18382	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
38	NC_020822	AATT	2	8	19180	19187	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
39	NC_020822	AATT	2	8	19324	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
40	NC_020822	AATT	2	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
41	NC_020822	CTTG	2	8	20448	20455	0 %	50 %	25 %	25 %	472279674
42	NC_020822	CAAA	2	8	21107	21114	75 %	0 %	0 %	25 %	472279674
43	NC_020822	ATTA	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
44	NC_020822	ATTG	2	8	21900	21907	25 %	50 %	25 %	0 %	472279674
45	NC_020822	AATG	2	8	22809	22816	50 %	25 %	25 %	0 %	472279675
46	NC_020822	AAAT	2	8	24206	24213	75 %	25 %	0 %	0 %	472279678
47	NC_020822	TGAT	2	8	25038	25045	25 %	50 %	25 %	0 %	472279678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.